MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_015942	GAG	2	6	1957834	1957839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40002	NC_015942	AAC	2	6	1957856	1957861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40003	NC_015942	GAA	2	6	1957967	1957972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40004	NC_015942	GCG	2	6	1957987	1957992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40005	NC_015942	GAC	2	6	1958063	1958068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40006	NC_015942	CAA	2	6	1958109	1958114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40007	NC_015942	TTG	2	6	1958134	1958139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40008	NC_015942	A	6	6	1958196	1958201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40009	NC_015942	TAAG	2	8	1958214	1958221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40010	NC_015942	GCG	2	6	1958317	1958322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200100
40011	NC_015942	TAA	3	9	1958334	1958342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200100
40012	NC_015942	TGGT	2	8	1958385	1958392	0 %	50 %	50 %	0 %	344200100
40013	NC_015942	CTG	2	6	1958414	1958419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200100
40014	NC_015942	ATAC	2	8	1958538	1958545	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40015	NC_015942	ACA	2	6	1958558	1958563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40016	NC_015942	CAA	2	6	1958571	1958576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40017	NC_015942	CTT	2	6	1958603	1958608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40018	NC_015942	TTA	2	6	1958631	1958636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40019	NC_015942	ATT	2	6	1958638	1958643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40020	NC_015942	GC	3	6	1958720	1958725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40021	NC_015942	TTA	2	6	1958735	1958740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40022	NC_015942	AAAT	2	8	1958765	1958772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40023	NC_015942	ATA	2	6	1958789	1958794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40024	NC_015942	TTTG	2	8	1958829	1958836	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40025	NC_015942	GCG	2	6	1958859	1958864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40026	NC_015942	GGC	2	6	1959031	1959036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200101
40027	NC_015942	CAG	2	6	1959044	1959049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200101
40028	NC_015942	CAG	2	6	1959090	1959095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200101
40029	NC_015942	GAT	2	6	1959145	1959150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200101
40030	NC_015942	CCCG	2	8	1959195	1959202	0 %	0 %	25 %	75 %	344200101
40031	NC_015942	CGG	2	6	1959262	1959267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200101
40032	NC_015942	GAA	2	6	1959287	1959292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200101
40033	NC_015942	CCA	2	6	1959298	1959303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200101
40034	NC_015942	GGCTT	2	10	1959306	1959315	0 %	40 %	40 %	20 %	344200101
40035	NC_015942	GCC	2	6	1959414	1959419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200101
40036	NC_015942	GAA	2	6	1959446	1959451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200101
40037	NC_015942	ACG	2	6	1959455	1959460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200101
40038	NC_015942	TCT	2	6	1959502	1959507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200101
40039	NC_015942	GTG	2	6	1959556	1959561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200101
40040	NC_015942	CGG	2	6	1959597	1959602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200101
40041	NC_015942	GGCC	2	8	1959688	1959695	0 %	0 %	50 %	50 %	344200101
40042	NC_015942	AGG	2	6	1959771	1959776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200101
40043	NC_015942	CGA	2	6	1959886	1959891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200101
40044	NC_015942	GCGG	2	8	1959948	1959955	0 %	0 %	75 %	25 %	344200101
40045	NC_015942	CAC	2	6	1960010	1960015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200101
40046	NC_015942	GCT	2	6	1960027	1960032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200101
40047	NC_015942	TGC	2	6	1960054	1960059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200101
40048	NC_015942	GAA	2	6	1960145	1960150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200101
40049	NC_015942	TCT	2	6	1960170	1960175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200101
40050	NC_015942	GGGT	2	8	1960216	1960223	0 %	25 %	75 %	0 %	344200101
40051	NC_015942	G	7	7	1960232	1960238	0 %	0 %	100 %	0 %	344200101
40052	NC_015942	CCG	2	6	1960240	1960245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200101
40053	NC_015942	TTG	2	6	1960411	1960416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200101
40054	NC_015942	CTG	2	6	1960453	1960458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200102
40055	NC_015942	GCC	3	9	1960469	1960477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200102
40056	NC_015942	GCT	2	6	1960508	1960513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200102
40057	NC_015942	CGT	2	6	1960516	1960521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200102
40058	NC_015942	GA	3	6	1960698	1960703	50 %	0 %	50 %	0 %	344200103
40059	NC_015942	ACA	2	6	1960759	1960764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200103
40060	NC_015942	TGA	2	6	1960789	1960794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200103
40061	NC_015942	A	6	6	1960922	1960927	100 %	0 %	0 %	0 %	344200103
40062	NC_015942	TCG	2	6	1961003	1961008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200104
40063	NC_015942	CG	3	6	1961007	1961012	0 %	0 %	50 %	50 %	344200104
40064	NC_015942	GGT	2	6	1961018	1961023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200104
40065	NC_015942	GC	3	6	1961037	1961042	0 %	0 %	50 %	50 %	344200104
40066	NC_015942	GTGGG	2	10	1961063	1961072	0 %	20 %	80 %	0 %	344200104
40067	NC_015942	GCC	3	9	1961105	1961113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200104
40068	NC_015942	GCA	2	6	1961136	1961141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200104
40069	NC_015942	CTGC	2	8	1961217	1961224	0 %	25 %	25 %	50 %	344200104
40070	NC_015942	CGC	2	6	1961360	1961365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40071	NC_015942	ATC	2	6	1961420	1961425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200105
40072	NC_015942	GAC	2	6	1961492	1961497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200105
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40074	NC_015942	A	6	6	1961634	1961639	100 %	0 %	0 %	0 %	344200105
40075	NC_015942	TAGG	2	8	1961718	1961725	25 %	25 %	50 %	0 %	344200105
40076	NC_015942	AGA	2	6	1961801	1961806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200105
40077	NC_015942	ATTT	2	8	1961852	1961859	25 %	75 %	0 %	0 %	344200105
40078	NC_015942	TAT	2	6	1961887	1961892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200105
40079	NC_015942	TG	3	6	1961898	1961903	0 %	50 %	50 %	0 %	344200105
40080	NC_015942	TA	3	6	1962109	1962114	50 %	50 %	0 %	0 %	344200105
40081	NC_015942	TACTT	2	10	1962171	1962180	20 %	60 %	0 %	20 %	344200105
40082	NC_015942	CT	3	6	1962249	1962254	0 %	50 %	0 %	50 %	344200105
40083	NC_015942	TA	3	6	1962278	1962283	50 %	50 %	0 %	0 %	344200105
40084	NC_015942	A	6	6	1962285	1962290	100 %	0 %	0 %	0 %	344200105
40085	NC_015942	TAA	2	6	1962349	1962354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200105
40086	NC_015942	GTA	2	6	1962362	1962367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200105
40087	NC_015942	GTT	2	6	1962377	1962382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200105
40088	NC_015942	CTT	2	6	1962388	1962393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200105
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40091	NC_015942	GCCA	2	8	1962529	1962536	25 %	0 %	25 %	50 %	344200106
40092	NC_015942	TCC	2	6	1962578	1962583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200106
40093	NC_015942	CCTC	2	8	1962607	1962614	0 %	25 %	0 %	75 %	344200106
40094	NC_015942	CCG	2	6	1962633	1962638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200106
40095	NC_015942	GGCA	2	8	1962728	1962735	25 %	0 %	50 %	25 %	344200106
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40101	NC_015942	CTC	2	6	1963310	1963315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200107
40102	NC_015942	TTCTGC	2	12	1963541	1963552	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	344200107
40103	NC_015942	CCG	2	6	1963599	1963604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200107
40104	NC_015942	ACC	2	6	1963637	1963642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200107
40105	NC_015942	T	6	6	1963724	1963729	0 %	100 %	0 %	0 %	344200107
40106	NC_015942	CCA	2	6	1963824	1963829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200107
40107	NC_015942	AAC	2	6	1963851	1963856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200107
40108	NC_015942	GCA	2	6	1963966	1963971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200107
40109	NC_015942	CG	3	6	1963976	1963981	0 %	0 %	50 %	50 %	344200107
40110	NC_015942	GGC	2	6	1964009	1964014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200107
40111	NC_015942	TCC	2	6	1964097	1964102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200107
40112	NC_015942	CAG	2	6	1964107	1964112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200107
40113	NC_015942	CTG	2	6	1964174	1964179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200107
40114	NC_015942	T	7	7	1964310	1964316	0 %	100 %	0 %	0 %	344200107
40115	NC_015942	CATG	2	8	1964317	1964324	25 %	25 %	25 %	25 %	344200107
40116	NC_015942	T	7	7	1964366	1964372	0 %	100 %	0 %	0 %	344200107
40117	NC_015942	GTA	2	6	1964412	1964417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200108
40118	NC_015942	GTG	2	6	1964424	1964429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200108
40119	NC_015942	T	6	6	1964449	1964454	0 %	100 %	0 %	0 %	344200108
40120	NC_015942	CGC	2	6	1964470	1964475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200108
40121	NC_015942	TC	3	6	1964488	1964493	0 %	50 %	0 %	50 %	344200108
40122	NC_015942	TTTG	2	8	1964609	1964616	0 %	75 %	25 %	0 %	344200108
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40124	NC_015942	CAT	2	6	1964770	1964775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200108
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40149	NC_015942	GACA	2	8	1965584	1965591	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40150	NC_015942	TGC	2	6	1965596	1965601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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40209	NC_015942	ATCC	2	8	1968592	1968599	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40210	NC_015942	TTTC	2	8	1968600	1968607	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40211	NC_015942	TTTCTG	2	12	1968610	1968621	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40212	NC_015942	ACC	2	6	1968779	1968784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40213	NC_015942	CG	3	6	1968797	1968802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40214	NC_015942	AGGG	2	8	1968817	1968824	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40215	NC_015942	CGC	2	6	1968876	1968881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200112
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40219	NC_015942	GGTCAT	2	12	1969020	1969031	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344200112
40220	NC_015942	TA	3	6	1969048	1969053	50 %	50 %	0 %	0 %	344200112
40221	NC_015942	CCA	2	6	1969095	1969100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200112
40222	NC_015942	T	7	7	1969193	1969199	0 %	100 %	0 %	0 %	344200112
40223	NC_015942	TCAG	2	8	1969232	1969239	25 %	25 %	25 %	25 %	344200112
40224	NC_015942	T	7	7	1969256	1969262	0 %	100 %	0 %	0 %	344200112
40225	NC_015942	GAGG	2	8	1969310	1969317	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40226	NC_015942	TC	4	8	1969326	1969333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40227	NC_015942	CTCCGT	2	12	1969380	1969391	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40228	NC_015942	AGC	2	6	1969431	1969436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40229	NC_015942	A	6	6	1969441	1969446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40230	NC_015942	A	10	10	1969459	1969468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40231	NC_015942	ACGC	2	8	1969481	1969488	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40232	NC_015942	TCACA	2	10	1969492	1969501	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
40233	NC_015942	TAC	2	6	1969510	1969515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40234	NC_015942	TCGT	2	8	1969649	1969656	0 %	50 %	25 %	25 %	344200113
40235	NC_015942	T	6	6	1969666	1969671	0 %	100 %	0 %	0 %	344200113
40236	NC_015942	TGG	2	6	1969706	1969711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200113
40237	NC_015942	TGT	2	6	1969725	1969730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200113
40238	NC_015942	CAC	2	6	1969777	1969782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200113
40239	NC_015942	ACC	2	6	1969829	1969834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200113
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40332	NC_015942	A	6	6	1975139	1975144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40333	NC_015942	TGT	2	6	1975223	1975228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200118
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40475	NC_015942	GCC	2	6	1981679	1981684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200124
40476	NC_015942	AAC	2	6	1981695	1981700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200124
40477	NC_015942	GCC	3	9	1981739	1981747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200124
40478	NC_015942	CGGTG	2	10	1981759	1981768	0 %	20 %	60 %	20 %	344200124
40479	NC_015942	CGCC	2	8	1981782	1981789	0 %	0 %	25 %	75 %	344200124
40480	NC_015942	TTCG	2	8	1981832	1981839	0 %	50 %	25 %	25 %	344200124
40481	NC_015942	T	6	6	1981990	1981995	0 %	100 %	0 %	0 %	344200124
40482	NC_015942	AACA	2	8	1982022	1982029	75 %	0 %	0 %	25 %	344200124
40483	NC_015942	TCA	2	6	1982031	1982036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40484	NC_015942	CCA	2	6	1982063	1982068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200125
40485	NC_015942	CGC	2	6	1982076	1982081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200125
40486	NC_015942	GCG	2	6	1982095	1982100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200125
40487	NC_015942	AAG	2	6	1982227	1982232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200125
40488	NC_015942	TGC	2	6	1982237	1982242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200125
40489	NC_015942	CGG	2	6	1982349	1982354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200125
40490	NC_015942	GCGCG	2	10	1982380	1982389	0 %	0 %	60 %	40 %	344200125
40491	NC_015942	TCGT	2	8	1982425	1982432	0 %	50 %	25 %	25 %	344200125
40492	NC_015942	TGG	2	6	1982465	1982470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200125
40493	NC_015942	TC	3	6	1982520	1982525	0 %	50 %	0 %	50 %	344200125
40494	NC_015942	CGG	2	6	1982526	1982531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200125
40495	NC_015942	CAT	2	6	1982577	1982582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200125
40496	NC_015942	GTG	2	6	1982617	1982622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200125
40497	NC_015942	TTG	2	6	1982633	1982638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200125
40498	NC_015942	AGG	2	6	1982639	1982644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200125
40499	NC_015942	ACGG	2	8	1982720	1982727	25 %	0 %	50 %	25 %	344200125
40500	NC_015942	CCG	2	6	1982732	1982737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200125

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