MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
63501	NC_015942	CCA	2	6	3123786	3123791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201253
63502	NC_015942	CCG	2	6	3123909	3123914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201254
63503	NC_015942	CTT	2	6	3123925	3123930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201254
63504	NC_015942	GTC	2	6	3123934	3123939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201254
63505	NC_015942	T	6	6	3123949	3123954	0 %	100 %	0 %	0 %	344201254
63506	NC_015942	TCA	2	6	3123969	3123974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201254
63507	NC_015942	ATT	2	6	3123982	3123987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201254
63508	NC_015942	CAC	2	6	3124056	3124061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201254
63509	NC_015942	GGC	2	6	3124066	3124071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201254
63510	NC_015942	CAC	2	6	3124078	3124083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201254
63511	NC_015942	GCC	2	6	3124205	3124210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201254
63512	NC_015942	TGA	2	6	3124260	3124265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201254
63513	NC_015942	CAC	2	6	3124281	3124286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201254
63514	NC_015942	CGGA	2	8	3124321	3124328	25 %	0 %	50 %	25 %	344201254
63515	NC_015942	AGAT	2	8	3124355	3124362	50 %	25 %	25 %	0 %	344201254
63516	NC_015942	TGG	2	6	3124389	3124394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201254
63517	NC_015942	CGCC	2	8	3124413	3124420	0 %	0 %	25 %	75 %	344201254
63518	NC_015942	GAT	2	6	3124429	3124434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201254
63519	NC_015942	CGA	2	6	3124491	3124496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201254
63520	NC_015942	CG	3	6	3124509	3124514	0 %	0 %	50 %	50 %	344201254
63521	NC_015942	CGG	2	6	3124583	3124588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201254
63522	NC_015942	CAA	2	6	3124591	3124596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201254
63523	NC_015942	GCTT	2	8	3124619	3124626	0 %	50 %	25 %	25 %	344201254
63524	NC_015942	CAGC	2	8	3124691	3124698	25 %	0 %	25 %	50 %	344201254
63525	NC_015942	GGC	2	6	3124720	3124725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201254
63526	NC_015942	GGC	2	6	3124741	3124746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201254
63527	NC_015942	GTG	2	6	3124754	3124759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201254
63528	NC_015942	TTC	2	6	3124777	3124782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201254
63529	NC_015942	CAC	2	6	3124792	3124797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201254
63530	NC_015942	TGCAC	2	10	3124839	3124848	20 %	20 %	20 %	40 %	344201254
63531	NC_015942	TGAT	2	8	3124862	3124869	25 %	50 %	25 %	0 %	344201254
63532	NC_015942	GAT	2	6	3124915	3124920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201254
63533	NC_015942	TCA	2	6	3124988	3124993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201254
63534	NC_015942	T	6	6	3125025	3125030	0 %	100 %	0 %	0 %	344201254
63535	NC_015942	CGT	2	6	3125037	3125042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201254
63536	NC_015942	CAC	2	6	3125095	3125100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201254
63537	NC_015942	CAG	2	6	3125107	3125112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201254
63538	NC_015942	GAC	2	6	3125155	3125160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201254
63539	NC_015942	GCC	2	6	3125161	3125166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201254
63540	NC_015942	GCC	2	6	3125245	3125250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201254
63541	NC_015942	GAA	2	6	3125301	3125306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201254
63542	NC_015942	TGA	2	6	3125322	3125327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201254
63543	NC_015942	GTT	2	6	3125412	3125417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201254
63544	NC_015942	TGC	2	6	3125463	3125468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201255
63545	NC_015942	CACG	2	8	3125476	3125483	25 %	0 %	25 %	50 %	344201255
63546	NC_015942	CCA	2	6	3125523	3125528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201255
63547	NC_015942	GCG	2	6	3125535	3125540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201255
63548	NC_015942	ACG	2	6	3125579	3125584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201255
63549	NC_015942	GTC	2	6	3125604	3125609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201255
63550	NC_015942	GGC	2	6	3125678	3125683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201255
63551	NC_015942	TGG	2	6	3125727	3125732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201255
63552	NC_015942	AGC	2	6	3125793	3125798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201255
63553	NC_015942	CT	3	6	3125913	3125918	0 %	50 %	0 %	50 %	344201255
63554	NC_015942	GAT	2	6	3126012	3126017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201256
63555	NC_015942	TCG	2	6	3126034	3126039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201256
63556	NC_015942	ACC	2	6	3126073	3126078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201256
63557	NC_015942	CCA	2	6	3126083	3126088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201256
63558	NC_015942	GCA	2	6	3126098	3126103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201256
63559	NC_015942	GGTT	2	8	3126116	3126123	0 %	50 %	50 %	0 %	344201256
63560	NC_015942	GC	4	8	3126139	3126146	0 %	0 %	50 %	50 %	344201256
63561	NC_015942	GAT	2	6	3126153	3126158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201256
63562	NC_015942	CCT	2	6	3126167	3126172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201256
63563	NC_015942	GCC	2	6	3126241	3126246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201256
63564	NC_015942	AGC	2	6	3126265	3126270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201256
63565	NC_015942	TCT	2	6	3126301	3126306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201256
63566	NC_015942	GCT	2	6	3126319	3126324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201256
63567	NC_015942	CG	3	6	3126345	3126350	0 %	0 %	50 %	50 %	344201256
63568	NC_015942	GTC	2	6	3126354	3126359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201256
63569	NC_015942	CATA	2	8	3126380	3126387	50 %	25 %	0 %	25 %	344201256
63570	NC_015942	ACA	2	6	3126395	3126400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201256
63571	NC_015942	CCA	2	6	3126404	3126409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201256
63572	NC_015942	TACC	2	8	3126452	3126459	25 %	25 %	0 %	50 %	344201256
63573	NC_015942	AAT	2	6	3126558	3126563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201257
63574	NC_015942	GCG	2	6	3126700	3126705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201257
63575	NC_015942	AGC	2	6	3126735	3126740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201257
63576	NC_015942	AAT	2	6	3126744	3126749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201257
63577	NC_015942	AAT	2	6	3126794	3126799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63578	NC_015942	CAC	2	6	3126931	3126936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201258
63579	NC_015942	GCA	2	6	3126938	3126943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201258
63580	NC_015942	CAG	3	9	3126948	3126956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201258
63581	NC_015942	ATG	3	9	3127039	3127047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201258
63582	NC_015942	GCCA	2	8	3127057	3127064	25 %	0 %	25 %	50 %	344201258
63583	NC_015942	CCA	2	6	3127130	3127135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201258
63584	NC_015942	CAG	2	6	3127137	3127142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201258
63585	NC_015942	CGT	2	6	3127167	3127172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201258
63586	NC_015942	TCA	2	6	3127268	3127273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201258
63587	NC_015942	TCA	2	6	3127351	3127356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201258
63588	NC_015942	CCAG	2	8	3127376	3127383	25 %	0 %	25 %	50 %	344201258
63589	NC_015942	CAC	2	6	3127425	3127430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201258
63590	NC_015942	TGA	2	6	3127439	3127444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201258
63591	NC_015942	ACCCA	2	10	3127462	3127471	40 %	0 %	0 %	60 %	344201258
63592	NC_015942	CAA	2	6	3127759	3127764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201259
63593	NC_015942	GCT	2	6	3127827	3127832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201259
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63596	NC_015942	GTTT	2	8	3127935	3127942	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63597	NC_015942	T	6	6	3127940	3127945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63598	NC_015942	TCA	2	6	3128031	3128036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201260
63599	NC_015942	AC	3	6	3128044	3128049	50 %	0 %	0 %	50 %	344201260
63600	NC_015942	GCC	2	6	3128067	3128072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201260
63601	NC_015942	TCC	2	6	3128085	3128090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201260
63602	NC_015942	CGC	2	6	3128107	3128112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201260
63603	NC_015942	GCG	2	6	3128154	3128159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201260
63604	NC_015942	GCA	2	6	3128175	3128180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201260
63605	NC_015942	GGCCC	2	10	3128213	3128222	0 %	0 %	40 %	60 %	344201260
63606	NC_015942	GAC	2	6	3128270	3128275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201260
63607	NC_015942	GCA	2	6	3128386	3128391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201260
63608	NC_015942	GGC	2	6	3128411	3128416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201260
63609	NC_015942	TCG	2	6	3128466	3128471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201260
63610	NC_015942	CTT	2	6	3128494	3128499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201260
63611	NC_015942	GCG	2	6	3128624	3128629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201260
63612	NC_015942	CCG	3	9	3128655	3128663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201260
63613	NC_015942	CAC	2	6	3128687	3128692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201260
63614	NC_015942	GGC	2	6	3128711	3128716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201260
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63616	NC_015942	CTC	2	6	3128732	3128737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201260
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63725	NC_015942	A	6	6	3133151	3133156	100 %	0 %	0 %	0 %	344201265
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63731	NC_015942	GGC	2	6	3133394	3133399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201266
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