MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39002	NC_015942	T	6	6	1908580	1908585	0 %	100 %	0 %	0 %	344200043
39003	NC_015942	AT	3	6	1908591	1908596	50 %	50 %	0 %	0 %	344200043
39004	NC_015942	CGT	2	6	1908647	1908652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200043
39005	NC_015942	T	7	7	1908715	1908721	0 %	100 %	0 %	0 %	344200043
39006	NC_015942	TAT	2	6	1908735	1908740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200043
39007	NC_015942	GAA	2	6	1908928	1908933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200043
39008	NC_015942	TGC	2	6	1908969	1908974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200043
39009	NC_015942	ATATCA	2	12	1909042	1909053	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	344200043
39010	NC_015942	TTCA	2	8	1909071	1909078	25 %	50 %	0 %	25 %	344200043
39011	NC_015942	CAT	2	6	1909115	1909120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39012	NC_015942	CAA	2	6	1909188	1909193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39013	NC_015942	TCT	2	6	1909293	1909298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39014	NC_015942	TA	5	10	1909299	1909308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39015	NC_015942	TTAT	3	12	1909327	1909338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39016	NC_015942	TAA	2	6	1909352	1909357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39017	NC_015942	TTTA	2	8	1909432	1909439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39018	NC_015942	TGT	2	6	1909445	1909450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39019	NC_015942	T	6	6	1909475	1909480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39020	NC_015942	G	6	6	1909570	1909575	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39021	NC_015942	T	6	6	1909580	1909585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39022	NC_015942	AT	3	6	1909629	1909634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39023	NC_015942	GTC	2	6	1909658	1909663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39024	NC_015942	A	6	6	1909785	1909790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39025	NC_015942	GAA	2	6	1909802	1909807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39026	NC_015942	TC	3	6	1909830	1909835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39027	NC_015942	CCG	3	9	1909851	1909859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200044
39028	NC_015942	AC	4	8	1909905	1909912	50 %	0 %	0 %	50 %	344200044
39029	NC_015942	AGC	2	6	1909971	1909976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200044
39030	NC_015942	TCCT	2	8	1910073	1910080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39031	NC_015942	ATAA	2	8	1910093	1910100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39032	NC_015942	TA	3	6	1910154	1910159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39033	NC_015942	CGG	2	6	1910193	1910198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39034	NC_015942	ACC	2	6	1910211	1910216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39035	NC_015942	TGA	2	6	1910237	1910242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200045
39036	NC_015942	CAA	2	6	1910247	1910252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200045
39037	NC_015942	GGA	2	6	1910301	1910306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200045
39038	NC_015942	ACA	2	6	1910330	1910335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200045
39039	NC_015942	GAC	2	6	1910353	1910358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200045
39040	NC_015942	GGC	2	6	1910390	1910395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200045
39041	NC_015942	GGA	2	6	1910466	1910471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200045
39042	NC_015942	TAC	2	6	1910482	1910487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200045
39043	NC_015942	GGA	2	6	1910492	1910497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200045
39044	NC_015942	GCA	2	6	1910528	1910533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200045
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39046	NC_015942	GGC	2	6	1910690	1910695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39047	NC_015942	ATT	2	6	1910700	1910705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39048	NC_015942	AC	3	6	1910745	1910750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39049	NC_015942	TC	3	6	1910837	1910842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39050	NC_015942	AAC	2	6	1910853	1910858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39051	NC_015942	AAC	2	6	1910906	1910911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39052	NC_015942	GAA	2	6	1910945	1910950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39053	NC_015942	AG	3	6	1910964	1910969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39054	NC_015942	TGGT	2	8	1910980	1910987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39055	NC_015942	GAT	2	6	1911120	1911125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39056	NC_015942	TGA	2	6	1911140	1911145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39057	NC_015942	CCCA	2	8	1911208	1911215	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
39058	NC_015942	GAT	2	6	1911288	1911293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200046
39059	NC_015942	TGA	2	6	1911308	1911313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200046
39060	NC_015942	CGT	2	6	1911414	1911419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200046
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39062	NC_015942	TCGG	2	8	1911517	1911524	0 %	25 %	50 %	25 %	344200046
39063	NC_015942	CTG	2	6	1911566	1911571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200046
39064	NC_015942	TTGGG	2	10	1911572	1911581	0 %	40 %	60 %	0 %	344200046
39065	NC_015942	ATCAA	2	10	1911625	1911634	60 %	20 %	0 %	20 %	344200046
39066	NC_015942	CT	3	6	1911635	1911640	0 %	50 %	0 %	50 %	344200047
39067	NC_015942	CGG	2	6	1911643	1911648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200047
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39070	NC_015942	GCAG	2	8	1911840	1911847	25 %	0 %	50 %	25 %	344200047
39071	NC_015942	CTTG	2	8	1911868	1911875	0 %	50 %	25 %	25 %	344200047
39072	NC_015942	CTC	2	6	1911905	1911910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39073	NC_015942	GAT	2	6	1911993	1911998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39074	NC_015942	AATC	2	8	1912030	1912037	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39075	NC_015942	CTG	2	6	1912043	1912048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39076	NC_015942	G	6	6	1912048	1912053	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39077	NC_015942	GCCC	2	8	1912132	1912139	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39078	NC_015942	TC	3	6	1912233	1912238	0 %	50 %	0 %	50 %	344200048
39079	NC_015942	A	6	6	1912276	1912281	100 %	0 %	0 %	0 %	344200048
39080	NC_015942	CTT	2	6	1912291	1912296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200048
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39084	NC_015942	AAT	2	6	1912486	1912491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200048
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39088	NC_015942	TTG	2	6	1912758	1912763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39089	NC_015942	CCG	2	6	1913011	1913016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200049
39090	NC_015942	GAC	2	6	1913139	1913144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200049
39091	NC_015942	CAG	2	6	1913204	1913209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39092	NC_015942	TCA	2	6	1913308	1913313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200050
39093	NC_015942	GCAA	2	8	1913356	1913363	50 %	0 %	25 %	25 %	344200050
39094	NC_015942	CAG	2	6	1913523	1913528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200050
39095	NC_015942	GCC	2	6	1913532	1913537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200050
39096	NC_015942	TA	3	6	1913582	1913587	50 %	50 %	0 %	0 %	344200051
39097	NC_015942	TG	3	6	1913605	1913610	0 %	50 %	50 %	0 %	344200051
39098	NC_015942	AC	3	6	1913619	1913624	50 %	0 %	0 %	50 %	344200051
39099	NC_015942	AC	3	6	1913626	1913631	50 %	0 %	0 %	50 %	344200051
39100	NC_015942	ACG	2	6	1913637	1913642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200051
39101	NC_015942	GCTG	2	8	1913658	1913665	0 %	25 %	50 %	25 %	344200051
39102	NC_015942	AT	3	6	1913749	1913754	50 %	50 %	0 %	0 %	344200051
39103	NC_015942	TA	3	6	1913788	1913793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39104	NC_015942	TTTTC	3	15	1913824	1913838	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39105	NC_015942	ACA	2	6	1913882	1913887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200052
39106	NC_015942	AGC	2	6	1913983	1913988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200052
39107	NC_015942	CAT	2	6	1914143	1914148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200052
39108	NC_015942	CTA	2	6	1914185	1914190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200052
39109	NC_015942	GAAC	2	8	1914222	1914229	50 %	0 %	25 %	25 %	344200052
39110	NC_015942	CAT	2	6	1914239	1914244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200052
39111	NC_015942	AGG	2	6	1914295	1914300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200052
39112	NC_015942	CA	3	6	1914368	1914373	50 %	0 %	0 %	50 %	344200053
39113	NC_015942	TCC	3	9	1914424	1914432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200053
39114	NC_015942	GAA	2	6	1914444	1914449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200053
39115	NC_015942	CGC	2	6	1914462	1914467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200053
39116	NC_015942	TGG	2	6	1914490	1914495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200053
39117	NC_015942	A	6	6	1914558	1914563	100 %	0 %	0 %	0 %	344200053
39118	NC_015942	GCA	2	6	1914565	1914570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200053
39119	NC_015942	T	6	6	1914576	1914581	0 %	100 %	0 %	0 %	344200053
39120	NC_015942	CCAA	2	8	1914592	1914599	50 %	0 %	0 %	50 %	344200053
39121	NC_015942	ACCCG	2	10	1914692	1914701	20 %	0 %	20 %	60 %	344200053
39122	NC_015942	TCC	2	6	1914763	1914768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200053
39123	NC_015942	CAA	2	6	1914779	1914784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200053
39124	NC_015942	TCT	2	6	1914824	1914829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200053
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39128	NC_015942	GGTT	2	8	1915023	1915030	0 %	50 %	50 %	0 %	344200053
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39133	NC_015942	TA	3	6	1915400	1915405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39134	NC_015942	GTTTT	3	15	1915420	1915434	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39135	NC_015942	AG	3	6	1915467	1915472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39136	NC_015942	GAAAAA	2	12	1915482	1915493	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39137	NC_015942	GTT	2	6	1915519	1915524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39138	NC_015942	TCTGC	2	10	1915577	1915586	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39139	NC_015942	GC	3	6	1915660	1915665	0 %	0 %	50 %	50 %	344200054
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39143	NC_015942	CGC	2	6	1915862	1915867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200054
39144	NC_015942	GC	3	6	1915947	1915952	0 %	0 %	50 %	50 %	344200054
39145	NC_015942	GAAG	2	8	1915954	1915961	50 %	0 %	50 %	0 %	344200054
39146	NC_015942	CCGGCG	2	12	1915989	1916000	0 %	0 %	50 %	50 %	344200054
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39148	NC_015942	CCG	2	6	1916034	1916039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200054
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39152	NC_015942	GGC	2	6	1916161	1916166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200054
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39159	NC_015942	GCC	2	6	1916491	1916496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200054
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39161	NC_015942	GCA	2	6	1916680	1916685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200054
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39188	NC_015942	GCAACC	2	12	1917771	1917782	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39189	NC_015942	CACAA	2	10	1917787	1917796	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
39190	NC_015942	CGA	2	6	1917903	1917908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200056
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39192	NC_015942	GTCGG	2	10	1918019	1918028	0 %	20 %	60 %	20 %	344200056
39193	NC_015942	CTG	2	6	1918030	1918035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200056
39194	NC_015942	G	6	6	1918035	1918040	0 %	0 %	100 %	0 %	344200056
39195	NC_015942	GCC	2	6	1918109	1918114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200056
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39198	NC_015942	CGG	2	6	1918193	1918198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39199	NC_015942	GCA	2	6	1918275	1918280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200057
39200	NC_015942	CAA	2	6	1918298	1918303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200057
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39203	NC_015942	CAG	2	6	1918485	1918490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200057
39204	NC_015942	CAG	2	6	1918494	1918499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200057
39205	NC_015942	TAC	2	6	1918503	1918508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200057
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39211	NC_015942	ACTG	2	8	1918702	1918709	25 %	25 %	25 %	25 %	344200058
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39214	NC_015942	GCT	2	6	1918834	1918839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200059
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39217	NC_015942	GAC	2	6	1918933	1918938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200059
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39219	NC_015942	GCT	2	6	1919055	1919060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200059
39220	NC_015942	AGG	2	6	1919096	1919101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200059
39221	NC_015942	AGG	2	6	1919295	1919300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39222	NC_015942	ATC	2	6	1919316	1919321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200060
39223	NC_015942	ATC	2	6	1919328	1919333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200060
39224	NC_015942	CAA	2	6	1919372	1919377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200060
39225	NC_015942	GGC	2	6	1919402	1919407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200060
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39227	NC_015942	AGAT	2	8	1919446	1919453	50 %	25 %	25 %	0 %	344200060
39228	NC_015942	CTG	2	6	1919485	1919490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200060
39229	NC_015942	GCC	2	6	1919511	1919516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200060
39230	NC_015942	CGA	2	6	1919617	1919622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200060
39231	NC_015942	CGC	2	6	1919628	1919633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200060
39232	NC_015942	AAC	2	6	1919709	1919714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200060
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39234	NC_015942	A	6	6	1919775	1919780	100 %	0 %	0 %	0 %	344200060
39235	NC_015942	GT	3	6	1919866	1919871	0 %	50 %	50 %	0 %	344200060
39236	NC_015942	GAT	2	6	1919942	1919947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200060
39237	NC_015942	TGC	2	6	1920014	1920019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200060
39238	NC_015942	TACT	2	8	1920077	1920084	25 %	50 %	0 %	25 %	344200060
39239	NC_015942	ATC	2	6	1920087	1920092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200060
39240	NC_015942	AGC	2	6	1920190	1920195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200060
39241	NC_015942	CGC	2	6	1920269	1920274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200060
39242	NC_015942	TCC	2	6	1920405	1920410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200060
39243	NC_015942	AAGC	2	8	1920432	1920439	50 %	0 %	25 %	25 %	344200060
39244	NC_015942	TGG	2	6	1920467	1920472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200060
39245	NC_015942	AT	3	6	1920627	1920632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39246	NC_015942	TTTC	2	8	1920636	1920643	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39247	NC_015942	T	6	6	1920644	1920649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39248	NC_015942	CTA	2	6	1920697	1920702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200061
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39250	NC_015942	A	8	8	1920733	1920740	100 %	0 %	0 %	0 %	344200061
39251	NC_015942	A	6	6	1920742	1920747	100 %	0 %	0 %	0 %	344200061
39252	NC_015942	CG	3	6	1920765	1920770	0 %	0 %	50 %	50 %	344200061
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39255	NC_015942	CGA	2	6	1920848	1920853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200061
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39317	NC_015942	GGA	2	6	1924476	1924481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200063
39318	NC_015942	CTG	2	6	1924490	1924495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200063
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39323	NC_015942	CAG	2	6	1924681	1924686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200063
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39337	NC_015942	AGT	2	6	1925478	1925483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200063
39338	NC_015942	CGT	2	6	1925539	1925544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200063
39339	NC_015942	GTCG	2	8	1925583	1925590	0 %	25 %	50 %	25 %	344200063
39340	NC_015942	TGAT	2	8	1925621	1925628	25 %	50 %	25 %	0 %	344200063
39341	NC_015942	GGGCA	2	10	1925629	1925638	20 %	0 %	60 %	20 %	344200063
39342	NC_015942	CAG	2	6	1925722	1925727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200063
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39344	NC_015942	CAAA	2	8	1925810	1925817	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39345	NC_015942	A	9	9	1925815	1925823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39346	NC_015942	ACT	2	6	1925868	1925873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39347	NC_015942	AAT	2	6	1925900	1925905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200064
39348	NC_015942	GCA	2	6	1925922	1925927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200064
39349	NC_015942	A	6	6	1926030	1926035	100 %	0 %	0 %	0 %	344200064
39350	NC_015942	GCA	2	6	1926089	1926094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200064
39351	NC_015942	TCTG	2	8	1926132	1926139	0 %	50 %	25 %	25 %	344200064
39352	NC_015942	ATC	2	6	1926145	1926150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200064
39353	NC_015942	AAT	2	6	1926354	1926359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200064
39354	NC_015942	GAT	2	6	1926469	1926474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200064
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39356	NC_015942	CGG	2	6	1926553	1926558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200065
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39474	NC_015942	CCAT	2	8	1932427	1932434	25 %	25 %	0 %	50 %	344200071
39475	NC_015942	GAC	2	6	1932443	1932448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200071
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39478	NC_015942	TCA	2	6	1932793	1932798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200071
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