MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015942	CAA	3	9	476024	476032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198679
10002	NC_015942	A	6	6	476139	476144	100 %	0 %	0 %	0 %	344198679
10003	NC_015942	TAG	2	6	476184	476189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198679
10004	NC_015942	CGT	2	6	476228	476233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_015942	CAAGG	2	10	476385	476394	40 %	0 %	40 %	20 %	344198680
10006	NC_015942	CTA	2	6	476400	476405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198680
10007	NC_015942	ATC	3	9	476434	476442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198680
10008	NC_015942	GA	3	6	476488	476493	50 %	0 %	50 %	0 %	344198680
10009	NC_015942	CGC	2	6	476497	476502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198680
10010	NC_015942	CCG	2	6	476536	476541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198680
10011	NC_015942	TCC	2	6	476570	476575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198680
10012	NC_015942	GTT	2	6	476577	476582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198680
10013	NC_015942	CTG	2	6	476616	476621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198681
10014	NC_015942	GTC	2	6	476676	476681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198681
10015	NC_015942	TGA	2	6	476765	476770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198681
10016	NC_015942	GTT	2	6	476858	476863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198681
10017	NC_015942	CCT	2	6	476936	476941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198681
10018	NC_015942	CAC	2	6	476942	476947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198681
10019	NC_015942	TGG	2	6	476977	476982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198681
10020	NC_015942	GGT	2	6	476984	476989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198681
10021	NC_015942	CGG	2	6	477108	477113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198682
10022	NC_015942	GGGCA	2	10	477194	477203	20 %	0 %	60 %	20 %	344198682
10023	NC_015942	TGGC	2	8	477268	477275	0 %	25 %	50 %	25 %	344198682
10024	NC_015942	TGG	2	6	477342	477347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198682
10025	NC_015942	GCC	2	6	477368	477373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198682
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10027	NC_015942	T	6	6	477427	477432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_015942	T	6	6	477527	477532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_015942	AAC	2	6	477611	477616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_015942	GAG	2	6	477621	477626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_015942	AC	3	6	477639	477644	50 %	0 %	0 %	50 %	344198683
10032	NC_015942	CGC	2	6	477703	477708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198683
10033	NC_015942	CCT	2	6	477750	477755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198683
10034	NC_015942	CTG	2	6	477788	477793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198683
10035	NC_015942	TTTCC	2	10	477881	477890	0 %	60 %	0 %	40 %	344198683
10036	NC_015942	TCA	2	6	477963	477968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198683
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10038	NC_015942	TCG	2	6	478050	478055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198683
10039	NC_015942	TAC	3	9	478136	478144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198683
10040	NC_015942	GT	3	6	478145	478150	0 %	50 %	50 %	0 %	344198683
10041	NC_015942	TGC	2	6	478165	478170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198683
10042	NC_015942	AAC	2	6	478203	478208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198683
10043	NC_015942	TCCAT	2	10	478280	478289	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10044	NC_015942	TGA	2	6	478294	478299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_015942	AGTC	2	8	478349	478356	25 %	25 %	25 %	25 %	344198684
10046	NC_015942	TGC	2	6	478357	478362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198684
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10053	NC_015942	TCG	2	6	478693	478698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198685
10054	NC_015942	GAC	2	6	478787	478792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198685
10055	NC_015942	CAT	2	6	478825	478830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198685
10056	NC_015942	TGA	2	6	478834	478839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198685
10057	NC_015942	TGC	2	6	478878	478883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198685
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10062	NC_015942	CA	3	6	478985	478990	50 %	0 %	0 %	50 %	344198685
10063	NC_015942	CCTG	2	8	479020	479027	0 %	25 %	25 %	50 %	344198685
10064	NC_015942	CGT	2	6	479050	479055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198685
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10068	NC_015942	AG	3	6	479175	479180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_015942	TCG	3	9	479182	479190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10089	NC_015942	GCCCC	2	10	480050	480059	0 %	0 %	20 %	80 %	344198687
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10092	NC_015942	TTGG	2	8	480289	480296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10096	NC_015942	TGG	2	6	480530	480535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10100	NC_015942	TGG	2	6	480709	480714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_015942	CAC	2	6	480742	480747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10102	NC_015942	GCA	2	6	480938	480943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10104	NC_015942	GGGC	2	8	481088	481095	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10105	NC_015942	TGG	2	6	481196	481201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_015942	CGC	2	6	481228	481233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10107	NC_015942	GGT	2	6	481262	481267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_015942	TCC	2	6	481354	481359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10109	NC_015942	GGC	2	6	481425	481430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10111	NC_015942	GCC	2	6	481502	481507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10112	NC_015942	GAT	2	6	481580	481585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10114	NC_015942	CGT	2	6	481675	481680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_015942	CAA	3	9	481718	481726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_015942	CGG	2	6	481774	481779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10117	NC_015942	GTA	2	6	481823	481828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_015942	GAA	2	6	481857	481862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_015942	TCC	2	6	481955	481960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10120	NC_015942	TGG	2	6	482053	482058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_015942	GGC	2	6	482113	482118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_015942	ACC	2	6	482134	482139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198688
10123	NC_015942	GCC	2	6	482147	482152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198688
10124	NC_015942	TTG	2	6	482165	482170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198688
10125	NC_015942	GAT	2	6	482182	482187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198688
10126	NC_015942	GGC	2	6	482225	482230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198688
10127	NC_015942	CAGT	2	8	482244	482251	25 %	25 %	25 %	25 %	344198688
10128	NC_015942	TGA	2	6	482273	482278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198688
10129	NC_015942	ACCC	2	8	482295	482302	25 %	0 %	0 %	75 %	344198688
10130	NC_015942	CCAT	2	8	482323	482330	25 %	25 %	0 %	50 %	344198688
10131	NC_015942	AGC	2	6	482340	482345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198688
10132	NC_015942	CCA	2	6	482565	482570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198688
10133	NC_015942	GCA	2	6	482582	482587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198688
10134	NC_015942	GATC	2	8	482652	482659	25 %	25 %	25 %	25 %	344198688
10135	NC_015942	TCT	2	6	482675	482680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198688
10136	NC_015942	CAC	2	6	482688	482693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198688
10137	NC_015942	CGTC	2	8	482730	482737	0 %	25 %	25 %	50 %	344198688
10138	NC_015942	AAGG	2	8	482752	482759	50 %	0 %	50 %	0 %	344198688
10139	NC_015942	TCGC	2	8	482765	482772	0 %	25 %	25 %	50 %	344198688
10140	NC_015942	GCT	2	6	482859	482864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198688
10141	NC_015942	GCG	2	6	482904	482909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198688
10142	NC_015942	GTT	2	6	482934	482939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198688
10143	NC_015942	GCG	2	6	483021	483026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198688
10144	NC_015942	CTG	2	6	483046	483051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198688
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10147	NC_015942	GAT	2	6	483232	483237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198688
10148	NC_015942	GAC	2	6	483241	483246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198688
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10150	NC_015942	CAG	2	6	483358	483363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198688
10151	NC_015942	GCAC	2	8	483388	483395	25 %	0 %	25 %	50 %	344198688
10152	NC_015942	CGG	2	6	483455	483460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198688
10153	NC_015942	TC	3	6	483481	483486	0 %	50 %	0 %	50 %	344198688
10154	NC_015942	ACC	2	6	483545	483550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198688
10155	NC_015942	GCA	2	6	483577	483582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198688
10156	NC_015942	TCCA	2	8	483739	483746	25 %	25 %	0 %	50 %	344198688
10157	NC_015942	A	7	7	483783	483789	100 %	0 %	0 %	0 %	344198688
10158	NC_015942	TGT	2	6	483815	483820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198688
10159	NC_015942	GTG	2	6	483926	483931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10160	NC_015942	CGT	2	6	483975	483980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10161	NC_015942	ATA	2	6	484036	484041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198689
10162	NC_015942	GCT	2	6	484101	484106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198689
10163	NC_015942	TGA	2	6	484157	484162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198689
10164	NC_015942	C	6	6	484212	484217	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10165	NC_015942	AGG	2	6	484313	484318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10166	NC_015942	GA	3	6	484399	484404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10167	NC_015942	CAA	2	6	484587	484592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10168	NC_015942	GCG	2	6	484600	484605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10169	NC_015942	GCG	3	9	484609	484617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10170	NC_015942	CTG	2	6	484756	484761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10171	NC_015942	GCC	2	6	484790	484795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10172	NC_015942	ATG	2	6	484932	484937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10173	NC_015942	TGG	2	6	485011	485016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10174	NC_015942	TCA	2	6	485023	485028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10175	NC_015942	AGG	2	6	485065	485070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10176	NC_015942	GATC	2	8	485098	485105	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10177	NC_015942	GAA	2	6	485118	485123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10178	NC_015942	CGG	2	6	485153	485158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10179	NC_015942	GCC	2	6	485167	485172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10180	NC_015942	GCC	2	6	485382	485387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198690
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10183	NC_015942	GCC	2	6	485470	485475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198690
10184	NC_015942	CTG	2	6	485499	485504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198690
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10189	NC_015942	CTG	2	6	485703	485708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198690
10190	NC_015942	CGA	2	6	485726	485731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198690
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10192	NC_015942	GGA	2	6	485759	485764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198690
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10195	NC_015942	GCG	2	6	485854	485859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10196	NC_015942	ATC	2	6	485906	485911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198691
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10199	NC_015942	CGC	2	6	485983	485988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198691
10200	NC_015942	GCAT	2	8	486104	486111	25 %	25 %	25 %	25 %	344198691
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10203	NC_015942	CTC	2	6	486215	486220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198691
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10208	NC_015942	GGCC	2	8	486471	486478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10209	NC_015942	GAT	2	6	486479	486484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10210	NC_015942	TCA	2	6	486498	486503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10211	NC_015942	CCG	2	6	486544	486549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10212	NC_015942	TCA	2	6	486558	486563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10213	NC_015942	GCT	2	6	486610	486615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10215	NC_015942	CTG	2	6	486659	486664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10216	NC_015942	CTG	2	6	486716	486721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10217	NC_015942	AGG	2	6	486747	486752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10218	NC_015942	TTC	2	6	486779	486784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10219	NC_015942	A	6	6	486936	486941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10220	NC_015942	GCC	2	6	486953	486958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10221	NC_015942	CGCC	2	8	486973	486980	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10222	NC_015942	TCC	2	6	487029	487034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10223	NC_015942	GCC	2	6	487054	487059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10224	NC_015942	CAC	2	6	487199	487204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10225	NC_015942	TGG	2	6	487242	487247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10226	NC_015942	CGA	2	6	487252	487257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10227	NC_015942	CAT	2	6	487339	487344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10228	NC_015942	CTG	3	9	487499	487507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10229	NC_015942	GTC	2	6	487591	487596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10230	NC_015942	CCG	2	6	487698	487703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10231	NC_015942	CGC	2	6	487708	487713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10232	NC_015942	GGAC	2	8	487726	487733	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10233	NC_015942	TCG	2	6	487773	487778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10234	NC_015942	ATCG	2	8	487802	487809	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10235	NC_015942	TGC	2	6	487854	487859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10236	NC_015942	GGC	2	6	487893	487898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10237	NC_015942	ACGG	2	8	487917	487924	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10238	NC_015942	GCC	2	6	487952	487957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10239	NC_015942	ATC	2	6	487977	487982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10240	NC_015942	AGG	2	6	487996	488001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10241	NC_015942	CAG	2	6	488017	488022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10242	NC_015942	ACAGCC	2	12	488024	488035	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10243	NC_015942	C	7	7	488034	488040	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10244	NC_015942	GCAA	2	8	488106	488113	50 %	0 %	25 %	25 %	344198692
10245	NC_015942	GGA	2	6	488139	488144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198692
10246	NC_015942	TCA	2	6	488180	488185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198692
10247	NC_015942	GTC	2	6	488186	488191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198692
10248	NC_015942	TTC	2	6	488198	488203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198692
10249	NC_015942	GCA	2	6	488243	488248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198692
10250	NC_015942	GGCT	2	8	488355	488362	0 %	25 %	50 %	25 %	344198692
10251	NC_015942	CGC	2	6	488421	488426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198692
10252	NC_015942	CAA	2	6	488514	488519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198692
10253	NC_015942	ACA	2	6	488558	488563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198692
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10256	NC_015942	TTC	2	6	488868	488873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10257	NC_015942	AGG	2	6	488878	488883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10258	NC_015942	CAT	2	6	488972	488977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10259	NC_015942	GTT	2	6	489015	489020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10260	NC_015942	GC	3	6	489025	489030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10261	NC_015942	CCA	2	6	489167	489172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198693
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10320	NC_015942	TAAG	2	8	492903	492910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10338	NC_015942	ATTC	2	8	493874	493881	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10359	NC_015942	CGG	2	6	495217	495222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198700
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