MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_015942	GCT	2	6	850495	850500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199015
17502	NC_015942	GGT	2	6	850508	850513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199015
17503	NC_015942	TCC	2	6	850554	850559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199015
17504	NC_015942	CTC	2	6	850565	850570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199015
17505	NC_015942	TGC	2	6	850585	850590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199015
17506	NC_015942	TCT	2	6	850591	850596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344199015
17507	NC_015942	GC	3	6	850664	850669	0 %	0 %	50 %	50 %	344199015
17508	NC_015942	TCA	2	6	850717	850722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199015
17509	NC_015942	GCG	2	6	850730	850735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199015
17510	NC_015942	A	6	6	850844	850849	100 %	0 %	0 %	0 %	344199015
17511	NC_015942	CCG	2	6	850851	850856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199015
17512	NC_015942	CGCA	2	8	850899	850906	25 %	0 %	25 %	50 %	344199015
17513	NC_015942	CCA	2	6	850909	850914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199015
17514	NC_015942	GC	4	8	850927	850934	0 %	0 %	50 %	50 %	344199015
17515	NC_015942	CGC	2	6	850954	850959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199015
17516	NC_015942	GCA	2	6	850984	850989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199015
17517	NC_015942	GGTGTC	2	12	851012	851023	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344199015
17518	NC_015942	ATC	2	6	851049	851054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199015
17519	NC_015942	A	7	7	851106	851112	100 %	0 %	0 %	0 %	344199015
17520	NC_015942	CGG	2	6	851219	851224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199015
17521	NC_015942	GGT	2	6	851239	851244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199015
17522	NC_015942	GCT	2	6	851296	851301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199015
17523	NC_015942	CGC	2	6	851459	851464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199016
17524	NC_015942	CGC	2	6	851502	851507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199016
17525	NC_015942	GT	3	6	851605	851610	0 %	50 %	50 %	0 %	344199016
17526	NC_015942	CGC	2	6	851668	851673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199016
17527	NC_015942	GGC	2	6	851676	851681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199016
17528	NC_015942	GTC	2	6	851682	851687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199016
17529	NC_015942	CGG	2	6	851693	851698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199016
17530	NC_015942	TGGC	2	8	851703	851710	0 %	25 %	50 %	25 %	344199016
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17533	NC_015942	CTG	2	6	851881	851886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199016
17534	NC_015942	GCCA	2	8	851929	851936	25 %	0 %	25 %	50 %	344199016
17535	NC_015942	TGC	2	6	851958	851963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199016
17536	NC_015942	GATC	2	8	852010	852017	25 %	25 %	25 %	25 %	344199016
17537	NC_015942	CCG	2	6	852091	852096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199016
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17539	NC_015942	TG	3	6	852130	852135	0 %	50 %	50 %	0 %	344199016
17540	NC_015942	GCT	2	6	852136	852141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199016
17541	NC_015942	CAGT	2	8	852157	852164	25 %	25 %	25 %	25 %	344199016
17542	NC_015942	GATC	2	8	852181	852188	25 %	25 %	25 %	25 %	344199016
17543	NC_015942	CGC	2	6	852203	852208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199017
17544	NC_015942	CAG	2	6	852236	852241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199017
17545	NC_015942	CAC	2	6	852293	852298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199017
17546	NC_015942	TCA	2	6	852381	852386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199017
17547	NC_015942	TGGA	2	8	852389	852396	25 %	25 %	50 %	0 %	344199017
17548	NC_015942	TGA	2	6	852527	852532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199017
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17550	NC_015942	CAG	2	6	852701	852706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199017
17551	NC_015942	CAG	2	6	852812	852817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199017
17552	NC_015942	GCA	2	6	852847	852852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199017
17553	NC_015942	CTG	2	6	852872	852877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199017
17554	NC_015942	TTC	2	6	852921	852926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344199017
17555	NC_015942	CCT	2	6	852946	852951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199017
17556	NC_015942	GAA	2	6	852989	852994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199017
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17560	NC_015942	CCACG	2	10	853162	853171	20 %	0 %	20 %	60 %	344199017
17561	NC_015942	CGG	2	6	853217	853222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199017
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17565	NC_015942	CTG	2	6	853310	853315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199017
17566	NC_015942	GGCAT	2	10	853353	853362	20 %	20 %	40 %	20 %	344199017
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17571	NC_015942	CAC	2	6	853814	853819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199017
17572	NC_015942	TTC	2	6	853857	853862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344199017
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17580	NC_015942	T	6	6	854199	854204	0 %	100 %	0 %	0 %	344199018
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17584	NC_015942	GTT	2	6	854370	854375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344199018
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17587	NC_015942	TTGC	2	8	854485	854492	0 %	50 %	25 %	25 %	344199018
17588	NC_015942	GCA	2	6	854550	854555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199018
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17590	NC_015942	CGCC	2	8	854679	854686	0 %	0 %	25 %	75 %	344199018
17591	NC_015942	TCA	2	6	854810	854815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199018
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17604	NC_015942	G	6	6	855301	855306	0 %	0 %	100 %	0 %	344199018
17605	NC_015942	AT	3	6	855351	855356	50 %	50 %	0 %	0 %	344199018
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17609	NC_015942	CAA	2	6	855519	855524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344199018
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17611	NC_015942	T	6	6	855584	855589	0 %	100 %	0 %	0 %	344199018
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17617	NC_015942	TCATC	2	10	855797	855806	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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17619	NC_015942	TC	4	8	855919	855926	0 %	50 %	0 %	50 %	344199019
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17977	NC_015942	AG	3	6	872198	872203	50 %	0 %	50 %	0 %	344199037
17978	NC_015942	CAG	2	6	872227	872232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199037
17979	NC_015942	GCA	2	6	872320	872325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199037
17980	NC_015942	GGCGT	2	10	872437	872446	0 %	20 %	60 %	20 %	344199037
17981	NC_015942	CAG	2	6	872451	872456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199037
17982	NC_015942	AT	3	6	872563	872568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17983	NC_015942	CGC	2	6	872597	872602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17984	NC_015942	CAGA	2	8	872669	872676	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17985	NC_015942	AGT	2	6	872779	872784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199038
17986	NC_015942	GGGC	2	8	872844	872851	0 %	0 %	75 %	25 %	344199038
17987	NC_015942	GTG	2	6	872858	872863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199038
17988	NC_015942	TCA	2	6	872871	872876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199038
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17990	NC_015942	TGG	2	6	872913	872918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199038
17991	NC_015942	CCAT	2	8	872925	872932	25 %	25 %	0 %	50 %	344199038
17992	NC_015942	CTG	2	6	872945	872950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199038
17993	NC_015942	CAG	2	6	872983	872988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199038
17994	NC_015942	GCC	2	6	872992	872997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199038
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17996	NC_015942	CTG	2	6	873062	873067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199038
17997	NC_015942	GCCA	2	8	873133	873140	25 %	0 %	25 %	50 %	344199038
17998	NC_015942	CGC	2	6	873157	873162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199038
17999	NC_015942	CAT	2	6	873169	873174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199038
18000	NC_015942	TATCGG	2	12	873292	873303	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344199038

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