MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40502	NC_015942	GGA	2	6	1982946	1982951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200126
40503	NC_015942	TGA	2	6	1982969	1982974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200126
40504	NC_015942	G	7	7	1983022	1983028	0 %	0 %	100 %	0 %	344200126
40505	NC_015942	GCC	2	6	1983178	1983183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200126
40506	NC_015942	GCC	2	6	1983202	1983207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200126
40507	NC_015942	TCG	2	6	1983212	1983217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200126
40508	NC_015942	GAA	2	6	1983286	1983291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200126
40509	NC_015942	TGG	2	6	1983320	1983325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200126
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40511	NC_015942	GTG	2	6	1983364	1983369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200126
40512	NC_015942	CATC	2	8	1983498	1983505	25 %	25 %	0 %	50 %	344200126
40513	NC_015942	T	6	6	1983561	1983566	0 %	100 %	0 %	0 %	344200126
40514	NC_015942	AAC	2	6	1983616	1983621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200126
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40516	NC_015942	GCC	2	6	1983793	1983798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200126
40517	NC_015942	CT	3	6	1983841	1983846	0 %	50 %	0 %	50 %	344200126
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40522	NC_015942	CTG	2	6	1984006	1984011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200126
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40528	NC_015942	GC	3	6	1984174	1984179	0 %	0 %	50 %	50 %	344200127
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40542	NC_015942	CGA	2	6	1984962	1984967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200128
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40544	NC_015942	CATC	2	8	1984997	1985004	25 %	25 %	0 %	50 %	344200128
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40552	NC_015942	GC	3	6	1985473	1985478	0 %	0 %	50 %	50 %	344200128
40553	NC_015942	CG	3	6	1985517	1985522	0 %	0 %	50 %	50 %	344200128
40554	NC_015942	AT	3	6	1985602	1985607	50 %	50 %	0 %	0 %	344200128
40555	NC_015942	GC	3	6	1985626	1985631	0 %	0 %	50 %	50 %	344200128
40556	NC_015942	GCA	2	6	1985657	1985662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200128
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40559	NC_015942	T	6	6	1985939	1985944	0 %	100 %	0 %	0 %	344200129
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40567	NC_015942	ACAG	2	8	1986218	1986225	50 %	0 %	25 %	25 %	344200129
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40590	NC_015942	CGG	2	6	1987175	1987180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200129
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40601	NC_015942	G	6	6	1987706	1987711	0 %	0 %	100 %	0 %	344200129
40602	NC_015942	GAA	2	6	1987728	1987733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200129
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40607	NC_015942	GCA	2	6	1988035	1988040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200129
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40609	NC_015942	GAT	2	6	1988129	1988134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200129
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40612	NC_015942	ACT	2	6	1988430	1988435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200130
40613	NC_015942	GCGG	2	8	1988473	1988480	0 %	0 %	75 %	25 %	344200130
40614	NC_015942	TCACC	2	10	1988521	1988530	20 %	20 %	0 %	60 %	344200130
40615	NC_015942	CAG	2	6	1988590	1988595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200130
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40617	NC_015942	TGG	2	6	1988671	1988676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200130
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40852	NC_015942	GCT	2	6	1998805	1998810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200138
40853	NC_015942	ATG	2	6	1998823	1998828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200138
40854	NC_015942	ACGCA	2	10	1998838	1998847	40 %	0 %	20 %	40 %	344200139
40855	NC_015942	GAT	2	6	1998903	1998908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200139
40856	NC_015942	CACAC	2	10	1998962	1998971	40 %	0 %	0 %	60 %	344200139
40857	NC_015942	CG	3	6	1998978	1998983	0 %	0 %	50 %	50 %	344200139
40858	NC_015942	GCCAC	2	10	1999236	1999245	20 %	0 %	20 %	60 %	344200140
40859	NC_015942	GCA	2	6	1999258	1999263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200140
40860	NC_015942	GGC	2	6	1999322	1999327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200140
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40862	NC_015942	CACC	2	8	1999442	1999449	25 %	0 %	0 %	75 %	344200140
40863	NC_015942	TTC	2	6	1999752	1999757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200140
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40867	NC_015942	TCTG	2	8	1999893	1999900	0 %	50 %	25 %	25 %	344200140
40868	NC_015942	CGG	2	6	1999906	1999911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200140
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40870	NC_015942	CGC	2	6	1999972	1999977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200140
40871	NC_015942	CAC	2	6	2000071	2000076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200140
40872	NC_015942	CCG	2	6	2000091	2000096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200140
40873	NC_015942	CCG	2	6	2000111	2000116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200140
40874	NC_015942	CTG	2	6	2000120	2000125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200140
40875	NC_015942	ATGGC	2	10	2000228	2000237	20 %	20 %	40 %	20 %	344200140
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40878	NC_015942	GCTG	2	8	2000436	2000443	0 %	25 %	50 %	25 %	344200140
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40880	NC_015942	CAG	2	6	2000522	2000527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200140
40881	NC_015942	AAC	2	6	2000559	2000564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200140
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40883	NC_015942	CGCC	2	8	2000644	2000651	0 %	0 %	25 %	75 %	344200140
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40912	NC_015942	T	6	6	2002118	2002123	0 %	100 %	0 %	0 %	344200141
40913	NC_015942	CAT	2	6	2002192	2002197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200141
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40915	NC_015942	GGA	2	6	2002323	2002328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40916	NC_015942	ATG	2	6	2002332	2002337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200142
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40920	NC_015942	AGTC	2	8	2002592	2002599	25 %	25 %	25 %	25 %	344200142
40921	NC_015942	GCGCG	2	10	2002662	2002671	0 %	0 %	60 %	40 %	344200142
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40929	NC_015942	CGA	2	6	2003033	2003038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200143
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40940	NC_015942	CTG	2	6	2003282	2003287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200143
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40954	NC_015942	ACC	2	6	2003602	2003607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200144
40955	NC_015942	GCG	3	9	2003632	2003640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200144
40956	NC_015942	GCC	2	6	2003647	2003652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200144
40957	NC_015942	CGC	2	6	2003694	2003699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40958	NC_015942	TCA	2	6	2003770	2003775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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