MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38090	NC_015942	TCGA	2	8	1865608	1865615	25 %	25 %	25 %	25 %	344200003
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38102	NC_015942	CAC	2	6	1866469	1866474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200004
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38356	NC_015942	AGT	2	6	1878317	1878322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200016
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38360	NC_015942	TCA	2	6	1878697	1878702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200017
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38429	NC_015942	GCA	2	6	1881741	1881746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200020
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38432	NC_015942	TCCA	2	8	1881924	1881931	25 %	25 %	0 %	50 %	344200020
38433	NC_015942	CGCGC	2	10	1881934	1881943	0 %	0 %	40 %	60 %	344200020
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38438	NC_015942	ACC	2	6	1882041	1882046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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38440	NC_015942	CTG	3	9	1882133	1882141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200021
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38467	NC_015942	ATG	2	6	1882885	1882890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200021
38468	NC_015942	CAC	2	6	1883149	1883154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200021
38469	NC_015942	ATGT	2	8	1883192	1883199	25 %	50 %	25 %	0 %	344200021
38470	NC_015942	TGCGGG	2	12	1883329	1883340	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	344200021
38471	NC_015942	GCC	2	6	1883351	1883356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200021
38472	NC_015942	TGA	2	6	1883472	1883477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200021
38473	NC_015942	CAG	2	6	1883506	1883511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200021
38474	NC_015942	TCA	2	6	1883532	1883537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200021
38475	NC_015942	GAT	2	6	1883557	1883562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200021
38476	NC_015942	TCG	2	6	1883564	1883569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200021
38477	NC_015942	CAA	2	6	1883746	1883751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200021
38478	NC_015942	ACC	2	6	1883759	1883764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200021
38479	NC_015942	GGTA	2	8	1883771	1883778	25 %	25 %	50 %	0 %	344200021
38480	NC_015942	CGC	2	6	1883801	1883806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200021
38481	NC_015942	TTC	2	6	1883810	1883815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200021
38482	NC_015942	T	6	6	1883843	1883848	0 %	100 %	0 %	0 %	344200022
38483	NC_015942	GCT	2	6	1883852	1883857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200022
38484	NC_015942	GCT	2	6	1883886	1883891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200022
38485	NC_015942	GCCC	2	8	1883912	1883919	0 %	0 %	25 %	75 %	344200022
38486	NC_015942	GAAC	2	8	1883928	1883935	50 %	0 %	25 %	25 %	344200022
38487	NC_015942	CTG	2	6	1883961	1883966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200022
38488	NC_015942	CAT	2	6	1884008	1884013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200022
38489	NC_015942	TCT	2	6	1884038	1884043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200022
38490	NC_015942	CCTG	2	8	1884079	1884086	0 %	25 %	25 %	50 %	344200022
38491	NC_015942	GCC	2	6	1884106	1884111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200022
38492	NC_015942	CTGG	2	8	1884114	1884121	0 %	25 %	50 %	25 %	344200022
38493	NC_015942	TGC	2	6	1884131	1884136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200022
38494	NC_015942	CTG	2	6	1884240	1884245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200022
38495	NC_015942	TGC	2	6	1884254	1884259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200022
38496	NC_015942	TGCCC	2	10	1884326	1884335	0 %	20 %	20 %	60 %	344200022
38497	NC_015942	CTGA	2	8	1884372	1884379	25 %	25 %	25 %	25 %	344200022
38498	NC_015942	CCG	2	6	1884452	1884457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200022
38499	NC_015942	TAC	2	6	1884551	1884556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200022
38500	NC_015942	T	6	6	1884657	1884662	0 %	100 %	0 %	0 %	344200022

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