MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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60504	NC_015942	TCT	2	6	2972212	2972217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201111
60505	NC_015942	CGC	2	6	2972263	2972268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201111
60506	NC_015942	GATG	2	8	2972371	2972378	25 %	25 %	50 %	0 %	344201111
60507	NC_015942	TGA	2	6	2972611	2972616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201111
60508	NC_015942	CGC	2	6	2972630	2972635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201111
60509	NC_015942	CAC	2	6	2972705	2972710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201111
60510	NC_015942	ACCG	2	8	2972880	2972887	25 %	0 %	25 %	50 %	344201111
60511	NC_015942	ATG	2	6	2972904	2972909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201111
60512	NC_015942	CTG	2	6	2972939	2972944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201111
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60514	NC_015942	CGG	3	9	2973039	2973047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201112
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60519	NC_015942	TCG	2	6	2973339	2973344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201112
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60522	NC_015942	TGC	2	6	2973579	2973584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201112
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60525	NC_015942	GCG	2	6	2973692	2973697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201112
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60543	NC_015942	AATG	2	8	2974238	2974245	50 %	25 %	25 %	0 %	344201113
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60615	NC_015942	GA	3	6	2978618	2978623	50 %	0 %	50 %	0 %	344201117
60616	NC_015942	GCA	2	6	2978668	2978673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201117
60617	NC_015942	GCT	2	6	2978677	2978682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201117
60618	NC_015942	GCC	2	6	2978703	2978708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201117
60619	NC_015942	CGG	2	6	2978716	2978721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201117
60620	NC_015942	TCT	2	6	2978734	2978739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201117
60621	NC_015942	GGC	2	6	2978843	2978848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201117
60622	NC_015942	CCG	3	9	2978893	2978901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201117
60623	NC_015942	GAT	2	6	2979002	2979007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201117
60624	NC_015942	GT	3	6	2979059	2979064	0 %	50 %	50 %	0 %	344201117
60625	NC_015942	CCGT	2	8	2979066	2979073	0 %	25 %	25 %	50 %	344201117
60626	NC_015942	GCC	2	6	2979077	2979082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201117
60627	NC_015942	CTG	2	6	2979117	2979122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201117
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60629	NC_015942	GGC	2	6	2979149	2979154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201117
60630	NC_015942	CCT	2	6	2979303	2979308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201118
60631	NC_015942	CGC	2	6	2979319	2979324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201118
60632	NC_015942	CGA	2	6	2979365	2979370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201118
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60634	NC_015942	ATG	2	6	2979548	2979553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201118
60635	NC_015942	GTC	2	6	2979571	2979576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201118
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60638	NC_015942	CGT	3	9	2979868	2979876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201118
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60640	NC_015942	CGG	2	6	2979897	2979902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201118
60641	NC_015942	CTGA	2	8	2979922	2979929	25 %	25 %	25 %	25 %	344201118
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60645	NC_015942	GTC	2	6	2980206	2980211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201118
60646	NC_015942	TGC	2	6	2980236	2980241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201118
60647	NC_015942	CGC	2	6	2980285	2980290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201118
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60669	NC_015942	TGA	2	6	2981266	2981271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201120
60670	NC_015942	GTA	2	6	2981285	2981290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201120
60671	NC_015942	CCG	2	6	2981304	2981309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201120
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60674	NC_015942	ACC	2	6	2981372	2981377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201120
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60677	NC_015942	CGG	2	6	2981434	2981439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201120
60678	NC_015942	ACC	2	6	2981450	2981455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201120
60679	NC_015942	CAT	3	9	2981480	2981488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201120
60680	NC_015942	CGA	2	6	2981494	2981499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201120
60681	NC_015942	GCC	2	6	2981508	2981513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201120
60682	NC_015942	CTT	2	6	2981525	2981530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201120
60683	NC_015942	ATC	2	6	2981559	2981564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201120
60684	NC_015942	AG	3	6	2981623	2981628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60685	NC_015942	GCG	2	6	2981708	2981713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201121
60686	NC_015942	TGA	2	6	2981714	2981719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201121
60687	NC_015942	TTCC	2	8	2981750	2981757	0 %	50 %	0 %	50 %	344201121
60688	NC_015942	CAT	2	6	2981835	2981840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201121
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60690	NC_015942	TGGC	2	8	2982109	2982116	0 %	25 %	50 %	25 %	344201121
60691	NC_015942	TCA	2	6	2982173	2982178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201121
60692	NC_015942	GTT	2	6	2982218	2982223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201122
60693	NC_015942	CTGACC	2	12	2982227	2982238	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344201122
60694	NC_015942	CGG	2	6	2982256	2982261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201122
60695	NC_015942	TGT	2	6	2982334	2982339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201122
60696	NC_015942	CCT	2	6	2982367	2982372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201122
60697	NC_015942	TCG	2	6	2982460	2982465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201122
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60700	NC_015942	CGC	2	6	2982529	2982534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201122
60701	NC_015942	TAC	2	6	2982586	2982591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201122
60702	NC_015942	TCA	2	6	2982679	2982684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201122
60703	NC_015942	ATGG	2	8	2982755	2982762	25 %	25 %	50 %	0 %	344201122
60704	NC_015942	CCT	2	6	2982780	2982785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201122
60705	NC_015942	CT	3	6	2982823	2982828	0 %	50 %	0 %	50 %	344201122
60706	NC_015942	TGC	2	6	2982838	2982843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201122
60707	NC_015942	CGA	2	6	2982928	2982933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201122
60708	NC_015942	AGAT	2	8	2983017	2983024	50 %	25 %	25 %	0 %	344201122
60709	NC_015942	T	6	6	2983028	2983033	0 %	100 %	0 %	0 %	344201122
60710	NC_015942	TCA	2	6	2983054	2983059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201122
60711	NC_015942	ACC	2	6	2983200	2983205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201122
60712	NC_015942	GCG	2	6	2983234	2983239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201122
60713	NC_015942	TGC	3	9	2983245	2983253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201122
60714	NC_015942	TCA	2	6	2983270	2983275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201122
60715	NC_015942	CTG	2	6	2983316	2983321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201122
60716	NC_015942	GCC	2	6	2983443	2983448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201122
60717	NC_015942	CTT	2	6	2983463	2983468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201122
60718	NC_015942	TGG	2	6	2983552	2983557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201122
60719	NC_015942	TTC	2	6	2983566	2983571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201122
60720	NC_015942	GCTG	2	8	2983612	2983619	0 %	25 %	50 %	25 %	344201122
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60722	NC_015942	GCA	2	6	2983647	2983652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201122
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60724	NC_015942	TACC	2	8	2983726	2983733	25 %	25 %	0 %	50 %	344201122
60725	NC_015942	TGGT	2	8	2983892	2983899	0 %	50 %	50 %	0 %	344201123
60726	NC_015942	GCC	2	6	2984417	2984422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201123
60727	NC_015942	TG	3	6	2984433	2984438	0 %	50 %	50 %	0 %	344201123
60728	NC_015942	GCG	2	6	2984471	2984476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201123
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60730	NC_015942	GCG	2	6	2984508	2984513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201123
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