MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_015942	CGC	2	6	923320	923325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199074
19002	NC_015942	GGGC	2	8	923377	923384	0 %	0 %	75 %	25 %	344199074
19003	NC_015942	ACA	2	6	923403	923408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344199074
19004	NC_015942	AGG	2	6	923512	923517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199074
19005	NC_015942	GCC	2	6	923561	923566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199074
19006	NC_015942	CTG	2	6	923600	923605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199074
19007	NC_015942	CTC	2	6	923615	923620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199074
19008	NC_015942	CAT	2	6	923653	923658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199074
19009	NC_015942	CTG	2	6	923660	923665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199074
19010	NC_015942	GGT	2	6	923687	923692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199074
19011	NC_015942	CGGTGG	2	12	923727	923738	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	344199074
19012	NC_015942	GGC	2	6	923767	923772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199074
19013	NC_015942	GTG	2	6	923783	923788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199074
19014	NC_015942	CTC	2	6	923813	923818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199074
19015	NC_015942	TGC	2	6	923886	923891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199074
19016	NC_015942	TGG	3	9	923922	923930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199074
19017	NC_015942	CAT	2	6	923944	923949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199074
19018	NC_015942	TGA	2	6	923976	923981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199074
19019	NC_015942	GCC	2	6	923990	923995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199074
19020	NC_015942	TGG	2	6	924000	924005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199074
19021	NC_015942	GCT	2	6	924034	924039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199074
19022	NC_015942	GCG	2	6	924073	924078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199074
19023	NC_015942	GAT	2	6	924090	924095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199074
19024	NC_015942	GAG	2	6	924108	924113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19025	NC_015942	ATG	2	6	924120	924125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199075
19026	NC_015942	TGG	2	6	924189	924194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199075
19027	NC_015942	ATG	2	6	924207	924212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199075
19028	NC_015942	CCT	2	6	924236	924241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199075
19029	NC_015942	CAT	2	6	924287	924292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199075
19030	NC_015942	CGG	2	6	924302	924307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199075
19031	NC_015942	CGC	2	6	924317	924322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199075
19032	NC_015942	TGG	2	6	924328	924333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199075
19033	NC_015942	CAT	2	6	924338	924343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199075
19034	NC_015942	CCG	2	6	924360	924365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199075
19035	NC_015942	GC	3	6	924369	924374	0 %	0 %	50 %	50 %	344199075
19036	NC_015942	CCT	2	6	924383	924388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199075
19037	NC_015942	TTCT	2	8	924618	924625	0 %	75 %	0 %	25 %	344199075
19038	NC_015942	GCT	2	6	924626	924631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199075
19039	NC_015942	GCC	2	6	924682	924687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199075
19040	NC_015942	GCG	2	6	924796	924801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199075
19041	NC_015942	ACGG	2	8	924883	924890	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19042	NC_015942	AAGG	2	8	924911	924918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19043	NC_015942	CAA	2	6	924972	924977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19044	NC_015942	CGG	3	9	925031	925039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199076
19045	NC_015942	GGGCA	2	10	925135	925144	20 %	0 %	60 %	20 %	344199076
19046	NC_015942	TGGC	2	8	925209	925216	0 %	25 %	50 %	25 %	344199076
19047	NC_015942	TGC	2	6	925308	925313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199076
19048	NC_015942	G	6	6	925315	925320	0 %	0 %	100 %	0 %	344199076
19049	NC_015942	CAT	2	6	925323	925328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199076
19050	NC_015942	ATC	2	6	925420	925425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19051	NC_015942	AATA	2	8	925452	925459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19052	NC_015942	CCA	2	6	925491	925496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199077
19053	NC_015942	AAAG	2	8	925507	925514	75 %	0 %	25 %	0 %	344199077
19054	NC_015942	TGC	2	6	925542	925547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199077
19055	NC_015942	ATG	2	6	925561	925566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199077
19056	NC_015942	CCAA	2	8	925618	925625	50 %	0 %	0 %	50 %	344199077
19057	NC_015942	AC	4	8	925672	925679	50 %	0 %	0 %	50 %	344199077
19058	NC_015942	CAAA	2	8	925752	925759	75 %	0 %	0 %	25 %	344199077
19059	NC_015942	GGCG	2	8	925812	925819	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19060	NC_015942	GAT	2	6	925860	925865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19061	NC_015942	GAT	2	6	925882	925887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19062	NC_015942	GCT	2	6	925937	925942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19063	NC_015942	GAAT	2	8	925959	925966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19064	NC_015942	CAG	2	6	925986	925991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19065	NC_015942	AC	3	6	926109	926114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19066	NC_015942	CAG	2	6	926201	926206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19067	NC_015942	TA	3	6	926280	926285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19068	NC_015942	TCG	2	6	926287	926292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19069	NC_015942	CGGC	2	8	926467	926474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19070	NC_015942	GCT	2	6	926494	926499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19071	NC_015942	TGC	2	6	926571	926576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19072	NC_015942	GGC	2	6	926587	926592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19073	NC_015942	GCTTGG	2	12	926598	926609	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19074	NC_015942	T	6	6	926713	926718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19075	NC_015942	CGC	2	6	926811	926816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19076	NC_015942	CAG	2	6	926817	926822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19077	NC_015942	CAC	2	6	926829	926834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19078	NC_015942	GGCTCT	2	12	926905	926916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19079	NC_015942	TTCTCA	2	12	926917	926928	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19080	NC_015942	GCC	2	6	927001	927006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19081	NC_015942	TGC	2	6	927099	927104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19082	NC_015942	CTG	2	6	927209	927214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19083	NC_015942	ACC	2	6	927261	927266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19084	NC_015942	AAT	2	6	927385	927390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19085	NC_015942	TGC	2	6	927429	927434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19086	NC_015942	CTC	2	6	927628	927633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199078
19087	NC_015942	TAA	2	6	927647	927652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344199078
19088	NC_015942	GAT	2	6	927688	927693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199078
19089	NC_015942	TTG	2	6	927749	927754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344199078
19090	NC_015942	T	6	6	927757	927762	0 %	100 %	0 %	0 %	344199078
19091	NC_015942	TAA	2	6	927780	927785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344199078
19092	NC_015942	ATT	2	6	927846	927851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19093	NC_015942	GAT	2	6	927856	927861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19094	NC_015942	CTGCC	2	10	927903	927912	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19095	NC_015942	ACG	2	6	927962	927967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19096	NC_015942	CA	3	6	927994	927999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19097	NC_015942	GCC	2	6	928004	928009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19098	NC_015942	CCG	2	6	928045	928050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19099	NC_015942	CTG	2	6	928083	928088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19100	NC_015942	TTC	2	6	928118	928123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19101	NC_015942	CGG	2	6	928144	928149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19102	NC_015942	AAT	2	6	928159	928164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19103	NC_015942	T	7	7	928170	928176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19104	NC_015942	T	7	7	928210	928216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19105	NC_015942	GAA	2	6	928251	928256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199079
19106	NC_015942	ATCC	2	8	928263	928270	25 %	25 %	0 %	50 %	344199079
19107	NC_015942	GCT	2	6	928368	928373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199079
19108	NC_015942	CGG	2	6	928379	928384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199079
19109	NC_015942	TCA	2	6	928454	928459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199079
19110	NC_015942	CGA	2	6	928482	928487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199079
19111	NC_015942	GGT	2	6	928551	928556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199079
19112	NC_015942	CCTTT	2	10	928634	928643	0 %	60 %	0 %	40 %	344199079
19113	NC_015942	GGA	2	6	928726	928731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199079
19114	NC_015942	GCTG	2	8	928745	928752	0 %	25 %	50 %	25 %	344199079
19115	NC_015942	CG	4	8	928760	928767	0 %	0 %	50 %	50 %	344199079
19116	NC_015942	AAC	2	6	928801	928806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344199079
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19118	NC_015942	GAC	2	6	928914	928919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199079
19119	NC_015942	A	6	6	928921	928926	100 %	0 %	0 %	0 %	344199079
19120	NC_015942	TCA	2	6	928940	928945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199079
19121	NC_015942	TCC	2	6	929026	929031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199079
19122	NC_015942	CGGGA	2	10	929060	929069	20 %	0 %	60 %	20 %	344199079
19123	NC_015942	GAT	2	6	929070	929075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199079
19124	NC_015942	GGA	2	6	929133	929138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199079
19125	NC_015942	CGGA	2	8	929144	929151	25 %	0 %	50 %	25 %	344199079
19126	NC_015942	CGT	2	6	929190	929195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199079
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19153	NC_015942	TTC	2	6	930529	930534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19159	NC_015942	GA	4	8	930819	930826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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19162	NC_015942	CGT	2	6	930977	930982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199081
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19227	NC_015942	CGC	2	6	934295	934300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19228	NC_015942	ATG	2	6	934302	934307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19230	NC_015942	CTCA	2	8	934513	934520	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19231	NC_015942	TG	3	6	934533	934538	0 %	50 %	50 %	0 %	344199084
19232	NC_015942	GAT	2	6	934660	934665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199084
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19234	NC_015942	AT	3	6	934680	934685	50 %	50 %	0 %	0 %	344199084
19235	NC_015942	GC	3	6	934727	934732	0 %	0 %	50 %	50 %	344199084
19236	NC_015942	TCA	2	6	934782	934787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199084
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19238	NC_015942	TATTT	2	10	934904	934913	20 %	80 %	0 %	0 %	344199084
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19240	NC_015942	TTG	2	6	935036	935041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19241	NC_015942	T	6	6	935047	935052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19242	NC_015942	ACC	2	6	935192	935197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199085
19243	NC_015942	GGA	2	6	935272	935277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199085
19244	NC_015942	ACC	2	6	935312	935317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199085
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19250	NC_015942	CTG	2	6	935598	935603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199086
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19368	NC_015942	CGG	2	6	942107	942112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199091
19369	NC_015942	CAT	2	6	942212	942217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199091
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19491	NC_015942	A	6	6	948392	948397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19492	NC_015942	CAG	2	6	948416	948421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19493	NC_015942	TCAA	2	8	948508	948515	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19494	NC_015942	AT	3	6	948523	948528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19495	NC_015942	AAC	2	6	948675	948680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19496	NC_015942	TGC	2	6	948713	948718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19498	NC_015942	TAAA	2	8	948807	948814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19499	NC_015942	ATT	2	6	948852	948857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19500	NC_015942	A	7	7	948865	948871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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