MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_015942	CAT	2	6	1644436	1644441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199782
33502	NC_015942	TGG	2	6	1644519	1644524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199782
33503	NC_015942	C	6	6	1644541	1644546	0 %	0 %	0 %	100 %	344199782
33504	NC_015942	CTT	2	6	1644599	1644604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344199782
33505	NC_015942	GTC	2	6	1644623	1644628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199782
33506	NC_015942	CCG	2	6	1644729	1644734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199782
33507	NC_015942	GTA	2	6	1644798	1644803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199782
33508	NC_015942	ATA	2	6	1644809	1644814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344199782
33509	NC_015942	CTC	2	6	1644992	1644997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199782
33510	NC_015942	AC	3	6	1645000	1645005	50 %	0 %	0 %	50 %	344199782
33511	NC_015942	TCA	2	6	1645059	1645064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199782
33512	NC_015942	TTC	2	6	1645115	1645120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344199782
33513	NC_015942	TCA	2	6	1645132	1645137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199782
33514	NC_015942	TC	3	6	1645140	1645145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33515	NC_015942	CTG	2	6	1645205	1645210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199783
33516	NC_015942	CAGC	2	8	1645211	1645218	25 %	0 %	25 %	50 %	344199783
33517	NC_015942	CGG	2	6	1645220	1645225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199783
33518	NC_015942	CTTC	2	8	1645250	1645257	0 %	50 %	0 %	50 %	344199783
33519	NC_015942	ATG	2	6	1645261	1645266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199783
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33521	NC_015942	TGC	2	6	1645429	1645434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199783
33522	NC_015942	CCAGTT	2	12	1645499	1645510	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344199783
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33524	NC_015942	CGC	2	6	1645556	1645561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199783
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33529	NC_015942	CGT	2	6	1645709	1645714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199783
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33531	NC_015942	ACC	2	6	1645812	1645817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199783
33532	NC_015942	TTCCAG	2	12	1645863	1645874	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344199783
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33536	NC_015942	GTGCC	2	10	1646180	1646189	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33537	NC_015942	ATT	2	6	1646215	1646220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33538	NC_015942	AAT	2	6	1646231	1646236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33539	NC_015942	CA	3	6	1646302	1646307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33540	NC_015942	TCG	2	6	1646348	1646353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33541	NC_015942	TTTG	2	8	1646386	1646393	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33542	NC_015942	GAT	2	6	1646418	1646423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33543	NC_015942	T	6	6	1646428	1646433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33544	NC_015942	AT	3	6	1646478	1646483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33545	NC_015942	GGA	2	6	1646538	1646543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33546	NC_015942	ATG	2	6	1646648	1646653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199784
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33550	NC_015942	GTGA	2	8	1646776	1646783	25 %	25 %	50 %	0 %	344199784
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33554	NC_015942	GCA	2	6	1647013	1647018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199785
33555	NC_015942	TCCG	2	8	1647032	1647039	0 %	25 %	25 %	50 %	344199785
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33559	NC_015942	CGGCG	2	10	1647472	1647481	0 %	0 %	60 %	40 %	344199785
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33594	NC_015942	AGA	2	6	1649187	1649192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33599	NC_015942	GGAA	2	8	1649445	1649452	50 %	0 %	50 %	0 %	344199787
33600	NC_015942	TC	3	6	1649501	1649506	0 %	50 %	0 %	50 %	344199787
33601	NC_015942	TCAG	2	8	1649546	1649553	25 %	25 %	25 %	25 %	344199787
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33618	NC_015942	CCA	2	6	1650485	1650490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199787
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33851	NC_015942	CCG	2	6	1661806	1661811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199805
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33865	NC_015942	AGTA	2	8	1662633	1662640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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33903	NC_015942	ATA	2	6	1664593	1664598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33951	NC_015942	TTC	2	6	1666890	1666895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344199810
33952	NC_015942	CTG	2	6	1666900	1666905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199810
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33955	NC_015942	GCCCG	2	10	1666960	1666969	0 %	0 %	40 %	60 %	344199810
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33958	NC_015942	CTG	2	6	1667266	1667271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199810
33959	NC_015942	GCG	2	6	1667275	1667280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199810
33960	NC_015942	GTC	2	6	1667296	1667301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199810
33961	NC_015942	TGG	2	6	1667313	1667318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199810
33962	NC_015942	CAT	2	6	1667328	1667333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199810
33963	NC_015942	TGG	2	6	1667357	1667362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199810
33964	NC_015942	GC	3	6	1667488	1667493	0 %	0 %	50 %	50 %	344199810
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