MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_015942	GCGG	2	8	1314851	1314858	0 %	0 %	75 %	25 %	344199468
27003	NC_015942	GAA	2	6	1314963	1314968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199468
27004	NC_015942	GCC	3	9	1314982	1314990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199468
27005	NC_015942	CTG	2	6	1315017	1315022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199468
27006	NC_015942	GCCAC	2	10	1315049	1315058	20 %	0 %	20 %	60 %	344199468
27007	NC_015942	GCGG	2	8	1315071	1315078	0 %	0 %	75 %	25 %	344199468
27008	NC_015942	GAT	2	6	1315170	1315175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199468
27009	NC_015942	CAT	2	6	1315229	1315234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199468
27010	NC_015942	TCA	2	6	1315252	1315257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199468
27011	NC_015942	CAG	2	6	1315299	1315304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199468
27012	NC_015942	CGG	3	9	1315354	1315362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199468
27013	NC_015942	TCG	2	6	1315377	1315382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199468
27014	NC_015942	GCG	2	6	1315400	1315405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199468
27015	NC_015942	TTG	2	6	1315432	1315437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344199468
27016	NC_015942	TCG	2	6	1315441	1315446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199468
27017	NC_015942	TGC	2	6	1315645	1315650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199468
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27019	NC_015942	GGA	2	6	1315676	1315681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199468
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27022	NC_015942	CAA	2	6	1315793	1315798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344199468
27023	NC_015942	T	6	6	1315866	1315871	0 %	100 %	0 %	0 %	344199468
27024	NC_015942	GGC	2	6	1315874	1315879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199468
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27029	NC_015942	GCGG	2	8	1316051	1316058	0 %	0 %	75 %	25 %	344199468
27030	NC_015942	AG	3	6	1316085	1316090	50 %	0 %	50 %	0 %	344199468
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27033	NC_015942	GT	3	6	1316197	1316202	0 %	50 %	50 %	0 %	344199468
27034	NC_015942	AGC	2	6	1316243	1316248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199468
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27042	NC_015942	TGG	2	6	1316500	1316505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199468
27043	NC_015942	GCA	2	6	1316515	1316520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199468
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27055	NC_015942	GC	3	6	1316955	1316960	0 %	0 %	50 %	50 %	344199468
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27083	NC_015942	CTG	2	6	1318268	1318273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199470
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27233	NC_015942	CTA	2	6	1325329	1325334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199476
27234	NC_015942	GCT	3	9	1325337	1325345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199476
27235	NC_015942	GCG	2	6	1325346	1325351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199476
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27237	NC_015942	GC	3	6	1325368	1325373	0 %	0 %	50 %	50 %	344199476
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27240	NC_015942	GGC	2	6	1325492	1325497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199476
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27244	NC_015942	TGC	2	6	1325934	1325939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199476
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27263	NC_015942	GCA	2	6	1326777	1326782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199477
27264	NC_015942	GC	3	6	1326879	1326884	0 %	0 %	50 %	50 %	344199477
27265	NC_015942	GGCC	2	8	1326933	1326940	0 %	0 %	50 %	50 %	344199477
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27291	NC_015942	T	7	7	1328924	1328930	0 %	100 %	0 %	0 %	344199478
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27297	NC_015942	GCT	2	6	1329025	1329030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199478
27298	NC_015942	GCCAGC	2	12	1329104	1329115	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344199478
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27301	NC_015942	TGC	2	6	1329252	1329257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199478
27302	NC_015942	GCT	2	6	1329268	1329273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199478
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27309	NC_015942	TAAAG	2	10	1329551	1329560	60 %	20 %	20 %	0 %	344199478
27310	NC_015942	TCA	2	6	1329608	1329613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199478
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27312	NC_015942	ATC	2	6	1329685	1329690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199478
27313	NC_015942	TCC	2	6	1329703	1329708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199478
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27320	NC_015942	GGTA	2	8	1329975	1329982	25 %	25 %	50 %	0 %	344199478
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27329	NC_015942	CAA	2	6	1330289	1330294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344199478
27330	NC_015942	CAG	2	6	1330322	1330327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199478
27331	NC_015942	CAG	2	6	1330406	1330411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199478
27332	NC_015942	CCA	2	6	1330453	1330458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199478
27333	NC_015942	GCC	2	6	1330608	1330613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199478
27334	NC_015942	GCTG	2	8	1330644	1330651	0 %	25 %	50 %	25 %	344199478
27335	NC_015942	CAA	2	6	1330653	1330658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344199478
27336	NC_015942	ATT	2	6	1330666	1330671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344199478
27337	NC_015942	AGCAAT	2	12	1330674	1330685	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	344199478
27338	NC_015942	CTT	2	6	1330749	1330754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27339	NC_015942	GA	3	6	1330772	1330777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27340	NC_015942	ATC	2	6	1330826	1330831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199479
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27345	NC_015942	TCC	2	6	1331064	1331069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199479
27346	NC_015942	AT	3	6	1331097	1331102	50 %	50 %	0 %	0 %	344199479
27347	NC_015942	ATTTT	2	10	1331175	1331184	20 %	80 %	0 %	0 %	344199479
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27349	NC_015942	ATC	2	6	1331283	1331288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199479
27350	NC_015942	T	6	6	1331303	1331308	0 %	100 %	0 %	0 %	344199479
27351	NC_015942	GAT	2	6	1331347	1331352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199479
27352	NC_015942	ACA	2	6	1331358	1331363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344199479
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27354	NC_015942	TCG	2	6	1331457	1331462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199479
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27360	NC_015942	A	6	6	1331826	1331831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27361	NC_015942	T	6	6	1331856	1331861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27362	NC_015942	A	8	8	1331871	1331878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27363	NC_015942	TCC	2	6	1331908	1331913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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27368	NC_015942	ATA	2	6	1332241	1332246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27370	NC_015942	GCAG	2	8	1332310	1332317	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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27380	NC_015942	ATT	2	6	1332977	1332982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27385	NC_015942	TTG	2	6	1333104	1333109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344199481
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27463	NC_015942	TA	3	6	1336705	1336710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27464	NC_015942	GTG	2	6	1336741	1336746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27465	NC_015942	AG	3	6	1336916	1336921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27466	NC_015942	TG	3	6	1336932	1336937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27467	NC_015942	TTGGA	2	10	1336948	1336957	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27468	NC_015942	CCG	2	6	1337037	1337042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199484
27469	NC_015942	AGAA	2	8	1337066	1337073	75 %	0 %	25 %	0 %	344199484
27470	NC_015942	GC	3	6	1337083	1337088	0 %	0 %	50 %	50 %	344199484
27471	NC_015942	ATT	2	6	1337103	1337108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344199484
27472	NC_015942	TCTA	2	8	1337149	1337156	25 %	50 %	0 %	25 %	344199484
27473	NC_015942	ACA	2	6	1337171	1337176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344199484
27474	NC_015942	GCG	2	6	1337249	1337254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199484
27475	NC_015942	TTG	3	9	1337264	1337272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344199484
27476	NC_015942	TGCGC	2	10	1337400	1337409	0 %	20 %	40 %	40 %	344199484
27477	NC_015942	AGA	2	6	1337455	1337460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199484
27478	NC_015942	A	6	6	1337572	1337577	100 %	0 %	0 %	0 %	344199484
27479	NC_015942	CCTG	2	8	1337637	1337644	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27480	NC_015942	CAGGG	2	10	1337752	1337761	20 %	0 %	60 %	20 %	344199485
27481	NC_015942	CGGC	2	8	1337772	1337779	0 %	0 %	50 %	50 %	344199485
27482	NC_015942	GC	3	6	1337867	1337872	0 %	0 %	50 %	50 %	344199485
27483	NC_015942	CGAC	2	8	1337888	1337895	25 %	0 %	25 %	50 %	344199485
27484	NC_015942	TCC	2	6	1338001	1338006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199485
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27487	NC_015942	GA	3	6	1338207	1338212	50 %	0 %	50 %	0 %	344199485
27488	NC_015942	TGA	2	6	1338245	1338250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199485
27489	NC_015942	CAA	2	6	1338270	1338275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344199485
27490	NC_015942	CTGG	2	8	1338276	1338283	0 %	25 %	50 %	25 %	344199485
27491	NC_015942	T	6	6	1338287	1338292	0 %	100 %	0 %	0 %	344199485
27492	NC_015942	CCG	2	6	1338418	1338423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199485
27493	NC_015942	AGT	2	6	1338495	1338500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199485
27494	NC_015942	GC	3	6	1338520	1338525	0 %	0 %	50 %	50 %	344199485
27495	NC_015942	CAT	2	6	1338542	1338547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199485
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27497	NC_015942	GGT	2	6	1338726	1338731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199485
27498	NC_015942	GCT	2	6	1338761	1338766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199485
27499	NC_015942	GAAT	2	8	1338831	1338838	50 %	25 %	25 %	0 %	344199485
27500	NC_015942	CTT	2	6	1338872	1338877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344199485

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