MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015942	G	6	6	621547	621552	0 %	0 %	100 %	0 %	344198811
13002	NC_015942	TCT	2	6	621738	621743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198811
13003	NC_015942	TC	3	6	621796	621801	0 %	50 %	0 %	50 %	344198811
13004	NC_015942	ACC	2	6	621870	621875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198811
13005	NC_015942	CTG	2	6	621889	621894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198811
13006	NC_015942	A	6	6	621898	621903	100 %	0 %	0 %	0 %	344198811
13007	NC_015942	CTGC	2	8	621927	621934	0 %	25 %	25 %	50 %	344198811
13008	NC_015942	GGAA	2	8	622044	622051	50 %	0 %	50 %	0 %	344198812
13009	NC_015942	GGC	2	6	622151	622156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198812
13010	NC_015942	C	6	6	622168	622173	0 %	0 %	0 %	100 %	344198812
13011	NC_015942	GCC	2	6	622175	622180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198812
13012	NC_015942	CAC	2	6	622199	622204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198812
13013	NC_015942	C	7	7	622209	622215	0 %	0 %	0 %	100 %	344198812
13014	NC_015942	GAG	2	6	622278	622283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198812
13015	NC_015942	TGGT	2	8	622627	622634	0 %	50 %	50 %	0 %	344198812
13016	NC_015942	CCA	2	6	622670	622675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198812
13017	NC_015942	GGC	2	6	622763	622768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198812
13018	NC_015942	GC	3	6	622808	622813	0 %	0 %	50 %	50 %	344198812
13019	NC_015942	GCG	2	6	622819	622824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198812
13020	NC_015942	TGG	2	6	622831	622836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198812
13021	NC_015942	GCC	3	9	622851	622859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198812
13022	NC_015942	CTC	2	6	622878	622883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198812
13023	NC_015942	GC	3	6	622925	622930	0 %	0 %	50 %	50 %	344198812
13024	NC_015942	GCG	2	6	622960	622965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198812
13025	NC_015942	TCC	2	6	623024	623029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198812
13026	NC_015942	C	6	6	623028	623033	0 %	0 %	0 %	100 %	344198812
13027	NC_015942	TCG	2	6	623063	623068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198812
13028	NC_015942	GCA	2	6	623102	623107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198812
13029	NC_015942	T	6	6	623124	623129	0 %	100 %	0 %	0 %	344198812
13030	NC_015942	GGT	2	6	623241	623246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198812
13031	NC_015942	C	6	6	623301	623306	0 %	0 %	0 %	100 %	344198812
13032	NC_015942	GC	3	6	623402	623407	0 %	0 %	50 %	50 %	344198812
13033	NC_015942	GGC	2	6	623499	623504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198812
13034	NC_015942	CTC	2	6	623529	623534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198812
13035	NC_015942	AG	3	6	623549	623554	50 %	0 %	50 %	0 %	344198812
13036	NC_015942	TCA	2	6	623561	623566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198812
13037	NC_015942	TGG	2	6	623572	623577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198812
13038	NC_015942	AGA	2	6	623603	623608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198812
13039	NC_015942	GGC	2	6	623720	623725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198812
13040	NC_015942	AAC	2	6	623729	623734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198812
13041	NC_015942	CTGGAT	2	12	623772	623783	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344198812
13042	NC_015942	CGC	2	6	623789	623794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198812
13043	NC_015942	CG	3	6	623821	623826	0 %	0 %	50 %	50 %	344198812
13044	NC_015942	TTG	2	6	623836	623841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198812
13045	NC_015942	TCC	2	6	623866	623871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198812
13046	NC_015942	TC	3	6	623927	623932	0 %	50 %	0 %	50 %	344198812
13047	NC_015942	CG	3	6	623955	623960	0 %	0 %	50 %	50 %	344198812
13048	NC_015942	TCA	2	6	623963	623968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198812
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13050	NC_015942	GGC	2	6	624076	624081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198812
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13053	NC_015942	CCG	2	6	624259	624264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198812
13054	NC_015942	TGG	2	6	624501	624506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198812
13055	NC_015942	CTG	2	6	624909	624914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198812
13056	NC_015942	TTGA	2	8	625023	625030	25 %	50 %	25 %	0 %	344198812
13057	NC_015942	GGC	2	6	625064	625069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198812
13058	NC_015942	GAT	2	6	625071	625076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198812
13059	NC_015942	CCG	2	6	625085	625090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198812
13060	NC_015942	T	6	6	625092	625097	0 %	100 %	0 %	0 %	344198812
13061	NC_015942	CTGG	2	8	625110	625117	0 %	25 %	50 %	25 %	344198812
13062	NC_015942	GGA	2	6	625127	625132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198812
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13064	NC_015942	CCG	2	6	625247	625252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198812
13065	NC_015942	GGC	2	6	625273	625278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198812
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13069	NC_015942	GCGG	2	8	625433	625440	0 %	0 %	75 %	25 %	344198812
13070	NC_015942	CTC	2	6	625494	625499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198812
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13072	NC_015942	GACC	2	8	625583	625590	25 %	0 %	25 %	50 %	344198812
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13076	NC_015942	CCTG	2	8	625805	625812	0 %	25 %	25 %	50 %	344198812
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13088	NC_015942	GC	3	6	626771	626776	0 %	0 %	50 %	50 %	344198812
13089	NC_015942	GTG	2	6	626844	626849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198812
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13092	NC_015942	AGGG	2	8	627001	627008	25 %	0 %	75 %	0 %	344198812
13093	NC_015942	GTC	2	6	627028	627033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198812
13094	NC_015942	CTC	2	6	627057	627062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198812
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13096	NC_015942	GCC	2	6	627152	627157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13097	NC_015942	TGGCGG	2	12	627186	627197	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13098	NC_015942	T	7	7	627205	627211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_015942	A	6	6	627218	627223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_015942	CTG	2	6	627239	627244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198813
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13103	NC_015942	GTAG	2	8	627331	627338	25 %	25 %	50 %	0 %	344198813
13104	NC_015942	TTG	2	6	627340	627345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198813
13105	NC_015942	GCATA	2	10	627385	627394	40 %	20 %	20 %	20 %	344198813
13106	NC_015942	TGGT	2	8	627477	627484	0 %	50 %	50 %	0 %	344198813
13107	NC_015942	TCA	2	6	627487	627492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198813
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13109	NC_015942	CTA	2	6	627581	627586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198814
13110	NC_015942	TGG	2	6	627629	627634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_015942	T	8	8	627653	627660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_015942	TGA	2	6	627711	627716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_015942	GTGTT	2	10	627775	627784	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_015942	CAA	2	6	627792	627797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_015942	TAT	2	6	627826	627831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_015942	AAT	2	6	627944	627949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198815
13117	NC_015942	CGA	2	6	628009	628014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198815
13118	NC_015942	C	7	7	628092	628098	0 %	0 %	0 %	100 %	344198815
13119	NC_015942	GGGC	2	8	628158	628165	0 %	0 %	75 %	25 %	344198815
13120	NC_015942	AGTA	2	8	628185	628192	50 %	25 %	25 %	0 %	344198815
13121	NC_015942	TAAA	2	8	628197	628204	75 %	25 %	0 %	0 %	344198815
13122	NC_015942	GCG	2	6	628311	628316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198815
13123	NC_015942	GCA	2	6	628324	628329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198815
13124	NC_015942	TCA	2	6	628339	628344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198815
13125	NC_015942	GGC	2	6	628424	628429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198815
13126	NC_015942	GGT	2	6	628454	628459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198815
13127	NC_015942	ACAA	2	8	628539	628546	75 %	0 %	0 %	25 %	344198815
13128	NC_015942	GCA	2	6	628626	628631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198816
13129	NC_015942	AT	3	6	628632	628637	50 %	50 %	0 %	0 %	344198816
13130	NC_015942	AAG	2	6	628676	628681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198816
13131	NC_015942	CACC	2	8	628704	628711	25 %	0 %	0 %	75 %	344198816
13132	NC_015942	CAA	2	6	628740	628745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198816
13133	NC_015942	CTA	2	6	628775	628780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198816
13134	NC_015942	GCA	2	6	628821	628826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198816
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13138	NC_015942	AAGA	2	8	629197	629204	75 %	0 %	25 %	0 %	344198816
13139	NC_015942	AAC	2	6	629209	629214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198816
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13141	NC_015942	GTG	2	6	629276	629281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198816
13142	NC_015942	AGGG	2	8	629282	629289	25 %	0 %	75 %	0 %	344198816
13143	NC_015942	GCA	2	6	629361	629366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198816
13144	NC_015942	CAT	2	6	629389	629394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198816
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13146	NC_015942	TGCGA	2	10	629442	629451	20 %	20 %	40 %	20 %	344198816
13147	NC_015942	AATATA	2	12	629489	629500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198816
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13149	NC_015942	ATC	2	6	629645	629650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198816
13150	NC_015942	AGCAGG	2	12	629651	629662	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	344198816
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13152	NC_015942	T	6	6	629690	629695	0 %	100 %	0 %	0 %	344198816
13153	NC_015942	GTG	2	6	629843	629848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198817
13154	NC_015942	CCA	2	6	629974	629979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198817
13155	NC_015942	CTTT	2	8	629994	630001	0 %	75 %	0 %	25 %	344198817
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13158	NC_015942	T	6	6	630202	630207	0 %	100 %	0 %	0 %	344198817
13159	NC_015942	GAC	2	6	630266	630271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198817
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13161	NC_015942	TGC	3	9	630280	630288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198817
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13179	NC_015942	TCGC	2	8	631077	631084	0 %	25 %	25 %	50 %	344198818
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13186	NC_015942	AAT	2	6	631433	631438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198819
13187	NC_015942	CATGC	2	10	631522	631531	20 %	20 %	20 %	40 %	344198819
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13191	NC_015942	TAG	2	6	631636	631641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198819
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13195	NC_015942	TGC	2	6	631841	631846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198819
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13203	NC_015942	GCT	2	6	631978	631983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198819
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13210	NC_015942	TGT	2	6	632339	632344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13211	NC_015942	AT	3	6	632349	632354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13212	NC_015942	TAA	2	6	632359	632364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13215	NC_015942	GT	3	6	632460	632465	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13216	NC_015942	TGT	2	6	632474	632479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13219	NC_015942	G	6	6	632610	632615	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13220	NC_015942	CCT	2	6	632620	632625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13221	NC_015942	TTC	2	6	632674	632679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198821
13222	NC_015942	TGC	2	6	632720	632725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198821
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13227	NC_015942	TGCT	2	8	632994	633001	0 %	50 %	25 %	25 %	344198821
13228	NC_015942	ATAGA	2	10	633023	633032	60 %	20 %	20 %	0 %	344198821
13229	NC_015942	TAG	2	6	633158	633163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13230	NC_015942	CTGT	2	8	633192	633199	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13231	NC_015942	TTC	2	6	633241	633246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13232	NC_015942	CAT	2	6	633252	633257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13233	NC_015942	CTT	2	6	633346	633351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198822
13234	NC_015942	GCA	2	6	633376	633381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198822
13235	NC_015942	GC	4	8	633393	633400	0 %	0 %	50 %	50 %	344198822
13236	NC_015942	CAG	2	6	633438	633443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198822
13237	NC_015942	CGT	2	6	633444	633449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198822
13238	NC_015942	AGC	2	6	633603	633608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198822
13239	NC_015942	GT	3	6	633807	633812	0 %	50 %	50 %	0 %	344198822
13240	NC_015942	GATG	2	8	633823	633830	25 %	25 %	50 %	0 %	344198822
13241	NC_015942	A	6	6	633980	633985	100 %	0 %	0 %	0 %	344198822
13242	NC_015942	ATTC	2	8	634015	634022	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13243	NC_015942	AGT	2	6	634028	634033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13246	NC_015942	ATC	2	6	634167	634172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198823
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13353	NC_015942	GACG	2	8	639705	639712	25 %	0 %	50 %	25 %	344198827
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13364	NC_015942	GAT	2	6	640022	640027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198827
13365	NC_015942	T	6	6	640100	640105	0 %	100 %	0 %	0 %	344198827
13366	NC_015942	GCT	2	6	640115	640120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198827
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13368	NC_015942	TGG	2	6	640183	640188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198827
13369	NC_015942	GGC	2	6	640217	640222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198827
13370	NC_015942	TGT	2	6	640246	640251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198827
13371	NC_015942	GCA	2	6	640298	640303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198827
13372	NC_015942	CTG	2	6	640305	640310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198827
13373	NC_015942	GGC	2	6	640349	640354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198827
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13375	NC_015942	TGG	2	6	640375	640380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198827
13376	NC_015942	GGC	5	15	640418	640432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198827
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13379	NC_015942	CGGG	2	8	640646	640653	0 %	0 %	75 %	25 %	344198827
13380	NC_015942	TTG	2	6	640686	640691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198827
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13383	NC_015942	GAT	2	6	640797	640802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13384	NC_015942	GTT	2	6	640813	640818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13385	NC_015942	CCGA	2	8	640820	640827	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13386	NC_015942	AGA	2	6	640874	640879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198828
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13388	NC_015942	TGA	2	6	641079	641084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198828
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13393	NC_015942	GGT	2	6	641287	641292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198828
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13471	NC_015942	GCCA	2	8	644601	644608	25 %	0 %	25 %	50 %	344198830
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13479	NC_015942	CGG	2	6	644927	644932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198830
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13481	NC_015942	TC	3	6	645005	645010	0 %	50 %	0 %	50 %	344198830
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13483	NC_015942	AGG	2	6	645151	645156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198830
13484	NC_015942	CTG	2	6	645168	645173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198830
13485	NC_015942	TC	3	6	645185	645190	0 %	50 %	0 %	50 %	344198830
13486	NC_015942	CCG	2	6	645199	645204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198830
13487	NC_015942	TGC	2	6	645296	645301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198831
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