MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015942	GCG	2	6	302868	302873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198516
6502	NC_015942	GC	3	6	302952	302957	0 %	0 %	50 %	50 %	344198516
6503	NC_015942	TGC	2	6	302988	302993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198517
6504	NC_015942	GCG	2	6	303095	303100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198517
6505	NC_015942	GGCGA	2	10	303135	303144	20 %	0 %	60 %	20 %	344198517
6506	NC_015942	CTT	2	6	303200	303205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198517
6507	NC_015942	CAC	2	6	303251	303256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198517
6508	NC_015942	TGG	2	6	303330	303335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198517
6509	NC_015942	GCA	3	9	303395	303403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_015942	GGCG	2	8	303443	303450	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6511	NC_015942	CAG	2	6	303498	303503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_015942	CAT	2	6	303518	303523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6513	NC_015942	TCA	2	6	303703	303708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_015942	AGA	2	6	303715	303720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_015942	TATT	2	8	303721	303728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_015942	TCA	2	6	303798	303803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_015942	GCG	2	6	303831	303836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_015942	TGAG	2	8	303972	303979	25 %	25 %	50 %	0 %	344198518
6519	NC_015942	ATA	2	6	303981	303986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198518
6520	NC_015942	CTG	2	6	304019	304024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198518
6521	NC_015942	GGT	2	6	304045	304050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198518
6522	NC_015942	TAA	2	6	304063	304068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198518
6523	NC_015942	ATG	2	6	304143	304148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198518
6524	NC_015942	GC	3	6	304167	304172	0 %	0 %	50 %	50 %	344198518
6525	NC_015942	CGG	2	6	304206	304211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198518
6526	NC_015942	ACC	3	9	304247	304255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198518
6527	NC_015942	AAAGA	2	10	304286	304295	80 %	0 %	20 %	0 %	344198518
6528	NC_015942	GCC	2	6	304334	304339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198518
6529	NC_015942	CAG	2	6	304403	304408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198518
6530	NC_015942	GCG	2	6	304439	304444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198518
6531	NC_015942	GCG	2	6	304449	304454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198518
6532	NC_015942	ACG	2	6	304458	304463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198518
6533	NC_015942	TCG	2	6	304470	304475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198518
6534	NC_015942	CGG	2	6	304479	304484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198518
6535	NC_015942	GAT	2	6	304507	304512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198518
6536	NC_015942	CGG	2	6	304536	304541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198518
6537	NC_015942	ACG	2	6	304617	304622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198518
6538	NC_015942	TGG	2	6	304818	304823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198518
6539	NC_015942	CAG	2	6	304832	304837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198518
6540	NC_015942	CAT	2	6	305047	305052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198518
6541	NC_015942	CAT	2	6	305078	305083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198518
6542	NC_015942	CGG	2	6	305111	305116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198518
6543	NC_015942	ATG	2	6	305177	305182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198518
6544	NC_015942	A	7	7	305195	305201	100 %	0 %	0 %	0 %	344198518
6545	NC_015942	AGGG	2	8	305326	305333	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_015942	GCG	2	6	305380	305385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198519
6547	NC_015942	GCC	2	6	305431	305436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198519
6548	NC_015942	GAA	2	6	305573	305578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198519
6549	NC_015942	GTGG	2	8	305625	305632	0 %	25 %	75 %	0 %	344198520
6550	NC_015942	T	6	6	305681	305686	0 %	100 %	0 %	0 %	344198520
6551	NC_015942	ACT	2	6	305717	305722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198520
6552	NC_015942	GGA	2	6	305763	305768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198520
6553	NC_015942	GTG	2	6	305791	305796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198520
6554	NC_015942	TGG	2	6	305999	306004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198520
6555	NC_015942	CGA	2	6	306006	306011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198520
6556	NC_015942	GCT	2	6	306027	306032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198520
6557	NC_015942	CCG	2	6	306074	306079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198520
6558	NC_015942	AGG	2	6	306166	306171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198521
6559	NC_015942	CG	3	6	306183	306188	0 %	0 %	50 %	50 %	344198521
6560	NC_015942	CGG	2	6	306252	306257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198521
6561	NC_015942	G	9	9	306276	306284	0 %	0 %	100 %	0 %	344198521
6562	NC_015942	GCC	2	6	306305	306310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198521
6563	NC_015942	GGC	2	6	306317	306322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198521
6564	NC_015942	GCA	3	9	306392	306400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198521
6565	NC_015942	GCTG	2	8	306440	306447	0 %	25 %	50 %	25 %	344198521
6566	NC_015942	TGA	2	6	306464	306469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198521
6567	NC_015942	GGC	2	6	306479	306484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198521
6568	NC_015942	GGCG	2	8	306521	306528	0 %	0 %	75 %	25 %	344198521
6569	NC_015942	CTG	2	6	306582	306587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198521
6570	NC_015942	CAG	2	6	306601	306606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198521
6571	NC_015942	GGA	2	6	306608	306613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198521
6572	NC_015942	TTG	2	6	306633	306638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198521
6573	NC_015942	TGC	2	6	306694	306699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198521
6574	NC_015942	CCG	2	6	306722	306727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198521
6575	NC_015942	CCG	2	6	306757	306762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198521
6576	NC_015942	ATT	2	6	306815	306820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198521
6577	NC_015942	GCG	2	6	306841	306846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198521
6578	NC_015942	CAT	2	6	306884	306889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198522
6579	NC_015942	GAAG	2	8	306971	306978	50 %	0 %	50 %	0 %	344198522
6580	NC_015942	TTGCA	2	10	307013	307022	20 %	40 %	20 %	20 %	344198522
6581	NC_015942	CCT	2	6	307099	307104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198522
6582	NC_015942	CGC	2	6	307108	307113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198522
6583	NC_015942	CGT	2	6	307137	307142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198522
6584	NC_015942	GCGCC	2	10	307151	307160	0 %	0 %	40 %	60 %	344198522
6585	NC_015942	CTA	2	6	307166	307171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198522
6586	NC_015942	CGCA	2	8	307196	307203	25 %	0 %	25 %	50 %	344198522
6587	NC_015942	GC	3	6	307376	307381	0 %	0 %	50 %	50 %	344198523
6588	NC_015942	TTG	2	6	307398	307403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198523
6589	NC_015942	TGG	2	6	307410	307415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198523
6590	NC_015942	GCC	3	9	307416	307424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198523
6591	NC_015942	CTC	2	6	307467	307472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198523
6592	NC_015942	TGCAGG	2	12	307516	307527	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344198523
6593	NC_015942	CAGC	2	8	307542	307549	25 %	0 %	25 %	50 %	344198523
6594	NC_015942	CGCTG	2	10	307562	307571	0 %	20 %	40 %	40 %	344198523
6595	NC_015942	GCC	2	6	307581	307586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198523
6596	NC_015942	GCT	2	6	307664	307669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198523
6597	NC_015942	GGA	2	6	307682	307687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198523
6598	NC_015942	ATG	2	6	307786	307791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198523
6599	NC_015942	CCG	3	9	307792	307800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198523
6600	NC_015942	CTGC	2	8	307860	307867	0 %	25 %	25 %	50 %	344198523
6601	NC_015942	GGT	3	9	307877	307885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198523
6602	NC_015942	TGA	2	6	308038	308043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198523
6603	NC_015942	GTG	3	9	308053	308061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198523
6604	NC_015942	ACCGC	2	10	308123	308132	20 %	0 %	20 %	60 %	344198523
6605	NC_015942	GGCA	2	8	308140	308147	25 %	0 %	50 %	25 %	344198523
6606	NC_015942	GTT	2	6	308156	308161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198523
6607	NC_015942	ACT	2	6	308175	308180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198523
6608	NC_015942	GCC	2	6	308304	308309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198523
6609	NC_015942	GTG	2	6	308330	308335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198523
6610	NC_015942	GTG	2	6	308353	308358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198523
6611	NC_015942	GC	3	6	308408	308413	0 %	0 %	50 %	50 %	344198523
6612	NC_015942	GT	3	6	308489	308494	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_015942	TCC	2	6	308512	308517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6614	NC_015942	CTG	2	6	308543	308548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198524
6615	NC_015942	CAG	2	6	308566	308571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198524
6616	NC_015942	A	7	7	308603	308609	100 %	0 %	0 %	0 %	344198524
6617	NC_015942	TCT	2	6	308646	308651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198524
6618	NC_015942	CCG	2	6	308696	308701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198524
6619	NC_015942	CTG	2	6	308722	308727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198524
6620	NC_015942	GGC	2	6	308748	308753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198524
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6622	NC_015942	CG	3	6	308869	308874	0 %	0 %	50 %	50 %	344198524
6623	NC_015942	TGC	2	6	308912	308917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198524
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6689	NC_015942	ACTGC	2	10	312135	312144	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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6988	NC_015942	TGG	2	6	325478	325483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198537
6989	NC_015942	GGT	2	6	325506	325511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198537
6990	NC_015942	GC	3	6	325585	325590	0 %	0 %	50 %	50 %	344198537
6991	NC_015942	CTGG	2	8	325671	325678	0 %	25 %	50 %	25 %	344198537
6992	NC_015942	GC	3	6	325706	325711	0 %	0 %	50 %	50 %	344198537
6993	NC_015942	TGA	2	6	325761	325766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198537
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