MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38501	NC_015942	GAAAA	3	15	1884691	1884705	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38502	NC_015942	A	7	7	1884702	1884708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38503	NC_015942	A	7	7	1884710	1884716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38504	NC_015942	GAAAA	2	10	1884717	1884726	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38505	NC_015942	ATC	2	6	1884733	1884738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38506	NC_015942	CAT	2	6	1884764	1884769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38507	NC_015942	GAT	2	6	1884775	1884780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38508	NC_015942	T	9	9	1884869	1884877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38509	NC_015942	TGCC	2	8	1884897	1884904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38510	NC_015942	CAC	2	6	1884951	1884956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38511	NC_015942	CCA	3	9	1885004	1885012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200023
38512	NC_015942	AAC	2	6	1885013	1885018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200023
38513	NC_015942	CTG	2	6	1885049	1885054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200023
38514	NC_015942	TGAC	2	8	1885064	1885071	25 %	25 %	25 %	25 %	344200023
38515	NC_015942	GGAT	2	8	1885162	1885169	25 %	25 %	50 %	0 %	344200023
38516	NC_015942	CCA	2	6	1885185	1885190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200023
38517	NC_015942	GAAA	2	8	1885209	1885216	75 %	0 %	25 %	0 %	344200023
38518	NC_015942	CCA	2	6	1885328	1885333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200023
38519	NC_015942	ATG	2	6	1885428	1885433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200023
38520	NC_015942	CAC	2	6	1885458	1885463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200023
38521	NC_015942	GCC	2	6	1885522	1885527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200023
38522	NC_015942	GTA	2	6	1885570	1885575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200023
38523	NC_015942	TGA	2	6	1885611	1885616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200023
38524	NC_015942	CAT	2	6	1885734	1885739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200023
38525	NC_015942	CTG	2	6	1885751	1885756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200023
38526	NC_015942	CCG	2	6	1885796	1885801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200023
38527	NC_015942	CTT	2	6	1885887	1885892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200023
38528	NC_015942	TAC	2	6	1885903	1885908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200023
38529	NC_015942	GAT	2	6	1885927	1885932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200023
38530	NC_015942	GGC	2	6	1885940	1885945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200023
38531	NC_015942	TCG	2	6	1886004	1886009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200023
38532	NC_015942	TTG	2	6	1886077	1886082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200023
38533	NC_015942	TA	5	10	1886151	1886160	50 %	50 %	0 %	0 %	344200023
38534	NC_015942	CCG	2	6	1886321	1886326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200023
38535	NC_015942	GCC	2	6	1886350	1886355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200023
38536	NC_015942	CCCA	2	8	1886497	1886504	25 %	0 %	0 %	75 %	344200023
38537	NC_015942	CTG	2	6	1886517	1886522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200023
38538	NC_015942	CCGG	2	8	1886612	1886619	0 %	0 %	50 %	50 %	344200023
38539	NC_015942	A	6	6	1886698	1886703	100 %	0 %	0 %	0 %	344200023
38540	NC_015942	ACC	2	6	1886710	1886715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200023
38541	NC_015942	AAACA	2	10	1886716	1886725	80 %	0 %	0 %	20 %	344200023
38542	NC_015942	CAA	2	6	1886856	1886861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200023
38543	NC_015942	CGG	2	6	1887075	1887080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200023
38544	NC_015942	TGCTG	2	10	1887085	1887094	0 %	40 %	40 %	20 %	344200023
38545	NC_015942	CCA	2	6	1887132	1887137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200023
38546	NC_015942	TGA	2	6	1887154	1887159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200023
38547	NC_015942	TTA	2	6	1887176	1887181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200023
38548	NC_015942	GAA	2	6	1887224	1887229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200023
38549	NC_015942	TGT	2	6	1887261	1887266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200023
38550	NC_015942	ATATA	2	10	1887384	1887393	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38551	NC_015942	GATC	2	8	1887488	1887495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38552	NC_015942	AT	4	8	1887537	1887544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38553	NC_015942	CGCA	2	8	1887618	1887625	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38554	NC_015942	GCTG	2	8	1887696	1887703	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38555	NC_015942	G	9	9	1887747	1887755	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38556	NC_015942	CAA	2	6	1887762	1887767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38557	NC_015942	CGC	3	9	1887793	1887801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200024
38558	NC_015942	AC	3	6	1887862	1887867	50 %	0 %	0 %	50 %	344200024
38559	NC_015942	GCAT	2	8	1888012	1888019	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38560	NC_015942	TA	3	6	1888029	1888034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38561	NC_015942	CAC	2	6	1888036	1888041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38562	NC_015942	CTG	3	9	1888079	1888087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200025
38563	NC_015942	TTC	2	6	1888092	1888097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200025
38564	NC_015942	CTG	2	6	1888124	1888129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200025
38565	NC_015942	GCC	2	6	1888203	1888208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200025
38566	NC_015942	CTG	2	6	1888220	1888225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200025
38567	NC_015942	GCC	2	6	1888233	1888238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200025
38568	NC_015942	CGC	2	6	1888247	1888252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200025
38569	NC_015942	GCC	2	6	1888284	1888289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200025
38570	NC_015942	CTG	2	6	1888337	1888342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200025
38571	NC_015942	CCTGCG	2	12	1888366	1888377	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344200025
38572	NC_015942	CTT	2	6	1888388	1888393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200025
38573	NC_015942	CTG	2	6	1888406	1888411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200025
38574	NC_015942	GTT	2	6	1888418	1888423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200025
38575	NC_015942	CTG	2	6	1888460	1888465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200025
38576	NC_015942	CCA	2	6	1888552	1888557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200025
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38578	NC_015942	CGCC	2	8	1888624	1888631	0 %	0 %	25 %	75 %	344200025
38579	NC_015942	GTT	2	6	1888655	1888660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200025
38580	NC_015942	CAC	2	6	1888673	1888678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200025
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38584	NC_015942	CAT	2	6	1888792	1888797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200025
38585	NC_015942	GCC	2	6	1888881	1888886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200025
38586	NC_015942	GCTGG	2	10	1888917	1888926	0 %	20 %	60 %	20 %	344200025
38587	NC_015942	CTG	2	6	1889047	1889052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200025
38588	NC_015942	GGA	2	6	1889063	1889068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200025
38589	NC_015942	TTA	2	6	1889103	1889108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200025
38590	NC_015942	AGT	2	6	1889307	1889312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200025
38591	NC_015942	AG	3	6	1889324	1889329	50 %	0 %	50 %	0 %	344200025
38592	NC_015942	CCT	2	6	1889387	1889392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38593	NC_015942	ACA	2	6	1889398	1889403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38594	NC_015942	TCA	2	6	1889418	1889423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200026
38595	NC_015942	GTC	2	6	1889451	1889456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200026
38596	NC_015942	GAA	2	6	1889474	1889479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200026
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38598	NC_015942	CA	3	6	1889613	1889618	50 %	0 %	0 %	50 %	344200026
38599	NC_015942	CAC	2	6	1889692	1889697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38600	NC_015942	CT	3	6	1889740	1889745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38601	NC_015942	AAGCGG	2	12	1889761	1889772	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38602	NC_015942	CCT	2	6	1889789	1889794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38603	NC_015942	CGT	2	6	1889833	1889838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38604	NC_015942	TCT	2	6	1889841	1889846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38605	NC_015942	AC	4	8	1889851	1889858	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38606	NC_015942	ACA	2	6	1889867	1889872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38607	NC_015942	GTCC	2	8	1889917	1889924	0 %	25 %	25 %	50 %	344200027
38608	NC_015942	TGG	2	6	1889937	1889942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200027
38609	NC_015942	GC	3	6	1889974	1889979	0 %	0 %	50 %	50 %	344200027
38610	NC_015942	TCAC	2	8	1890026	1890033	25 %	25 %	0 %	50 %	344200027
38611	NC_015942	CGG	2	6	1890077	1890082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200027
38612	NC_015942	CTG	2	6	1890127	1890132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200027
38613	NC_015942	GCA	2	6	1890197	1890202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200027
38614	NC_015942	GCA	2	6	1890213	1890218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200027
38615	NC_015942	TCAGA	2	10	1890270	1890279	40 %	20 %	20 %	20 %	344200027
38616	NC_015942	TG	3	6	1890287	1890292	0 %	50 %	50 %	0 %	344200027
38617	NC_015942	TCT	2	6	1890345	1890350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200027
38618	NC_015942	CAT	2	6	1890370	1890375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200027
38619	NC_015942	CAG	2	6	1890391	1890396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200027
38620	NC_015942	GCC	2	6	1890473	1890478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200027
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38623	NC_015942	TGG	2	6	1890689	1890694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200027
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38631	NC_015942	ATCCGC	2	12	1891444	1891455	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344200027
38632	NC_015942	TAT	2	6	1891476	1891481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200027
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38719	NC_015942	TG	3	6	1895262	1895267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38720	NC_015942	GTC	2	6	1895303	1895308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38721	NC_015942	ATT	2	6	1895335	1895340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38722	NC_015942	A	7	7	1895346	1895352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38723	NC_015942	CGCT	2	8	1895406	1895413	0 %	25 %	25 %	50 %	344200033
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38732	NC_015942	GGC	2	6	1895714	1895719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200033
38733	NC_015942	CATC	2	8	1895750	1895757	25 %	25 %	0 %	50 %	344200033
38734	NC_015942	TCA	2	6	1895773	1895778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200033
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38738	NC_015942	GTC	2	6	1895863	1895868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200034
38739	NC_015942	TTC	2	6	1895869	1895874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200034
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38741	NC_015942	CGG	2	6	1895961	1895966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200034
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38744	NC_015942	TC	3	6	1895999	1896004	0 %	50 %	0 %	50 %	344200034
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38837	NC_015942	ACCA	2	8	1900621	1900628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38838	NC_015942	CACT	2	8	1900637	1900644	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38839	NC_015942	CTC	2	6	1900654	1900659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38840	NC_015942	A	9	9	1900672	1900680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38841	NC_015942	AAT	2	6	1900699	1900704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38848	NC_015942	AAT	2	6	1900975	1900980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200038
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38851	NC_015942	ACA	2	6	1901067	1901072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200038
38852	NC_015942	GC	3	6	1901173	1901178	0 %	0 %	50 %	50 %	344200038
38853	NC_015942	ATG	2	6	1901179	1901184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200038
38854	NC_015942	GAC	2	6	1901235	1901240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200038
38855	NC_015942	CCG	2	6	1901241	1901246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200038
38856	NC_015942	GTT	2	6	1901254	1901259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200038
38857	NC_015942	AGAC	2	8	1901306	1901313	50 %	0 %	25 %	25 %	344200038
38858	NC_015942	CCG	2	6	1901397	1901402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200038
38859	NC_015942	CGT	2	6	1901447	1901452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200038
38860	NC_015942	ACC	2	6	1901468	1901473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200038
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38865	NC_015942	CCGG	2	8	1901815	1901822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38866	NC_015942	TCGAT	2	10	1901891	1901900	20 %	40 %	20 %	20 %	344200039
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38874	NC_015942	GATT	2	8	1902175	1902182	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38875	NC_015942	TGCTT	2	10	1902199	1902208	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38876	NC_015942	GTAT	2	8	1902272	1902279	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38877	NC_015942	CG	3	6	1902294	1902299	0 %	0 %	50 %	50 %	344200040
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38952	NC_015942	GTAT	2	8	1906144	1906151	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38953	NC_015942	ACAAA	2	10	1906201	1906210	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38954	NC_015942	A	7	7	1906230	1906236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38955	NC_015942	CCG	2	6	1906289	1906294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38956	NC_015942	TCC	2	6	1906360	1906365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200043
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38960	NC_015942	ATC	2	6	1906531	1906536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200043
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