MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26501	NC_015942	ACA	2	6	1288977	1288982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344199442
26502	NC_015942	TTA	2	6	1289099	1289104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344199442
26503	NC_015942	GCT	2	6	1289173	1289178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199442
26504	NC_015942	GTG	2	6	1289183	1289188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199442
26505	NC_015942	GGT	2	6	1289279	1289284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199442
26506	NC_015942	C	7	7	1289413	1289419	0 %	0 %	0 %	100 %	344199442
26507	NC_015942	TAA	2	6	1289443	1289448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26508	NC_015942	TGA	2	6	1289541	1289546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199443
26509	NC_015942	GCAG	2	8	1289569	1289576	25 %	0 %	50 %	25 %	344199443
26510	NC_015942	CCG	2	6	1289586	1289591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199443
26511	NC_015942	GGC	2	6	1289594	1289599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199443
26512	NC_015942	TGG	2	6	1289686	1289691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199443
26513	NC_015942	ATT	2	6	1289798	1289803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344199443
26514	NC_015942	CGT	2	6	1289815	1289820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199443
26515	NC_015942	CTG	2	6	1290063	1290068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199443
26516	NC_015942	GTGG	2	8	1290086	1290093	0 %	25 %	75 %	0 %	344199443
26517	NC_015942	TGC	2	6	1290205	1290210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199443
26518	NC_015942	GTG	2	6	1290218	1290223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199443
26519	NC_015942	GCG	2	6	1290254	1290259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199443
26520	NC_015942	ACCA	2	8	1290302	1290309	50 %	0 %	0 %	50 %	344199443
26521	NC_015942	GC	3	6	1290404	1290409	0 %	0 %	50 %	50 %	344199443
26522	NC_015942	GCG	2	6	1290494	1290499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199443
26523	NC_015942	GAAA	2	8	1290506	1290513	75 %	0 %	25 %	0 %	344199443
26524	NC_015942	GGC	2	6	1290573	1290578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199444
26525	NC_015942	CG	3	6	1290615	1290620	0 %	0 %	50 %	50 %	344199444
26526	NC_015942	ACG	2	6	1290624	1290629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199444
26527	NC_015942	GCTG	2	8	1290656	1290663	0 %	25 %	50 %	25 %	344199444
26528	NC_015942	TCCTGC	2	12	1290686	1290697	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	344199444
26529	NC_015942	T	7	7	1290719	1290725	0 %	100 %	0 %	0 %	344199444
26530	NC_015942	TCA	2	6	1290744	1290749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199444
26531	NC_015942	T	6	6	1290762	1290767	0 %	100 %	0 %	0 %	344199444
26532	NC_015942	CTG	2	6	1290853	1290858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199444
26533	NC_015942	CCA	2	6	1290869	1290874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199444
26534	NC_015942	TTAT	2	8	1290889	1290896	25 %	75 %	0 %	0 %	344199444
26535	NC_015942	CTG	2	6	1290949	1290954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199444
26536	NC_015942	ATC	2	6	1290970	1290975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199444
26537	NC_015942	ATC	2	6	1291040	1291045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199444
26538	NC_015942	CCG	2	6	1291084	1291089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199444
26539	NC_015942	TAT	2	6	1291116	1291121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344199444
26540	NC_015942	CGG	2	6	1291268	1291273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199444
26541	NC_015942	CGG	2	6	1291278	1291283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199444
26542	NC_015942	CGC	2	6	1291392	1291397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199444
26543	NC_015942	TCA	2	6	1291475	1291480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199444
26544	NC_015942	TGGTGC	2	12	1291490	1291501	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344199444
26545	NC_015942	GGC	2	6	1291559	1291564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199445
26546	NC_015942	GCC	2	6	1291585	1291590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199445
26547	NC_015942	ACG	2	6	1291629	1291634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199445
26548	NC_015942	CT	3	6	1291677	1291682	0 %	50 %	0 %	50 %	344199445
26549	NC_015942	TGA	2	6	1291780	1291785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199445
26550	NC_015942	CTGG	2	8	1291824	1291831	0 %	25 %	50 %	25 %	344199445
26551	NC_015942	GCC	2	6	1291861	1291866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199445
26552	NC_015942	T	7	7	1291883	1291889	0 %	100 %	0 %	0 %	344199445
26553	NC_015942	GC	3	6	1291906	1291911	0 %	0 %	50 %	50 %	344199445
26554	NC_015942	TTTA	2	8	1291932	1291939	25 %	75 %	0 %	0 %	344199445
26555	NC_015942	GTG	3	9	1291947	1291955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199445
26556	NC_015942	TTTTGC	2	12	1292002	1292013	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	344199445
26557	NC_015942	CGT	2	6	1292015	1292020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199445
26558	NC_015942	CAC	2	6	1292027	1292032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199445
26559	NC_015942	GGC	2	6	1292072	1292077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199445
26560	NC_015942	GAT	2	6	1292105	1292110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199445
26561	NC_015942	CTG	2	6	1292160	1292165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199445
26562	NC_015942	GCG	2	6	1292182	1292187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199445
26563	NC_015942	ACCGC	2	10	1292190	1292199	20 %	0 %	20 %	60 %	344199445
26564	NC_015942	GCA	2	6	1292309	1292314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199445
26565	NC_015942	GGGC	2	8	1292323	1292330	0 %	0 %	75 %	25 %	344199445
26566	NC_015942	TCCG	2	8	1292435	1292442	0 %	25 %	25 %	50 %	344199446
26567	NC_015942	T	8	8	1292452	1292459	0 %	100 %	0 %	0 %	344199446
26568	NC_015942	CAA	2	6	1292467	1292472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344199446
26569	NC_015942	CTG	2	6	1292618	1292623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199446
26570	NC_015942	TGC	2	6	1292664	1292669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199446
26571	NC_015942	GC	3	6	1292668	1292673	0 %	0 %	50 %	50 %	344199446
26572	NC_015942	ACA	2	6	1292727	1292732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344199446
26573	NC_015942	GGGCTG	2	12	1292852	1292863	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	344199446
26574	NC_015942	CGG	2	6	1292866	1292871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199446
26575	NC_015942	GCA	3	9	1292872	1292880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199446
26576	NC_015942	GC	4	8	1292894	1292901	0 %	0 %	50 %	50 %	344199446
26577	NC_015942	CTG	2	6	1292927	1292932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199446
26578	NC_015942	GTGA	2	8	1292987	1292994	25 %	25 %	50 %	0 %	344199446
26579	NC_015942	GCA	2	6	1293037	1293042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199446
26580	NC_015942	GGC	2	6	1293043	1293048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199446
26581	NC_015942	GC	3	6	1293047	1293052	0 %	0 %	50 %	50 %	344199446
26582	NC_015942	TGG	2	6	1293090	1293095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199446
26583	NC_015942	A	6	6	1293134	1293139	100 %	0 %	0 %	0 %	344199446
26584	NC_015942	CAGA	2	8	1293140	1293147	50 %	0 %	25 %	25 %	344199446
26585	NC_015942	G	6	6	1293261	1293266	0 %	0 %	100 %	0 %	344199447
26586	NC_015942	GTG	2	6	1293268	1293273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199447
26587	NC_015942	GAG	2	6	1293382	1293387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199447
26588	NC_015942	GCC	2	6	1293421	1293426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199447
26589	NC_015942	TGA	2	6	1293443	1293448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199447
26590	NC_015942	TGCGGA	2	12	1293630	1293641	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344199447
26591	NC_015942	GCC	2	6	1293704	1293709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199447
26592	NC_015942	TTAC	2	8	1293713	1293720	25 %	50 %	0 %	25 %	344199447
26593	NC_015942	ATG	2	6	1293721	1293726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199447
26594	NC_015942	A	6	6	1293843	1293848	100 %	0 %	0 %	0 %	344199447
26595	NC_015942	CGA	2	6	1293867	1293872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199447
26596	NC_015942	CACAGC	2	12	1293914	1293925	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344199448
26597	NC_015942	GGC	2	6	1293944	1293949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199448
26598	NC_015942	GTT	2	6	1293981	1293986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344199448
26599	NC_015942	AGA	2	6	1293989	1293994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199448
26600	NC_015942	CGTT	2	8	1294037	1294044	0 %	50 %	25 %	25 %	344199448
26601	NC_015942	GCG	2	6	1294091	1294096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199448
26602	NC_015942	GC	3	6	1294113	1294118	0 %	0 %	50 %	50 %	344199448
26603	NC_015942	TGC	2	6	1294193	1294198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199448
26604	NC_015942	GCG	2	6	1294322	1294327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199448
26605	NC_015942	TGG	2	6	1294330	1294335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199448
26606	NC_015942	G	8	8	1294344	1294351	0 %	0 %	100 %	0 %	344199448
26607	NC_015942	TG	3	6	1294416	1294421	0 %	50 %	50 %	0 %	344199448
26608	NC_015942	GCT	2	6	1294464	1294469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199448
26609	NC_015942	GAT	2	6	1294518	1294523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199448
26610	NC_015942	TTC	2	6	1294556	1294561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344199448
26611	NC_015942	TCGGT	2	10	1294663	1294672	0 %	40 %	40 %	20 %	344199448
26612	NC_015942	GCC	2	6	1294713	1294718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199448
26613	NC_015942	GGGT	2	8	1294727	1294734	0 %	25 %	75 %	0 %	344199448
26614	NC_015942	TCA	2	6	1294735	1294740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199448
26615	NC_015942	CATC	2	8	1294835	1294842	25 %	25 %	0 %	50 %	344199448
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26617	NC_015942	CAG	2	6	1294948	1294953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199448
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