MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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60002	NC_015942	GTC	2	6	2948060	2948065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201083
60003	NC_015942	CT	3	6	2948072	2948077	0 %	50 %	0 %	50 %	344201083
60004	NC_015942	TTC	2	6	2948096	2948101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201083
60005	NC_015942	TGA	2	6	2948138	2948143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201083
60006	NC_015942	ACG	2	6	2948193	2948198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201083
60007	NC_015942	GATG	2	8	2948212	2948219	25 %	25 %	50 %	0 %	344201083
60008	NC_015942	GCG	2	6	2948270	2948275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201083
60009	NC_015942	GCC	2	6	2948304	2948309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201083
60010	NC_015942	CCTG	2	8	2948397	2948404	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60011	NC_015942	TTAG	2	8	2948413	2948420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60012	NC_015942	CGG	2	6	2948620	2948625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201084
60013	NC_015942	GAT	2	6	2948637	2948642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201084
60014	NC_015942	GCA	2	6	2948695	2948700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201084
60015	NC_015942	GA	4	8	2948706	2948713	50 %	0 %	50 %	0 %	344201084
60016	NC_015942	AAT	2	6	2948895	2948900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201084
60017	NC_015942	GGC	2	6	2949008	2949013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201085
60018	NC_015942	CGT	2	6	2949054	2949059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201085
60019	NC_015942	TAT	2	6	2949088	2949093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201085
60020	NC_015942	CAG	2	6	2949118	2949123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201085
60021	NC_015942	AGGA	2	8	2949131	2949138	50 %	0 %	50 %	0 %	344201085
60022	NC_015942	CGG	2	6	2949197	2949202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201085
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60024	NC_015942	GCG	2	6	2949275	2949280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201085
60025	NC_015942	CGGGC	2	10	2949310	2949319	0 %	0 %	60 %	40 %	344201085
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60027	NC_015942	CGG	2	6	2949564	2949569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201086
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60030	NC_015942	GCG	2	6	2949763	2949768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201086
60031	NC_015942	TGG	2	6	2949824	2949829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201086
60032	NC_015942	GGC	2	6	2949848	2949853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201086
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60034	NC_015942	T	6	6	2949875	2949880	0 %	100 %	0 %	0 %	344201086
60035	NC_015942	TGT	2	6	2949906	2949911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201086
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60037	NC_015942	GTT	2	6	2950042	2950047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60038	NC_015942	TGC	2	6	2950111	2950116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60039	NC_015942	GAG	2	6	2950144	2950149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60040	NC_015942	TG	3	6	2950150	2950155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60041	NC_015942	CAGAAG	2	12	2950156	2950167	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60042	NC_015942	G	6	6	2950174	2950179	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60043	NC_015942	CT	3	6	2950219	2950224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60044	NC_015942	CAG	2	6	2950388	2950393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60045	NC_015942	GA	3	6	2950394	2950399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60046	NC_015942	ATGGCA	2	12	2950405	2950416	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60047	NC_015942	CGC	2	6	2950507	2950512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60048	NC_015942	CAAT	2	8	2950519	2950526	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60049	NC_015942	TAA	2	6	2950530	2950535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60050	NC_015942	TG	3	6	2950576	2950581	0 %	50 %	50 %	0 %	344201087
60051	NC_015942	TCA	2	6	2950639	2950644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201087
60052	NC_015942	TGGT	2	8	2950656	2950663	0 %	50 %	50 %	0 %	344201087
60053	NC_015942	GTT	2	6	2950682	2950687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201087
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60055	NC_015942	GTG	2	6	2951025	2951030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201087
60056	NC_015942	G	6	6	2951041	2951046	0 %	0 %	100 %	0 %	344201087
60057	NC_015942	TTC	2	6	2951047	2951052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201087
60058	NC_015942	TGC	2	6	2951176	2951181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201087
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60060	NC_015942	ATT	2	6	2951222	2951227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201087
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60062	NC_015942	CGG	2	6	2951293	2951298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201087
60063	NC_015942	GCC	2	6	2951391	2951396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201087
60064	NC_015942	GCC	2	6	2951406	2951411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201087
60065	NC_015942	TGG	2	6	2951443	2951448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201087
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60067	NC_015942	CGT	2	6	2951492	2951497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201087
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60069	NC_015942	CAT	2	6	2951540	2951545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201087
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60071	NC_015942	CAT	2	6	2951575	2951580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201087
60072	NC_015942	CTG	2	6	2951646	2951651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201087
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60078	NC_015942	GCG	2	6	2951913	2951918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201087
60079	NC_015942	GGC	2	6	2951942	2951947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201087
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60081	NC_015942	TGC	2	6	2952087	2952092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201088
60082	NC_015942	GCT	2	6	2952123	2952128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201088
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60084	NC_015942	GCT	2	6	2952145	2952150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201088
60085	NC_015942	ACG	2	6	2952321	2952326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201088
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60087	NC_015942	TGTGC	2	10	2952409	2952418	0 %	40 %	40 %	20 %	344201088
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60089	NC_015942	TGG	2	6	2952457	2952462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201088
60090	NC_015942	TCCGGC	2	12	2952498	2952509	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344201088
60091	NC_015942	T	6	6	2952566	2952571	0 %	100 %	0 %	0 %	344201088
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60100	NC_015942	CTT	2	6	2953040	2953045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201088
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60102	NC_015942	TCG	2	6	2953134	2953139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201088
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60107	NC_015942	GGA	2	6	2953522	2953527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201089
60108	NC_015942	CAT	2	6	2953583	2953588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201089
60109	NC_015942	AACT	2	8	2953614	2953621	50 %	25 %	0 %	25 %	344201089
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60113	NC_015942	CAC	2	6	2953764	2953769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201089
60114	NC_015942	AAAGGA	2	12	2953928	2953939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201089
60115	NC_015942	TGT	2	6	2953941	2953946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201089
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60117	NC_015942	T	7	7	2954004	2954010	0 %	100 %	0 %	0 %	344201089
60118	NC_015942	A	7	7	2954011	2954017	100 %	0 %	0 %	0 %	344201089
60119	NC_015942	AC	4	8	2954031	2954038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60120	NC_015942	CAACC	2	10	2954064	2954073	40 %	0 %	0 %	60 %	344201090
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60149	NC_015942	GATA	2	8	2955191	2955198	50 %	25 %	25 %	0 %	344201090
60150	NC_015942	AG	3	6	2955240	2955245	50 %	0 %	50 %	0 %	344201090
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60153	NC_015942	ATG	2	6	2955354	2955359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201090
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60162	NC_015942	TGA	2	6	2955833	2955838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201090
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60220	NC_015942	CGG	2	6	2958645	2958650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201093
60221	NC_015942	T	7	7	2958682	2958688	0 %	100 %	0 %	0 %	344201093
60222	NC_015942	TGC	2	6	2958887	2958892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201093
60223	NC_015942	ATCC	2	8	2958945	2958952	25 %	25 %	0 %	50 %	344201093
60224	NC_015942	A	6	6	2959017	2959022	100 %	0 %	0 %	0 %	344201093
60225	NC_015942	AT	3	6	2959034	2959039	50 %	50 %	0 %	0 %	344201094
60226	NC_015942	TTA	2	6	2959042	2959047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201094
60227	NC_015942	A	6	6	2959049	2959054	100 %	0 %	0 %	0 %	344201094
60228	NC_015942	GAC	2	6	2959190	2959195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201095
60229	NC_015942	CATTCG	2	12	2959216	2959227	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344201095
60230	NC_015942	GAT	2	6	2959237	2959242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201095
60231	NC_015942	ACC	2	6	2959245	2959250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201095
60232	NC_015942	CAC	2	6	2959370	2959375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60233	NC_015942	T	7	7	2959396	2959402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60234	NC_015942	TTC	2	6	2959415	2959420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201096
60235	NC_015942	ACC	2	6	2959435	2959440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201096
60236	NC_015942	CCG	2	6	2959527	2959532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201096
60237	NC_015942	GCC	2	6	2959552	2959557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201096
60238	NC_015942	CAC	2	6	2959665	2959670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201096
60239	NC_015942	TTGC	2	8	2959794	2959801	0 %	50 %	25 %	25 %	344201096
60240	NC_015942	TA	3	6	2959803	2959808	50 %	50 %	0 %	0 %	344201096
60241	NC_015942	CGT	2	6	2959943	2959948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201096
60242	NC_015942	ACC	2	6	2960039	2960044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201096
60243	NC_015942	CGA	2	6	2960045	2960050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201096
60244	NC_015942	AAC	2	6	2960053	2960058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201096
60245	NC_015942	C	6	6	2960058	2960063	0 %	0 %	0 %	100 %	344201096
60246	NC_015942	CCCG	2	8	2960092	2960099	0 %	0 %	25 %	75 %	344201097
60247	NC_015942	ACC	2	6	2960115	2960120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201097
60248	NC_015942	CTT	2	6	2960198	2960203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201097
60249	NC_015942	TCC	2	6	2960229	2960234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201097
60250	NC_015942	GCC	2	6	2960326	2960331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201097
60251	NC_015942	ATC	2	6	2960433	2960438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201097
60252	NC_015942	CTG	2	6	2960492	2960497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201097
60253	NC_015942	GTC	2	6	2960510	2960515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201097
60254	NC_015942	CGTAT	2	10	2960567	2960576	20 %	40 %	20 %	20 %	344201097
60255	NC_015942	TCG	2	6	2960641	2960646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201097
60256	NC_015942	GC	3	6	2960697	2960702	0 %	0 %	50 %	50 %	344201097
60257	NC_015942	GAT	2	6	2960744	2960749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201097
60258	NC_015942	GCA	2	6	2960787	2960792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201097
60259	NC_015942	TTTG	2	8	2960880	2960887	0 %	75 %	25 %	0 %	344201098
60260	NC_015942	GCC	2	6	2960918	2960923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201098
60261	NC_015942	AT	3	6	2961046	2961051	50 %	50 %	0 %	0 %	344201098
60262	NC_015942	CAA	2	6	2961057	2961062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201098
60263	NC_015942	A	6	6	2961067	2961072	100 %	0 %	0 %	0 %	344201098
60264	NC_015942	TA	3	6	2961099	2961104	50 %	50 %	0 %	0 %	344201098
60265	NC_015942	TTA	2	6	2961173	2961178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60266	NC_015942	GAT	2	6	2961253	2961258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201099
60267	NC_015942	AAACA	2	10	2961259	2961268	80 %	0 %	0 %	20 %	344201099
60268	NC_015942	TGA	2	6	2961312	2961317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201099
60269	NC_015942	GCC	2	6	2961335	2961340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201099
60270	NC_015942	AAG	2	6	2961341	2961346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201099
60271	NC_015942	ACC	2	6	2961359	2961364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201099
60272	NC_015942	CCT	2	6	2961407	2961412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60273	NC_015942	ACT	2	6	2961422	2961427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201100
60274	NC_015942	CAAC	2	8	2961479	2961486	50 %	0 %	0 %	50 %	344201100
60275	NC_015942	ATG	2	6	2961502	2961507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201100
60276	NC_015942	TGA	2	6	2961545	2961550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201100
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60279	NC_015942	CCA	3	9	2961818	2961826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201101
60280	NC_015942	CGC	2	6	2961838	2961843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201101
60281	NC_015942	GAC	2	6	2961848	2961853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201101
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60283	NC_015942	T	6	6	2961888	2961893	0 %	100 %	0 %	0 %	344201101
60284	NC_015942	CAG	2	6	2961960	2961965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201101
60285	NC_015942	GCCCA	2	10	2962066	2962075	20 %	0 %	20 %	60 %	344201101
60286	NC_015942	ATGCCG	2	12	2962077	2962088	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344201101
60287	NC_015942	CAG	2	6	2962094	2962099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201101
60288	NC_015942	CCA	2	6	2962175	2962180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201101
60289	NC_015942	GCC	2	6	2962190	2962195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201101
60290	NC_015942	ATG	2	6	2962269	2962274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201101
60291	NC_015942	TTC	2	6	2962286	2962291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201101
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60293	NC_015942	GCC	2	6	2962501	2962506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201102
60294	NC_015942	TCAGG	2	10	2962533	2962542	20 %	20 %	40 %	20 %	344201102
60295	NC_015942	GCT	2	6	2962563	2962568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201102
60296	NC_015942	GC	3	6	2962595	2962600	0 %	0 %	50 %	50 %	344201102
60297	NC_015942	GTT	2	6	2962699	2962704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201102
60298	NC_015942	TCC	2	6	2962729	2962734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201102
60299	NC_015942	TGC	2	6	2962752	2962757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201102
60300	NC_015942	AGGC	2	8	2962766	2962773	25 %	0 %	50 %	25 %	344201102
60301	NC_015942	GCA	2	6	2962800	2962805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201102
60302	NC_015942	TCC	2	6	2962812	2962817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201103
60303	NC_015942	ATCC	2	8	2962897	2962904	25 %	25 %	0 %	50 %	344201103
60304	NC_015942	TGGCG	2	10	2962984	2962993	0 %	20 %	60 %	20 %	344201103
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60308	NC_015942	TCC	2	6	2963359	2963364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201104
60309	NC_015942	GCG	2	6	2963366	2963371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201104
60310	NC_015942	CGG	2	6	2963434	2963439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201104
60311	NC_015942	GTC	2	6	2963624	2963629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201104
60312	NC_015942	CTG	2	6	2963659	2963664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201104
60313	NC_015942	CGG	2	6	2963694	2963699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201104
60314	NC_015942	CGT	2	6	2963793	2963798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201104
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60319	NC_015942	GA	3	6	2964044	2964049	50 %	0 %	50 %	0 %	344201104
60320	NC_015942	TCT	2	6	2964092	2964097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201104
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60327	NC_015942	TGA	2	6	2964273	2964278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201104
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60330	NC_015942	CGT	2	6	2964310	2964315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201104
60331	NC_015942	TCC	2	6	2964340	2964345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201104
60332	NC_015942	CAGG	2	8	2964407	2964414	25 %	0 %	50 %	25 %	344201104
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60334	NC_015942	A	6	6	2964567	2964572	100 %	0 %	0 %	0 %	344201104
60335	NC_015942	GAG	2	6	2964577	2964582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201104
60336	NC_015942	GGC	2	6	2964586	2964591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201104
60337	NC_015942	TCA	2	6	2964600	2964605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201104
60338	NC_015942	GTG	2	6	2964628	2964633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201105
60339	NC_015942	GGT	2	6	2964645	2964650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201105
60340	NC_015942	CAG	2	6	2964695	2964700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201105
60341	NC_015942	ACC	2	6	2964734	2964739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201105
60342	NC_015942	CGT	2	6	2964749	2964754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201105
60343	NC_015942	ACC	2	6	2964797	2964802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201105
60344	NC_015942	CAC	2	6	2964886	2964891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201105
60345	NC_015942	C	6	6	2964942	2964947	0 %	0 %	0 %	100 %	344201105
60346	NC_015942	GTC	2	6	2965003	2965008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201105
60347	NC_015942	CGT	2	6	2965020	2965025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201105
60348	NC_015942	GGT	2	6	2965074	2965079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201105
60349	NC_015942	TTC	2	6	2965105	2965110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201105
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60351	NC_015942	CCG	2	6	2965145	2965150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201105
60352	NC_015942	ATA	2	6	2965275	2965280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201105
60353	NC_015942	TTC	2	6	2965305	2965310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201105
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60461	NC_015942	TAG	2	6	2970164	2970169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201109
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60464	NC_015942	GCCC	2	8	2970258	2970265	0 %	0 %	25 %	75 %	344201109
60465	NC_015942	TAA	2	6	2970309	2970314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201109
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60467	NC_015942	CGGCG	2	10	2970390	2970399	0 %	0 %	60 %	40 %	344201109
60468	NC_015942	GAA	2	6	2970427	2970432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201109
60469	NC_015942	TGG	2	6	2970458	2970463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201110
60470	NC_015942	GAT	2	6	2970466	2970471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201110
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60498	NC_015942	GGCA	2	8	2971877	2971884	25 %	0 %	50 %	25 %	344201111
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