MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46501	NC_015942	TTG	2	6	2269523	2269528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200401
46502	NC_015942	CCG	2	6	2269560	2269565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200401
46503	NC_015942	CCA	2	6	2269587	2269592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200401
46504	NC_015942	TGC	2	6	2269758	2269763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200401
46505	NC_015942	GC	3	6	2269762	2269767	0 %	0 %	50 %	50 %	344200401
46506	NC_015942	CAG	2	6	2269768	2269773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200401
46507	NC_015942	C	7	7	2269831	2269837	0 %	0 %	0 %	100 %	344200401
46508	NC_015942	GAG	2	6	2269843	2269848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200401
46509	NC_015942	GTT	2	6	2269977	2269982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200401
46510	NC_015942	GC	3	6	2269997	2270002	0 %	0 %	50 %	50 %	344200401
46511	NC_015942	TGT	2	6	2270117	2270122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200401
46512	NC_015942	GCG	2	6	2270135	2270140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200401
46513	NC_015942	GCC	2	6	2270260	2270265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200401
46514	NC_015942	GGC	2	6	2270320	2270325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200401
46515	NC_015942	T	6	6	2270384	2270389	0 %	100 %	0 %	0 %	344200401
46516	NC_015942	GCC	2	6	2270390	2270395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200401
46517	NC_015942	GGC	2	6	2270455	2270460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200401
46518	NC_015942	AGCA	2	8	2270461	2270468	50 %	0 %	25 %	25 %	344200401
46519	NC_015942	CG	3	6	2270551	2270556	0 %	0 %	50 %	50 %	344200401
46520	NC_015942	CCA	2	6	2270568	2270573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200401
46521	NC_015942	CAT	2	6	2270614	2270619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200401
46522	NC_015942	GAT	2	6	2270651	2270656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46523	NC_015942	TAC	2	6	2270673	2270678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200402
46524	NC_015942	TTC	2	6	2270788	2270793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200402
46525	NC_015942	CAC	2	6	2270944	2270949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46526	NC_015942	TAA	2	6	2271148	2271153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46527	NC_015942	GAG	2	6	2271157	2271162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46528	NC_015942	CAT	2	6	2271187	2271192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200403
46529	NC_015942	GCA	2	6	2271246	2271251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200403
46530	NC_015942	CTC	2	6	2271283	2271288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200403
46531	NC_015942	CCGGAC	2	12	2271334	2271345	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344200403
46532	NC_015942	GGC	2	6	2271390	2271395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200403
46533	NC_015942	CCA	2	6	2271401	2271406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200403
46534	NC_015942	ACC	2	6	2271418	2271423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200403
46535	NC_015942	GCTG	3	12	2271449	2271460	0 %	25 %	50 %	25 %	344200403
46536	NC_015942	ATT	2	6	2271470	2271475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200403
46537	NC_015942	GAA	2	6	2271481	2271486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200403
46538	NC_015942	ACG	2	6	2271515	2271520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200403
46539	NC_015942	GGC	2	6	2271555	2271560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200403
46540	NC_015942	CGC	2	6	2271599	2271604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200403
46541	NC_015942	GGC	2	6	2271645	2271650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200403
46542	NC_015942	CAA	2	6	2271687	2271692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200403
46543	NC_015942	CCA	2	6	2271725	2271730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200403
46544	NC_015942	ATCGGT	2	12	2271751	2271762	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344200403
46545	NC_015942	CCT	2	6	2271804	2271809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200403
46546	NC_015942	ATC	2	6	2271836	2271841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200403
46547	NC_015942	GCC	2	6	2271868	2271873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200403
46548	NC_015942	TCA	2	6	2271962	2271967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200403
46549	NC_015942	CACGG	2	10	2271970	2271979	20 %	0 %	40 %	40 %	344200403
46550	NC_015942	GGC	2	6	2272012	2272017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200403
46551	NC_015942	ACACCC	2	12	2272088	2272099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200403
46552	NC_015942	AC	3	6	2272133	2272138	50 %	0 %	0 %	50 %	344200403
46553	NC_015942	ATG	2	6	2272205	2272210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200403
46554	NC_015942	AAGGC	2	10	2272211	2272220	40 %	0 %	40 %	20 %	344200403
46555	NC_015942	AGG	2	6	2272322	2272327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200403
46556	NC_015942	GCA	2	6	2272478	2272483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200403
46557	NC_015942	T	6	6	2272516	2272521	0 %	100 %	0 %	0 %	344200403
46558	NC_015942	GGC	2	6	2272528	2272533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200403
46559	NC_015942	CAC	2	6	2272608	2272613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200403
46560	NC_015942	TCGC	2	8	2272623	2272630	0 %	25 %	25 %	50 %	344200403
46561	NC_015942	AGG	2	6	2272646	2272651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200403
46562	NC_015942	ATC	2	6	2272654	2272659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200403
46563	NC_015942	GC	3	6	2272761	2272766	0 %	0 %	50 %	50 %	344200403
46564	NC_015942	CAT	2	6	2272800	2272805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200403
46565	NC_015942	GTT	2	6	2272900	2272905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200403
46566	NC_015942	GCC	2	6	2272965	2272970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200403
46567	NC_015942	ACC	2	6	2272987	2272992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200403
46568	NC_015942	ACA	2	6	2273111	2273116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200403
46569	NC_015942	AGA	2	6	2273133	2273138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200403
46570	NC_015942	CATG	2	8	2273178	2273185	25 %	25 %	25 %	25 %	344200403
46571	NC_015942	GCG	2	6	2273413	2273418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200403
46572	NC_015942	ACC	2	6	2273435	2273440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200404
46573	NC_015942	GAA	2	6	2273444	2273449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200404
46574	NC_015942	TCGC	2	8	2273510	2273517	0 %	25 %	25 %	50 %	344200404
46575	NC_015942	CTC	2	6	2273573	2273578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200404
46576	NC_015942	GGC	2	6	2273597	2273602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200404
46577	NC_015942	CGG	2	6	2273627	2273632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200404
46578	NC_015942	TCA	2	6	2273643	2273648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200404
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46580	NC_015942	GTGC	2	8	2273736	2273743	0 %	25 %	50 %	25 %	344200405
46581	NC_015942	TGA	2	6	2273816	2273821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200405
46582	NC_015942	ATC	2	6	2273834	2273839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200405
46583	NC_015942	GGA	2	6	2273841	2273846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200405
46584	NC_015942	T	7	7	2273848	2273854	0 %	100 %	0 %	0 %	344200405
46585	NC_015942	GGA	2	6	2273892	2273897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200405
46586	NC_015942	ATC	2	6	2273899	2273904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200405
46587	NC_015942	TCAGC	2	10	2273949	2273958	20 %	20 %	20 %	40 %	344200405
46588	NC_015942	CGG	2	6	2273960	2273965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200405
46589	NC_015942	GAC	2	6	2274084	2274089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200405
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46591	NC_015942	GCA	2	6	2274126	2274131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200405
46592	NC_015942	CAG	2	6	2274133	2274138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200405
46593	NC_015942	ACC	2	6	2274151	2274156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200405
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46596	NC_015942	TGC	2	6	2274249	2274254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200405
46597	NC_015942	GCA	2	6	2274258	2274263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200405
46598	NC_015942	CTG	2	6	2274289	2274294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200405
46599	NC_015942	TTC	2	6	2274300	2274305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200405
46600	NC_015942	CAG	2	6	2274378	2274383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200405
46601	NC_015942	TCA	2	6	2274523	2274528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46602	NC_015942	TGC	2	6	2274568	2274573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200406
46603	NC_015942	GTT	2	6	2274602	2274607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200406
46604	NC_015942	TGG	2	6	2274648	2274653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200406
46605	NC_015942	GTG	2	6	2274755	2274760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200406
46606	NC_015942	ACC	2	6	2275070	2275075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200406
46607	NC_015942	GTCC	2	8	2275106	2275113	0 %	25 %	25 %	50 %	344200406
46608	NC_015942	TCG	2	6	2275197	2275202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200406
46609	NC_015942	AGG	2	6	2275272	2275277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200406
46610	NC_015942	GCG	2	6	2275320	2275325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200406
46611	NC_015942	ACC	2	6	2275355	2275360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200406
46612	NC_015942	TGC	2	6	2275382	2275387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200406
46613	NC_015942	CAT	3	9	2275408	2275416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200406
46614	NC_015942	CGG	2	6	2275498	2275503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200406
46615	NC_015942	TCG	2	6	2275533	2275538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200406
46616	NC_015942	CGA	2	6	2275567	2275572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200406
46617	NC_015942	GAT	2	6	2275573	2275578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200406
46618	NC_015942	GCA	2	6	2275668	2275673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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46723	NC_015942	TGAT	2	8	2281529	2281536	25 %	50 %	25 %	0 %	344200412
46724	NC_015942	CAC	2	6	2281657	2281662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200412
46725	NC_015942	TCG	2	6	2281812	2281817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200412
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46728	NC_015942	AAAG	2	8	2282054	2282061	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46729	NC_015942	AG	3	6	2282064	2282069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46730	NC_015942	GAG	2	6	2282105	2282110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200413
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46732	NC_015942	GGA	2	6	2282191	2282196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200413
46733	NC_015942	ACG	2	6	2282222	2282227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200413
46734	NC_015942	CCGA	2	8	2282261	2282268	25 %	0 %	25 %	50 %	344200413
46735	NC_015942	AGA	2	6	2282271	2282276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200413
46736	NC_015942	CAG	2	6	2282300	2282305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200413
46737	NC_015942	ACC	2	6	2282312	2282317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200413
46738	NC_015942	TTC	2	6	2282318	2282323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200413
46739	NC_015942	CTG	3	9	2282324	2282332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200413
46740	NC_015942	GC	3	6	2282334	2282339	0 %	0 %	50 %	50 %	344200413
46741	NC_015942	GAT	2	6	2282374	2282379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200413
46742	NC_015942	TGG	2	6	2282484	2282489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200413
46743	NC_015942	GC	3	6	2282515	2282520	0 %	0 %	50 %	50 %	344200413
46744	NC_015942	CT	3	6	2282554	2282559	0 %	50 %	0 %	50 %	344200413
46745	NC_015942	ACG	3	9	2282613	2282621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200413
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46761	NC_015942	CGA	2	6	2283280	2283285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200413
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46764	NC_015942	ACG	2	6	2283615	2283620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200413
46765	NC_015942	TCG	2	6	2283672	2283677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200413
46766	NC_015942	TGG	2	6	2283747	2283752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200413
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46770	NC_015942	GTT	2	6	2283978	2283983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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46847	NC_015942	CG	4	8	2287750	2287757	0 %	0 %	50 %	50 %	344200414
46848	NC_015942	GCAG	2	8	2287833	2287840	25 %	0 %	50 %	25 %	344200414
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46850	NC_015942	CAG	2	6	2287950	2287955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200414
46851	NC_015942	CTG	2	6	2287987	2287992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200414
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46853	NC_015942	CTG	2	6	2288234	2288239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200415
46854	NC_015942	AGTC	2	8	2288395	2288402	25 %	25 %	25 %	25 %	344200415
46855	NC_015942	AAG	2	6	2288441	2288446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200415
46856	NC_015942	TGG	2	6	2288449	2288454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200415
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46861	NC_015942	CAGC	2	8	2288609	2288616	25 %	0 %	25 %	50 %	344200415
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46864	NC_015942	TGCT	2	8	2288745	2288752	0 %	50 %	25 %	25 %	344200415
46865	NC_015942	TGC	2	6	2288781	2288786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200415
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46872	NC_015942	TG	3	6	2289120	2289125	0 %	50 %	50 %	0 %	344200415
46873	NC_015942	CGA	2	6	2289265	2289270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200415
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46890	NC_015942	GC	4	8	2290127	2290134	0 %	0 %	50 %	50 %	344200415
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46933	NC_015942	CTGGA	2	10	2292020	2292029	20 %	20 %	40 %	20 %	344200417
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46960	NC_015942	GCTG	2	8	2293583	2293590	0 %	25 %	50 %	25 %	344200418
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46963	NC_015942	CAT	2	6	2293641	2293646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200418
46964	NC_015942	GGAG	2	8	2293658	2293665	25 %	0 %	75 %	0 %	344200418
46965	NC_015942	TGC	2	6	2293789	2293794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200418
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46967	NC_015942	GTC	2	6	2293876	2293881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200418
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