MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61001	NC_015942	GAG	2	6	2998846	2998851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201139
61002	NC_015942	CACT	2	8	2998854	2998861	25 %	25 %	0 %	50 %	344201139
61003	NC_015942	CGA	2	6	2998988	2998993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201140
61004	NC_015942	CGC	2	6	2999003	2999008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201140
61005	NC_015942	GCC	2	6	2999012	2999017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201140
61006	NC_015942	TCG	2	6	2999029	2999034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201140
61007	NC_015942	CG	3	6	2999044	2999049	0 %	0 %	50 %	50 %	344201140
61008	NC_015942	CA	3	6	2999054	2999059	50 %	0 %	0 %	50 %	344201140
61009	NC_015942	CA	3	6	2999061	2999066	50 %	0 %	0 %	50 %	344201140
61010	NC_015942	TCGTCT	2	12	2999143	2999154	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	344201140
61011	NC_015942	TCG	2	6	2999225	2999230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201140
61012	NC_015942	TTTCAC	2	12	2999278	2999289	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61013	NC_015942	GGC	2	6	2999351	2999356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201141
61014	NC_015942	GAT	2	6	2999426	2999431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201141
61015	NC_015942	CAC	2	6	2999507	2999512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201141
61016	NC_015942	CAT	2	6	2999636	2999641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201141
61017	NC_015942	T	6	6	2999664	2999669	0 %	100 %	0 %	0 %	344201141
61018	NC_015942	CTGT	2	8	2999748	2999755	0 %	50 %	25 %	25 %	344201142
61019	NC_015942	CCA	2	6	2999804	2999809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201142
61020	NC_015942	CCT	2	6	2999911	2999916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201142
61021	NC_015942	CGA	2	6	2999930	2999935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201142
61022	NC_015942	GGC	3	9	2999994	3000002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201142
61023	NC_015942	T	6	6	3000053	3000058	0 %	100 %	0 %	0 %	344201142
61024	NC_015942	CCG	2	6	3000068	3000073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201142
61025	NC_015942	CGC	2	6	3000162	3000167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201142
61026	NC_015942	C	6	6	3000262	3000267	0 %	0 %	0 %	100 %	344201142
61027	NC_015942	GCC	2	6	3000311	3000316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201142
61028	NC_015942	GGT	2	6	3000321	3000326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201142
61029	NC_015942	TGT	2	6	3000419	3000424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201142
61030	NC_015942	AGG	2	6	3000430	3000435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201142
61031	NC_015942	GCTG	2	8	3000437	3000444	0 %	25 %	50 %	25 %	344201142
61032	NC_015942	GCG	2	6	3000478	3000483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201142
61033	NC_015942	AAC	2	6	3000507	3000512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201142
61034	NC_015942	T	7	7	3000527	3000533	0 %	100 %	0 %	0 %	344201142
61035	NC_015942	TTTC	2	8	3000547	3000554	0 %	75 %	0 %	25 %	344201142
61036	NC_015942	CGA	2	6	3000758	3000763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201142
61037	NC_015942	TAT	2	6	3000836	3000841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201142
61038	NC_015942	TGT	2	6	3000863	3000868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201142
61039	NC_015942	AGA	2	6	3000929	3000934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61040	NC_015942	TGT	2	6	3001024	3001029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61041	NC_015942	AGC	2	6	3001094	3001099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61042	NC_015942	T	7	7	3001139	3001145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61043	NC_015942	CCTC	2	8	3001170	3001177	0 %	25 %	0 %	75 %	344201143
61044	NC_015942	GCC	2	6	3001216	3001221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201143
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61048	NC_015942	CTT	2	6	3001659	3001664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61049	NC_015942	ATA	2	6	3001665	3001670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61050	NC_015942	AACG	2	8	3001756	3001763	50 %	0 %	25 %	25 %	344201145
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61052	NC_015942	GCA	2	6	3001885	3001890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201145
61053	NC_015942	TTG	2	6	3001896	3001901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201145
61054	NC_015942	TCG	2	6	3001908	3001913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201145
61055	NC_015942	GA	3	6	3001939	3001944	50 %	0 %	50 %	0 %	344201145
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61059	NC_015942	A	7	7	3002134	3002140	100 %	0 %	0 %	0 %	344201145
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61061	NC_015942	ACA	2	6	3002268	3002273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61062	NC_015942	T	6	6	3002280	3002285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61063	NC_015942	ACA	2	6	3002389	3002394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201146
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61065	NC_015942	CAGAA	2	10	3002456	3002465	60 %	0 %	20 %	20 %	344201146
61066	NC_015942	TCG	2	6	3002507	3002512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201146
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61068	NC_015942	GAAG	2	8	3002544	3002551	50 %	0 %	50 %	0 %	344201146
61069	NC_015942	CTTC	2	8	3002667	3002674	0 %	50 %	0 %	50 %	344201147
61070	NC_015942	CAT	2	6	3002707	3002712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201147
61071	NC_015942	CGA	2	6	3002717	3002722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201147
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61078	NC_015942	CAA	2	6	3002992	3002997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201147
61079	NC_015942	GCGGGA	2	12	3003012	3003023	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	344201147
61080	NC_015942	T	6	6	3003040	3003045	0 %	100 %	0 %	0 %	344201147
61081	NC_015942	CGG	2	6	3003054	3003059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201147
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61083	NC_015942	ATG	2	6	3003155	3003160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201147
61084	NC_015942	TCG	2	6	3003162	3003167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201147
61085	NC_015942	CTG	2	6	3003216	3003221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201147
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61088	NC_015942	A	6	6	3003321	3003326	100 %	0 %	0 %	0 %	344201147
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61091	NC_015942	T	7	7	3003458	3003464	0 %	100 %	0 %	0 %	344201147
61092	NC_015942	ATA	2	6	3003487	3003492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201147
61093	NC_015942	T	6	6	3003514	3003519	0 %	100 %	0 %	0 %	344201147
61094	NC_015942	CTT	2	6	3003541	3003546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201147
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61101	NC_015942	GCA	2	6	3004362	3004367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201148
61102	NC_015942	CCA	2	6	3004392	3004397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201148
61103	NC_015942	GGA	2	6	3004398	3004403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201148
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61105	NC_015942	TGC	2	6	3004488	3004493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201148
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61108	NC_015942	CGA	2	6	3004578	3004583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201148
61109	NC_015942	GC	3	6	3004589	3004594	0 %	0 %	50 %	50 %	344201148
61110	NC_015942	GGC	2	6	3004625	3004630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201148
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61113	NC_015942	CAC	2	6	3004777	3004782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201148
61114	NC_015942	TTC	2	6	3004804	3004809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201148
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61116	NC_015942	CG	4	8	3004845	3004852	0 %	0 %	50 %	50 %	344201148
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61118	NC_015942	GCC	2	6	3005057	3005062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201149
61119	NC_015942	CCA	2	6	3005087	3005092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201149
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61153	NC_015942	GCA	2	6	3007215	3007220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201150
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61157	NC_015942	CAA	2	6	3007547	3007552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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61215	NC_015942	CG	3	6	3010129	3010134	0 %	0 %	50 %	50 %	344201152
61216	NC_015942	CTGA	2	8	3010204	3010211	25 %	25 %	25 %	25 %	344201152
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61221	NC_015942	CTG	2	6	3010375	3010380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201152
61222	NC_015942	GCTG	2	8	3010405	3010412	0 %	25 %	50 %	25 %	344201152
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61227	NC_015942	GCTG	2	8	3010525	3010532	0 %	25 %	50 %	25 %	344201152
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61231	NC_015942	CCA	2	6	3010689	3010694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201152
61232	NC_015942	AGC	3	9	3010834	3010842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201152
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61234	NC_015942	GTCGGC	2	12	3010927	3010938	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344201152
61235	NC_015942	TCG	2	6	3011004	3011009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201152
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61466	NC_015942	ACC	2	6	3021142	3021147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61467	NC_015942	TGTC	2	8	3021183	3021190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61468	NC_015942	CACT	2	8	3021218	3021225	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61469	NC_015942	CTC	2	6	3021261	3021266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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61471	NC_015942	GGT	2	6	3021365	3021370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61472	NC_015942	CCA	2	6	3021386	3021391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61473	NC_015942	ATC	2	6	3021436	3021441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61474	NC_015942	GTA	2	6	3021462	3021467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61475	NC_015942	CAT	2	6	3021560	3021565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61476	NC_015942	GCC	2	6	3021635	3021640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61477	NC_015942	TCC	2	6	3021796	3021801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61478	NC_015942	CTT	2	6	3021831	3021836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61479	NC_015942	TC	3	6	3021879	3021884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61480	NC_015942	TTC	2	6	3021900	3021905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61481	NC_015942	TCAC	2	8	3021980	3021987	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61482	NC_015942	TCC	2	6	3021991	3021996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61483	NC_015942	TCA	2	6	3022008	3022013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61484	NC_015942	AAG	2	6	3022044	3022049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61485	NC_015942	ACA	2	6	3022123	3022128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61486	NC_015942	TTGAC	2	10	3022205	3022214	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61487	NC_015942	GGT	2	6	3022241	3022246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61488	NC_015942	AC	3	6	3022361	3022366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61489	NC_015942	CGACT	2	10	3022416	3022425	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61490	NC_015942	CTTT	2	8	3022440	3022447	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61491	NC_015942	GCT	2	6	3022456	3022461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61492	NC_015942	CCT	2	6	3022472	3022477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61493	NC_015942	GAC	2	6	3022560	3022565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61494	NC_015942	GTCT	2	8	3022583	3022590	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61495	NC_015942	AAGT	2	8	3022936	3022943	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61496	NC_015942	GGA	2	6	3023107	3023112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61497	NC_015942	C	6	6	3023117	3023122	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61498	NC_015942	CCA	2	6	3023174	3023179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61499	NC_015942	TCGC	2	8	3023276	3023283	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61500	NC_015942	CTA	2	6	3023286	3023291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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