MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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59002	NC_015942	TGA	2	6	2893365	2893370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201009
59003	NC_015942	GCG	2	6	2893473	2893478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201009
59004	NC_015942	CGG	2	6	2893512	2893517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201009
59005	NC_015942	CATGC	2	10	2893550	2893559	20 %	20 %	20 %	40 %	344201009
59006	NC_015942	ACA	2	6	2893575	2893580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201009
59007	NC_015942	TCA	2	6	2893599	2893604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201009
59008	NC_015942	ACC	2	6	2893784	2893789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201009
59009	NC_015942	CCG	2	6	2893821	2893826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201009
59010	NC_015942	GTC	2	6	2893940	2893945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201009
59011	NC_015942	AC	3	6	2893968	2893973	50 %	0 %	0 %	50 %	344201009
59012	NC_015942	TGC	2	6	2894026	2894031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201010
59013	NC_015942	GAT	2	6	2894134	2894139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201010
59014	NC_015942	CAT	2	6	2894211	2894216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201010
59015	NC_015942	GC	3	6	2894317	2894322	0 %	0 %	50 %	50 %	344201010
59016	NC_015942	GAA	2	6	2894416	2894421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201010
59017	NC_015942	TAACCA	2	12	2894441	2894452	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	344201011
59018	NC_015942	AGCC	2	8	2894570	2894577	25 %	0 %	25 %	50 %	344201011
59019	NC_015942	CAT	2	6	2894630	2894635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201011
59020	NC_015942	AGGAC	2	10	2894636	2894645	40 %	0 %	40 %	20 %	344201011
59021	NC_015942	AT	3	6	2894698	2894703	50 %	50 %	0 %	0 %	344201011
59022	NC_015942	T	7	7	2894703	2894709	0 %	100 %	0 %	0 %	344201011
59023	NC_015942	GTG	2	6	2894719	2894724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201011
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59025	NC_015942	CGG	2	6	2894813	2894818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201011
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59028	NC_015942	GCA	2	6	2895023	2895028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201012
59029	NC_015942	ACG	2	6	2895046	2895051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201012
59030	NC_015942	TCAAT	2	10	2895067	2895076	40 %	40 %	0 %	20 %	344201012
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59032	NC_015942	CCGC	2	8	2895200	2895207	0 %	0 %	25 %	75 %	344201013
59033	NC_015942	CATC	2	8	2895370	2895377	25 %	25 %	0 %	50 %	344201013
59034	NC_015942	GCA	2	6	2895411	2895416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201013
59035	NC_015942	C	6	6	2895460	2895465	0 %	0 %	0 %	100 %	344201013
59036	NC_015942	CTG	2	6	2895480	2895485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201013
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59043	NC_015942	GCA	2	6	2895726	2895731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201013
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59050	NC_015942	CCGC	2	8	2896311	2896318	0 %	0 %	25 %	75 %	344201013
59051	NC_015942	GAT	2	6	2896379	2896384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201013
59052	NC_015942	CGCC	2	8	2896407	2896414	0 %	0 %	25 %	75 %	344201014
59053	NC_015942	GCA	2	6	2896545	2896550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201014
59054	NC_015942	GC	3	6	2896554	2896559	0 %	0 %	50 %	50 %	344201014
59055	NC_015942	TGC	2	6	2896564	2896569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201014
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59058	NC_015942	GC	3	6	2896816	2896821	0 %	0 %	50 %	50 %	344201014
59059	NC_015942	CGA	2	6	2896845	2896850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201014
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59061	NC_015942	TGGG	2	8	2896916	2896923	0 %	25 %	75 %	0 %	344201014
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59064	NC_015942	GGA	2	6	2897016	2897021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201014
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59107	NC_015942	CGT	2	6	2898806	2898811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201017
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59112	NC_015942	A	7	7	2899033	2899039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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59117	NC_015942	GGC	2	6	2899354	2899359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201018
59118	NC_015942	CTT	2	6	2899427	2899432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201018
59119	NC_015942	TC	3	6	2899477	2899482	0 %	50 %	0 %	50 %	344201018
59120	NC_015942	C	6	6	2899624	2899629	0 %	0 %	0 %	100 %	344201018
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59188	NC_015942	TGC	2	6	2903839	2903844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201024
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59201	NC_015942	ATGG	2	8	2904448	2904455	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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59234	NC_015942	CCAC	2	8	2905923	2905930	25 %	0 %	0 %	75 %	344201025
59235	NC_015942	TGC	2	6	2906017	2906022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201025
59236	NC_015942	TGC	2	6	2906030	2906035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201025
59237	NC_015942	ATG	2	6	2906058	2906063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201025
59238	NC_015942	GA	3	6	2906209	2906214	50 %	0 %	50 %	0 %	344201026
59239	NC_015942	ACC	2	6	2906408	2906413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201027
59240	NC_015942	T	7	7	2906437	2906443	0 %	100 %	0 %	0 %	344201027
59241	NC_015942	CCG	2	6	2906455	2906460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201027
59242	NC_015942	TGG	2	6	2906571	2906576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201027
59243	NC_015942	AGG	2	6	2906603	2906608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201027
59244	NC_015942	GCG	2	6	2906614	2906619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201027
59245	NC_015942	GGT	2	6	2906628	2906633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201027
59246	NC_015942	ACG	2	6	2906645	2906650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201027
59247	NC_015942	GTT	2	6	2906700	2906705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201027
59248	NC_015942	CGC	2	6	2906732	2906737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201027
59249	NC_015942	T	6	6	2906816	2906821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59250	NC_015942	GTG	2	6	2906822	2906827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59251	NC_015942	CTC	2	6	2906941	2906946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201028
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59255	NC_015942	GCG	2	6	2907283	2907288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201028
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59257	NC_015942	GTG	2	6	2907595	2907600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59258	NC_015942	TGTGTC	2	12	2907619	2907630	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59259	NC_015942	CCA	2	6	2907634	2907639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59260	NC_015942	CAT	2	6	2907711	2907716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59261	NC_015942	CTT	2	6	2907778	2907783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59262	NC_015942	CGG	2	6	2907895	2907900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201029
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59266	NC_015942	CTG	2	6	2908404	2908409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201029
59267	NC_015942	GAA	2	6	2908425	2908430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201029
59268	NC_015942	GCG	2	6	2908461	2908466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201029
59269	NC_015942	AAG	2	6	2908479	2908484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201029
59270	NC_015942	GAC	2	6	2908524	2908529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201029
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59272	NC_015942	TCCTC	2	10	2908606	2908615	0 %	40 %	0 %	60 %	344201029
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59279	NC_015942	CAC	3	9	2909067	2909075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201030
59280	NC_015942	ACC	2	6	2909108	2909113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201030
59281	NC_015942	GCC	2	6	2909119	2909124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201030
59282	NC_015942	AAT	2	6	2909160	2909165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201030
59283	NC_015942	CCG	2	6	2909188	2909193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201030
59284	NC_015942	ACC	2	6	2909199	2909204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201030
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59288	NC_015942	AGATC	2	10	2909450	2909459	40 %	20 %	20 %	20 %	344201031
59289	NC_015942	CGG	2	6	2909466	2909471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201031
59290	NC_015942	GCG	2	6	2909503	2909508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201031
59291	NC_015942	GAA	2	6	2909544	2909549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201031
59292	NC_015942	AAG	2	6	2909729	2909734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201032
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59295	NC_015942	T	6	6	2909834	2909839	0 %	100 %	0 %	0 %	344201032
59296	NC_015942	CTC	2	6	2909872	2909877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201032
59297	NC_015942	GTA	2	6	2909924	2909929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201032
59298	NC_015942	G	6	6	2910059	2910064	0 %	0 %	100 %	0 %	344201032
59299	NC_015942	GGT	3	9	2910212	2910220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201032
59300	NC_015942	ACT	2	6	2910264	2910269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201032
59301	NC_015942	GAC	2	6	2910320	2910325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201032
59302	NC_015942	GCA	2	6	2910327	2910332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201032
59303	NC_015942	GGC	2	6	2910531	2910536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201033
59304	NC_015942	GAG	2	6	2910562	2910567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201033
59305	NC_015942	ATG	2	6	2910572	2910577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201033
59306	NC_015942	GCG	2	6	2910590	2910595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201033
59307	NC_015942	CAC	2	6	2910682	2910687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201033
59308	NC_015942	TCG	2	6	2910697	2910702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201034
59309	NC_015942	TCA	2	6	2910706	2910711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201034
59310	NC_015942	GTA	2	6	2911104	2911109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201035
59311	NC_015942	A	6	6	2911190	2911195	100 %	0 %	0 %	0 %	344201035
59312	NC_015942	ATA	2	6	2911255	2911260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201035
59313	NC_015942	GA	3	6	2911279	2911284	50 %	0 %	50 %	0 %	344201035
59314	NC_015942	ATA	2	6	2911411	2911416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201035
59315	NC_015942	GTG	2	6	2911420	2911425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201035
59316	NC_015942	CAT	2	6	2911488	2911493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201036
59317	NC_015942	ATC	2	6	2911518	2911523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201036
59318	NC_015942	GTCGTA	2	12	2911758	2911769	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344201036
59319	NC_015942	CTC	2	6	2911827	2911832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201036
59320	NC_015942	AGC	2	6	2911933	2911938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201036
59321	NC_015942	TGA	2	6	2912161	2912166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201037
59322	NC_015942	AGT	2	6	2912208	2912213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201037
59323	NC_015942	CAG	2	6	2912222	2912227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201037
59324	NC_015942	AAGA	2	8	2912300	2912307	75 %	0 %	25 %	0 %	344201037
59325	NC_015942	TCA	2	6	2912484	2912489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201037
59326	NC_015942	CTA	2	6	2912631	2912636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201037
59327	NC_015942	ATCC	2	8	2912756	2912763	25 %	25 %	0 %	50 %	344201037
59328	NC_015942	CCA	2	6	2912776	2912781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201038
59329	NC_015942	CACT	2	8	2912879	2912886	25 %	25 %	0 %	50 %	344201038
59330	NC_015942	TGA	2	6	2912961	2912966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201038
59331	NC_015942	TGG	2	6	2912967	2912972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201038
59332	NC_015942	CCATTT	2	12	2913004	2913015	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	344201038
59333	NC_015942	CGA	2	6	2913059	2913064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201038
59334	NC_015942	GCG	2	6	2913095	2913100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201038
59335	NC_015942	ATCC	2	8	2913109	2913116	25 %	25 %	0 %	50 %	344201038
59336	NC_015942	CTG	2	6	2913148	2913153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201038
59337	NC_015942	T	6	6	2913191	2913196	0 %	100 %	0 %	0 %	344201038
59338	NC_015942	CA	3	6	2913298	2913303	50 %	0 %	0 %	50 %	344201039
59339	NC_015942	GAT	2	6	2913365	2913370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201039
59340	NC_015942	AGT	2	6	2913415	2913420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201039
59341	NC_015942	GCT	2	6	2913444	2913449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201039
59342	NC_015942	CAT	2	6	2913452	2913457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201039
59343	NC_015942	CCT	2	6	2913463	2913468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59344	NC_015942	CTC	2	6	2913550	2913555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201040
59345	NC_015942	CGG	2	6	2913639	2913644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201040
59346	NC_015942	AGAGA	2	10	2913649	2913658	60 %	0 %	40 %	0 %	344201040
59347	NC_015942	CGA	2	6	2913678	2913683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201040
59348	NC_015942	TAA	2	6	2913727	2913732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201040
59349	NC_015942	ATG	2	6	2913737	2913742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201040
59350	NC_015942	GAACC	2	10	2913788	2913797	40 %	0 %	20 %	40 %	344201040
59351	NC_015942	AT	3	6	2913830	2913835	50 %	50 %	0 %	0 %	344201040
59352	NC_015942	A	7	7	2913919	2913925	100 %	0 %	0 %	0 %	344201040
59353	NC_015942	AGA	2	6	2913930	2913935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201040
59354	NC_015942	TTC	2	6	2914097	2914102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201040
59355	NC_015942	GAA	2	6	2914140	2914145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59356	NC_015942	GTT	2	6	2914325	2914330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201041
59357	NC_015942	GAT	2	6	2914337	2914342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201041
59358	NC_015942	ATC	2	6	2914371	2914376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201041
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59364	NC_015942	CCT	2	6	2914944	2914949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59365	NC_015942	ATCA	2	8	2915009	2915016	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59366	NC_015942	TCA	2	6	2915026	2915031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59367	NC_015942	GGT	2	6	2915077	2915082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201043
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59385	NC_015942	ATA	2	6	2915844	2915849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59386	NC_015942	CAT	2	6	2915932	2915937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201045
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59388	NC_015942	CT	3	6	2915975	2915980	0 %	50 %	0 %	50 %	344201045
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59467	NC_015942	TGT	2	6	2920168	2920173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201046
59468	NC_015942	GTC	2	6	2920236	2920241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201046
59469	NC_015942	TG	3	6	2920288	2920293	0 %	50 %	50 %	0 %	344201046
59470	NC_015942	CGG	2	6	2920303	2920308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201046
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59474	NC_015942	TGGA	2	8	2920488	2920495	25 %	25 %	50 %	0 %	344201046
59475	NC_015942	CTG	2	6	2920562	2920567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201046
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59492	NC_015942	T	6	6	2921688	2921693	0 %	100 %	0 %	0 %	344201047
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59498	NC_015942	TCC	2	6	2921943	2921948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201048
59499	NC_015942	CGC	2	6	2922056	2922061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201048
59500	NC_015942	GAG	2	6	2922068	2922073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201048

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