MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_015942	CTG	2	6	325945	325950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198537
7002	NC_015942	CAGAT	2	10	325952	325961	40 %	20 %	20 %	20 %	344198537
7003	NC_015942	GC	3	6	325977	325982	0 %	0 %	50 %	50 %	344198537
7004	NC_015942	ATGG	2	8	326001	326008	25 %	25 %	50 %	0 %	344198537
7005	NC_015942	TGAG	2	8	326033	326040	25 %	25 %	50 %	0 %	344198537
7006	NC_015942	GTT	2	6	326076	326081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198537
7007	NC_015942	CGC	2	6	326113	326118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198537
7008	NC_015942	CGG	2	6	326222	326227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198537
7009	NC_015942	ATGG	2	8	326239	326246	25 %	25 %	50 %	0 %	344198537
7010	NC_015942	CTGG	2	8	326268	326275	0 %	25 %	50 %	25 %	344198537
7011	NC_015942	GCA	2	6	326319	326324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198537
7012	NC_015942	GCA	2	6	326331	326336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198537
7013	NC_015942	AGC	2	6	326357	326362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198537
7014	NC_015942	GGA	2	6	326394	326399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198537
7015	NC_015942	CCG	2	6	326406	326411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198537
7016	NC_015942	CCTGC	2	10	326419	326428	0 %	20 %	20 %	60 %	344198537
7017	NC_015942	CGA	2	6	326456	326461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198537
7018	NC_015942	CCT	2	6	326493	326498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198537
7019	NC_015942	GGA	2	6	326499	326504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198537
7020	NC_015942	GGGT	2	8	326507	326514	0 %	25 %	75 %	0 %	344198537
7021	NC_015942	TGG	2	6	326549	326554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198537
7022	NC_015942	CAG	2	6	326627	326632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198538
7023	NC_015942	CGG	2	6	326741	326746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198538
7024	NC_015942	GGC	2	6	326782	326787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198538
7025	NC_015942	GTCC	2	8	326793	326800	0 %	25 %	25 %	50 %	344198538
7026	NC_015942	ACA	2	6	326809	326814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198538
7027	NC_015942	CGA	2	6	326821	326826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198538
7028	NC_015942	CGA	2	6	326858	326863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198538
7029	NC_015942	CAG	2	6	326908	326913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198538
7030	NC_015942	GAC	2	6	326931	326936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198538
7031	NC_015942	GC	3	6	326955	326960	0 %	0 %	50 %	50 %	344198538
7032	NC_015942	GAT	2	6	327024	327029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198538
7033	NC_015942	TGG	2	6	327128	327133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198538
7034	NC_015942	GGT	2	6	327158	327163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198538
7035	NC_015942	GC	3	6	327214	327219	0 %	0 %	50 %	50 %	344198538
7036	NC_015942	CGG	2	6	327236	327241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198538
7037	NC_015942	TGG	2	6	327245	327250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198538
7038	NC_015942	TGA	2	6	327290	327295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198538
7039	NC_015942	AGGC	2	8	327409	327416	25 %	0 %	50 %	25 %	344198538
7040	NC_015942	CAG	2	6	327417	327422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198538
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7042	NC_015942	AGC	2	6	327495	327500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198539
7043	NC_015942	TCA	3	9	327525	327533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198539
7044	NC_015942	GCA	2	6	327595	327600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198539
7045	NC_015942	GGC	2	6	327623	327628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198539
7046	NC_015942	ACC	2	6	327635	327640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198539
7047	NC_015942	GCCGCA	2	12	327857	327868	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344198539
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7049	NC_015942	C	7	7	327875	327881	0 %	0 %	0 %	100 %	344198539
7050	NC_015942	ATA	2	6	327891	327896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198539
7051	NC_015942	CGC	2	6	327925	327930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198539
7052	NC_015942	CTG	2	6	327944	327949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198539
7053	NC_015942	CCA	2	6	327957	327962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198539
7054	NC_015942	GCT	2	6	328009	328014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198539
7055	NC_015942	TCC	2	6	328023	328028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198539
7056	NC_015942	GCA	2	6	328147	328152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198539
7057	NC_015942	TCA	2	6	328161	328166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198539
7058	NC_015942	GAT	2	6	328210	328215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198539
7059	NC_015942	TCAG	2	8	328239	328246	25 %	25 %	25 %	25 %	344198539
7060	NC_015942	TGA	2	6	328252	328257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198539
7061	NC_015942	GGC	2	6	328265	328270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198539
7062	NC_015942	GCC	2	6	328376	328381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198539
7063	NC_015942	TATGG	2	10	328440	328449	20 %	40 %	40 %	0 %	344198540
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7067	NC_015942	CTGCC	2	10	328686	328695	0 %	20 %	20 %	60 %	344198540
7068	NC_015942	CGC	2	6	328844	328849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198540
7069	NC_015942	TCA	2	6	329065	329070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198540
7070	NC_015942	CGG	2	6	329071	329076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198540
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7072	NC_015942	GAT	2	6	329151	329156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198540
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7083	NC_015942	GAT	2	6	329625	329630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198540
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7088	NC_015942	TGC	2	6	329809	329814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198540
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7091	NC_015942	CGGTG	2	10	329924	329933	0 %	20 %	60 %	20 %	344198540
7092	NC_015942	GTC	2	6	329982	329987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198540
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7119	NC_015942	CTG	2	6	331335	331340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198541
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7121	NC_015942	CCG	2	6	331375	331380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198541
7122	NC_015942	CG	4	8	331424	331431	0 %	0 %	50 %	50 %	344198541
7123	NC_015942	AGC	2	6	331444	331449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198541
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7125	NC_015942	GTG	2	6	331477	331482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198541
7126	NC_015942	ACCAG	2	10	331667	331676	40 %	0 %	20 %	40 %	344198541
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7144	NC_015942	GCT	2	6	333114	333119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198542
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7153	NC_015942	GGC	2	6	333336	333341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198542
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7231	NC_015942	GTTG	2	8	337035	337042	0 %	50 %	50 %	0 %	344198545
7232	NC_015942	CCG	3	9	337052	337060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198545
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7239	NC_015942	GCT	2	6	337399	337404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198546
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7366	NC_015942	GCGCC	2	10	343475	343484	0 %	0 %	40 %	60 %	344198551
7367	NC_015942	GCT	2	6	343490	343495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198551
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7369	NC_015942	CCCGC	2	10	343742	343751	0 %	0 %	20 %	80 %	344198551
7370	NC_015942	TGC	2	6	343768	343773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198551
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7473	NC_015942	TGC	2	6	348572	348577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198557
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7481	NC_015942	CT	3	6	348835	348840	0 %	50 %	0 %	50 %	344198557
7482	NC_015942	TGGCGC	2	12	348841	348852	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344198557
7483	NC_015942	ACG	2	6	348945	348950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198557
7484	NC_015942	CGC	2	6	348998	349003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198557
7485	NC_015942	GGC	2	6	349028	349033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198557
7486	NC_015942	TGC	2	6	349105	349110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198557
7487	NC_015942	TTG	2	6	349143	349148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198557
7488	NC_015942	CTG	2	6	349221	349226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198557
7489	NC_015942	TGCTG	2	10	349337	349346	0 %	40 %	40 %	20 %	344198557
7490	NC_015942	T	6	6	349422	349427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7491	NC_015942	GGA	2	6	349428	349433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7492	NC_015942	CAA	2	6	349467	349472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198558
7493	NC_015942	GCAG	2	8	349626	349633	25 %	0 %	50 %	25 %	344198558
7494	NC_015942	CAG	2	6	349636	349641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198558
7495	NC_015942	GTTT	2	8	349703	349710	0 %	75 %	25 %	0 %	344198558
7496	NC_015942	TGCATC	2	12	349832	349843	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344198558
7497	NC_015942	TCG	2	6	349871	349876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198558
7498	NC_015942	GC	3	6	349878	349883	0 %	0 %	50 %	50 %	344198558
7499	NC_015942	GAC	2	6	349904	349909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7500	NC_015942	CGG	2	6	349923	349928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198559

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