MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
62001	NC_015942	TAA	2	6	3048290	3048295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62002	NC_015942	A	6	6	3048374	3048379	100 %	0 %	0 %	0 %	344201187
62003	NC_015942	CAAC	2	8	3048460	3048467	50 %	0 %	0 %	50 %	344201187
62004	NC_015942	ACCAG	2	10	3048492	3048501	40 %	0 %	20 %	40 %	344201187
62005	NC_015942	GCGA	2	8	3048538	3048545	25 %	0 %	50 %	25 %	344201187
62006	NC_015942	CAA	2	6	3048578	3048583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201187
62007	NC_015942	TGC	2	6	3048615	3048620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201187
62008	NC_015942	CAA	2	6	3048638	3048643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201187
62009	NC_015942	CTC	2	6	3048697	3048702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62010	NC_015942	AGCA	2	8	3048725	3048732	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62011	NC_015942	TGCA	2	8	3048769	3048776	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62012	NC_015942	GCT	2	6	3048930	3048935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62013	NC_015942	ACA	2	6	3049022	3049027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62014	NC_015942	GTG	2	6	3049082	3049087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62015	NC_015942	TA	3	6	3049116	3049121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62016	NC_015942	TGC	2	6	3049198	3049203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62017	NC_015942	CGG	2	6	3049246	3049251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62018	NC_015942	TATC	2	8	3049282	3049289	25 %	50 %	0 %	25 %	344201188
62019	NC_015942	GTTTT	2	10	3049378	3049387	0 %	80 %	20 %	0 %	344201188
62020	NC_015942	CGG	2	6	3049389	3049394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201188
62021	NC_015942	TCC	2	6	3049404	3049409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201188
62022	NC_015942	CTT	2	6	3049431	3049436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201188
62023	NC_015942	TAG	2	6	3049580	3049585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201188
62024	NC_015942	CGA	2	6	3049610	3049615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201188
62025	NC_015942	CGG	2	6	3049653	3049658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201188
62026	NC_015942	CGT	2	6	3049716	3049721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201189
62027	NC_015942	ACCA	2	8	3049845	3049852	50 %	0 %	0 %	50 %	344201189
62028	NC_015942	CCGC	2	8	3049891	3049898	0 %	0 %	25 %	75 %	344201189
62029	NC_015942	GT	3	6	3049921	3049926	0 %	50 %	50 %	0 %	344201189
62030	NC_015942	T	6	6	3050001	3050006	0 %	100 %	0 %	0 %	344201189
62031	NC_015942	TACA	2	8	3050049	3050056	50 %	25 %	0 %	25 %	344201189
62032	NC_015942	CAC	2	6	3050147	3050152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62033	NC_015942	AGT	2	6	3050170	3050175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62034	NC_015942	CAG	2	6	3050221	3050226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201190
62035	NC_015942	TTC	2	6	3050254	3050259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201190
62036	NC_015942	TGC	2	6	3050269	3050274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201190
62037	NC_015942	TCCG	2	8	3050282	3050289	0 %	25 %	25 %	50 %	344201190
62038	NC_015942	CAC	2	6	3050318	3050323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201190
62039	NC_015942	CGA	2	6	3050325	3050330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201190
62040	NC_015942	CAG	2	6	3050500	3050505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201190
62041	NC_015942	GCA	2	6	3050579	3050584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201190
62042	NC_015942	GCG	2	6	3050664	3050669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201190
62043	NC_015942	AGG	2	6	3050849	3050854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201190
62044	NC_015942	AAG	2	6	3050901	3050906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62045	NC_015942	AAT	2	6	3050984	3050989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201191
62046	NC_015942	T	6	6	3050996	3051001	0 %	100 %	0 %	0 %	344201191
62047	NC_015942	TTG	2	6	3051152	3051157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62048	NC_015942	CCA	2	6	3051254	3051259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201192
62049	NC_015942	GCA	2	6	3051325	3051330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201192
62050	NC_015942	GC	3	6	3051382	3051387	0 %	0 %	50 %	50 %	344201192
62051	NC_015942	ACCCCC	2	12	3051463	3051474	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	344201192
62052	NC_015942	CGC	2	6	3051502	3051507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201192
62053	NC_015942	GCT	2	6	3051528	3051533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201193
62054	NC_015942	GCA	2	6	3051537	3051542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201193
62055	NC_015942	CAG	2	6	3051610	3051615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201193
62056	NC_015942	CAC	2	6	3051725	3051730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201193
62057	NC_015942	CGT	2	6	3051787	3051792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201193
62058	NC_015942	CCT	2	6	3051819	3051824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201193
62059	NC_015942	GGGT	2	8	3051863	3051870	0 %	25 %	75 %	0 %	344201193
62060	NC_015942	GTG	2	6	3051880	3051885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201193
62061	NC_015942	CG	3	6	3051909	3051914	0 %	0 %	50 %	50 %	344201193
62062	NC_015942	GCA	2	6	3052110	3052115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201194
62063	NC_015942	A	6	6	3052122	3052127	100 %	0 %	0 %	0 %	344201194
62064	NC_015942	ACCG	2	8	3052176	3052183	25 %	0 %	25 %	50 %	344201194
62065	NC_015942	GTT	2	6	3052184	3052189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201194
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62068	NC_015942	TCA	2	6	3052247	3052252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201194
62069	NC_015942	GGC	2	6	3052430	3052435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201195
62070	NC_015942	A	7	7	3052479	3052485	100 %	0 %	0 %	0 %	344201195
62071	NC_015942	CTC	2	6	3052518	3052523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201195
62072	NC_015942	ATGATC	2	12	3052537	3052548	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	344201195
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62076	NC_015942	ATG	2	6	3052690	3052695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201195
62077	NC_015942	CTT	2	6	3052704	3052709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201195
62078	NC_015942	TCC	2	6	3052743	3052748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201196
62079	NC_015942	CAT	2	6	3052801	3052806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201196
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62082	NC_015942	ACCG	2	8	3052898	3052905	25 %	0 %	25 %	50 %	344201196
62083	NC_015942	GCG	2	6	3052924	3052929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201196
62084	NC_015942	TCA	2	6	3053032	3053037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201196
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62086	NC_015942	CCA	2	6	3053098	3053103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201196
62087	NC_015942	ACC	2	6	3053139	3053144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201196
62088	NC_015942	AGA	2	6	3053169	3053174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201196
62089	NC_015942	CAT	2	6	3053336	3053341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201196
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62091	NC_015942	ACC	2	6	3053378	3053383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201196
62092	NC_015942	CTG	2	6	3053401	3053406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201196
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62094	NC_015942	GCCGG	2	10	3053464	3053473	0 %	0 %	60 %	40 %	344201196
62095	NC_015942	CGTC	2	8	3053503	3053510	0 %	25 %	25 %	50 %	344201196
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62101	NC_015942	GGC	2	6	3053606	3053611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201196
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62105	NC_015942	CCAA	2	8	3053745	3053752	50 %	0 %	0 %	50 %	344201196
62106	NC_015942	AAG	2	6	3053753	3053758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201196
62107	NC_015942	GATA	2	8	3053851	3053858	50 %	25 %	25 %	0 %	344201196
62108	NC_015942	CAT	3	9	3053971	3053979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201196
62109	NC_015942	CGCA	2	8	3054047	3054054	25 %	0 %	25 %	50 %	344201196
62110	NC_015942	TAAG	2	8	3054144	3054151	50 %	25 %	25 %	0 %	344201196
62111	NC_015942	GCA	2	6	3054247	3054252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201196
62112	NC_015942	CTC	2	6	3054278	3054283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201196
62113	NC_015942	T	6	6	3054321	3054326	0 %	100 %	0 %	0 %	344201196
62114	NC_015942	A	6	6	3054378	3054383	100 %	0 %	0 %	0 %	344201196
62115	NC_015942	A	6	6	3054398	3054403	100 %	0 %	0 %	0 %	344201196
62116	NC_015942	GAC	2	6	3054790	3054795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201196
62117	NC_015942	GGC	2	6	3054796	3054801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201196
62118	NC_015942	GGAT	2	8	3054841	3054848	25 %	25 %	50 %	0 %	344201196
62119	NC_015942	ATG	2	6	3054935	3054940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201196
62120	NC_015942	CCT	2	6	3054949	3054954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201196
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62235	NC_015942	GAAT	2	8	3060227	3060234	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62236	NC_015942	CACCGG	2	12	3060270	3060281	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62237	NC_015942	CAT	2	6	3060318	3060323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62238	NC_015942	GTT	2	6	3060411	3060416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201200
62239	NC_015942	GA	3	6	3060476	3060481	50 %	0 %	50 %	0 %	344201200
62240	NC_015942	TTC	2	6	3060498	3060503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201200
62241	NC_015942	CCG	2	6	3060557	3060562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201200
62242	NC_015942	T	6	6	3060591	3060596	0 %	100 %	0 %	0 %	344201200
62243	NC_015942	GAATC	2	10	3060760	3060769	40 %	20 %	20 %	20 %	344201200
62244	NC_015942	TTG	2	6	3060796	3060801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201200
62245	NC_015942	AGC	2	6	3060814	3060819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201200
62246	NC_015942	TGG	2	6	3060878	3060883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201200
62247	NC_015942	GATC	2	8	3060893	3060900	25 %	25 %	25 %	25 %	344201200
62248	NC_015942	AGC	2	6	3060901	3060906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201200
62249	NC_015942	GA	3	6	3060913	3060918	50 %	0 %	50 %	0 %	344201200
62250	NC_015942	CAT	2	6	3060942	3060947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201200
62251	NC_015942	GCT	2	6	3060962	3060967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201200
62252	NC_015942	GC	3	6	3060991	3060996	0 %	0 %	50 %	50 %	344201200
62253	NC_015942	CTTG	2	8	3061031	3061038	0 %	50 %	25 %	25 %	344201200
62254	NC_015942	TCA	2	6	3061123	3061128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201200
62255	NC_015942	CAC	2	6	3061142	3061147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201200
62256	NC_015942	CGG	2	6	3061233	3061238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201200
62257	NC_015942	TGG	2	6	3061268	3061273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201200
62258	NC_015942	GAA	2	6	3061287	3061292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201200
62259	NC_015942	CAT	2	6	3061322	3061327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201200
62260	NC_015942	CGCCGG	2	12	3061328	3061339	0 %	0 %	50 %	50 %	344201200
62261	NC_015942	TGC	2	6	3061390	3061395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201200
62262	NC_015942	GTC	2	6	3061461	3061466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201200
62263	NC_015942	TGC	2	6	3061519	3061524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201200
62264	NC_015942	GCA	2	6	3061531	3061536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201200
62265	NC_015942	CG	3	6	3061553	3061558	0 %	0 %	50 %	50 %	344201200
62266	NC_015942	CTG	2	6	3061584	3061589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201200
62267	NC_015942	CAG	2	6	3061650	3061655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201200
62268	NC_015942	GC	3	6	3061668	3061673	0 %	0 %	50 %	50 %	344201200
62269	NC_015942	GT	3	6	3061714	3061719	0 %	50 %	50 %	0 %	344201200
62270	NC_015942	CAAC	2	8	3061787	3061794	50 %	0 %	0 %	50 %	344201200
62271	NC_015942	GTG	2	6	3061846	3061851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201200
62272	NC_015942	TGA	2	6	3061858	3061863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201200
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62275	NC_015942	AAT	2	6	3061971	3061976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201200
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62281	NC_015942	GCG	2	6	3062082	3062087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201200
62282	NC_015942	GC	3	6	3062201	3062206	0 %	0 %	50 %	50 %	344201200
62283	NC_015942	GCCC	2	8	3062228	3062235	0 %	0 %	25 %	75 %	344201200
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62289	NC_015942	ACC	2	6	3062509	3062514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201200
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62291	NC_015942	AGG	2	6	3062612	3062617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201200
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62302	NC_015942	CG	3	6	3063133	3063138	0 %	0 %	50 %	50 %	344201201
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62305	NC_015942	TCG	2	6	3063190	3063195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201201
62306	NC_015942	CG	3	6	3063217	3063222	0 %	0 %	50 %	50 %	344201201
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62327	NC_015942	GGTG	2	8	3064315	3064322	0 %	25 %	75 %	0 %	344201203
62328	NC_015942	CGT	2	6	3064329	3064334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201203
62329	NC_015942	CGC	2	6	3064343	3064348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201203
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62332	NC_015942	CTG	2	6	3064429	3064434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62333	NC_015942	GCT	2	6	3064437	3064442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62334	NC_015942	CCG	2	6	3064449	3064454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62335	NC_015942	TGC	2	6	3064703	3064708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201204
62336	NC_015942	TC	3	6	3064740	3064745	0 %	50 %	0 %	50 %	344201205
62337	NC_015942	CTC	2	6	3064795	3064800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201205
62338	NC_015942	GCA	2	6	3064803	3064808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201205
62339	NC_015942	CTG	2	6	3064833	3064838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201205
62340	NC_015942	AGT	2	6	3064854	3064859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201205
62341	NC_015942	CTT	2	6	3064866	3064871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201205
62342	NC_015942	TCC	2	6	3064922	3064927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201205
62343	NC_015942	GGC	2	6	3064949	3064954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201205
62344	NC_015942	CTC	2	6	3065023	3065028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201205
62345	NC_015942	GC	3	6	3065058	3065063	0 %	0 %	50 %	50 %	344201205
62346	NC_015942	GC	4	8	3065133	3065140	0 %	0 %	50 %	50 %	344201205
62347	NC_015942	CAT	2	6	3065152	3065157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201205
62348	NC_015942	GTA	2	6	3065251	3065256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201206
62349	NC_015942	ATG	2	6	3065286	3065291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201206
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62351	NC_015942	CCG	2	6	3065347	3065352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201206
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62468	NC_015942	AGT	2	6	3070626	3070631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201212
62469	NC_015942	T	6	6	3070713	3070718	0 %	100 %	0 %	0 %	344201212
62470	NC_015942	CTTT	2	8	3070801	3070808	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62471	NC_015942	CG	3	6	3070811	3070816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62472	NC_015942	CGC	2	6	3070837	3070842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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