MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57501	NC_015942	GCC	2	6	2822176	2822181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200929
57502	NC_015942	TCG	2	6	2822276	2822281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200929
57503	NC_015942	GATG	2	8	2822392	2822399	25 %	25 %	50 %	0 %	344200929
57504	NC_015942	GGA	2	6	2822502	2822507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200929
57505	NC_015942	CG	3	6	2822634	2822639	0 %	0 %	50 %	50 %	344200929
57506	NC_015942	CATC	2	8	2822667	2822674	25 %	25 %	0 %	50 %	344200929
57507	NC_015942	CCAGT	2	10	2822702	2822711	20 %	20 %	20 %	40 %	344200929
57508	NC_015942	GAT	2	6	2822740	2822745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200929
57509	NC_015942	CCA	2	6	2822805	2822810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200929
57510	NC_015942	CAC	2	6	2822814	2822819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200929
57511	NC_015942	GC	3	6	2822829	2822834	0 %	0 %	50 %	50 %	344200929
57512	NC_015942	GCG	2	6	2822873	2822878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200929
57513	NC_015942	AAT	2	6	2822917	2822922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200929
57514	NC_015942	GTG	2	6	2822936	2822941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200929
57515	NC_015942	CG	4	8	2823031	2823038	0 %	0 %	50 %	50 %	344200930
57516	NC_015942	GTA	2	6	2823060	2823065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200930
57517	NC_015942	ATA	2	6	2823106	2823111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200930
57518	NC_015942	GATCA	2	10	2823238	2823247	40 %	20 %	20 %	20 %	344200930
57519	NC_015942	CAG	2	6	2823289	2823294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200930
57520	NC_015942	CG	3	6	2823305	2823310	0 %	0 %	50 %	50 %	344200930
57521	NC_015942	C	6	6	2823361	2823366	0 %	0 %	0 %	100 %	344200930
57522	NC_015942	CG	4	8	2823384	2823391	0 %	0 %	50 %	50 %	344200930
57523	NC_015942	GAT	2	6	2823397	2823402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200930
57524	NC_015942	CAA	2	6	2823415	2823420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200930
57525	NC_015942	GCA	2	6	2823447	2823452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200930
57526	NC_015942	GC	3	6	2823485	2823490	0 %	0 %	50 %	50 %	344200930
57527	NC_015942	GTTCCA	2	12	2823549	2823560	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344200930
57528	NC_015942	GGC	2	6	2823585	2823590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200930
57529	NC_015942	CAA	2	6	2823691	2823696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200930
57530	NC_015942	AG	3	6	2823881	2823886	50 %	0 %	50 %	0 %	344200931
57531	NC_015942	AAT	2	6	2823927	2823932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200931
57532	NC_015942	CGG	3	9	2823938	2823946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200931
57533	NC_015942	GCC	2	6	2823973	2823978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200931
57534	NC_015942	CCAG	2	8	2824005	2824012	25 %	0 %	25 %	50 %	344200931
57535	NC_015942	CGA	2	6	2824055	2824060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200931
57536	NC_015942	CAG	2	6	2824101	2824106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200931
57537	NC_015942	CCAG	2	8	2824205	2824212	25 %	0 %	25 %	50 %	344200931
57538	NC_015942	CGC	2	6	2824218	2824223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200931
57539	NC_015942	GCG	2	6	2824252	2824257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200931
57540	NC_015942	CCA	2	6	2824267	2824272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200931
57541	NC_015942	CAC	2	6	2824335	2824340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200931
57542	NC_015942	CGC	2	6	2824383	2824388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200931
57543	NC_015942	CCT	2	6	2824429	2824434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200931
57544	NC_015942	CAG	2	6	2824467	2824472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200932
57545	NC_015942	AG	3	6	2824485	2824490	50 %	0 %	50 %	0 %	344200932
57546	NC_015942	CAG	2	6	2824509	2824514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200932
57547	NC_015942	AGCC	2	8	2824516	2824523	25 %	0 %	25 %	50 %	344200932
57548	NC_015942	C	6	6	2824522	2824527	0 %	0 %	0 %	100 %	344200932
57549	NC_015942	GGCAT	2	10	2824549	2824558	20 %	20 %	40 %	20 %	344200932
57550	NC_015942	CCAGC	2	10	2824647	2824656	20 %	0 %	20 %	60 %	344200932
57551	NC_015942	CGC	3	9	2824688	2824696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200932
57552	NC_015942	GCC	2	6	2824706	2824711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200932
57553	NC_015942	ATA	2	6	2824722	2824727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200932
57554	NC_015942	CAG	2	6	2824833	2824838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200932
57555	NC_015942	CAG	2	6	2824848	2824853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200932
57556	NC_015942	ATCA	2	8	2824896	2824903	50 %	25 %	0 %	25 %	344200932
57557	NC_015942	GCCAGC	2	12	2824906	2824917	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344200932
57558	NC_015942	CGA	2	6	2824973	2824978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200932
57559	NC_015942	CCA	2	6	2824979	2824984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200932
57560	NC_015942	CAA	3	9	2825064	2825072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200932
57561	NC_015942	GATG	2	8	2825141	2825148	25 %	25 %	50 %	0 %	344200932
57562	NC_015942	ACC	2	6	2825176	2825181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200932
57563	NC_015942	CGA	2	6	2825219	2825224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200932
57564	NC_015942	CTG	2	6	2825280	2825285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200933
57565	NC_015942	CAG	2	6	2825318	2825323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200933
57566	NC_015942	ATG	2	6	2825333	2825338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200933
57567	NC_015942	GCA	2	6	2825371	2825376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200933
57568	NC_015942	TGC	2	6	2825378	2825383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200933
57569	NC_015942	GGCA	2	8	2825429	2825436	25 %	0 %	50 %	25 %	344200933
57570	NC_015942	GCT	2	6	2825438	2825443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200933
57571	NC_015942	TGC	2	6	2825455	2825460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200933
57572	NC_015942	TTC	3	9	2825474	2825482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200933
57573	NC_015942	GAC	2	6	2825512	2825517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200933
57574	NC_015942	ACC	2	6	2825564	2825569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200933
57575	NC_015942	GCCC	2	8	2825617	2825624	0 %	0 %	25 %	75 %	344200933
57576	NC_015942	TCC	2	6	2825664	2825669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200933
57577	NC_015942	AGG	2	6	2825684	2825689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200933
57578	NC_015942	AGA	2	6	2825721	2825726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200933
57579	NC_015942	CGA	2	6	2825730	2825735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200933
57580	NC_015942	CAA	2	6	2825746	2825751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200933
57581	NC_015942	TGC	2	6	2825833	2825838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200933
57582	NC_015942	GC	3	6	2825850	2825855	0 %	0 %	50 %	50 %	344200933
57583	NC_015942	CAT	2	6	2825873	2825878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200933
57584	NC_015942	GCC	2	6	2825912	2825917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200933
57585	NC_015942	GCC	2	6	2825922	2825927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200933
57586	NC_015942	TACCAG	2	12	2826094	2826105	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344200933
57587	NC_015942	CGG	2	6	2826147	2826152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200933
57588	NC_015942	TCG	2	6	2826156	2826161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200933
57589	NC_015942	GCGA	2	8	2826230	2826237	25 %	0 %	50 %	25 %	344200933
57590	NC_015942	CGC	2	6	2826261	2826266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200933
57591	NC_015942	CGG	2	6	2826337	2826342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200933
57592	NC_015942	GAC	2	6	2826394	2826399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200933
57593	NC_015942	AGGC	2	8	2826471	2826478	25 %	0 %	50 %	25 %	344200933
57594	NC_015942	CAA	2	6	2826542	2826547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200933
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57596	NC_015942	TCA	2	6	2826564	2826569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200933
57597	NC_015942	CAT	2	6	2826608	2826613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200933
57598	NC_015942	TCC	2	6	2826614	2826619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200934
57599	NC_015942	CAC	2	6	2826660	2826665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200934
57600	NC_015942	CAAT	2	8	2826683	2826690	50 %	25 %	0 %	25 %	344200934
57601	NC_015942	A	6	6	2826763	2826768	100 %	0 %	0 %	0 %	344200934
57602	NC_015942	CGCA	2	8	2826850	2826857	25 %	0 %	25 %	50 %	344200934
57603	NC_015942	TCG	2	6	2826879	2826884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200934
57604	NC_015942	TCT	2	6	2826887	2826892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200934
57605	NC_015942	GC	3	6	2826906	2826911	0 %	0 %	50 %	50 %	344200934
57606	NC_015942	GCA	2	6	2826918	2826923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200934
57607	NC_015942	CGA	2	6	2827119	2827124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200934
57608	NC_015942	TC	3	6	2827143	2827148	0 %	50 %	0 %	50 %	344200934
57609	NC_015942	CG	3	6	2827172	2827177	0 %	0 %	50 %	50 %	344200934
57610	NC_015942	GCC	2	6	2827262	2827267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200934
57611	NC_015942	GAC	2	6	2827269	2827274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200934
57612	NC_015942	GCC	2	6	2827280	2827285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200934
57613	NC_015942	AGC	2	6	2827331	2827336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200934
57614	NC_015942	CAG	2	6	2827378	2827383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200934
57615	NC_015942	ATC	3	9	2827430	2827438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200934
57616	NC_015942	TGC	2	6	2827610	2827615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200934
57617	NC_015942	GAC	2	6	2827645	2827650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200934
57618	NC_015942	TGA	2	6	2827695	2827700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200934
57619	NC_015942	CACCGC	2	12	2827717	2827728	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	344200934
57620	NC_015942	AT	3	6	2827744	2827749	50 %	50 %	0 %	0 %	344200934
57621	NC_015942	GCG	2	6	2827764	2827769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200934
57622	NC_015942	CA	3	6	2827829	2827834	50 %	0 %	0 %	50 %	344200934
57623	NC_015942	CAG	2	6	2827879	2827884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200934
57624	NC_015942	AAG	2	6	2827886	2827891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200934
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57628	NC_015942	GGC	2	6	2828044	2828049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200934
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57630	NC_015942	CACC	2	8	2828190	2828197	25 %	0 %	0 %	75 %	344200934
57631	NC_015942	CTG	2	6	2828232	2828237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57632	NC_015942	ACA	2	6	2828244	2828249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57633	NC_015942	GCA	2	6	2828262	2828267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57634	NC_015942	CCCT	2	8	2828375	2828382	0 %	25 %	0 %	75 %	344200935
57635	NC_015942	CTCC	2	8	2828418	2828425	0 %	25 %	0 %	75 %	344200935
57636	NC_015942	ACC	2	6	2828458	2828463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200935
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57638	NC_015942	CCGC	2	8	2828702	2828709	0 %	0 %	25 %	75 %	344200935
57639	NC_015942	CAT	2	6	2828763	2828768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200935
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57642	NC_015942	AGGA	2	8	2828882	2828889	50 %	0 %	50 %	0 %	344200935
57643	NC_015942	GGC	3	9	2828896	2828904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200935
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57647	NC_015942	TGG	2	6	2829201	2829206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200935
57648	NC_015942	A	6	6	2829209	2829214	100 %	0 %	0 %	0 %	344200935
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57670	NC_015942	AAAT	2	8	2830414	2830421	75 %	25 %	0 %	0 %	344200936
57671	NC_015942	GCC	2	6	2830465	2830470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200936
57672	NC_015942	C	8	8	2830469	2830476	0 %	0 %	0 %	100 %	344200936
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57674	NC_015942	AC	3	6	2830590	2830595	50 %	0 %	0 %	50 %	344200936
57675	NC_015942	GCT	2	6	2830634	2830639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200936
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57680	NC_015942	GA	3	6	2830810	2830815	50 %	0 %	50 %	0 %	344200936
57681	NC_015942	CCG	3	9	2830858	2830866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200936
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57686	NC_015942	CCG	2	6	2831292	2831297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200937
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57692	NC_015942	GTT	2	6	2831613	2831618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200937
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57700	NC_015942	CAA	2	6	2832085	2832090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57701	NC_015942	GCA	2	6	2832105	2832110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57702	NC_015942	CAGC	2	8	2832229	2832236	25 %	0 %	25 %	50 %	344200938
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57715	NC_015942	GAC	2	6	2832886	2832891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200939
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57732	NC_015942	CG	3	6	2833741	2833746	0 %	0 %	50 %	50 %	344200940
57733	NC_015942	GC	3	6	2833773	2833778	0 %	0 %	50 %	50 %	344200940
57734	NC_015942	CG	3	6	2833842	2833847	0 %	0 %	50 %	50 %	344200940
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57850	NC_015942	CTG	2	6	2838922	2838927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200946
57851	NC_015942	CTGG	2	8	2838957	2838964	0 %	25 %	50 %	25 %	344200946
57852	NC_015942	GCT	4	12	2838966	2838977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200946
57853	NC_015942	CTGGG	2	10	2838982	2838991	0 %	20 %	60 %	20 %	344200946
57854	NC_015942	TGGGC	2	10	2839001	2839010	0 %	20 %	60 %	20 %	344200946
57855	NC_015942	TGC	2	6	2839016	2839021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200946
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57880	NC_015942	A	6	6	2840431	2840436	100 %	0 %	0 %	0 %	344200947
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57923	NC_015942	CGG	2	6	2842477	2842482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200949
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57941	NC_015942	CCGCG	2	10	2842995	2843004	0 %	0 %	40 %	60 %	344200949
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57952	NC_015942	A	6	6	2843714	2843719	100 %	0 %	0 %	0 %	344200951
57953	NC_015942	GATC	2	8	2843754	2843761	25 %	25 %	25 %	25 %	344200951
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57963	NC_015942	GCG	2	6	2844123	2844128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200951
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57965	NC_015942	GCCA	2	8	2844178	2844185	25 %	0 %	25 %	50 %	344200951
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57967	NC_015942	ACC	2	6	2844287	2844292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200951
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57969	NC_015942	CCA	2	6	2844354	2844359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200951
57970	NC_015942	GCC	2	6	2844386	2844391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200951
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57980	NC_015942	CCAA	2	8	2844772	2844779	50 %	0 %	0 %	50 %	344200952
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57984	NC_015942	GCT	2	6	2844968	2844973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200952
57985	NC_015942	CTG	2	6	2845008	2845013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200952
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57991	NC_015942	CGGC	2	8	2845378	2845385	0 %	0 %	50 %	50 %	344200953
57992	NC_015942	GAT	2	6	2845439	2845444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200953
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57995	NC_015942	AGG	2	6	2845521	2845526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200953
57996	NC_015942	GCC	2	6	2845596	2845601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200953
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57999	NC_015942	CCG	2	6	2845828	2845833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200953
58000	NC_015942	CCT	2	6	2845933	2845938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200953

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