MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_015942	GGT	3	9	826624	826632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199001
17002	NC_015942	CTC	2	6	826646	826651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199001
17003	NC_015942	GGT	2	6	826720	826725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199001
17004	NC_015942	GAG	2	6	826734	826739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199001
17005	NC_015942	GGCCAG	2	12	826895	826906	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344199001
17006	NC_015942	GTG	2	6	826907	826912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199001
17007	NC_015942	TGA	3	9	826923	826931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199001
17008	NC_015942	CCA	2	6	826960	826965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199001
17009	NC_015942	CCCT	2	8	826994	827001	0 %	25 %	0 %	75 %	344199001
17010	NC_015942	GCA	2	6	827055	827060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199001
17011	NC_015942	GAA	2	6	827087	827092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199001
17012	NC_015942	CTG	2	6	827126	827131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199001
17013	NC_015942	CG	4	8	827132	827139	0 %	0 %	50 %	50 %	344199001
17014	NC_015942	TGG	2	6	827148	827153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199001
17015	NC_015942	TCG	2	6	827157	827162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199001
17016	NC_015942	GCC	2	6	827183	827188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199001
17017	NC_015942	TCA	2	6	827193	827198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199001
17018	NC_015942	CAT	2	6	827224	827229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199001
17019	NC_015942	GGC	2	6	827237	827242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199001
17020	NC_015942	TGA	2	6	827262	827267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199001
17021	NC_015942	GCG	3	9	827339	827347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199001
17022	NC_015942	GGC	3	9	827350	827358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199001
17023	NC_015942	GGA	2	6	827359	827364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199001
17024	NC_015942	GGTC	2	8	827365	827372	0 %	25 %	50 %	25 %	344199001
17025	NC_015942	ATC	2	6	827396	827401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199001
17026	NC_015942	TCCT	2	8	827408	827415	0 %	50 %	0 %	50 %	344199001
17027	NC_015942	GAG	2	6	827438	827443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199001
17028	NC_015942	GCC	4	12	827489	827500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199001
17029	NC_015942	GTG	2	6	827516	827521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199001
17030	NC_015942	CATGG	2	10	827530	827539	20 %	20 %	40 %	20 %	344199001
17031	NC_015942	ACCG	2	8	827604	827611	25 %	0 %	25 %	50 %	344199001
17032	NC_015942	GC	3	6	827629	827634	0 %	0 %	50 %	50 %	344199001
17033	NC_015942	CTG	2	6	827660	827665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199001
17034	NC_015942	CTA	2	6	827680	827685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199001
17035	NC_015942	C	7	7	827717	827723	0 %	0 %	0 %	100 %	344199001
17036	NC_015942	GCT	2	6	827737	827742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199001
17037	NC_015942	CAG	2	6	827801	827806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199001
17038	NC_015942	GGT	2	6	827911	827916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199001
17039	NC_015942	CGG	2	6	828088	828093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199001
17040	NC_015942	CGG	2	6	828190	828195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199001
17041	NC_015942	GCC	2	6	828230	828235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199001
17042	NC_015942	ACC	2	6	828302	828307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199001
17043	NC_015942	CGC	2	6	828397	828402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199001
17044	NC_015942	GGGC	2	8	828454	828461	0 %	0 %	75 %	25 %	344199001
17045	NC_015942	ACA	2	6	828480	828485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344199001
17046	NC_015942	AGG	2	6	828589	828594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199001
17047	NC_015942	GCC	2	6	828638	828643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199001
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17050	NC_015942	CAT	2	6	828730	828735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199001
17051	NC_015942	CTG	2	6	828737	828742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199001
17052	NC_015942	GGT	2	6	828764	828769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199001
17053	NC_015942	CGGTGG	2	12	828804	828815	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	344199001
17054	NC_015942	GGCG	2	8	828835	828842	0 %	0 %	75 %	25 %	344199001
17055	NC_015942	GGC	2	6	828844	828849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199001
17056	NC_015942	GTG	2	6	828860	828865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199001
17057	NC_015942	CTC	2	6	828890	828895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199001
17058	NC_015942	TGC	2	6	828963	828968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199001
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17060	NC_015942	CAT	2	6	829021	829026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199001
17061	NC_015942	TGA	2	6	829053	829058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199001
17062	NC_015942	GCC	2	6	829067	829072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199001
17063	NC_015942	TGG	2	6	829077	829082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199001
17064	NC_015942	GCT	2	6	829111	829116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199001
17065	NC_015942	GCG	2	6	829150	829155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199001
17066	NC_015942	GAT	2	6	829167	829172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199001
17067	NC_015942	GAG	2	6	829185	829190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17068	NC_015942	ATG	2	6	829197	829202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199002
17069	NC_015942	GCT	2	6	829247	829252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199002
17070	NC_015942	TGG	2	6	829266	829271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199002
17071	NC_015942	ATG	2	6	829284	829289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199002
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17076	NC_015942	TGG	2	6	829405	829410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199002
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17079	NC_015942	CCT	2	6	829460	829465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199002
17080	NC_015942	TTCT	2	8	829695	829702	0 %	75 %	0 %	25 %	344199002
17081	NC_015942	GCT	2	6	829703	829708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199002
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17083	NC_015942	GCG	2	6	829873	829878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199002
17084	NC_015942	ACGG	2	8	829960	829967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17085	NC_015942	AAGG	2	8	829988	829995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17086	NC_015942	CAA	2	6	830049	830054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17087	NC_015942	CGG	3	9	830108	830116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199003
17088	NC_015942	GGGCA	2	10	830212	830221	20 %	0 %	60 %	20 %	344199003
17089	NC_015942	TGGC	2	8	830286	830293	0 %	25 %	50 %	25 %	344199003
17090	NC_015942	TGC	2	6	830385	830390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199003
17091	NC_015942	G	6	6	830392	830397	0 %	0 %	100 %	0 %	344199003
17092	NC_015942	CAT	2	6	830400	830405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199003
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17094	NC_015942	AATA	2	8	830529	830536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17095	NC_015942	CCA	2	6	830568	830573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199004
17096	NC_015942	AAAG	2	8	830584	830591	75 %	0 %	25 %	0 %	344199004
17097	NC_015942	TGC	2	6	830619	830624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199004
17098	NC_015942	ATG	2	6	830638	830643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199004
17099	NC_015942	CCAA	2	8	830695	830702	50 %	0 %	0 %	50 %	344199004
17100	NC_015942	GGA	2	6	830787	830792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199004
17101	NC_015942	CAAA	2	8	830829	830836	75 %	0 %	0 %	25 %	344199004
17102	NC_015942	CTG	2	6	830865	830870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17103	NC_015942	CGG	2	6	830913	830918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17104	NC_015942	CTG	2	6	830936	830941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17105	NC_015942	CAG	2	6	830960	830965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17106	NC_015942	CTA	2	6	831000	831005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17107	NC_015942	CGGT	2	8	831006	831013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17108	NC_015942	CTGG	2	8	831043	831050	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17109	NC_015942	GGGCC	2	10	831314	831323	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17110	NC_015942	CGG	2	6	831346	831351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17111	NC_015942	GAA	2	6	831392	831397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17112	NC_015942	CCGTAT	2	12	831581	831592	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344199005
17113	NC_015942	CAT	2	6	831809	831814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17114	NC_015942	CCCT	2	8	831914	831921	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
17115	NC_015942	GC	4	8	831934	831941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17116	NC_015942	TCG	2	6	831977	831982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17117	NC_015942	TCC	2	6	831992	831997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17118	NC_015942	GCC	2	6	832008	832013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17119	NC_015942	CAT	2	6	832156	832161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199006
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17121	NC_015942	TAA	2	6	832188	832193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344199006
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17130	NC_015942	CGT	2	6	832437	832442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17135	NC_015942	CTG	2	6	832673	832678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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