MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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57002	NC_015942	GC	3	6	2797747	2797752	0 %	0 %	50 %	50 %	344200902
57003	NC_015942	CGC	2	6	2797778	2797783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200902
57004	NC_015942	AT	3	6	2797784	2797789	50 %	50 %	0 %	0 %	344200902
57005	NC_015942	CGTGC	2	10	2797806	2797815	0 %	20 %	40 %	40 %	344200902
57006	NC_015942	CTT	2	6	2797980	2797985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200902
57007	NC_015942	GCG	2	6	2798011	2798016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200902
57008	NC_015942	TTC	2	6	2798050	2798055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200902
57009	NC_015942	GC	3	6	2798239	2798244	0 %	0 %	50 %	50 %	344200902
57010	NC_015942	AC	3	6	2798286	2798291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57011	NC_015942	CT	4	8	2798292	2798299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57012	NC_015942	AAT	2	6	2798309	2798314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57013	NC_015942	GC	3	6	2798359	2798364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57014	NC_015942	C	7	7	2798367	2798373	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57015	NC_015942	ATTT	2	8	2798454	2798461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57016	NC_015942	GCC	2	6	2798468	2798473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57017	NC_015942	ATC	2	6	2798561	2798566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200903
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57117	NC_015942	GACT	2	8	2803009	2803016	25 %	25 %	25 %	25 %	344200909
57118	NC_015942	GGCT	2	8	2803024	2803031	0 %	25 %	50 %	25 %	344200909
57119	NC_015942	GCC	2	6	2803032	2803037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200909
57120	NC_015942	GC	4	8	2803083	2803090	0 %	0 %	50 %	50 %	344200909
57121	NC_015942	CCG	2	6	2803207	2803212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200909
57122	NC_015942	AGC	3	9	2803227	2803235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200909
57123	NC_015942	AGC	2	6	2803242	2803247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200909
57124	NC_015942	CAC	2	6	2803264	2803269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200910
57125	NC_015942	CGCAG	2	10	2803271	2803280	20 %	0 %	40 %	40 %	344200910
57126	NC_015942	CGC	3	9	2803317	2803325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200910
57127	NC_015942	CGG	3	9	2803339	2803347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200910
57128	NC_015942	CCT	2	6	2803383	2803388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200910
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57130	NC_015942	CCG	2	6	2803416	2803421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200910
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57134	NC_015942	ATC	2	6	2803529	2803534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200910
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57137	NC_015942	CAT	2	6	2803685	2803690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57138	NC_015942	ATC	2	6	2803761	2803766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57139	NC_015942	CGG	2	6	2803818	2803823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57140	NC_015942	CA	3	6	2803905	2803910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57141	NC_015942	CGG	2	6	2803948	2803953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57142	NC_015942	GGA	2	6	2803982	2803987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57143	NC_015942	CGG	2	6	2803993	2803998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57144	NC_015942	GCC	2	6	2804014	2804019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57145	NC_015942	CAC	2	6	2804037	2804042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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57147	NC_015942	AT	3	6	2804119	2804124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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57162	NC_015942	CA	3	6	2804884	2804889	50 %	0 %	0 %	50 %	344200911
57163	NC_015942	CGA	2	6	2804894	2804899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200911
57164	NC_015942	GGA	2	6	2804948	2804953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57165	NC_015942	A	6	6	2804967	2804972	100 %	0 %	0 %	0 %	344200912
57166	NC_015942	AC	3	6	2805000	2805005	50 %	0 %	0 %	50 %	344200912
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57182	NC_015942	GCGAT	2	10	2805774	2805783	20 %	20 %	40 %	20 %	344200912
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57189	NC_015942	A	6	6	2806254	2806259	100 %	0 %	0 %	0 %	344200912
57190	NC_015942	ACA	2	6	2806307	2806312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200913
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57200	NC_015942	T	6	6	2806729	2806734	0 %	100 %	0 %	0 %	344200913
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57208	NC_015942	CG	3	6	2806992	2806997	0 %	0 %	50 %	50 %	344200913
57209	NC_015942	TTAT	2	8	2807030	2807037	25 %	75 %	0 %	0 %	344200913
57210	NC_015942	TTG	2	6	2807055	2807060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200913
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57214	NC_015942	ACATG	2	10	2807373	2807382	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57215	NC_015942	ATT	2	6	2807397	2807402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57216	NC_015942	TAG	2	6	2807423	2807428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57217	NC_015942	CTGA	2	8	2807564	2807571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57218	NC_015942	CAC	2	6	2807598	2807603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57219	NC_015942	TAT	2	6	2807662	2807667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200914
57220	NC_015942	TGCCT	2	10	2807676	2807685	0 %	40 %	20 %	40 %	344200914
57221	NC_015942	CCGC	2	8	2807718	2807725	0 %	0 %	25 %	75 %	344200914
57222	NC_015942	AGC	2	6	2807753	2807758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200914
57223	NC_015942	TCC	2	6	2807803	2807808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200914
57224	NC_015942	GCAA	2	8	2807911	2807918	50 %	0 %	25 %	25 %	344200914
57225	NC_015942	CTTA	2	8	2807985	2807992	25 %	50 %	0 %	25 %	344200914
57226	NC_015942	ACA	2	6	2807995	2808000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200914
57227	NC_015942	CTG	2	6	2808027	2808032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200914
57228	NC_015942	ATA	2	6	2808033	2808038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200914
57229	NC_015942	A	6	6	2808061	2808066	100 %	0 %	0 %	0 %	344200914
57230	NC_015942	CAG	2	6	2808109	2808114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57231	NC_015942	AT	3	6	2808256	2808261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57232	NC_015942	ATATT	2	10	2808426	2808435	40 %	60 %	0 %	0 %	344200915
57233	NC_015942	ATC	2	6	2808588	2808593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200915
57234	NC_015942	ACT	2	6	2808598	2808603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200915
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57236	NC_015942	T	6	6	2808677	2808682	0 %	100 %	0 %	0 %	344200915
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57344	NC_015942	GCG	3	9	2813872	2813880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200921
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57349	NC_015942	GCC	2	6	2814121	2814126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200921
57350	NC_015942	TTA	2	6	2814178	2814183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200921
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57352	NC_015942	TCA	2	6	2814223	2814228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200921
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57433	NC_015942	CATA	2	8	2818527	2818534	50 %	25 %	0 %	25 %	344200925
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57454	NC_015942	A	6	6	2819548	2819553	100 %	0 %	0 %	0 %	344200926
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57465	NC_015942	CTG	2	6	2820033	2820038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200926
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57467	NC_015942	TGG	2	6	2820121	2820126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200926
57468	NC_015942	TACC	2	8	2820132	2820139	25 %	25 %	0 %	50 %	344200926
57469	NC_015942	CCGC	2	8	2820183	2820190	0 %	0 %	25 %	75 %	344200926
57470	NC_015942	CAT	2	6	2820372	2820377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200926
57471	NC_015942	T	7	7	2820414	2820420	0 %	100 %	0 %	0 %	344200926
57472	NC_015942	GGT	2	6	2820430	2820435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200926
57473	NC_015942	GCA	2	6	2820447	2820452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200926
57474	NC_015942	GCC	2	6	2820476	2820481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200926
57475	NC_015942	CAT	2	6	2820621	2820626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200926
57476	NC_015942	TGAT	2	8	2820631	2820638	25 %	50 %	25 %	0 %	344200926
57477	NC_015942	TCA	2	6	2820642	2820647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200926
57478	NC_015942	A	6	6	2820685	2820690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57479	NC_015942	CAT	2	6	2820695	2820700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57480	NC_015942	CAAT	2	8	2820845	2820852	50 %	25 %	0 %	25 %	344200927
57481	NC_015942	TGC	2	6	2820889	2820894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200927
57482	NC_015942	A	6	6	2820903	2820908	100 %	0 %	0 %	0 %	344200927
57483	NC_015942	GC	3	6	2820978	2820983	0 %	0 %	50 %	50 %	344200927
57484	NC_015942	AAC	2	6	2821087	2821092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200927
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57488	NC_015942	CAT	2	6	2821179	2821184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200927
57489	NC_015942	GC	3	6	2821203	2821208	0 %	0 %	50 %	50 %	344200927
57490	NC_015942	CAA	2	6	2821232	2821237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200927
57491	NC_015942	T	6	6	2821279	2821284	0 %	100 %	0 %	0 %	344200927
57492	NC_015942	GACA	2	8	2821326	2821333	50 %	0 %	25 %	25 %	344200927
57493	NC_015942	GCAT	2	8	2821357	2821364	25 %	25 %	25 %	25 %	344200927
57494	NC_015942	AAG	2	6	2821410	2821415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200927
57495	NC_015942	A	6	6	2821438	2821443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57496	NC_015942	ATT	2	6	2821556	2821561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200928
57497	NC_015942	GC	3	6	2821702	2821707	0 %	0 %	50 %	50 %	344200928
57498	NC_015942	GTG	2	6	2821821	2821826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200928
57499	NC_015942	GAT	2	6	2821956	2821961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200929
57500	NC_015942	CGC	2	6	2822070	2822075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200929

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