MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_015942	CTG	2	6	1044661	1044666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199188
21502	NC_015942	ATA	2	6	1044686	1044691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344199188
21503	NC_015942	TGG	2	6	1044754	1044759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199188
21504	NC_015942	GAT	2	6	1044786	1044791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199188
21505	NC_015942	ATG	2	6	1044811	1044816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199188
21506	NC_015942	GCG	3	9	1044869	1044877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21507	NC_015942	CT	3	6	1044906	1044911	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21508	NC_015942	GAT	2	6	1044934	1044939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21509	NC_015942	GGT	2	6	1044970	1044975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21510	NC_015942	TGG	2	6	1045041	1045046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21511	NC_015942	CAT	2	6	1045119	1045124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199189
21512	NC_015942	AAG	2	6	1045130	1045135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199189
21513	NC_015942	CGA	2	6	1045155	1045160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199189
21514	NC_015942	TC	3	6	1045186	1045191	0 %	50 %	0 %	50 %	344199189
21515	NC_015942	TC	3	6	1045231	1045236	0 %	50 %	0 %	50 %	344199189
21516	NC_015942	CCG	2	6	1045247	1045252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199189
21517	NC_015942	CGG	2	6	1045332	1045337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199189
21518	NC_015942	TCG	2	6	1045361	1045366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199189
21519	NC_015942	GCC	2	6	1045430	1045435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199189
21520	NC_015942	GCC	2	6	1045453	1045458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199189
21521	NC_015942	GCC	2	6	1045471	1045476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199189
21522	NC_015942	TGG	2	6	1045526	1045531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199189
21523	NC_015942	GTC	2	6	1045549	1045554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199189
21524	NC_015942	GCC	2	6	1045620	1045625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199189
21525	NC_015942	CGC	2	6	1045659	1045664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199189
21526	NC_015942	CTG	2	6	1045684	1045689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199189
21527	NC_015942	CGC	2	6	1045890	1045895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199189
21528	NC_015942	TG	3	6	1045914	1045919	0 %	50 %	50 %	0 %	344199189
21529	NC_015942	CGG	2	6	1045975	1045980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199189
21530	NC_015942	CTT	2	6	1046058	1046063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344199189
21531	NC_015942	C	6	6	1046070	1046075	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21532	NC_015942	GC	3	6	1046159	1046164	0 %	0 %	50 %	50 %	344199190
21533	NC_015942	CTAC	2	8	1046183	1046190	25 %	25 %	0 %	50 %	344199190
21534	NC_015942	T	7	7	1046236	1046242	0 %	100 %	0 %	0 %	344199190
21535	NC_015942	T	6	6	1046251	1046256	0 %	100 %	0 %	0 %	344199191
21536	NC_015942	GCC	2	6	1046258	1046263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199191
21537	NC_015942	GC	3	6	1046278	1046283	0 %	0 %	50 %	50 %	344199191
21538	NC_015942	ACA	2	6	1046386	1046391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344199191
21539	NC_015942	CAG	2	6	1046459	1046464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199191
21540	NC_015942	CTG	2	6	1046467	1046472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199191
21541	NC_015942	AAT	2	6	1046477	1046482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344199191
21542	NC_015942	AGGA	2	8	1046496	1046503	50 %	0 %	50 %	0 %	344199191
21543	NC_015942	CCA	2	6	1046548	1046553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199191
21544	NC_015942	CG	4	8	1046661	1046668	0 %	0 %	50 %	50 %	344199191
21545	NC_015942	ATG	2	6	1046691	1046696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199191
21546	NC_015942	ATC	2	6	1046703	1046708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199191
21547	NC_015942	GCA	2	6	1046718	1046723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199191
21548	NC_015942	CG	4	8	1046847	1046854	0 %	0 %	50 %	50 %	344199191
21549	NC_015942	ACC	2	6	1046861	1046866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199191
21550	NC_015942	AGA	2	6	1046890	1046895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199191
21551	NC_015942	GAT	2	6	1046999	1047004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199191
21552	NC_015942	GCA	2	6	1047046	1047051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199191
21553	NC_015942	AGTA	2	8	1047063	1047070	50 %	25 %	25 %	0 %	344199191
21554	NC_015942	TGT	2	6	1047075	1047080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344199191
21555	NC_015942	GC	3	6	1047146	1047151	0 %	0 %	50 %	50 %	344199192
21556	NC_015942	TCC	2	6	1047284	1047289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199192
21557	NC_015942	CCG	2	6	1047320	1047325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199192
21558	NC_015942	GAT	2	6	1047366	1047371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199192
21559	NC_015942	TGCT	2	8	1047403	1047410	0 %	50 %	25 %	25 %	344199192
21560	NC_015942	GA	3	6	1047443	1047448	50 %	0 %	50 %	0 %	344199192
21561	NC_015942	GC	4	8	1047458	1047465	0 %	0 %	50 %	50 %	344199192
21562	NC_015942	GGA	2	6	1047617	1047622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199193
21563	NC_015942	TCC	2	6	1047631	1047636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199193
21564	NC_015942	TCA	2	6	1047638	1047643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199193
21565	NC_015942	GCA	2	6	1047655	1047660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199193
21566	NC_015942	TAG	2	6	1047691	1047696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199193
21567	NC_015942	ACG	2	6	1047720	1047725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199193
21568	NC_015942	TGA	3	9	1047770	1047778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199193
21569	NC_015942	CGA	2	6	1047806	1047811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199193
21570	NC_015942	TTG	2	6	1047835	1047840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344199193
21571	NC_015942	TGG	2	6	1047890	1047895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199193
21572	NC_015942	CTT	2	6	1047948	1047953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344199193
21573	NC_015942	CAG	2	6	1048092	1048097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199193
21574	NC_015942	TGA	2	6	1048118	1048123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199193
21575	NC_015942	CCGT	2	8	1048265	1048272	0 %	25 %	25 %	50 %	344199193
21576	NC_015942	GC	3	6	1048276	1048281	0 %	0 %	50 %	50 %	344199193
21577	NC_015942	TCA	2	6	1048334	1048339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199193
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21582	NC_015942	CCTG	2	8	1048456	1048463	0 %	25 %	25 %	50 %	344199193
21583	NC_015942	ACC	2	6	1048650	1048655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199193
21584	NC_015942	AAG	2	6	1048664	1048669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199193
21585	NC_015942	GC	4	8	1048696	1048703	0 %	0 %	50 %	50 %	344199193
21586	NC_015942	GTG	2	6	1048822	1048827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199193
21587	NC_015942	CGA	2	6	1048829	1048834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199193
21588	NC_015942	CGG	2	6	1048844	1048849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199193
21589	NC_015942	GCG	2	6	1048874	1048879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199193
21590	NC_015942	ACC	2	6	1048884	1048889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199193
21591	NC_015942	CGA	2	6	1048925	1048930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199193
21592	NC_015942	ATG	2	6	1049023	1049028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199193
21593	NC_015942	CAA	2	6	1049071	1049076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344199193
21594	NC_015942	GGGT	2	8	1049192	1049199	0 %	25 %	75 %	0 %	344199193
21595	NC_015942	CGG	2	6	1049210	1049215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199193
21596	NC_015942	GCT	2	6	1049279	1049284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199193
21597	NC_015942	CAG	2	6	1049295	1049300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199193
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21599	NC_015942	CCCA	2	8	1049471	1049478	25 %	0 %	0 %	75 %	344199193
21600	NC_015942	CGA	2	6	1049570	1049575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199193
21601	NC_015942	TCA	2	6	1049581	1049586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199193
21602	NC_015942	TCACC	2	10	1049660	1049669	20 %	20 %	0 %	60 %	344199193
21603	NC_015942	GGC	2	6	1049838	1049843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199193
21604	NC_015942	ATG	2	6	1050121	1050126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199193
21605	NC_015942	CAC	2	6	1050147	1050152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199193
21606	NC_015942	TTC	2	6	1050186	1050191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344199193
21607	NC_015942	CTC	2	6	1050249	1050254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199193
21608	NC_015942	GCC	3	9	1050270	1050278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199193
21609	NC_015942	AGG	2	6	1050296	1050301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199193
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21611	NC_015942	TTC	2	6	1050396	1050401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344199193
21612	NC_015942	T	6	6	1050408	1050413	0 %	100 %	0 %	0 %	344199193
21613	NC_015942	TCT	2	6	1050427	1050432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344199193
21614	NC_015942	TGG	2	6	1050542	1050547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199193
21615	NC_015942	GGA	2	6	1050548	1050553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199193
21616	NC_015942	GAT	2	6	1050576	1050581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199193
21617	NC_015942	GC	3	6	1050582	1050587	0 %	0 %	50 %	50 %	344199193
21618	NC_015942	CCG	2	6	1050626	1050631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199193
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21847	NC_015942	CA	3	6	1062353	1062358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21848	NC_015942	GTA	2	6	1062375	1062380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21850	NC_015942	TCA	2	6	1062404	1062409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21851	NC_015942	TCA	2	6	1062413	1062418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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