MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30501	NC_015942	TTG	2	6	1487892	1487897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344199621
30502	NC_015942	ATT	2	6	1487997	1488002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344199621
30503	NC_015942	AAGA	2	8	1488012	1488019	75 %	0 %	25 %	0 %	344199621
30504	NC_015942	GACA	2	8	1488028	1488035	50 %	0 %	25 %	25 %	344199621
30505	NC_015942	GCG	2	6	1488091	1488096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199621
30506	NC_015942	ATGA	2	8	1488114	1488121	50 %	25 %	25 %	0 %	344199621
30507	NC_015942	GAT	2	6	1488150	1488155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199621
30508	NC_015942	TAT	2	6	1488159	1488164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344199621
30509	NC_015942	GT	3	6	1488207	1488212	0 %	50 %	50 %	0 %	344199621
30510	NC_015942	GC	3	6	1488240	1488245	0 %	0 %	50 %	50 %	344199621
30511	NC_015942	CAT	2	6	1488258	1488263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199621
30512	NC_015942	CGC	2	6	1488314	1488319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199621
30513	NC_015942	ATTC	2	8	1488326	1488333	25 %	50 %	0 %	25 %	344199621
30514	NC_015942	GGC	2	6	1488374	1488379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199621
30515	NC_015942	TGC	2	6	1488407	1488412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199621
30516	NC_015942	TGC	2	6	1488463	1488468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199621
30517	NC_015942	GCC	2	6	1488606	1488611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199621
30518	NC_015942	CGCA	2	8	1488661	1488668	25 %	0 %	25 %	50 %	344199621
30519	NC_015942	ACGC	2	8	1488676	1488683	25 %	0 %	25 %	50 %	344199621
30520	NC_015942	GCC	2	6	1488690	1488695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199621
30521	NC_015942	GTG	2	6	1488739	1488744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199621
30522	NC_015942	GC	3	6	1488850	1488855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30523	NC_015942	GCA	2	6	1488991	1488996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30524	NC_015942	CGC	2	6	1489211	1489216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30525	NC_015942	AGC	2	6	1489226	1489231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30526	NC_015942	TGG	2	6	1489264	1489269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30527	NC_015942	ACC	2	6	1489275	1489280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30528	NC_015942	GCG	2	6	1489406	1489411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30529	NC_015942	GTG	2	6	1489497	1489502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30530	NC_015942	C	6	6	1489646	1489651	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30531	NC_015942	GA	3	6	1489694	1489699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30532	NC_015942	TCA	2	6	1489762	1489767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30533	NC_015942	CCA	2	6	1489880	1489885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30534	NC_015942	TG	3	6	1490041	1490046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30535	NC_015942	GCG	2	6	1490094	1490099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199622
30536	NC_015942	CG	3	6	1490109	1490114	0 %	0 %	50 %	50 %	344199622
30537	NC_015942	GGA	2	6	1490185	1490190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199622
30538	NC_015942	AT	3	6	1490316	1490321	50 %	50 %	0 %	0 %	344199622
30539	NC_015942	CCA	2	6	1490369	1490374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199622
30540	NC_015942	GAC	2	6	1490432	1490437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199622
30541	NC_015942	TGT	2	6	1490455	1490460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344199622
30542	NC_015942	CGTG	2	8	1490536	1490543	0 %	25 %	50 %	25 %	344199622
30543	NC_015942	AGT	2	6	1490575	1490580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199622
30544	NC_015942	ATG	2	6	1490613	1490618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199622
30545	NC_015942	GTCG	2	8	1490625	1490632	0 %	25 %	50 %	25 %	344199622
30546	NC_015942	CAG	3	9	1490654	1490662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199622
30547	NC_015942	AGTC	2	8	1490675	1490682	25 %	25 %	25 %	25 %	344199622
30548	NC_015942	TGCA	2	8	1490758	1490765	25 %	25 %	25 %	25 %	344199622
30549	NC_015942	A	7	7	1490864	1490870	100 %	0 %	0 %	0 %	344199622
30550	NC_015942	GTG	2	6	1490966	1490971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199622
30551	NC_015942	GCT	2	6	1490983	1490988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199622
30552	NC_015942	GTC	2	6	1491157	1491162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30553	NC_015942	GTT	2	6	1491211	1491216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30554	NC_015942	AT	4	8	1491219	1491226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30555	NC_015942	T	6	6	1491277	1491282	0 %	100 %	0 %	0 %	344199623
30556	NC_015942	ATC	2	6	1491283	1491288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199623
30557	NC_015942	CAT	2	6	1491353	1491358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199623
30558	NC_015942	CAC	2	6	1491432	1491437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199623
30559	NC_015942	G	6	6	1491455	1491460	0 %	0 %	100 %	0 %	344199623
30560	NC_015942	CATCG	2	10	1491489	1491498	20 %	20 %	20 %	40 %	344199623
30561	NC_015942	GGA	2	6	1491512	1491517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199623
30562	NC_015942	GC	3	6	1491523	1491528	0 %	0 %	50 %	50 %	344199623
30563	NC_015942	CAA	2	6	1491625	1491630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30564	NC_015942	CGC	2	6	1491698	1491703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30565	NC_015942	CAT	2	6	1491785	1491790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199624
30566	NC_015942	TGC	2	6	1491799	1491804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199624
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30569	NC_015942	TGC	2	6	1492157	1492162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199624
30570	NC_015942	GCT	2	6	1492235	1492240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199624
30571	NC_015942	TCG	2	6	1492411	1492416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199624
30572	NC_015942	GTG	2	6	1492418	1492423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199624
30573	NC_015942	CGGA	2	8	1492452	1492459	25 %	0 %	50 %	25 %	344199624
30574	NC_015942	GCA	2	6	1492467	1492472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199624
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30578	NC_015942	GTG	2	6	1492589	1492594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30579	NC_015942	TGTA	2	8	1492685	1492692	25 %	50 %	25 %	0 %	344199625
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30582	NC_015942	GCGG	2	8	1492843	1492850	0 %	0 %	75 %	25 %	344199625
30583	NC_015942	TGGT	2	8	1492889	1492896	0 %	50 %	50 %	0 %	344199625
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30586	NC_015942	TCG	2	6	1493126	1493131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199626
30587	NC_015942	CTA	2	6	1493156	1493161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199626
30588	NC_015942	GAA	2	6	1493304	1493309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199626
30589	NC_015942	GGA	2	6	1493332	1493337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199626
30590	NC_015942	CCG	2	6	1493347	1493352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199626
30591	NC_015942	AAAAC	2	10	1493354	1493363	80 %	0 %	0 %	20 %	344199626
30592	NC_015942	GATA	2	8	1493452	1493459	50 %	25 %	25 %	0 %	344199626
30593	NC_015942	CCG	2	6	1493490	1493495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30594	NC_015942	GCA	2	6	1493538	1493543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199627
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30596	NC_015942	TGA	2	6	1493768	1493773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199627
30597	NC_015942	AAG	2	6	1493789	1493794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199627
30598	NC_015942	AGA	2	6	1493833	1493838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199627
30599	NC_015942	GATCA	2	10	1493913	1493922	40 %	20 %	20 %	20 %	344199627
30600	NC_015942	ATG	2	6	1493977	1493982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199627
30601	NC_015942	TGC	2	6	1493996	1494001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199627
30602	NC_015942	TGGTC	2	10	1494065	1494074	0 %	40 %	40 %	20 %	344199627
30603	NC_015942	TGT	2	6	1494131	1494136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344199627
30604	NC_015942	CACC	2	8	1494197	1494204	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
30605	NC_015942	AGA	2	6	1494237	1494242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199628
30606	NC_015942	GCCT	2	8	1494379	1494386	0 %	25 %	25 %	50 %	344199628
30607	NC_015942	ACG	2	6	1494485	1494490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199628
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30609	NC_015942	GAT	2	6	1494637	1494642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199628
30610	NC_015942	GC	3	6	1494656	1494661	0 %	0 %	50 %	50 %	344199628
30611	NC_015942	GAG	2	6	1494714	1494719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30612	NC_015942	AAT	2	6	1494763	1494768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344199629
30613	NC_015942	CTC	2	6	1494854	1494859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199629
30614	NC_015942	TGC	2	6	1494898	1494903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199629
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30616	NC_015942	TCCG	2	8	1494978	1494985	0 %	25 %	25 %	50 %	344199629
30617	NC_015942	GTT	2	6	1494991	1494996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344199629
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30619	NC_015942	TGC	2	6	1495096	1495101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199629
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30979	NC_015942	CGG	2	6	1513455	1513460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199649
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30986	NC_015942	CGG	2	6	1513728	1513733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199650
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