MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_015942	GC	3	6	2727547	2727552	0 %	0 %	50 %	50 %	344200830
55502	NC_015942	CAT	2	6	2727580	2727585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200830
55503	NC_015942	GC	3	6	2727615	2727620	0 %	0 %	50 %	50 %	344200830
55504	NC_015942	GC	3	6	2727869	2727874	0 %	0 %	50 %	50 %	344200830
55505	NC_015942	GGGCG	2	10	2727883	2727892	0 %	0 %	80 %	20 %	344200830
55506	NC_015942	GCT	2	6	2727935	2727940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200831
55507	NC_015942	TGA	2	6	2728004	2728009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200831
55508	NC_015942	CAA	2	6	2728013	2728018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200831
55509	NC_015942	GAAA	2	8	2728031	2728038	75 %	0 %	25 %	0 %	344200831
55510	NC_015942	TGC	2	6	2728042	2728047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200831
55511	NC_015942	GTA	2	6	2728059	2728064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200831
55512	NC_015942	CAGCG	2	10	2728073	2728082	20 %	0 %	40 %	40 %	344200831
55513	NC_015942	ACT	2	6	2728108	2728113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200831
55514	NC_015942	CTG	2	6	2728137	2728142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200831
55515	NC_015942	CGC	2	6	2728221	2728226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200831
55516	NC_015942	ATT	2	6	2728247	2728252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200831
55517	NC_015942	ACCGCC	2	12	2728266	2728277	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	344200831
55518	NC_015942	ATC	2	6	2728290	2728295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200831
55519	NC_015942	GCT	2	6	2728319	2728324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200831
55520	NC_015942	GGA	3	9	2728379	2728387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200831
55521	NC_015942	TCC	2	6	2728456	2728461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200831
55522	NC_015942	ATC	2	6	2728473	2728478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200831
55523	NC_015942	TCA	2	6	2728561	2728566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200831
55524	NC_015942	CCCTG	2	10	2728567	2728576	0 %	20 %	20 %	60 %	344200831
55525	NC_015942	CAG	2	6	2728632	2728637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200831
55526	NC_015942	CAT	2	6	2728671	2728676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200831
55527	NC_015942	TTA	2	6	2728685	2728690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200831
55528	NC_015942	GGC	2	6	2728762	2728767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200831
55529	NC_015942	CTG	2	6	2728779	2728784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200831
55530	NC_015942	CGCC	2	8	2728792	2728799	0 %	0 %	25 %	75 %	344200831
55531	NC_015942	CTT	2	6	2728838	2728843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200831
55532	NC_015942	CCA	2	6	2728855	2728860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200831
55533	NC_015942	GC	3	6	2728914	2728919	0 %	0 %	50 %	50 %	344200831
55534	NC_015942	GCC	2	6	2728954	2728959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200831
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55536	NC_015942	TGG	2	6	2728993	2728998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200831
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55538	NC_015942	CTGG	2	8	2729024	2729031	0 %	25 %	50 %	25 %	344200831
55539	NC_015942	ATG	2	6	2729061	2729066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200831
55540	NC_015942	TAT	2	6	2729087	2729092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200831
55541	NC_015942	GCG	2	6	2729094	2729099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200831
55542	NC_015942	CTG	2	6	2729130	2729135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200831
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55545	NC_015942	CGG	2	6	2729324	2729329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200831
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55547	NC_015942	CTA	2	6	2729523	2729528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200831
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55550	NC_015942	TGG	2	6	2729810	2729815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200832
55551	NC_015942	CAA	2	6	2729825	2729830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200832
55552	NC_015942	GCG	2	6	2729959	2729964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200832
55553	NC_015942	GCT	2	6	2729979	2729984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200832
55554	NC_015942	GGCC	2	8	2730009	2730016	0 %	0 %	50 %	50 %	344200832
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55557	NC_015942	CCT	2	6	2730084	2730089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200832
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55569	NC_015942	TGT	2	6	2730637	2730642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200833
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55571	NC_015942	CG	3	6	2730741	2730746	0 %	0 %	50 %	50 %	344200833
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55587	NC_015942	GCC	3	9	2731487	2731495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200834
55588	NC_015942	CCG	2	6	2731587	2731592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200834
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55595	NC_015942	GCCC	2	8	2731948	2731955	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55596	NC_015942	CT	3	6	2731958	2731963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55597	NC_015942	GAA	2	6	2732001	2732006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200835
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55599	NC_015942	TGC	2	6	2732044	2732049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200835
55600	NC_015942	CG	3	6	2732077	2732082	0 %	0 %	50 %	50 %	344200835
55601	NC_015942	GATG	2	8	2732111	2732118	25 %	25 %	50 %	0 %	344200835
55602	NC_015942	AC	3	6	2732249	2732254	50 %	0 %	0 %	50 %	344200835
55603	NC_015942	CTG	3	9	2732271	2732279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200835
55604	NC_015942	CTG	2	6	2732283	2732288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200835
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55607	NC_015942	GAT	2	6	2732322	2732327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200835
55608	NC_015942	CAT	3	9	2732372	2732380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200835
55609	NC_015942	A	6	6	2732403	2732408	100 %	0 %	0 %	0 %	344200835
55610	NC_015942	TGC	2	6	2732444	2732449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200835
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55614	NC_015942	C	6	6	2732584	2732589	0 %	0 %	0 %	100 %	344200835
55615	NC_015942	ATG	2	6	2732699	2732704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55616	NC_015942	CAT	2	6	2732718	2732723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55617	NC_015942	CGC	2	6	2732731	2732736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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55780	NC_015942	A	6	6	2740178	2740183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55968	NC_015942	ACT	2	6	2749245	2749250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200856
55969	NC_015942	CCGGT	2	10	2749277	2749286	0 %	20 %	40 %	40 %	344200856
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55972	NC_015942	CG	4	8	2749431	2749438	0 %	0 %	50 %	50 %	344200856
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