MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015942	TGG	2	6	549336	549341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198741
11502	NC_015942	TGCG	2	8	549364	549371	0 %	25 %	50 %	25 %	344198741
11503	NC_015942	CAG	2	6	549385	549390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198741
11504	NC_015942	TCG	2	6	549467	549472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198741
11505	NC_015942	CAG	2	6	549514	549519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_015942	CGG	2	6	549622	549627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_015942	CCA	2	6	549655	549660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198742
11508	NC_015942	TTGT	2	8	549699	549706	0 %	75 %	25 %	0 %	344198742
11509	NC_015942	GGC	2	6	549708	549713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198742
11510	NC_015942	TGG	2	6	549722	549727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198742
11511	NC_015942	GCC	2	6	549822	549827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198742
11512	NC_015942	ATG	2	6	549834	549839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198742
11513	NC_015942	GCC	2	6	549876	549881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198742
11514	NC_015942	TGA	2	6	549893	549898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198742
11515	NC_015942	GAT	2	6	549899	549904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198742
11516	NC_015942	CCT	2	6	549905	549910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198742
11517	NC_015942	GGA	2	6	549988	549993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198742
11518	NC_015942	GCC	2	6	550011	550016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198742
11519	NC_015942	CCG	2	6	550055	550060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198742
11520	NC_015942	CCG	2	6	550147	550152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198742
11521	NC_015942	GAT	2	6	550245	550250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198742
11522	NC_015942	GCCA	2	8	550287	550294	25 %	0 %	25 %	50 %	344198742
11523	NC_015942	GGTTG	2	10	550386	550395	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_015942	GCC	2	6	550438	550443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11525	NC_015942	CGC	2	6	550444	550449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11526	NC_015942	GGC	2	6	550450	550455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_015942	GAA	2	6	550521	550526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_015942	TCT	2	6	550534	550539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198743
11529	NC_015942	CGC	2	6	550558	550563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198743
11530	NC_015942	GCC	2	6	550570	550575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198743
11531	NC_015942	CCTTT	2	10	550584	550593	0 %	60 %	0 %	40 %	344198743
11532	NC_015942	CCG	2	6	550624	550629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198743
11533	NC_015942	CG	3	6	550642	550647	0 %	0 %	50 %	50 %	344198743
11534	NC_015942	CGG	2	6	550649	550654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198743
11535	NC_015942	TC	3	6	550660	550665	0 %	50 %	0 %	50 %	344198743
11536	NC_015942	CGGG	2	8	550869	550876	0 %	0 %	75 %	25 %	344198744
11537	NC_015942	GCT	2	6	550881	550886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198744
11538	NC_015942	CGG	2	6	550921	550926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198744
11539	NC_015942	CGG	2	6	550942	550947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198744
11540	NC_015942	GCT	2	6	550968	550973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198744
11541	NC_015942	TGC	3	9	550979	550987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198744
11542	NC_015942	GGC	2	6	551044	551049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198744
11543	NC_015942	GC	3	6	551061	551066	0 %	0 %	50 %	50 %	344198744
11544	NC_015942	AGG	2	6	551105	551110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198744
11545	NC_015942	GCC	3	9	551113	551121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198744
11546	NC_015942	C	6	6	551168	551173	0 %	0 %	0 %	100 %	344198744
11547	NC_015942	TTG	2	6	551243	551248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_015942	TGGTGC	2	12	551291	551302	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344198745
11549	NC_015942	C	6	6	551310	551315	0 %	0 %	0 %	100 %	344198745
11550	NC_015942	GTT	2	6	551338	551343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198745
11551	NC_015942	GC	3	6	551365	551370	0 %	0 %	50 %	50 %	344198745
11552	NC_015942	GTC	2	6	551380	551385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198745
11553	NC_015942	CG	3	6	551407	551412	0 %	0 %	50 %	50 %	344198745
11554	NC_015942	ATG	2	6	551419	551424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198745
11555	NC_015942	GCC	2	6	551446	551451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198745
11556	NC_015942	GAT	3	9	551463	551471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198745
11557	NC_015942	TACA	2	8	551528	551535	50 %	25 %	0 %	25 %	344198745
11558	NC_015942	ACAT	2	8	551538	551545	50 %	25 %	0 %	25 %	344198745
11559	NC_015942	TAC	2	6	551762	551767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198746
11560	NC_015942	TC	3	6	551772	551777	0 %	50 %	0 %	50 %	344198746
11561	NC_015942	CTA	2	6	551789	551794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198746
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11563	NC_015942	CTGC	2	8	552012	552019	0 %	25 %	25 %	50 %	344198747
11564	NC_015942	CAG	2	6	552076	552081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198747
11565	NC_015942	CGG	2	6	552084	552089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198747
11566	NC_015942	GTG	2	6	552155	552160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198747
11567	NC_015942	TGG	2	6	552179	552184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198747
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11569	NC_015942	GGC	2	6	552205	552210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198747
11570	NC_015942	GCC	2	6	552258	552263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198747
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11573	NC_015942	GATC	2	8	552384	552391	25 %	25 %	25 %	25 %	344198747
11574	NC_015942	CTT	2	6	552402	552407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198747
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11579	NC_015942	TTG	2	6	552593	552598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198747
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11582	NC_015942	CCA	2	6	552750	552755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198747
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11587	NC_015942	GGA	2	6	552897	552902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198747
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11589	NC_015942	CGG	2	6	552940	552945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198747
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11591	NC_015942	CGG	2	6	553031	553036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198748
11592	NC_015942	GGCGAC	2	12	553122	553133	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344198748
11593	NC_015942	CAG	3	9	553158	553166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198748
11594	NC_015942	TCC	2	6	553216	553221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198748
11595	NC_015942	GCG	2	6	553267	553272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198748
11596	NC_015942	CAA	2	6	553311	553316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198748
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11601	NC_015942	GCC	2	6	553500	553505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198748
11602	NC_015942	CCA	2	6	553511	553516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198748
11603	NC_015942	GCG	2	6	553517	553522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198748
11604	NC_015942	TGA	2	6	553574	553579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198748
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11606	NC_015942	GCA	2	6	553748	553753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198749
11607	NC_015942	GTG	2	6	553765	553770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198749
11608	NC_015942	CG	3	6	553788	553793	0 %	0 %	50 %	50 %	344198749
11609	NC_015942	CGG	2	6	553808	553813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198749
11610	NC_015942	ATC	2	6	553824	553829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198749
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11612	NC_015942	GAT	2	6	553860	553865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198749
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11614	NC_015942	AG	3	6	553917	553922	50 %	0 %	50 %	0 %	344198749
11615	NC_015942	CGGTC	2	10	553944	553953	0 %	20 %	40 %	40 %	344198749
11616	NC_015942	CGG	2	6	554021	554026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198749
11617	NC_015942	CAGC	2	8	554036	554043	25 %	0 %	25 %	50 %	344198749
11618	NC_015942	GCG	2	6	554071	554076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198749
11619	NC_015942	ATGC	2	8	554130	554137	25 %	25 %	25 %	25 %	344198749
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11621	NC_015942	GCC	2	6	554293	554298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11844	NC_015942	GGC	2	6	564230	564235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198758
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11851	NC_015942	CAT	2	6	564503	564508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198758
11852	NC_015942	CGG	2	6	564513	564518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198758
11853	NC_015942	GAT	2	6	564560	564565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198758
11854	NC_015942	GTG	2	6	564597	564602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198758
11855	NC_015942	TCG	3	9	564643	564651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198758
11856	NC_015942	AC	3	6	565019	565024	50 %	0 %	0 %	50 %	344198759
11857	NC_015942	GTT	2	6	565078	565083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198759
11858	NC_015942	CAT	2	6	565141	565146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198759
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11860	NC_015942	TGC	2	6	565212	565217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198760
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11979	NC_015942	CGCGT	2	10	571014	571023	0 %	20 %	40 %	40 %	344198767
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11981	NC_015942	CCG	2	6	571089	571094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198767
11982	NC_015942	C	6	6	571112	571117	0 %	0 %	0 %	100 %	344198767
11983	NC_015942	CACT	2	8	571125	571132	25 %	25 %	0 %	50 %	344198767
11984	NC_015942	GCA	2	6	571170	571175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198767
11985	NC_015942	GAT	2	6	571252	571257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198767
11986	NC_015942	CTC	2	6	571261	571266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198767
11987	NC_015942	CTC	2	6	571273	571278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198767
11988	NC_015942	GAT	2	6	571348	571353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198767
11989	NC_015942	TGG	2	6	571395	571400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198767
11990	NC_015942	TGA	2	6	571410	571415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198767
11991	NC_015942	ATC	2	6	571481	571486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198767
11992	NC_015942	GGC	3	9	571520	571528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198767
11993	NC_015942	GAT	2	6	571594	571599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198767
11994	NC_015942	G	6	6	571629	571634	0 %	0 %	100 %	0 %	344198767
11995	NC_015942	TTC	2	6	571656	571661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198768
11996	NC_015942	GTGGTT	2	12	571668	571679	0 %	50 %	50 %	0 %	344198768
11997	NC_015942	TGC	2	6	571727	571732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198768
11998	NC_015942	GGGC	2	8	571733	571740	0 %	0 %	75 %	25 %	344198768
11999	NC_015942	CGC	2	6	571767	571772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198768
12000	NC_015942	CCG	2	6	571789	571794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198768

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