MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53502	NC_015942	CAA	2	6	2625765	2625770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200719
53503	NC_015942	CAT	2	6	2625774	2625779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200719
53504	NC_015942	ACG	2	6	2625855	2625860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200719
53505	NC_015942	TGT	2	6	2625863	2625868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200719
53506	NC_015942	GGC	3	9	2625920	2625928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200719
53507	NC_015942	GC	3	6	2625927	2625932	0 %	0 %	50 %	50 %	344200719
53508	NC_015942	CCA	2	6	2625935	2625940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200719
53509	NC_015942	GCCT	2	8	2625955	2625962	0 %	25 %	25 %	50 %	344200719
53510	NC_015942	A	6	6	2626000	2626005	100 %	0 %	0 %	0 %	344200719
53511	NC_015942	AAT	2	6	2626029	2626034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200719
53512	NC_015942	CGG	2	6	2626109	2626114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200719
53513	NC_015942	CTG	2	6	2626147	2626152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200719
53514	NC_015942	CCG	2	6	2626194	2626199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200719
53515	NC_015942	CAC	2	6	2626278	2626283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200719
53516	NC_015942	TGCC	2	8	2626313	2626320	0 %	25 %	25 %	50 %	344200720
53517	NC_015942	GCC	2	6	2626428	2626433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200720
53518	NC_015942	T	6	6	2626464	2626469	0 %	100 %	0 %	0 %	344200720
53519	NC_015942	GCCA	4	16	2626507	2626522	25 %	0 %	25 %	50 %	344200720
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53522	NC_015942	CGT	2	6	2626634	2626639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200720
53523	NC_015942	CCTGC	2	10	2626669	2626678	0 %	20 %	20 %	60 %	344200720
53524	NC_015942	T	8	8	2626753	2626760	0 %	100 %	0 %	0 %	344200720
53525	NC_015942	ATG	2	6	2626764	2626769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200720
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53531	NC_015942	TCCA	2	8	2626952	2626959	25 %	25 %	0 %	50 %	344200721
53532	NC_015942	GCA	2	6	2627013	2627018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200721
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53537	NC_015942	GCA	2	6	2627178	2627183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200721
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53545	NC_015942	ACG	2	6	2627506	2627511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200721
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53549	NC_015942	CACC	2	8	2627805	2627812	25 %	0 %	0 %	75 %	344200722
53550	NC_015942	CCGT	2	8	2627909	2627916	0 %	25 %	25 %	50 %	344200722
53551	NC_015942	ATC	2	6	2627981	2627986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200722
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53553	NC_015942	CGC	2	6	2628033	2628038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200722
53554	NC_015942	CGC	2	6	2628099	2628104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200722
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53557	NC_015942	AGCGC	2	10	2628198	2628207	20 %	0 %	40 %	40 %	344200722
53558	NC_015942	GC	5	10	2628228	2628237	0 %	0 %	50 %	50 %	344200722
53559	NC_015942	ACCT	2	8	2628243	2628250	25 %	25 %	0 %	50 %	344200722
53560	NC_015942	GGCA	2	8	2628424	2628431	25 %	0 %	50 %	25 %	344200723
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53575	NC_015942	GC	3	6	2629114	2629119	0 %	0 %	50 %	50 %	344200723
53576	NC_015942	GGCCA	2	10	2629168	2629177	20 %	0 %	40 %	40 %	344200723
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53580	NC_015942	ACC	2	6	2629413	2629418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200723
53581	NC_015942	TAC	2	6	2629463	2629468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200723
53582	NC_015942	AGGA	2	8	2629650	2629657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53583	NC_015942	AG	4	8	2629679	2629686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53584	NC_015942	ATTT	2	8	2629701	2629708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53585	NC_015942	C	6	6	2629768	2629773	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53586	NC_015942	CAA	2	6	2629783	2629788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53587	NC_015942	ATG	2	6	2629797	2629802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53589	NC_015942	CCTT	2	8	2629894	2629901	0 %	50 %	0 %	50 %	344200724
53590	NC_015942	CGCT	2	8	2629927	2629934	0 %	25 %	25 %	50 %	344200724
53591	NC_015942	GCA	2	6	2629952	2629957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200724
53592	NC_015942	TCCCG	2	10	2629963	2629972	0 %	20 %	20 %	60 %	344200724
53593	NC_015942	CAT	2	6	2630021	2630026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200724
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53597	NC_015942	TACCG	2	10	2630115	2630124	20 %	20 %	20 %	40 %	344200724
53598	NC_015942	TTC	2	6	2630154	2630159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200724
53599	NC_015942	GCC	2	6	2630181	2630186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200724
53600	NC_015942	ATA	2	6	2630233	2630238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200724
53601	NC_015942	TCA	2	6	2630288	2630293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200724
53602	NC_015942	GCC	2	6	2630309	2630314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200724
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53604	NC_015942	CCTT	2	8	2630485	2630492	0 %	50 %	0 %	50 %	344200724
53605	NC_015942	CATC	2	8	2630543	2630550	25 %	25 %	0 %	50 %	344200724
53606	NC_015942	CAC	2	6	2630564	2630569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200724
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53608	NC_015942	ACC	2	6	2630617	2630622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200724
53609	NC_015942	CCG	2	6	2630660	2630665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200724
53610	NC_015942	GCA	2	6	2630765	2630770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200724
53611	NC_015942	CCA	3	9	2630840	2630848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200724
53612	NC_015942	CGCC	2	8	2630903	2630910	0 %	0 %	25 %	75 %	344200724
53613	NC_015942	CTG	2	6	2630935	2630940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200724
53614	NC_015942	GC	3	6	2630960	2630965	0 %	0 %	50 %	50 %	344200724
53615	NC_015942	T	7	7	2631002	2631008	0 %	100 %	0 %	0 %	344200724
53616	NC_015942	CGC	2	6	2631029	2631034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200724
53617	NC_015942	TCT	2	6	2631043	2631048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200724
53618	NC_015942	CTG	2	6	2631072	2631077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200724
53619	NC_015942	CTT	2	6	2631080	2631085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200724
53620	NC_015942	TGC	2	6	2631095	2631100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200724
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53622	NC_015942	GC	3	6	2631164	2631169	0 %	0 %	50 %	50 %	344200724
53623	NC_015942	CCAC	2	8	2631194	2631201	25 %	0 %	0 %	75 %	344200724
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53646	NC_015942	GGC	2	6	2632229	2632234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200726
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53710	NC_015942	GCCGCG	2	12	2635295	2635306	0 %	0 %	50 %	50 %	344200728
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53714	NC_015942	CGCC	2	8	2635368	2635375	0 %	0 %	25 %	75 %	344200728
53715	NC_015942	CCG	2	6	2635376	2635381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200728
53716	NC_015942	GCA	2	6	2635383	2635388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200728
53717	NC_015942	GCG	2	6	2635394	2635399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200728
53718	NC_015942	CAT	3	9	2635402	2635410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200728
53719	NC_015942	GC	5	10	2635416	2635425	0 %	0 %	50 %	50 %	344200728
53720	NC_015942	C	6	6	2635425	2635430	0 %	0 %	0 %	100 %	344200728
53721	NC_015942	GCC	2	6	2635458	2635463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200728
53722	NC_015942	CTG	2	6	2635476	2635481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200728
53723	NC_015942	TGC	2	6	2635490	2635495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200728
53724	NC_015942	GCTTC	2	10	2635585	2635594	0 %	40 %	20 %	40 %	344200728
53725	NC_015942	CTG	2	6	2635610	2635615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200728
53726	NC_015942	CGC	2	6	2635634	2635639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200728
53727	NC_015942	CGG	2	6	2635646	2635651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200728
53728	NC_015942	CTG	2	6	2635655	2635660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200728
53729	NC_015942	ACA	2	6	2635800	2635805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200728
53730	NC_015942	CCG	2	6	2635825	2635830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200728
53731	NC_015942	GCG	2	6	2635856	2635861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200728
53732	NC_015942	GTG	2	6	2635917	2635922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200728
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53860	NC_015942	GCT	2	6	2643550	2643555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53861	NC_015942	TGC	2	6	2643621	2643626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53862	NC_015942	CTGCC	2	10	2643642	2643651	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
53863	NC_015942	T	7	7	2643695	2643701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53864	NC_015942	GCG	2	6	2643714	2643719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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53976	NC_015942	CGA	2	6	2649831	2649836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200737
53977	NC_015942	GC	4	8	2649937	2649944	0 %	0 %	50 %	50 %	344200737
53978	NC_015942	ACC	2	6	2649988	2649993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200737
53979	NC_015942	ATC	2	6	2649994	2649999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200737
53980	NC_015942	TCA	2	6	2650012	2650017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200737
53981	NC_015942	CAC	2	6	2650023	2650028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200737
53982	NC_015942	CCAT	2	8	2650063	2650070	25 %	25 %	0 %	50 %	344200737
53983	NC_015942	CA	3	6	2650194	2650199	50 %	0 %	0 %	50 %	344200737
53984	NC_015942	CCT	2	6	2650220	2650225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200737
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