MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
63001	NC_015942	GCCA	2	8	3096822	3096829	25 %	0 %	25 %	50 %	344201230
63002	NC_015942	CCG	2	6	3096879	3096884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201230
63003	NC_015942	T	8	8	3096909	3096916	0 %	100 %	0 %	0 %	344201231
63004	NC_015942	CTT	2	6	3097043	3097048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201231
63005	NC_015942	GGC	2	6	3097148	3097153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201231
63006	NC_015942	TGC	2	6	3097172	3097177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201231
63007	NC_015942	TCC	2	6	3097188	3097193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63008	NC_015942	ACA	2	6	3097201	3097206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63009	NC_015942	CATGC	2	10	3097276	3097285	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63010	NC_015942	ATGGC	2	10	3097300	3097309	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63011	NC_015942	GCA	2	6	3097342	3097347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63012	NC_015942	GCG	2	6	3097386	3097391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63013	NC_015942	TGC	2	6	3097406	3097411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63014	NC_015942	ACC	2	6	3097524	3097529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63015	NC_015942	TGGC	2	8	3097719	3097726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63016	NC_015942	ATC	2	6	3097748	3097753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63017	NC_015942	A	7	7	3097786	3097792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63018	NC_015942	GTCC	2	8	3097835	3097842	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63019	NC_015942	GC	3	6	3097868	3097873	0 %	0 %	50 %	50 %	344201232
63020	NC_015942	TTG	2	6	3097900	3097905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201232
63021	NC_015942	GGAC	2	8	3097987	3097994	25 %	0 %	50 %	25 %	344201232
63022	NC_015942	GGAT	2	8	3097995	3098002	25 %	25 %	50 %	0 %	344201232
63023	NC_015942	AGC	2	6	3098024	3098029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201232
63024	NC_015942	ATGC	2	8	3098032	3098039	25 %	25 %	25 %	25 %	344201232
63025	NC_015942	GCC	2	6	3098164	3098169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201232
63026	NC_015942	TTG	2	6	3098275	3098280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63027	NC_015942	CTG	2	6	3098359	3098364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201233
63028	NC_015942	AATTAG	2	12	3098367	3098378	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	344201233
63029	NC_015942	AAT	2	6	3098518	3098523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201233
63030	NC_015942	T	6	6	3098528	3098533	0 %	100 %	0 %	0 %	344201233
63031	NC_015942	GCG	2	6	3098561	3098566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201233
63032	NC_015942	GC	3	6	3098588	3098593	0 %	0 %	50 %	50 %	344201233
63033	NC_015942	CAA	2	6	3098848	3098853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201233
63034	NC_015942	AGTC	2	8	3098900	3098907	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63035	NC_015942	TGG	2	6	3099128	3099133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63036	NC_015942	GCA	2	6	3099190	3099195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63037	NC_015942	TGC	2	6	3099234	3099239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201234
63038	NC_015942	GCC	2	6	3099270	3099275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201234
63039	NC_015942	GA	3	6	3099318	3099323	50 %	0 %	50 %	0 %	344201234
63040	NC_015942	GCGG	2	8	3099329	3099336	0 %	0 %	75 %	25 %	344201234
63041	NC_015942	CA	3	6	3099609	3099614	50 %	0 %	0 %	50 %	344201234
63042	NC_015942	TCC	2	6	3099641	3099646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201234
63043	NC_015942	ATA	2	6	3099676	3099681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201234
63044	NC_015942	CCA	2	6	3099683	3099688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201234
63045	NC_015942	GCA	2	6	3099770	3099775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201234
63046	NC_015942	GTT	2	6	3099940	3099945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201234
63047	NC_015942	GCCA	2	8	3100038	3100045	25 %	0 %	25 %	50 %	344201234
63048	NC_015942	CCG	2	6	3100095	3100100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201234
63049	NC_015942	T	8	8	3100125	3100132	0 %	100 %	0 %	0 %	344201235
63050	NC_015942	CTT	2	6	3100259	3100264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201235
63051	NC_015942	GGC	2	6	3100364	3100369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201235
63052	NC_015942	TGC	2	6	3100388	3100393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201235
63053	NC_015942	TCC	2	6	3100404	3100409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63054	NC_015942	ACA	2	6	3100417	3100422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63055	NC_015942	A	6	6	3100492	3100497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63056	NC_015942	CAG	2	6	3100533	3100538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63057	NC_015942	GGT	2	6	3100553	3100558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63058	NC_015942	GAT	2	6	3100567	3100572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63059	NC_015942	GATA	2	8	3100633	3100640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63060	NC_015942	AGG	2	6	3100717	3100722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63061	NC_015942	TGA	2	6	3100723	3100728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63062	NC_015942	ACT	2	6	3100780	3100785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63063	NC_015942	ATA	2	6	3100851	3100856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63064	NC_015942	A	7	7	3101051	3101057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63065	NC_015942	ATG	2	6	3101145	3101150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63066	NC_015942	TAA	2	6	3101165	3101170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63067	NC_015942	GGC	2	6	3101214	3101219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63068	NC_015942	AAG	2	6	3101220	3101225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63069	NC_015942	AGTAA	2	10	3101302	3101311	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63070	NC_015942	ATT	2	6	3101315	3101320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63071	NC_015942	CAAA	2	8	3101452	3101459	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63072	NC_015942	A	6	6	3101457	3101462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63073	NC_015942	ATAA	2	8	3101553	3101560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63074	NC_015942	TTGG	3	12	3101654	3101665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63075	NC_015942	AATA	2	8	3101708	3101715	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63076	NC_015942	GGA	2	6	3101757	3101762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63077	NC_015942	AAACCA	2	12	3101846	3101857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63078	NC_015942	AAC	2	6	3101927	3101932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63079	NC_015942	GTT	2	6	3101996	3102001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63080	NC_015942	T	6	6	3102167	3102172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63081	NC_015942	ATT	2	6	3102250	3102255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63082	NC_015942	GAAA	2	8	3102348	3102355	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63083	NC_015942	TGG	2	6	3102391	3102396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63084	NC_015942	TGGCA	2	10	3102403	3102412	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63085	NC_015942	AGA	2	6	3102553	3102558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63086	NC_015942	A	6	6	3102607	3102612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63087	NC_015942	TTC	2	6	3102785	3102790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63088	NC_015942	GAGAT	2	10	3102843	3102852	40 %	20 %	40 %	0 %	344201236
63089	NC_015942	CTGC	2	8	3102926	3102933	0 %	25 %	25 %	50 %	344201236
63090	NC_015942	CTA	2	6	3103038	3103043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201236
63091	NC_015942	AT	3	6	3103045	3103050	50 %	50 %	0 %	0 %	344201236
63092	NC_015942	AGG	2	6	3103081	3103086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201236
63093	NC_015942	CTG	2	6	3103133	3103138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201236
63094	NC_015942	TTG	2	6	3103251	3103256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201236
63095	NC_015942	CAA	3	9	3103411	3103419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201236
63096	NC_015942	ATG	2	6	3103470	3103475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201236
63097	NC_015942	AATG	2	8	3103519	3103526	50 %	25 %	25 %	0 %	344201236
63098	NC_015942	TTA	2	6	3103614	3103619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201236
63099	NC_015942	GCT	2	6	3103645	3103650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201236
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63101	NC_015942	TATT	2	8	3103745	3103752	25 %	75 %	0 %	0 %	344201237
63102	NC_015942	CCT	2	6	3103762	3103767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201237
63103	NC_015942	GGC	2	6	3103814	3103819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201237
63104	NC_015942	T	7	7	3103822	3103828	0 %	100 %	0 %	0 %	344201237
63105	NC_015942	TAT	2	6	3103831	3103836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201237
63106	NC_015942	CTGG	2	8	3103838	3103845	0 %	25 %	50 %	25 %	344201237
63107	NC_015942	CTT	2	6	3103877	3103882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201237
63108	NC_015942	AT	3	6	3103889	3103894	50 %	50 %	0 %	0 %	344201237
63109	NC_015942	ATG	2	6	3103944	3103949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201237
63110	NC_015942	TA	3	6	3103958	3103963	50 %	50 %	0 %	0 %	344201237
63111	NC_015942	TAA	2	6	3104037	3104042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201237
63112	NC_015942	A	6	6	3104191	3104196	100 %	0 %	0 %	0 %	344201237
63113	NC_015942	GAG	2	6	3104239	3104244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201237
63114	NC_015942	CAT	2	6	3104256	3104261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201237
63115	NC_015942	CTT	2	6	3104272	3104277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201237
63116	NC_015942	T	6	6	3104285	3104290	0 %	100 %	0 %	0 %	344201237
63117	NC_015942	AGGA	2	8	3104340	3104347	50 %	0 %	50 %	0 %	344201237
63118	NC_015942	AAG	2	6	3104387	3104392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201237
63119	NC_015942	A	7	7	3104458	3104464	100 %	0 %	0 %	0 %	344201237
63120	NC_015942	TA	3	6	3104543	3104548	50 %	50 %	0 %	0 %	344201237
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63122	NC_015942	TTG	2	6	3104669	3104674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201237
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63241	NC_015942	GCC	2	6	3110318	3110323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201244
63242	NC_015942	CA	3	6	3110340	3110345	50 %	0 %	0 %	50 %	344201244
63243	NC_015942	CAT	2	6	3110354	3110359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201244
63244	NC_015942	TGC	2	6	3110425	3110430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201244
63245	NC_015942	GAG	2	6	3110445	3110450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201244
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63247	NC_015942	ATCG	2	8	3110595	3110602	25 %	25 %	25 %	25 %	344201244
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63249	NC_015942	GC	3	6	3110683	3110688	0 %	0 %	50 %	50 %	344201244
63250	NC_015942	GC	4	8	3110693	3110700	0 %	0 %	50 %	50 %	344201244
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63307	NC_015942	GCA	2	6	3113396	3113401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201244
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63341	NC_015942	GC	3	6	3115493	3115498	0 %	0 %	50 %	50 %	344201246
63342	NC_015942	T	6	6	3115510	3115515	0 %	100 %	0 %	0 %	344201246
63343	NC_015942	CG	3	6	3115615	3115620	0 %	0 %	50 %	50 %	344201246
63344	NC_015942	C	6	6	3115649	3115654	0 %	0 %	0 %	100 %	344201246
63345	NC_015942	ATC	2	6	3115710	3115715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201246
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63349	NC_015942	ATC	2	6	3115893	3115898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201246
63350	NC_015942	CA	3	6	3115909	3115914	50 %	0 %	0 %	50 %	344201246
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63353	NC_015942	AC	3	6	3116069	3116074	50 %	0 %	0 %	50 %	344201247
63354	NC_015942	TGC	2	6	3116111	3116116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201247
63355	NC_015942	GAG	2	6	3116117	3116122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201247
63356	NC_015942	A	6	6	3116249	3116254	100 %	0 %	0 %	0 %	344201247
63357	NC_015942	AGT	2	6	3116284	3116289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201247
63358	NC_015942	GCT	2	6	3116409	3116414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201247
63359	NC_015942	CGT	2	6	3116437	3116442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201247
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63449	NC_015942	GCA	2	6	3121126	3121131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201251
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63457	NC_015942	CCA	3	9	3121471	3121479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201251
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63470	NC_015942	GTC	2	6	3122007	3122012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201252
63471	NC_015942	ATC	2	6	3122033	3122038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201252
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63473	NC_015942	TTC	2	6	3122117	3122122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201252
63474	NC_015942	AGC	2	6	3122166	3122171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201252
63475	NC_015942	GC	3	6	3122283	3122288	0 %	0 %	50 %	50 %	344201252
63476	NC_015942	TCAT	2	8	3122307	3122314	25 %	50 %	0 %	25 %	344201252
63477	NC_015942	CAT	2	6	3122459	3122464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201252
63478	NC_015942	CGC	2	6	3122576	3122581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201252
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63480	NC_015942	CG	3	6	3122782	3122787	0 %	0 %	50 %	50 %	344201252
63481	NC_015942	CCG	3	9	3123006	3123014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201253
63482	NC_015942	GC	3	6	3123058	3123063	0 %	0 %	50 %	50 %	344201253
63483	NC_015942	TTG	2	6	3123065	3123070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201253
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63488	NC_015942	CG	3	6	3123262	3123267	0 %	0 %	50 %	50 %	344201253
63489	NC_015942	GCA	2	6	3123300	3123305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201253
63490	NC_015942	GCA	2	6	3123327	3123332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201253
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63500	NC_015942	GC	4	8	3123762	3123769	0 %	0 %	50 %	50 %	344201253

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