MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015942	GCG	2	6	526448	526453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198725
11002	NC_015942	GGC	2	6	526504	526509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198725
11003	NC_015942	CGG	2	6	526524	526529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198725
11004	NC_015942	CGG	2	6	526587	526592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198725
11005	NC_015942	TGC	2	6	526602	526607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198725
11006	NC_015942	CTG	2	6	526636	526641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198725
11007	NC_015942	GCT	2	6	526888	526893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198725
11008	NC_015942	CGG	2	6	526955	526960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198725
11009	NC_015942	CAT	2	6	527010	527015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198725
11010	NC_015942	CGAT	2	8	527064	527071	25 %	25 %	25 %	25 %	344198725
11011	NC_015942	GCG	2	6	527110	527115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198725
11012	NC_015942	GGCC	2	8	527121	527128	0 %	0 %	50 %	50 %	344198725
11013	NC_015942	CCA	2	6	527133	527138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198725
11014	NC_015942	CAT	2	6	527148	527153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198725
11015	NC_015942	AGG	2	6	527171	527176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198725
11016	NC_015942	GCCA	2	8	527206	527213	25 %	0 %	25 %	50 %	344198725
11017	NC_015942	GCC	2	6	527257	527262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198725
11018	NC_015942	CTG	2	6	527317	527322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198725
11019	NC_015942	GCT	2	6	527331	527336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198725
11020	NC_015942	GTT	2	6	527340	527345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198725
11021	NC_015942	CGG	2	6	527379	527384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198725
11022	NC_015942	T	6	6	527392	527397	0 %	100 %	0 %	0 %	344198725
11023	NC_015942	GTG	2	6	527627	527632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_015942	CAA	2	6	527665	527670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198726
11025	NC_015942	AGC	2	6	527675	527680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198726
11026	NC_015942	ATTGC	2	10	527693	527702	20 %	40 %	20 %	20 %	344198726
11027	NC_015942	TTGTT	2	10	527727	527736	0 %	80 %	20 %	0 %	344198726
11028	NC_015942	A	7	7	527755	527761	100 %	0 %	0 %	0 %	344198726
11029	NC_015942	TGC	2	6	527791	527796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198726
11030	NC_015942	TTG	2	6	527959	527964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_015942	TTA	2	6	527986	527991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_015942	GCC	3	9	528042	528050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198727
11033	NC_015942	TCG	2	6	528173	528178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11034	NC_015942	TCG	2	6	528194	528199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11035	NC_015942	GCT	2	6	528222	528227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11036	NC_015942	GCG	2	6	528245	528250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198727
11037	NC_015942	A	7	7	528263	528269	100 %	0 %	0 %	0 %	344198727
11038	NC_015942	GTC	2	6	528349	528354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11039	NC_015942	GC	3	6	528416	528421	0 %	0 %	50 %	50 %	344198727
11040	NC_015942	TCGC	2	8	528442	528449	0 %	25 %	25 %	50 %	344198727
11041	NC_015942	ACG	2	6	528461	528466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11042	NC_015942	CG	3	6	528465	528470	0 %	0 %	50 %	50 %	344198727
11043	NC_015942	GCGA	2	8	528526	528533	25 %	0 %	50 %	25 %	344198727
11044	NC_015942	TTC	2	6	528538	528543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198727
11045	NC_015942	CCT	2	6	528546	528551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198727
11046	NC_015942	TGTGCC	2	12	528554	528565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11047	NC_015942	ATGGGC	2	12	528616	528627	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344198727
11048	NC_015942	CTT	2	6	528642	528647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198727
11049	NC_015942	GCC	2	6	528683	528688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198727
11050	NC_015942	GGC	2	6	528742	528747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198727
11051	NC_015942	CGA	2	6	528857	528862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11052	NC_015942	GCC	2	6	528869	528874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198727
11053	NC_015942	GAT	2	6	528890	528895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198727
11054	NC_015942	CTG	2	6	528910	528915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11055	NC_015942	GTC	2	6	528923	528928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11056	NC_015942	GAT	2	6	529014	529019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198727
11057	NC_015942	CCT	2	6	529074	529079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198727
11058	NC_015942	GC	3	6	529143	529148	0 %	0 %	50 %	50 %	344198727
11059	NC_015942	CCG	2	6	529188	529193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198727
11060	NC_015942	AGGC	2	8	529207	529214	25 %	0 %	50 %	25 %	344198727
11061	NC_015942	TCT	2	6	529260	529265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198727
11062	NC_015942	TGCT	2	8	529276	529283	0 %	50 %	25 %	25 %	344198727
11063	NC_015942	GGC	2	6	529336	529341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198727
11064	NC_015942	GCA	2	6	529364	529369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11065	NC_015942	CCG	2	6	529374	529379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198727
11066	NC_015942	GCG	2	6	529397	529402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198727
11067	NC_015942	CTCA	2	8	529453	529460	25 %	25 %	0 %	50 %	344198727
11068	NC_015942	CGA	2	6	529488	529493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11069	NC_015942	CCT	2	6	529494	529499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198727
11070	NC_015942	GCA	2	6	529512	529517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11071	NC_015942	CCG	2	6	529572	529577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198727
11072	NC_015942	TCT	2	6	529692	529697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198727
11073	NC_015942	CG	3	6	529738	529743	0 %	0 %	50 %	50 %	344198727
11074	NC_015942	CAGCGT	2	12	529746	529757	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11075	NC_015942	GCA	2	6	529805	529810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11076	NC_015942	GGC	2	6	529834	529839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198727
11077	NC_015942	CTCG	2	8	529863	529870	0 %	25 %	25 %	50 %	344198727
11078	NC_015942	ACTTGC	2	12	529922	529933	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344198727
11079	NC_015942	GTGG	2	8	529936	529943	0 %	25 %	75 %	0 %	344198727
11080	NC_015942	CGG	2	6	529953	529958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198727
11081	NC_015942	GTC	2	6	529987	529992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11082	NC_015942	GGT	2	6	530080	530085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198727
11083	NC_015942	TCG	2	6	530114	530119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198727
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11085	NC_015942	TGG	2	6	530169	530174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198727
11086	NC_015942	CTG	2	6	530197	530202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11087	NC_015942	GC	3	6	530327	530332	0 %	0 %	50 %	50 %	344198727
11088	NC_015942	GTT	2	6	530340	530345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198727
11089	NC_015942	TCC	2	6	530372	530377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198727
11090	NC_015942	CGG	2	6	530410	530415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198727
11091	NC_015942	CTT	2	6	530492	530497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198727
11092	NC_015942	GCG	2	6	530561	530566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198727
11093	NC_015942	GTC	2	6	530657	530662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11094	NC_015942	CGG	2	6	530682	530687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198727
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11098	NC_015942	GGC	2	6	530809	530814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198727
11099	NC_015942	CGCAG	2	10	530864	530873	20 %	0 %	40 %	40 %	344198727
11100	NC_015942	TTC	2	6	530962	530967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198727
11101	NC_015942	GGC	2	6	531042	531047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198727
11102	NC_015942	CAG	2	6	531049	531054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11103	NC_015942	TGC	2	6	531056	531061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11104	NC_015942	CAG	2	6	531121	531126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11105	NC_015942	AGC	2	6	531203	531208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11106	NC_015942	TCT	2	6	531221	531226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198727
11107	NC_015942	TTC	2	6	531259	531264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198727
11108	NC_015942	TGCGG	2	10	531385	531394	0 %	20 %	60 %	20 %	344198727
11109	NC_015942	TCG	2	6	531395	531400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198727
11110	NC_015942	GTG	2	6	531434	531439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198727
11111	NC_015942	GTC	2	6	531559	531564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198728
11112	NC_015942	TAG	2	6	531642	531647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198728
11113	NC_015942	TTG	2	6	531684	531689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198728
11114	NC_015942	CCT	2	6	531704	531709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198728
11115	NC_015942	CGC	2	6	531726	531731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198728
11116	NC_015942	ATC	2	6	531780	531785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198728
11117	NC_015942	GTC	2	6	531823	531828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198728
11118	NC_015942	TGC	2	6	531889	531894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198728
11119	NC_015942	GGC	2	6	532014	532019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198728
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11121	NC_015942	GCG	2	6	532048	532053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198728
11122	NC_015942	CAATG	2	10	532089	532098	40 %	20 %	20 %	20 %	344198728
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11140	NC_015942	ATTGT	2	10	532869	532878	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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11207	NC_015942	TGC	3	9	536054	536062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198730
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11225	NC_015942	CT	3	6	536606	536611	0 %	50 %	0 %	50 %	344198731
11226	NC_015942	AAGG	2	8	536613	536620	50 %	0 %	50 %	0 %	344198731
11227	NC_015942	GAC	2	6	536622	536627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198731
11228	NC_015942	CGCC	2	8	536642	536649	0 %	0 %	25 %	75 %	344198731
11229	NC_015942	CTG	2	6	536691	536696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198731
11230	NC_015942	TCGC	2	8	536724	536731	0 %	25 %	25 %	50 %	344198731
11231	NC_015942	CGG	2	6	536777	536782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198731
11232	NC_015942	CGA	2	6	536804	536809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198731
11233	NC_015942	AGCC	2	8	536862	536869	25 %	0 %	25 %	50 %	344198731
11234	NC_015942	TGGA	2	8	536901	536908	25 %	25 %	50 %	0 %	344198731
11235	NC_015942	GGC	2	6	536927	536932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198731
11236	NC_015942	GCT	2	6	536955	536960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198731
11237	NC_015942	GCC	3	9	536976	536984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198731
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11239	NC_015942	AAC	2	6	537061	537066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198731
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11363	NC_015942	ACA	2	6	542185	542190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198733
11364	NC_015942	ACCAC	2	10	542203	542212	40 %	0 %	0 %	60 %	344198733
11365	NC_015942	CCG	2	6	542332	542337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198733
11366	NC_015942	GCC	2	6	542390	542395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198733
11367	NC_015942	GCAA	2	8	542420	542427	50 %	0 %	25 %	25 %	344198733
11368	NC_015942	ATCT	2	8	542446	542453	25 %	50 %	0 %	25 %	344198733
11369	NC_015942	AGTTC	2	10	542508	542517	20 %	40 %	20 %	20 %	344198733
11370	NC_015942	GGCG	2	8	542622	542629	0 %	0 %	75 %	25 %	344198733
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11377	NC_015942	TGA	2	6	542951	542956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198733
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11384	NC_015942	GTC	2	6	543277	543282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198733
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11386	NC_015942	ATG	2	6	543353	543358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11390	NC_015942	A	6	6	543576	543581	100 %	0 %	0 %	0 %	344198734
11391	NC_015942	TCC	2	6	543652	543657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11392	NC_015942	GGT	2	6	543716	543721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11393	NC_015942	CG	3	6	543725	543730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11394	NC_015942	GT	3	6	543906	543911	0 %	50 %	50 %	0 %	344198735
11395	NC_015942	GC	3	6	543932	543937	0 %	0 %	50 %	50 %	344198735
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11420	NC_015942	AGGGC	2	10	545103	545112	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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11482	NC_015942	TGC	2	6	548043	548048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198739
11483	NC_015942	TCC	2	6	548103	548108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198739
11484	NC_015942	CGA	2	6	548134	548139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198739
11485	NC_015942	GGT	2	6	548224	548229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198739
11486	NC_015942	GGC	2	6	548240	548245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198739
11487	NC_015942	GCC	2	6	548438	548443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198739
11488	NC_015942	CCG	2	6	548470	548475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198739
11489	NC_015942	T	7	7	548730	548736	0 %	100 %	0 %	0 %	344198740
11490	NC_015942	CTG	2	6	548745	548750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198740
11491	NC_015942	TTCCG	2	10	548847	548856	0 %	40 %	20 %	40 %	344198740
11492	NC_015942	GGT	3	9	548859	548867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198740
11493	NC_015942	GAT	2	6	548933	548938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198740
11494	NC_015942	AGC	2	6	548991	548996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198740
11495	NC_015942	TCG	2	6	549054	549059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198740
11496	NC_015942	CAG	2	6	549074	549079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198740
11497	NC_015942	AGC	2	6	549093	549098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198740
11498	NC_015942	TGGG	2	8	549129	549136	0 %	25 %	75 %	0 %	344198740
11499	NC_015942	ACGA	2	8	549268	549275	50 %	0 %	25 %	25 %	344198741
11500	NC_015942	CGC	2	6	549278	549283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198741

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