MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_015942	GC	3	6	899512	899517	0 %	0 %	50 %	50 %	344199057
18502	NC_015942	CGAC	2	8	899619	899626	25 %	0 %	25 %	50 %	344199057
18503	NC_015942	GCG	2	6	899632	899637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199057
18504	NC_015942	TCG	2	6	899697	899702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18505	NC_015942	GAC	2	6	899713	899718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18506	NC_015942	GCG	2	6	899797	899802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18507	NC_015942	GCG	2	6	899846	899851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199058
18508	NC_015942	AAG	2	6	899865	899870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199058
18509	NC_015942	CCG	2	6	899881	899886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199058
18510	NC_015942	GAA	2	6	899918	899923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199058
18511	NC_015942	GCA	2	6	899947	899952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199058
18512	NC_015942	CGG	2	6	899978	899983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199058
18513	NC_015942	GTCG	2	8	899996	900003	0 %	25 %	50 %	25 %	344199058
18514	NC_015942	GAA	2	6	900005	900010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199058
18515	NC_015942	GTG	2	6	900123	900128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199058
18516	NC_015942	CCG	2	6	900143	900148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199058
18517	NC_015942	GCA	2	6	900213	900218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199058
18518	NC_015942	GTC	2	6	900338	900343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199058
18519	NC_015942	GTAG	2	8	900423	900430	25 %	25 %	50 %	0 %	344199058
18520	NC_015942	GCT	2	6	900599	900604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18521	NC_015942	TGTA	2	8	900609	900616	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18522	NC_015942	AGC	2	6	900623	900628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18523	NC_015942	GCTG	2	8	900669	900676	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18524	NC_015942	GT	3	6	900747	900752	0 %	50 %	50 %	0 %	344199059
18525	NC_015942	CAC	2	6	900756	900761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199059
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18527	NC_015942	CTT	2	6	900894	900899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18528	NC_015942	CCG	2	6	900932	900937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18529	NC_015942	TAT	2	6	900976	900981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18530	NC_015942	TGC	2	6	901080	901085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18531	NC_015942	CGGGT	2	10	901116	901125	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18532	NC_015942	GCC	2	6	901126	901131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18533	NC_015942	CGC	2	6	901135	901140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18534	NC_015942	TGA	2	6	901141	901146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18535	NC_015942	CAC	2	6	901308	901313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18536	NC_015942	CAT	2	6	901317	901322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18537	NC_015942	GGCT	2	8	901338	901345	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18538	NC_015942	CGT	2	6	901377	901382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18539	NC_015942	CAA	2	6	901383	901388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18540	NC_015942	ACG	2	6	901404	901409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18541	NC_015942	GTA	2	6	901412	901417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18542	NC_015942	TTTCC	2	10	901456	901465	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
18543	NC_015942	CA	3	6	901512	901517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18544	NC_015942	CAT	2	6	901527	901532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199060
18545	NC_015942	GCC	2	6	901557	901562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199060
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18547	NC_015942	ACTG	2	8	901634	901641	25 %	25 %	25 %	25 %	344199060
18548	NC_015942	T	6	6	901754	901759	0 %	100 %	0 %	0 %	344199060
18549	NC_015942	GAT	2	6	901760	901765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199060
18550	NC_015942	CGG	2	6	901803	901808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199060
18551	NC_015942	AC	3	6	901832	901837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18552	NC_015942	CTC	2	6	901865	901870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18553	NC_015942	TCT	2	6	901882	901887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18554	NC_015942	CAG	2	6	901920	901925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18555	NC_015942	TTCTTG	2	12	901929	901940	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18556	NC_015942	GTG	2	6	901947	901952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18557	NC_015942	TAGGGT	2	12	901953	901964	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
18558	NC_015942	CGA	2	6	902022	902027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18559	NC_015942	CAC	2	6	902052	902057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18560	NC_015942	CA	3	6	902079	902084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18561	NC_015942	TATC	2	8	902131	902138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18562	NC_015942	GCG	2	6	902262	902267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199061
18563	NC_015942	CTG	2	6	902299	902304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199061
18564	NC_015942	CCG	2	6	902309	902314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199061
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18566	NC_015942	GGAG	2	8	902406	902413	25 %	0 %	75 %	0 %	344199061
18567	NC_015942	TAT	2	6	902418	902423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344199061
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18569	NC_015942	CAT	2	6	902501	902506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199061
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18572	NC_015942	GAG	2	6	902661	902666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199061
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18575	NC_015942	GCA	2	6	902814	902819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199061
18576	NC_015942	TGA	2	6	902921	902926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199061
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18579	NC_015942	TG	3	6	903179	903184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18580	NC_015942	TGG	2	6	903224	903229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18581	NC_015942	CGC	2	6	903242	903247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18582	NC_015942	GTCTGT	2	12	903317	903328	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18583	NC_015942	TGCT	2	8	903369	903376	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18584	NC_015942	TTA	2	6	903402	903407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18585	NC_015942	GAAAA	2	10	903432	903441	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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18588	NC_015942	CAA	2	6	903594	903599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344199062
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18590	NC_015942	CAA	2	6	903636	903641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344199062
18591	NC_015942	GCA	2	6	903668	903673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199062
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18593	NC_015942	GAA	2	6	903769	903774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199062
18594	NC_015942	CTT	2	6	903831	903836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344199062
18595	NC_015942	GCTG	2	8	903843	903850	0 %	25 %	50 %	25 %	344199062
18596	NC_015942	GGC	2	6	903905	903910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199062
18597	NC_015942	CTG	2	6	903931	903936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199062
18598	NC_015942	GCC	2	6	903968	903973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199062
18599	NC_015942	T	7	7	904011	904017	0 %	100 %	0 %	0 %	344199062
18600	NC_015942	GAGC	2	8	904077	904084	25 %	0 %	50 %	25 %	344199062
18601	NC_015942	CGA	2	6	904146	904151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199062
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18603	NC_015942	GCA	2	6	904226	904231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199062
18604	NC_015942	CTG	2	6	904270	904275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199062
18605	NC_015942	GCA	2	6	904322	904327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199062
18606	NC_015942	GCGCG	2	10	904356	904365	0 %	0 %	60 %	40 %	344199062
18607	NC_015942	AACG	2	8	904462	904469	50 %	0 %	25 %	25 %	344199062
18608	NC_015942	ACT	2	6	904473	904478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199062
18609	NC_015942	GC	3	6	904498	904503	0 %	0 %	50 %	50 %	344199062
18610	NC_015942	CCG	3	9	904590	904598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199062
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18612	NC_015942	C	6	6	904824	904829	0 %	0 %	0 %	100 %	344199062
18613	NC_015942	TGG	2	6	904850	904855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199062
18614	NC_015942	GAT	2	6	904858	904863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199062
18615	NC_015942	CGC	2	6	904874	904879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199062
18616	NC_015942	CCG	2	6	904939	904944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199062
18617	NC_015942	CAGA	2	8	904963	904970	50 %	0 %	25 %	25 %	344199062
18618	NC_015942	GGTT	2	8	905044	905051	0 %	50 %	50 %	0 %	344199062
18619	NC_015942	GCC	2	6	905059	905064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199062
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18622	NC_015942	TTG	2	6	905246	905251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344199062
18623	NC_015942	ACCA	2	8	905257	905264	50 %	0 %	0 %	50 %	344199062
18624	NC_015942	AGGA	2	8	905268	905275	50 %	0 %	50 %	0 %	344199062
18625	NC_015942	TCA	2	6	905333	905338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199062
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18629	NC_015942	TGA	2	6	905460	905465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199062
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18742	NC_015942	AAT	2	6	910978	910983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18989	NC_015942	ACCG	2	8	922527	922534	25 %	0 %	25 %	50 %	344199074
18990	NC_015942	GC	3	6	922552	922557	0 %	0 %	50 %	50 %	344199074
18991	NC_015942	CTG	2	6	922583	922588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199074
18992	NC_015942	CTA	2	6	922603	922608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199074
18993	NC_015942	C	7	7	922640	922646	0 %	0 %	0 %	100 %	344199074
18994	NC_015942	GCT	2	6	922660	922665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199074
18995	NC_015942	CAG	2	6	922724	922729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199074
18996	NC_015942	GGT	2	6	922834	922839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199074
18997	NC_015942	CGG	2	6	923011	923016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199074
18998	NC_015942	CGG	2	6	923113	923118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199074
18999	NC_015942	GCC	2	6	923153	923158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199074
19000	NC_015942	ACC	2	6	923225	923230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199074

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