MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39502	NC_015942	CGT	2	6	1934404	1934409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200072
39503	NC_015942	TCCA	2	8	1934543	1934550	25 %	25 %	0 %	50 %	344200072
39504	NC_015942	CAG	2	6	1934594	1934599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200072
39505	NC_015942	TCG	2	6	1934619	1934624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200072
39506	NC_015942	AT	3	6	1934671	1934676	50 %	50 %	0 %	0 %	344200072
39507	NC_015942	TCG	2	6	1934778	1934783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200072
39508	NC_015942	T	6	6	1934789	1934794	0 %	100 %	0 %	0 %	344200072
39509	NC_015942	CGG	2	6	1934802	1934807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200072
39510	NC_015942	CCA	2	6	1934895	1934900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200072
39511	NC_015942	TTG	2	6	1934907	1934912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200072
39512	NC_015942	TTA	2	6	1935004	1935009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200072
39513	NC_015942	TCT	2	6	1935065	1935070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200072
39514	NC_015942	ATT	2	6	1935080	1935085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200072
39515	NC_015942	CGT	2	6	1935119	1935124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200072
39516	NC_015942	CTG	2	6	1935265	1935270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200072
39517	NC_015942	AGA	2	6	1935302	1935307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200072
39518	NC_015942	AAC	2	6	1935308	1935313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200072
39519	NC_015942	AGA	2	6	1935352	1935357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200072
39520	NC_015942	TCA	2	6	1935447	1935452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200072
39521	NC_015942	ATC	2	6	1935516	1935521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200072
39522	NC_015942	CAA	2	6	1935541	1935546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200072
39523	NC_015942	GTC	2	6	1935559	1935564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200072
39524	NC_015942	TCT	2	6	1935606	1935611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200072
39525	NC_015942	ATC	2	6	1935656	1935661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200072
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39527	NC_015942	CAT	2	6	1935682	1935687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200072
39528	NC_015942	CAT	2	6	1935725	1935730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200072
39529	NC_015942	TGC	2	6	1935772	1935777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200072
39530	NC_015942	CTT	2	6	1935790	1935795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200072
39531	NC_015942	ATC	2	6	1935897	1935902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200072
39532	NC_015942	GAT	2	6	1935962	1935967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200072
39533	NC_015942	GTG	2	6	1935978	1935983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200072
39534	NC_015942	CCA	2	6	1936102	1936107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200072
39535	NC_015942	TTC	2	6	1936199	1936204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200072
39536	NC_015942	A	8	8	1936319	1936326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39537	NC_015942	CTC	2	6	1936327	1936332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200073
39538	NC_015942	A	6	6	1936394	1936399	100 %	0 %	0 %	0 %	344200073
39539	NC_015942	GAT	2	6	1936422	1936427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200073
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39541	NC_015942	ATT	2	6	1936520	1936525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200073
39542	NC_015942	G	6	6	1936569	1936574	0 %	0 %	100 %	0 %	344200073
39543	NC_015942	CTT	2	6	1936664	1936669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200073
39544	NC_015942	CCA	2	6	1936670	1936675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200073
39545	NC_015942	ATT	2	6	1936683	1936688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200073
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39549	NC_015942	CTT	2	6	1936777	1936782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200073
39550	NC_015942	GGCA	2	8	1936819	1936826	25 %	0 %	50 %	25 %	344200073
39551	NC_015942	CAGG	2	8	1936831	1936838	25 %	0 %	50 %	25 %	344200073
39552	NC_015942	ATG	2	6	1936851	1936856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200073
39553	NC_015942	AGG	2	6	1936868	1936873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200073
39554	NC_015942	GTAA	2	8	1936889	1936896	50 %	25 %	25 %	0 %	344200073
39555	NC_015942	CTGC	2	8	1936908	1936915	0 %	25 %	25 %	50 %	344200073
39556	NC_015942	ATC	2	6	1936929	1936934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200073
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39558	NC_015942	ATT	2	6	1936953	1936958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200073
39559	NC_015942	C	7	7	1936988	1936994	0 %	0 %	0 %	100 %	344200073
39560	NC_015942	CAC	2	6	1936999	1937004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200073
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39562	NC_015942	TCA	2	6	1937049	1937054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200073
39563	NC_015942	TAA	2	6	1937084	1937089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200073
39564	NC_015942	T	7	7	1937109	1937115	0 %	100 %	0 %	0 %	344200073
39565	NC_015942	T	6	6	1937156	1937161	0 %	100 %	0 %	0 %	344200073
39566	NC_015942	AGC	2	6	1937180	1937185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200073
39567	NC_015942	TGT	2	6	1937209	1937214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200073
39568	NC_015942	TTATC	2	10	1937227	1937236	20 %	60 %	0 %	20 %	344200073
39569	NC_015942	CTATTG	2	12	1937278	1937289	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	344200073
39570	NC_015942	CAG	3	9	1937365	1937373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200073
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39572	NC_015942	TC	5	10	1937432	1937441	0 %	50 %	0 %	50 %	344200073
39573	NC_015942	CCTT	2	8	1937456	1937463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39574	NC_015942	T	6	6	1937470	1937475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39575	NC_015942	AT	3	6	1937510	1937515	50 %	50 %	0 %	0 %	344200074
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39578	NC_015942	GCC	2	6	1937607	1937612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200074
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39580	NC_015942	TCAAAA	2	12	1937680	1937691	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	344200074
39581	NC_015942	CAGA	2	8	1937704	1937711	50 %	0 %	25 %	25 %	344200074
39582	NC_015942	CTA	2	6	1937741	1937746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200074
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39584	NC_015942	ATC	2	6	1937820	1937825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200074
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39588	NC_015942	GAA	2	6	1938026	1938031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200074
39589	NC_015942	TGC	2	6	1938071	1938076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200074
39590	NC_015942	ATT	2	6	1938096	1938101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200074
39591	NC_015942	CAT	2	6	1938161	1938166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200074
39592	NC_015942	CA	3	6	1938251	1938256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39593	NC_015942	AACC	2	8	1938301	1938308	50 %	0 %	0 %	50 %	344200075
39594	NC_015942	TAA	2	6	1938334	1938339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200075
39595	NC_015942	TGA	3	9	1938362	1938370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200075
39596	NC_015942	GTC	2	6	1938458	1938463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200075
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39598	NC_015942	TAT	2	6	1938550	1938555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200075
39599	NC_015942	CAA	2	6	1938583	1938588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200075
39600	NC_015942	AGC	2	6	1938662	1938667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200075
39601	NC_015942	GAT	2	6	1938668	1938673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200075
39602	NC_015942	GAA	2	6	1938679	1938684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200075
39603	NC_015942	ACCCAA	2	12	1938693	1938704	50 %	0 %	0 %	50 %	344200075
39604	NC_015942	AAG	2	6	1938713	1938718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200075
39605	NC_015942	ATTT	2	8	1938729	1938736	25 %	75 %	0 %	0 %	344200075
39606	NC_015942	CAC	2	6	1938773	1938778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200076
39607	NC_015942	CT	3	6	1938786	1938791	0 %	50 %	0 %	50 %	344200076
39608	NC_015942	GCT	2	6	1938802	1938807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200076
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39612	NC_015942	CTT	2	6	1938842	1938847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200076
39613	NC_015942	CAT	2	6	1938889	1938894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200076
39614	NC_015942	CGC	2	6	1938953	1938958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200076
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39853	NC_015942	ACGTGG	2	12	1949487	1949498	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344200088
39854	NC_015942	ATGGT	2	10	1949588	1949597	20 %	40 %	40 %	0 %	344200088
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39857	NC_015942	GGT	2	6	1949873	1949878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200089
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39872	NC_015942	TTC	2	6	1950336	1950341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200090
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39965	NC_015942	CT	3	6	1955538	1955543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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39967	NC_015942	TTG	2	6	1955726	1955731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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