MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_015942	GCGAC	2	10	645942	645951	20 %	0 %	40 %	40 %	344198832
13502	NC_015942	TCG	2	6	645952	645957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198832
13503	NC_015942	ATC	2	6	645975	645980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198832
13504	NC_015942	TC	3	6	646048	646053	0 %	50 %	0 %	50 %	344198832
13505	NC_015942	ACC	2	6	646089	646094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198832
13506	NC_015942	GCCTGG	2	12	646096	646107	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344198832
13507	NC_015942	CGG	2	6	646130	646135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198832
13508	NC_015942	TGG	2	6	646213	646218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198832
13509	NC_015942	CGG	2	6	646226	646231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198832
13510	NC_015942	GGA	2	6	646238	646243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198832
13511	NC_015942	GCG	2	6	646248	646253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198832
13512	NC_015942	GGT	2	6	646283	646288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198832
13513	NC_015942	TAT	2	6	646346	646351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198832
13514	NC_015942	CGG	3	9	646369	646377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198832
13515	NC_015942	AGC	2	6	646397	646402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198832
13516	NC_015942	TG	3	6	646413	646418	0 %	50 %	50 %	0 %	344198832
13517	NC_015942	CCG	2	6	646426	646431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198832
13518	NC_015942	CTG	2	6	646532	646537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198833
13519	NC_015942	GCC	2	6	646538	646543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198833
13520	NC_015942	GCG	2	6	646550	646555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198833
13521	NC_015942	AGA	2	6	646615	646620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198833
13522	NC_015942	CAG	2	6	646680	646685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198833
13523	NC_015942	ACA	2	6	646737	646742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198833
13524	NC_015942	CTG	2	6	646751	646756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198833
13525	NC_015942	G	6	6	646760	646765	0 %	0 %	100 %	0 %	344198833
13526	NC_015942	TGA	2	6	646816	646821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198833
13527	NC_015942	CGC	2	6	646930	646935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198833
13528	NC_015942	CTG	3	9	646955	646963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198833
13529	NC_015942	AACA	2	8	646991	646998	75 %	0 %	0 %	25 %	344198833
13530	NC_015942	GC	3	6	646999	647004	0 %	0 %	50 %	50 %	344198833
13531	NC_015942	GGTG	2	8	647017	647024	0 %	25 %	75 %	0 %	344198833
13532	NC_015942	GCC	2	6	647030	647035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198833
13533	NC_015942	TGG	2	6	647067	647072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198833
13534	NC_015942	GAG	2	6	647156	647161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198833
13535	NC_015942	CTG	2	6	647171	647176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198833
13536	NC_015942	CCG	2	6	647247	647252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198833
13537	NC_015942	A	7	7	647295	647301	100 %	0 %	0 %	0 %	344198833
13538	NC_015942	CGG	2	6	647332	647337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198833
13539	NC_015942	CGG	2	6	647424	647429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198833
13540	NC_015942	CGC	2	6	647593	647598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198833
13541	NC_015942	CTG	3	9	647633	647641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198833
13542	NC_015942	TAA	2	6	647650	647655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198833
13543	NC_015942	TGG	2	6	647701	647706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198833
13544	NC_015942	CGG	2	6	647814	647819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198833
13545	NC_015942	GCCT	2	8	647850	647857	0 %	25 %	25 %	50 %	344198833
13546	NC_015942	ATT	2	6	647879	647884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198833
13547	NC_015942	GAA	2	6	647897	647902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198833
13548	NC_015942	GCC	2	6	647927	647932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198833
13549	NC_015942	CGT	2	6	647993	647998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198833
13550	NC_015942	GGC	2	6	648001	648006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198833
13551	NC_015942	TAT	2	6	648090	648095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198833
13552	NC_015942	A	7	7	648118	648124	100 %	0 %	0 %	0 %	344198833
13553	NC_015942	GAT	2	6	648154	648159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198834
13554	NC_015942	CTGG	2	8	648187	648194	0 %	25 %	50 %	25 %	344198834
13555	NC_015942	TGG	2	6	648269	648274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198834
13556	NC_015942	TCC	2	6	648278	648283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198834
13557	NC_015942	CAAGCT	2	12	648285	648296	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344198834
13558	NC_015942	GGT	3	9	648300	648308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198834
13559	NC_015942	TGA	2	6	648312	648317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198834
13560	NC_015942	GGC	2	6	648351	648356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198834
13561	NC_015942	TGA	2	6	648451	648456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198834
13562	NC_015942	AAT	2	6	648458	648463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13563	NC_015942	CCG	2	6	648482	648487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13564	NC_015942	CTG	2	6	648511	648516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198835
13565	NC_015942	GC	3	6	648612	648617	0 %	0 %	50 %	50 %	344198835
13566	NC_015942	ATA	2	6	648621	648626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198835
13567	NC_015942	CG	3	6	648640	648645	0 %	0 %	50 %	50 %	344198835
13568	NC_015942	CGC	2	6	648687	648692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198835
13569	NC_015942	TAG	2	6	648715	648720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198835
13570	NC_015942	GAG	2	6	648750	648755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198835
13571	NC_015942	GAT	2	6	648759	648764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198835
13572	NC_015942	TCC	2	6	648868	648873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198835
13573	NC_015942	TGA	2	6	648953	648958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198835
13574	NC_015942	CCG	3	9	648965	648973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198835
13575	NC_015942	CCG	2	6	648977	648982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198835
13576	NC_015942	ATA	2	6	649002	649007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198835
13577	NC_015942	GCT	2	6	649188	649193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198835
13578	NC_015942	CGA	2	6	649284	649289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198836
13579	NC_015942	GGCC	2	8	649326	649333	0 %	0 %	50 %	50 %	344198836
13580	NC_015942	TGC	2	6	649361	649366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198836
13581	NC_015942	TGG	2	6	649418	649423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198836
13582	NC_015942	GGT	2	6	649459	649464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198836
13583	NC_015942	CTGG	2	8	649506	649513	0 %	25 %	50 %	25 %	344198836
13584	NC_015942	GGCAG	2	10	649575	649584	20 %	0 %	60 %	20 %	344198836
13585	NC_015942	CGG	2	6	649671	649676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198836
13586	NC_015942	CTG	2	6	649711	649716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198836
13587	NC_015942	GTG	2	6	649717	649722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198836
13588	NC_015942	GC	3	6	649738	649743	0 %	0 %	50 %	50 %	344198836
13589	NC_015942	TGG	3	9	649818	649826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198836
13590	NC_015942	TGG	2	6	649919	649924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198836
13591	NC_015942	CCTGCG	2	12	649947	649958	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344198836
13592	NC_015942	TGG	2	6	650018	650023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198836
13593	NC_015942	ATG	2	6	650047	650052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198836
13594	NC_015942	GGC	2	6	650090	650095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198836
13595	NC_015942	CCG	2	6	650100	650105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198836
13596	NC_015942	TGA	2	6	650159	650164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198836
13597	NC_015942	GCT	2	6	650208	650213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198836
13598	NC_015942	GGT	2	6	650309	650314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198837
13599	NC_015942	GTTG	2	8	650433	650440	0 %	50 %	50 %	0 %	344198837
13600	NC_015942	GCC	2	6	650465	650470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198837
13601	NC_015942	GC	4	8	650486	650493	0 %	0 %	50 %	50 %	344198837
13602	NC_015942	GTG	2	6	650531	650536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198837
13603	NC_015942	GCG	2	6	650577	650582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198837
13604	NC_015942	GGC	2	6	650656	650661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198837
13605	NC_015942	GCGG	2	8	650743	650750	0 %	0 %	75 %	25 %	344198837
13606	NC_015942	GGA	2	6	650761	650766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198837
13607	NC_015942	GCC	2	6	650780	650785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198837
13608	NC_015942	CG	3	6	650905	650910	0 %	0 %	50 %	50 %	344198837
13609	NC_015942	AGG	2	6	650967	650972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198837
13610	NC_015942	GCG	2	6	651027	651032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198838
13611	NC_015942	GCC	2	6	651039	651044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198838
13612	NC_015942	GCG	2	6	651102	651107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198838
13613	NC_015942	CTG	2	6	651108	651113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198838
13614	NC_015942	TGA	2	6	651154	651159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198838
13615	NC_015942	AC	3	6	651278	651283	50 %	0 %	0 %	50 %	344198838
13616	NC_015942	ATG	3	9	651286	651294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198838
13617	NC_015942	TGC	2	6	651350	651355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198838
13618	NC_015942	CGG	2	6	651400	651405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198838
13619	NC_015942	GCG	2	6	651437	651442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198838
13620	NC_015942	GC	3	6	651468	651473	0 %	0 %	50 %	50 %	344198838
13621	NC_015942	GCA	2	6	651509	651514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198838
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13695	NC_015942	ATG	2	6	655376	655381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13719	NC_015942	TGC	2	6	656378	656383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198845
13720	NC_015942	GTG	3	9	656425	656433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198845
13721	NC_015942	A	7	7	656440	656446	100 %	0 %	0 %	0 %	344198845
13722	NC_015942	AC	3	6	656496	656501	50 %	0 %	0 %	50 %	344198845
13723	NC_015942	GATG	2	8	656556	656563	25 %	25 %	50 %	0 %	344198845
13724	NC_015942	GTATTG	2	12	656588	656599	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	344198845
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13727	NC_015942	CCA	2	6	656729	656734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198846
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13730	NC_015942	GCTTG	2	10	656817	656826	0 %	40 %	40 %	20 %	344198846
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13732	NC_015942	TCC	2	6	656955	656960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198846
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13738	NC_015942	ACC	2	6	657042	657047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198846
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13982	NC_015942	CGC	3	9	669692	669700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198858
13983	NC_015942	TCA	2	6	669706	669711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198858
13984	NC_015942	TCA	2	6	669752	669757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198858
13985	NC_015942	GCC	2	6	669759	669764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198858
13986	NC_015942	TGC	2	6	669808	669813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198858
13987	NC_015942	AGT	3	9	670028	670036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198858
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13991	NC_015942	ACG	2	6	670271	670276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198859
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