MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015942	CAT	2	6	599117	599122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198791
12502	NC_015942	TAAT	2	8	599246	599253	50 %	50 %	0 %	0 %	344198791
12503	NC_015942	GCC	2	6	599307	599312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12504	NC_015942	GCT	2	6	599326	599331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_015942	T	6	6	599356	599361	0 %	100 %	0 %	0 %	344198792
12506	NC_015942	AAG	2	6	599404	599409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198792
12507	NC_015942	AAT	2	6	599422	599427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198792
12508	NC_015942	CGT	2	6	599455	599460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198792
12509	NC_015942	T	6	6	599460	599465	0 %	100 %	0 %	0 %	344198792
12510	NC_015942	ACC	2	6	599480	599485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198792
12511	NC_015942	CGT	2	6	599571	599576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198792
12512	NC_015942	GC	3	6	599589	599594	0 %	0 %	50 %	50 %	344198792
12513	NC_015942	A	6	6	599631	599636	100 %	0 %	0 %	0 %	344198793
12514	NC_015942	ACC	3	9	599675	599683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198793
12515	NC_015942	AAG	2	6	599690	599695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198793
12516	NC_015942	GAA	2	6	599719	599724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198793
12517	NC_015942	GGT	2	6	599803	599808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_015942	CAT	2	6	599854	599859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_015942	T	6	6	599859	599864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_015942	ATG	2	6	599883	599888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_015942	GAT	2	6	599902	599907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_015942	C	6	6	599925	599930	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12523	NC_015942	TG	3	6	599984	599989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_015942	GGA	2	6	600166	600171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198794
12525	NC_015942	C	6	6	600189	600194	0 %	0 %	0 %	100 %	344198794
12526	NC_015942	T	7	7	600235	600241	0 %	100 %	0 %	0 %	344198794
12527	NC_015942	CTG	2	6	600251	600256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198794
12528	NC_015942	GGT	2	6	600259	600264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198794
12529	NC_015942	CGC	2	6	600343	600348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198794
12530	NC_015942	TC	3	6	600358	600363	0 %	50 %	0 %	50 %	344198794
12531	NC_015942	CGG	2	6	600401	600406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198794
12532	NC_015942	TTC	2	6	600557	600562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198794
12533	NC_015942	CGG	2	6	600574	600579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198794
12534	NC_015942	GCA	2	6	600622	600627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198794
12535	NC_015942	GGA	2	6	600688	600693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198794
12536	NC_015942	GGT	2	6	600931	600936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198794
12537	NC_015942	CAG	2	6	600977	600982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198794
12538	NC_015942	ATT	2	6	600983	600988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198794
12539	NC_015942	TGC	2	6	601043	601048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12540	NC_015942	CTTT	2	8	601098	601105	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12541	NC_015942	ATGA	2	8	601122	601129	50 %	25 %	25 %	0 %	344198795
12542	NC_015942	AGA	2	6	601130	601135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198795
12543	NC_015942	GTG	2	6	601182	601187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198795
12544	NC_015942	GC	3	6	601229	601234	0 %	0 %	50 %	50 %	344198795
12545	NC_015942	TGC	2	6	601324	601329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198795
12546	NC_015942	GCTGGC	2	12	601349	601360	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344198795
12547	NC_015942	TGG	2	6	601516	601521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198795
12548	NC_015942	TTG	2	6	601587	601592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198795
12549	NC_015942	CCAT	2	8	601596	601603	25 %	25 %	0 %	50 %	344198795
12550	NC_015942	GTTTCC	2	12	601605	601616	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	344198795
12551	NC_015942	GAT	2	6	601677	601682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_015942	ACC	2	6	601716	601721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198796
12553	NC_015942	CAC	2	6	601787	601792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198796
12554	NC_015942	TCG	2	6	601801	601806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198796
12555	NC_015942	GAA	2	6	601815	601820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198796
12556	NC_015942	TCA	2	6	601963	601968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198796
12557	NC_015942	AAG	2	6	602007	602012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198796
12558	NC_015942	GCA	2	6	602021	602026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198796
12559	NC_015942	AGA	2	6	602047	602052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198796
12560	NC_015942	GAA	2	6	602054	602059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198796
12561	NC_015942	TCA	2	6	602101	602106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198796
12562	NC_015942	ATT	2	6	602187	602192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198796
12563	NC_015942	GCG	2	6	602208	602213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198796
12564	NC_015942	GTG	2	6	602272	602277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198796
12565	NC_015942	CCA	2	6	602344	602349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198796
12566	NC_015942	CGG	3	9	602366	602374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198796
12567	NC_015942	ATTA	2	8	602394	602401	50 %	50 %	0 %	0 %	344198796
12568	NC_015942	GAAG	2	8	602471	602478	50 %	0 %	50 %	0 %	344198796
12569	NC_015942	CAG	2	6	602514	602519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198796
12570	NC_015942	AGA	2	6	602612	602617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198796
12571	NC_015942	ATC	2	6	602619	602624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198796
12572	NC_015942	CGA	2	6	602674	602679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198796
12573	NC_015942	TGG	2	6	602701	602706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198796
12574	NC_015942	AAGA	2	8	602841	602848	75 %	0 %	25 %	0 %	344198796
12575	NC_015942	TGA	2	6	602905	602910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198796
12576	NC_015942	GAA	2	6	602924	602929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198796
12577	NC_015942	T	6	6	602959	602964	0 %	100 %	0 %	0 %	344198796
12578	NC_015942	CGG	2	6	602968	602973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198796
12579	NC_015942	CGG	2	6	602986	602991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198796
12580	NC_015942	ATA	2	6	603034	603039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198796
12581	NC_015942	CAC	2	6	603079	603084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198796
12582	NC_015942	GAA	2	6	603213	603218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198796
12583	NC_015942	GAT	2	6	603227	603232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198796
12584	NC_015942	AGG	2	6	603235	603240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198796
12585	NC_015942	GCG	2	6	603252	603257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198796
12586	NC_015942	AAG	2	6	603264	603269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198796
12587	NC_015942	GCGT	2	8	603272	603279	0 %	25 %	50 %	25 %	344198796
12588	NC_015942	GGA	2	6	603335	603340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198796
12589	NC_015942	CGG	2	6	603391	603396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198796
12590	NC_015942	GAA	2	6	603399	603404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198796
12591	NC_015942	GGA	2	6	603416	603421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198796
12592	NC_015942	TTG	2	6	603474	603479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198796
12593	NC_015942	GCC	3	9	603486	603494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198796
12594	NC_015942	CAGGCG	2	12	603498	603509	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344198796
12595	NC_015942	GAC	2	6	603546	603551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198796
12596	NC_015942	GTG	2	6	603552	603557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198796
12597	NC_015942	GAA	2	6	603570	603575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198796
12598	NC_015942	AAG	2	6	603582	603587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198796
12599	NC_015942	AGA	2	6	603652	603657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198797
12600	NC_015942	TAC	2	6	603672	603677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198797
12601	NC_015942	CGCAG	2	10	603696	603705	20 %	0 %	40 %	40 %	344198797
12602	NC_015942	GAT	2	6	603771	603776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198797
12603	NC_015942	GGC	3	9	603882	603890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198797
12604	NC_015942	GGT	2	6	603924	603929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198797
12605	NC_015942	GC	3	6	603984	603989	0 %	0 %	50 %	50 %	344198797
12606	NC_015942	GAA	2	6	604044	604049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198797
12607	NC_015942	AAG	2	6	604063	604068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198797
12608	NC_015942	GT	3	6	604104	604109	0 %	50 %	50 %	0 %	344198797
12609	NC_015942	G	6	6	604161	604166	0 %	0 %	100 %	0 %	344198797
12610	NC_015942	TCT	2	6	604195	604200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198797
12611	NC_015942	GTCATG	2	12	604267	604278	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344198797
12612	NC_015942	TGCC	2	8	604315	604322	0 %	25 %	25 %	50 %	344198797
12613	NC_015942	GGCGAA	2	12	604356	604367	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	344198797
12614	NC_015942	G	6	6	604378	604383	0 %	0 %	100 %	0 %	344198797
12615	NC_015942	GAT	2	6	604449	604454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198797
12616	NC_015942	CTATGG	2	12	604486	604497	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344198797
12617	NC_015942	GTG	2	6	604498	604503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198797
12618	NC_015942	GCA	2	6	604609	604614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198797
12619	NC_015942	C	6	6	604669	604674	0 %	0 %	0 %	100 %	344198797
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12621	NC_015942	GGC	2	6	604710	604715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198797
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12742	NC_015942	CGGC	2	8	610182	610189	0 %	0 %	50 %	50 %	344198803
12743	NC_015942	GCT	3	9	610234	610242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198803
12744	NC_015942	TGC	2	6	610266	610271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198803
12745	NC_015942	GCC	3	9	610309	610317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12746	NC_015942	GCA	2	6	610346	610351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12747	NC_015942	CGG	2	6	610380	610385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12748	NC_015942	TCA	2	6	610425	610430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12749	NC_015942	CAAGT	2	10	610475	610484	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12750	NC_015942	ACG	2	6	610583	610588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12752	NC_015942	TCG	2	6	610659	610664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12753	NC_015942	GC	3	6	610745	610750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12754	NC_015942	CAAAAA	2	12	610754	610765	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12755	NC_015942	ACC	2	6	610795	610800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12756	NC_015942	TCGG	2	8	610806	610813	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12757	NC_015942	CCA	2	6	610861	610866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12758	NC_015942	TGCC	2	8	610930	610937	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12759	NC_015942	ACT	2	6	610944	610949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12761	NC_015942	TTG	2	6	611031	611036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12762	NC_015942	TCTG	2	8	611057	611064	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12763	NC_015942	AGCA	2	8	611081	611088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12764	NC_015942	T	6	6	611145	611150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12765	NC_015942	T	6	6	611155	611160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12766	NC_015942	TTA	2	6	611176	611181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12767	NC_015942	GTTA	2	8	611221	611228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12768	NC_015942	CCA	2	6	611250	611255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12779	NC_015942	CAT	2	6	611699	611704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198804
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12781	NC_015942	AT	3	6	611742	611747	50 %	50 %	0 %	0 %	344198804
12782	NC_015942	GACC	2	8	611762	611769	25 %	0 %	25 %	50 %	344198804
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12828	NC_015942	TCACC	2	10	614157	614166	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
12829	NC_015942	GTA	2	6	614204	614209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12848	NC_015942	A	6	6	615034	615039	100 %	0 %	0 %	0 %	344198809
12849	NC_015942	TAT	2	6	615054	615059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198809
12850	NC_015942	GAC	2	6	615094	615099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198809
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12853	NC_015942	TAC	2	6	615191	615196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198809
12854	NC_015942	CTGG	2	8	615201	615208	0 %	25 %	50 %	25 %	344198809
12855	NC_015942	TGCG	2	8	615253	615260	0 %	25 %	50 %	25 %	344198809
12856	NC_015942	TCC	2	6	615350	615355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198809
12857	NC_015942	TGA	2	6	615408	615413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198809
12858	NC_015942	CCATC	2	10	615480	615489	20 %	20 %	0 %	60 %	344198809
12859	NC_015942	ACG	2	6	615557	615562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198809
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12862	NC_015942	CGA	2	6	615756	615761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198809
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