MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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58502	NC_015942	AAC	2	6	2869885	2869890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200985
58503	NC_015942	CG	3	6	2869903	2869908	0 %	0 %	50 %	50 %	344200985
58504	NC_015942	TTC	2	6	2869929	2869934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200985
58505	NC_015942	CCA	2	6	2869946	2869951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200985
58506	NC_015942	TGC	2	6	2869984	2869989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200985
58507	NC_015942	GCACCA	2	12	2870000	2870011	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344200985
58508	NC_015942	A	6	6	2870086	2870091	100 %	0 %	0 %	0 %	344200985
58509	NC_015942	GC	3	6	2870116	2870121	0 %	0 %	50 %	50 %	344200985
58510	NC_015942	TCG	2	6	2870158	2870163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200985
58511	NC_015942	TGA	2	6	2870237	2870242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200985
58512	NC_015942	GCC	2	6	2870263	2870268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200985
58513	NC_015942	AGG	2	6	2870278	2870283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200985
58514	NC_015942	CAG	2	6	2870313	2870318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200985
58515	NC_015942	TCGC	2	8	2870352	2870359	0 %	25 %	25 %	50 %	344200985
58516	NC_015942	ATC	2	6	2870377	2870382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200985
58517	NC_015942	CGG	2	6	2870393	2870398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200985
58518	NC_015942	A	6	6	2870530	2870535	100 %	0 %	0 %	0 %	344200986
58519	NC_015942	GAC	2	6	2870601	2870606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200986
58520	NC_015942	GCC	2	6	2870628	2870633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200986
58521	NC_015942	A	6	6	2870634	2870639	100 %	0 %	0 %	0 %	344200986
58522	NC_015942	GCCC	2	8	2870664	2870671	0 %	0 %	25 %	75 %	344200986
58523	NC_015942	CAG	2	6	2870693	2870698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200986
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58527	NC_015942	GCTGC	2	10	2870824	2870833	0 %	20 %	40 %	40 %	344200986
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58531	NC_015942	TGCC	2	8	2870907	2870914	0 %	25 %	25 %	50 %	344200986
58532	NC_015942	TGC	2	6	2870987	2870992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200986
58533	NC_015942	TGC	2	6	2871009	2871014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200986
58534	NC_015942	CTG	2	6	2871038	2871043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200986
58535	NC_015942	TCG	2	6	2871090	2871095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200986
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58539	NC_015942	CG	3	6	2871167	2871172	0 %	0 %	50 %	50 %	344200986
58540	NC_015942	TGC	2	6	2871183	2871188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200986
58541	NC_015942	TCC	2	6	2871210	2871215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200986
58542	NC_015942	GGC	2	6	2871216	2871221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200986
58543	NC_015942	GC	4	8	2871291	2871298	0 %	0 %	50 %	50 %	344200986
58544	NC_015942	CTG	2	6	2871317	2871322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200986
58545	NC_015942	GCG	3	9	2871336	2871344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200986
58546	NC_015942	GCC	3	9	2871357	2871365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200986
58547	NC_015942	GCG	2	6	2871368	2871373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200986
58548	NC_015942	CCCG	2	8	2871479	2871486	0 %	0 %	25 %	75 %	344200987
58549	NC_015942	CTG	2	6	2871529	2871534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200987
58550	NC_015942	CTG	2	6	2871541	2871546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200987
58551	NC_015942	CGC	2	6	2871564	2871569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200987
58552	NC_015942	AG	3	6	2871576	2871581	50 %	0 %	50 %	0 %	344200987
58553	NC_015942	CCG	2	6	2871669	2871674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200987
58554	NC_015942	ATG	2	6	2871710	2871715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200987
58555	NC_015942	ATC	2	6	2871718	2871723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200987
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58557	NC_015942	CTG	2	6	2871829	2871834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200987
58558	NC_015942	CAA	2	6	2871841	2871846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200987
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58564	NC_015942	GCG	2	6	2872199	2872204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200987
58565	NC_015942	GAAT	2	8	2872215	2872222	50 %	25 %	25 %	0 %	344200987
58566	NC_015942	GCA	2	6	2872317	2872322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200987
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58578	NC_015942	GGC	2	6	2872831	2872836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200987
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58585	NC_015942	T	7	7	2873175	2873181	0 %	100 %	0 %	0 %	344200987
58586	NC_015942	CCT	2	6	2873214	2873219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200987
58587	NC_015942	CAG	2	6	2873242	2873247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200987
58588	NC_015942	GC	3	6	2873271	2873276	0 %	0 %	50 %	50 %	344200987
58589	NC_015942	GCCCG	2	10	2873286	2873295	0 %	0 %	40 %	60 %	344200987
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58600	NC_015942	CA	3	6	2873770	2873775	50 %	0 %	0 %	50 %	344200988
58601	NC_015942	GGT	2	6	2873855	2873860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200988
58602	NC_015942	ACA	2	6	2873866	2873871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200988
58603	NC_015942	TCA	2	6	2873872	2873877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200988
58604	NC_015942	CGTG	2	8	2873909	2873916	0 %	25 %	50 %	25 %	344200988
58605	NC_015942	C	6	6	2873949	2873954	0 %	0 %	0 %	100 %	344200988
58606	NC_015942	GCC	2	6	2873968	2873973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200988
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58609	NC_015942	CCGGG	2	10	2874023	2874032	0 %	0 %	60 %	40 %	344200988
58610	NC_015942	ACC	2	6	2874088	2874093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200988
58611	NC_015942	GCA	2	6	2874194	2874199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200988
58612	NC_015942	CGA	2	6	2874230	2874235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200988
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58614	NC_015942	GCA	2	6	2874290	2874295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200988
58615	NC_015942	GTG	2	6	2874378	2874383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200988
58616	NC_015942	GA	3	6	2874390	2874395	50 %	0 %	50 %	0 %	344200988
58617	NC_015942	CGC	2	6	2874407	2874412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200988
58618	NC_015942	CAG	2	6	2874419	2874424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200988
58619	NC_015942	GGGC	2	8	2874443	2874450	0 %	0 %	75 %	25 %	344200988
58620	NC_015942	GGCG	2	8	2874467	2874474	0 %	0 %	75 %	25 %	344200988
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58622	NC_015942	GGCG	2	8	2874515	2874522	0 %	0 %	75 %	25 %	344200988
58623	NC_015942	GGC	2	6	2874614	2874619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200988
58624	NC_015942	GC	3	6	2874632	2874637	0 %	0 %	50 %	50 %	344200988
58625	NC_015942	CAA	2	6	2874641	2874646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200988
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58627	NC_015942	GC	5	10	2874669	2874678	0 %	0 %	50 %	50 %	344200988
58628	NC_015942	CAG	2	6	2874687	2874692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200988
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58633	NC_015942	GGGTG	2	10	2874839	2874848	0 %	20 %	80 %	0 %	344200988
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58640	NC_015942	AT	3	6	2875241	2875246	50 %	50 %	0 %	0 %	344200989
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58650	NC_015942	CCTG	2	8	2875674	2875681	0 %	25 %	25 %	50 %	344200989
58651	NC_015942	GTT	2	6	2875701	2875706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200989
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58654	NC_015942	CGG	2	6	2875935	2875940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58655	NC_015942	GAC	2	6	2876033	2876038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200990
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58662	NC_015942	GCA	2	6	2876373	2876378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200991
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58682	NC_015942	ATCCGC	2	12	2877436	2877447	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344200992
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58684	NC_015942	TCA	2	6	2877560	2877565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200992
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58686	NC_015942	GCGCG	2	10	2877675	2877684	0 %	0 %	60 %	40 %	344200992
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58696	NC_015942	TGC	2	6	2878093	2878098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200993
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58720	NC_015942	AG	3	6	2879110	2879115	50 %	0 %	50 %	0 %	344200994
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58727	NC_015942	CTGG	2	8	2879524	2879531	0 %	25 %	50 %	25 %	344200994
58728	NC_015942	TCA	2	6	2879670	2879675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200994
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58733	NC_015942	TGC	2	6	2879846	2879851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200995
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58843	NC_015942	T	6	6	2885186	2885191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58844	NC_015942	GCC	2	6	2885245	2885250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201003
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58847	NC_015942	T	6	6	2885601	2885606	0 %	100 %	0 %	0 %	344201003
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58903	NC_015942	CCGGC	2	10	2888525	2888534	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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