MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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65002	NC_015942	CGC	2	6	3194571	3194576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201326
65003	NC_015942	CCGAAT	2	12	3194596	3194607	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344201326
65004	NC_015942	TAG	2	6	3194623	3194628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201326
65005	NC_015942	TTG	2	6	3194671	3194676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201326
65006	NC_015942	ACC	2	6	3194767	3194772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201326
65007	NC_015942	GTG	2	6	3194839	3194844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201326
65008	NC_015942	AT	4	8	3194927	3194934	50 %	50 %	0 %	0 %	344201326
65009	NC_015942	A	6	6	3194937	3194942	100 %	0 %	0 %	0 %	344201326
65010	NC_015942	AGAT	2	8	3194962	3194969	50 %	25 %	25 %	0 %	344201326
65011	NC_015942	TA	3	6	3195042	3195047	50 %	50 %	0 %	0 %	344201326
65012	NC_015942	CGT	2	6	3195113	3195118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201326
65013	NC_015942	GCA	2	6	3195200	3195205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201326
65014	NC_015942	TAA	2	6	3195235	3195240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201326
65015	NC_015942	GTA	2	6	3195264	3195269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201326
65016	NC_015942	CCT	2	6	3195344	3195349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65017	NC_015942	ACC	2	6	3195359	3195364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65018	NC_015942	ACA	2	6	3195400	3195405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201327
65019	NC_015942	CTTTT	2	10	3195409	3195418	0 %	80 %	0 %	20 %	344201327
65020	NC_015942	GAG	2	6	3195455	3195460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201327
65021	NC_015942	CCG	2	6	3195526	3195531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201327
65022	NC_015942	CCA	2	6	3195534	3195539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201327
65023	NC_015942	T	6	6	3195555	3195560	0 %	100 %	0 %	0 %	344201327
65024	NC_015942	GGT	2	6	3195587	3195592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201327
65025	NC_015942	GCT	2	6	3195659	3195664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201327
65026	NC_015942	TCTGC	2	10	3195701	3195710	0 %	40 %	20 %	40 %	344201327
65027	NC_015942	CCA	2	6	3195779	3195784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201327
65028	NC_015942	GCG	4	12	3195838	3195849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201327
65029	NC_015942	GCG	3	9	3195933	3195941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201327
65030	NC_015942	TTG	2	6	3195961	3195966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201327
65031	NC_015942	AAC	2	6	3196090	3196095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201328
65032	NC_015942	AGG	2	6	3196158	3196163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201328
65033	NC_015942	TCA	2	6	3196196	3196201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201328
65034	NC_015942	GC	3	6	3196281	3196286	0 %	0 %	50 %	50 %	344201328
65035	NC_015942	GGC	2	6	3196299	3196304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201328
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65038	NC_015942	CTG	2	6	3196410	3196415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201328
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65042	NC_015942	CTTTG	2	10	3196797	3196806	0 %	60 %	20 %	20 %	344201328
65043	NC_015942	TA	3	6	3196844	3196849	50 %	50 %	0 %	0 %	344201329
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65051	NC_015942	CGA	2	6	3197095	3197100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201329
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65053	NC_015942	GCG	2	6	3197172	3197177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201329
65054	NC_015942	CCA	2	6	3197188	3197193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201329
65055	NC_015942	CAC	2	6	3197354	3197359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201329
65056	NC_015942	CGA	2	6	3197384	3197389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201329
65057	NC_015942	GCA	2	6	3197394	3197399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201329
65058	NC_015942	GCT	2	6	3197424	3197429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201329
65059	NC_015942	CATGGC	2	12	3197486	3197497	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344201329
65060	NC_015942	TGA	2	6	3197519	3197524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201329
65061	NC_015942	T	7	7	3197532	3197538	0 %	100 %	0 %	0 %	344201329
65062	NC_015942	ACC	2	6	3197575	3197580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201329
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65064	NC_015942	A	6	6	3197733	3197738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65065	NC_015942	CTT	2	6	3197751	3197756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65066	NC_015942	GATA	2	8	3197841	3197848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65067	NC_015942	GCC	2	6	3197850	3197855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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65070	NC_015942	AT	3	6	3197952	3197957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65071	NC_015942	TGC	2	6	3198069	3198074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65072	NC_015942	TA	3	6	3198094	3198099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65073	NC_015942	A	7	7	3198142	3198148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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65092	NC_015942	GC	3	6	3199125	3199130	0 %	0 %	50 %	50 %	344201330
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65099	NC_015942	CAA	2	6	3199509	3199514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201331
65100	NC_015942	CG	3	6	3199583	3199588	0 %	0 %	50 %	50 %	344201331
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65105	NC_015942	CG	3	6	3199780	3199785	0 %	0 %	50 %	50 %	344201331
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65109	NC_015942	GCT	2	6	3200115	3200120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201332
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65113	NC_015942	AC	3	6	3200283	3200288	50 %	0 %	0 %	50 %	344201332
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65118	NC_015942	CCA	2	6	3200434	3200439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201332
65119	NC_015942	ACC	2	6	3200461	3200466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201332
65120	NC_015942	TC	3	6	3200504	3200509	0 %	50 %	0 %	50 %	344201332
65121	NC_015942	GAG	2	6	3200679	3200684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201332
65122	NC_015942	TTGA	2	8	3200721	3200728	25 %	50 %	25 %	0 %	344201332
65123	NC_015942	CTA	2	6	3200780	3200785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201332
65124	NC_015942	GAA	2	6	3200814	3200819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201332
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65126	NC_015942	AT	3	6	3200842	3200847	50 %	50 %	0 %	0 %	344201332
65127	NC_015942	CGC	2	6	3200918	3200923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201332
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65129	NC_015942	GC	3	6	3200939	3200944	0 %	0 %	50 %	50 %	344201332
65130	NC_015942	GC	3	6	3201109	3201114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65131	NC_015942	TCCC	2	8	3201196	3201203	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
65132	NC_015942	A	6	6	3201230	3201235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65133	NC_015942	GA	3	6	3201338	3201343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65134	NC_015942	ACG	2	6	3201357	3201362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65135	NC_015942	CG	3	6	3201361	3201366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65136	NC_015942	GCG	2	6	3201394	3201399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65137	NC_015942	AGG	2	6	3201419	3201424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65138	NC_015942	TCT	2	6	3201465	3201470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65139	NC_015942	AGA	2	6	3201479	3201484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65140	NC_015942	TAA	2	6	3201588	3201593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65141	NC_015942	GGTG	2	8	3201632	3201639	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
65142	NC_015942	CGG	2	6	3201692	3201697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65143	NC_015942	GCT	2	6	3201752	3201757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65144	NC_015942	CG	3	6	3201766	3201771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65145	NC_015942	AAC	2	6	3201797	3201802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65146	NC_015942	GGC	2	6	3201824	3201829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65147	NC_015942	GATACC	2	12	3201965	3201976	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65148	NC_015942	TCGC	2	8	3202033	3202040	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65149	NC_015942	TGAT	2	8	3202103	3202110	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65150	NC_015942	CAAA	2	8	3202113	3202120	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65151	NC_015942	GCG	2	6	3202161	3202166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201333
65152	NC_015942	GCA	2	6	3202189	3202194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201333
65153	NC_015942	TGC	2	6	3202227	3202232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201333
65154	NC_015942	CA	3	6	3202246	3202251	50 %	0 %	0 %	50 %	344201333
65155	NC_015942	CAAA	2	8	3202372	3202379	75 %	0 %	0 %	25 %	344201333
65156	NC_015942	TA	3	6	3202464	3202469	50 %	50 %	0 %	0 %	344201333
65157	NC_015942	TA	3	6	3202587	3202592	50 %	50 %	0 %	0 %	344201333
65158	NC_015942	TACG	2	8	3202662	3202669	25 %	25 %	25 %	25 %	344201333
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65182	NC_015942	AACC	2	8	3203663	3203670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65183	NC_015942	CAT	2	6	3203833	3203838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201334
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65188	NC_015942	CCA	2	6	3203939	3203944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201334
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65209	NC_015942	TCGC	2	8	3204824	3204831	0 %	25 %	25 %	50 %	344201336
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65214	NC_015942	GTA	2	6	3204947	3204952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201336
65215	NC_015942	TCT	2	6	3205002	3205007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201336
65216	NC_015942	GTA	2	6	3205023	3205028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201336
65217	NC_015942	TTC	2	6	3205070	3205075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201336
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65219	NC_015942	TCC	2	6	3205152	3205157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201336
65220	NC_015942	TCC	2	6	3205161	3205166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201336
65221	NC_015942	AAC	2	6	3205257	3205262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201336
65222	NC_015942	GAT	2	6	3205283	3205288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201336
65223	NC_015942	ATC	2	6	3205331	3205336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201336
65224	NC_015942	CAC	2	6	3205403	3205408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201336
65225	NC_015942	TCTGC	2	10	3205423	3205432	0 %	40 %	20 %	40 %	344201336
65226	NC_015942	ATGTT	2	10	3205618	3205627	20 %	60 %	20 %	0 %	344201336
65227	NC_015942	TCA	2	6	3205678	3205683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201336
65228	NC_015942	TAAA	2	8	3205863	3205870	75 %	25 %	0 %	0 %	344201336
65229	NC_015942	GC	3	6	3205960	3205965	0 %	0 %	50 %	50 %	344201336
65230	NC_015942	CAA	2	6	3206081	3206086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201336
65231	NC_015942	CCG	2	6	3206149	3206154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201336
65232	NC_015942	TCC	2	6	3206286	3206291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201336
65233	NC_015942	CCA	2	6	3206326	3206331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201336
65234	NC_015942	CATC	2	8	3206410	3206417	25 %	25 %	0 %	50 %	344201336
65235	NC_015942	CCG	2	6	3206539	3206544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201336
65236	NC_015942	CCCG	2	8	3206550	3206557	0 %	0 %	25 %	75 %	344201336
65237	NC_015942	GGC	2	6	3206636	3206641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201336
65238	NC_015942	AT	3	6	3206722	3206727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65239	NC_015942	GGATGT	2	12	3206738	3206749	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
65240	NC_015942	GCG	2	6	3206796	3206801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65241	NC_015942	TGC	2	6	3206945	3206950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65242	NC_015942	AGG	2	6	3206967	3206972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65243	NC_015942	GTG	2	6	3207051	3207056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65244	NC_015942	CAA	2	6	3207084	3207089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65245	NC_015942	A	6	6	3207091	3207096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65246	NC_015942	TTAT	2	8	3207097	3207104	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65247	NC_015942	ACT	2	6	3207122	3207127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65248	NC_015942	TGTC	2	8	3207241	3207248	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65249	NC_015942	CCG	2	6	3207265	3207270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65250	NC_015942	CGC	2	6	3207293	3207298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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65255	NC_015942	TA	3	6	3207519	3207524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65256	NC_015942	AAAT	2	8	3207539	3207546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

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