MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_015942	GCTGGA	2	12	670666	670677	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344198860
14002	NC_015942	TGG	2	6	670864	670869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198860
14003	NC_015942	GCG	2	6	670916	670921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198860
14004	NC_015942	GC	3	6	670924	670929	0 %	0 %	50 %	50 %	344198860
14005	NC_015942	GCA	2	6	670947	670952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198860
14006	NC_015942	GGTCAC	2	12	671008	671019	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344198860
14007	NC_015942	CGG	2	6	671080	671085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198860
14008	NC_015942	GCA	2	6	671108	671113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198860
14009	NC_015942	T	6	6	671115	671120	0 %	100 %	0 %	0 %	344198860
14010	NC_015942	GCGG	2	8	671222	671229	0 %	0 %	75 %	25 %	344198861
14011	NC_015942	GGC	2	6	671254	671259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198861
14012	NC_015942	GGT	2	6	671288	671293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198861
14013	NC_015942	G	6	6	671362	671367	0 %	0 %	100 %	0 %	344198861
14014	NC_015942	GC	3	6	671399	671404	0 %	0 %	50 %	50 %	344198861
14015	NC_015942	GCC	2	6	671420	671425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198861
14016	NC_015942	CGG	2	6	671451	671456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198861
14017	NC_015942	TTCCG	2	10	671487	671496	0 %	40 %	20 %	40 %	344198861
14018	NC_015942	TGG	2	6	671497	671502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198861
14019	NC_015942	G	6	6	671541	671546	0 %	0 %	100 %	0 %	344198861
14020	NC_015942	CGC	2	6	671623	671628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198861
14021	NC_015942	CAG	2	6	671693	671698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198861
14022	NC_015942	G	8	8	671725	671732	0 %	0 %	100 %	0 %	344198861
14023	NC_015942	CTG	2	6	671873	671878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198861
14024	NC_015942	GCC	2	6	671962	671967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198861
14025	NC_015942	CTCA	2	8	671986	671993	25 %	25 %	0 %	50 %	344198861
14026	NC_015942	GCG	2	6	672030	672035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198861
14027	NC_015942	ATA	2	6	672060	672065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198861
14028	NC_015942	TAG	2	6	672108	672113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198861
14029	NC_015942	AG	3	6	672182	672187	50 %	0 %	50 %	0 %	344198861
14030	NC_015942	GTG	2	6	672257	672262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198861
14031	NC_015942	GTG	2	6	672323	672328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198861
14032	NC_015942	G	8	8	672487	672494	0 %	0 %	100 %	0 %	344198861
14033	NC_015942	GGC	2	6	672514	672519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198861
14034	NC_015942	GCT	2	6	672520	672525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198861
14035	NC_015942	GC	3	6	672529	672534	0 %	0 %	50 %	50 %	344198861
14036	NC_015942	GCTG	2	8	672579	672586	0 %	25 %	50 %	25 %	344198861
14037	NC_015942	G	6	6	672600	672605	0 %	0 %	100 %	0 %	344198861
14038	NC_015942	CGG	2	6	672612	672617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198861
14039	NC_015942	GCG	2	6	672631	672636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198861
14040	NC_015942	TGC	2	6	672763	672768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198861
14041	NC_015942	TGG	2	6	672784	672789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198861
14042	NC_015942	ATT	2	6	672869	672874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198862
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14044	NC_015942	CGG	2	6	673099	673104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198862
14045	NC_015942	CG	3	6	673153	673158	0 %	0 %	50 %	50 %	344198862
14046	NC_015942	AAGCG	2	10	673209	673218	40 %	0 %	40 %	20 %	344198862
14047	NC_015942	GTGC	2	8	673238	673245	0 %	25 %	50 %	25 %	344198862
14048	NC_015942	GCC	2	6	673254	673259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198862
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14050	NC_015942	GTG	2	6	673309	673314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198862
14051	NC_015942	ACC	2	6	673323	673328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198862
14052	NC_015942	ATCGC	2	10	673359	673368	20 %	20 %	20 %	40 %	344198862
14053	NC_015942	GCC	2	6	673449	673454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198862
14054	NC_015942	GGC	2	6	673546	673551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198862
14055	NC_015942	CG	3	6	673694	673699	0 %	0 %	50 %	50 %	344198862
14056	NC_015942	GCGTT	2	10	673775	673784	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14057	NC_015942	A	7	7	673802	673808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_015942	AT	3	6	673840	673845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_015942	GAT	2	6	673876	673881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_015942	GGTC	2	8	673972	673979	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14061	NC_015942	GGCAT	2	10	673980	673989	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14062	NC_015942	AT	3	6	673988	673993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_015942	GCT	2	6	673994	673999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14064	NC_015942	TGG	2	6	674074	674079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198863
14065	NC_015942	ACC	2	6	674127	674132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198863
14066	NC_015942	CGC	2	6	674137	674142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198863
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14068	NC_015942	A	6	6	674262	674267	100 %	0 %	0 %	0 %	344198863
14069	NC_015942	CCA	2	6	674335	674340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198863
14070	NC_015942	CGG	2	6	674456	674461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198863
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14082	NC_015942	GCA	2	6	675168	675173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198863
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14085	NC_015942	ATG	2	6	675496	675501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198863
14086	NC_015942	TAC	3	9	675510	675518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198863
14087	NC_015942	CAG	2	6	675530	675535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198863
14088	NC_015942	GTGAG	2	10	675550	675559	20 %	20 %	60 %	0 %	344198863
14089	NC_015942	GGC	2	6	675740	675745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198863
14090	NC_015942	ATG	2	6	675754	675759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198863
14091	NC_015942	TTTC	2	8	675775	675782	0 %	75 %	0 %	25 %	344198863
14092	NC_015942	CTA	2	6	675815	675820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198863
14093	NC_015942	ACA	3	9	675825	675833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198863
14094	NC_015942	TTC	2	6	675860	675865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198863
14095	NC_015942	TA	3	6	675912	675917	50 %	50 %	0 %	0 %	344198863
14096	NC_015942	ACT	2	6	675931	675936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198863
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14100	NC_015942	AT	3	6	676103	676108	50 %	50 %	0 %	0 %	344198863
14101	NC_015942	GCA	2	6	676125	676130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198863
14102	NC_015942	TGCC	2	8	676144	676151	0 %	25 %	25 %	50 %	344198863
14103	NC_015942	A	6	6	676208	676213	100 %	0 %	0 %	0 %	344198863
14104	NC_015942	TCT	2	6	676241	676246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198863
14105	NC_015942	TAA	2	6	676289	676294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198863
14106	NC_015942	GAT	2	6	676325	676330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198863
14107	NC_015942	CTT	2	6	676340	676345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198863
14108	NC_015942	AT	3	6	676373	676378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_015942	GGC	2	6	676379	676384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14110	NC_015942	GCC	3	9	676407	676415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14111	NC_015942	CCA	2	6	676586	676591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198864
14112	NC_015942	GACCGG	2	12	676623	676634	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344198864
14113	NC_015942	CGA	2	6	676687	676692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198864
14114	NC_015942	CTC	2	6	676710	676715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198864
14115	NC_015942	TGC	2	6	676786	676791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198864
14116	NC_015942	GCC	2	6	676804	676809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198864
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14119	NC_015942	TCTGC	2	10	677066	677075	0 %	40 %	20 %	40 %	344198864
14120	NC_015942	TTA	2	6	677090	677095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198864
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14122	NC_015942	CCG	2	6	677284	677289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198864
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14245	NC_015942	CGC	2	6	683597	683602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198869
14246	NC_015942	CAC	2	6	683700	683705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198869
14247	NC_015942	CCCTAC	2	12	683847	683858	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	344198869
14248	NC_015942	GGC	2	6	683877	683882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198869
14249	NC_015942	TGG	2	6	683890	683895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198869
14250	NC_015942	CGTG	2	8	683960	683967	0 %	25 %	50 %	25 %	344198869
14251	NC_015942	ACG	2	6	684139	684144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198869
14252	NC_015942	CAA	2	6	684212	684217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198869
14253	NC_015942	GGCCTC	2	12	684252	684263	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344198869
14254	NC_015942	GTGG	2	8	684365	684372	0 %	25 %	75 %	0 %	344198869
14255	NC_015942	ATG	2	6	684378	684383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198869
14256	NC_015942	CTG	2	6	684472	684477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198869
14257	NC_015942	CGA	2	6	684578	684583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198869
14258	NC_015942	ATC	2	6	684667	684672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198869
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14268	NC_015942	TTTA	2	8	685179	685186	25 %	75 %	0 %	0 %	344198869
14269	NC_015942	GAT	2	6	685200	685205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198869
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14274	NC_015942	TGG	2	6	685321	685326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198869
14275	NC_015942	GCC	2	6	685487	685492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198869
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14281	NC_015942	CCA	2	6	685813	685818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198869
14282	NC_015942	AGG	2	6	685840	685845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198869
14283	NC_015942	GCC	2	6	685890	685895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198869
14284	NC_015942	CCG	2	6	685996	686001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14285	NC_015942	ATA	2	6	686065	686070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14286	NC_015942	GCC	2	6	686149	686154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198870
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14308	NC_015942	TGA	2	6	687287	687292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198870
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14315	NC_015942	GAAA	2	8	687609	687616	75 %	0 %	25 %	0 %	344198870
14316	NC_015942	GCC	2	6	687667	687672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198870
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14319	NC_015942	GCT	2	6	687708	687713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198870
14320	NC_015942	GACC	2	8	687771	687778	25 %	0 %	25 %	50 %	344198870
14321	NC_015942	GC	3	6	687895	687900	0 %	0 %	50 %	50 %	344198870
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14325	NC_015942	GAG	2	6	688084	688089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198870
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14327	NC_015942	GAG	2	6	688198	688203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198870
14328	NC_015942	GA	3	6	688221	688226	50 %	0 %	50 %	0 %	344198871
14329	NC_015942	AGA	2	6	688276	688281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198871
14330	NC_015942	GAT	2	6	688347	688352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198871
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14332	NC_015942	GAT	3	9	688475	688483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198871
14333	NC_015942	ATG	2	6	688513	688518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198871
14334	NC_015942	ATA	2	6	688525	688530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198871
14335	NC_015942	CCTT	2	8	688546	688553	0 %	50 %	0 %	50 %	344198871
14336	NC_015942	CGGG	2	8	688567	688574	0 %	0 %	75 %	25 %	344198871
14337	NC_015942	CAA	2	6	688665	688670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198871
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14341	NC_015942	GTCAAA	2	12	688806	688817	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	344198871
14342	NC_015942	TGGG	2	8	688832	688839	0 %	25 %	75 %	0 %	344198871
14343	NC_015942	AGA	2	6	688840	688845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198871
14344	NC_015942	CGGT	2	8	688870	688877	0 %	25 %	50 %	25 %	344198871
14345	NC_015942	TCT	2	6	688899	688904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198871
14346	NC_015942	ATC	2	6	689015	689020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198871
14347	NC_015942	TGA	2	6	689050	689055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198871
14348	NC_015942	TCA	2	6	689119	689124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198871
14349	NC_015942	GAA	2	6	689187	689192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198871
14350	NC_015942	CAC	2	6	689213	689218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198871
14351	NC_015942	TAAG	2	8	689230	689237	50 %	25 %	25 %	0 %	344198871
14352	NC_015942	GTT	2	6	689259	689264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198871
14353	NC_015942	CAT	2	6	689312	689317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198871
14354	NC_015942	A	7	7	689336	689342	100 %	0 %	0 %	0 %	344198871
14355	NC_015942	TA	3	6	689463	689468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14356	NC_015942	GAT	2	6	689471	689476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14357	NC_015942	AT	3	6	689493	689498	50 %	50 %	0 %	0 %	344198872
14358	NC_015942	AT	3	6	689511	689516	50 %	50 %	0 %	0 %	344198872
14359	NC_015942	GGA	2	6	689527	689532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198872
14360	NC_015942	TA	3	6	689601	689606	50 %	50 %	0 %	0 %	344198872
14361	NC_015942	TCCA	2	8	689607	689614	25 %	25 %	0 %	50 %	344198872
14362	NC_015942	CAA	2	6	689618	689623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198872
14363	NC_015942	TC	3	6	689668	689673	0 %	50 %	0 %	50 %	344198872
14364	NC_015942	TCC	2	6	689704	689709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198872
14365	NC_015942	GCA	2	6	689731	689736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198872
14366	NC_015942	GCG	2	6	689754	689759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198872
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14368	NC_015942	CTT	2	6	689815	689820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198872
14369	NC_015942	CCG	2	6	689936	689941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198872
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14372	NC_015942	AAAG	2	8	690060	690067	75 %	0 %	25 %	0 %	344198872
14373	NC_015942	AG	3	6	690121	690126	50 %	0 %	50 %	0 %	344198872
14374	NC_015942	TGT	2	6	690136	690141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198872
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14396	NC_015942	ATGAG	2	10	691265	691274	40 %	20 %	40 %	0 %	344198873
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14480	NC_015942	CAGC	2	8	695125	695132	25 %	0 %	25 %	50 %	344198877
14481	NC_015942	GAG	2	6	695180	695185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198877
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14483	NC_015942	TGA	2	6	695244	695249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198877
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