MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_015942	GGC	2	6	2601626	2601631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200697
53002	NC_015942	ATG	2	6	2601680	2601685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200697
53003	NC_015942	ACA	2	6	2601696	2601701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200697
53004	NC_015942	GTAA	2	8	2601783	2601790	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53005	NC_015942	CAG	2	6	2601813	2601818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53006	NC_015942	ATT	2	6	2601847	2601852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53007	NC_015942	CAG	2	6	2601906	2601911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53008	NC_015942	GGA	2	6	2602002	2602007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53009	NC_015942	CTG	2	6	2602013	2602018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53010	NC_015942	ATT	2	6	2602030	2602035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53011	NC_015942	CGA	2	6	2602114	2602119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53012	NC_015942	CCG	2	6	2602208	2602213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53013	NC_015942	ACT	2	6	2602222	2602227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53014	NC_015942	ATC	2	6	2602231	2602236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53015	NC_015942	ACT	2	6	2602270	2602275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53016	NC_015942	TGG	2	6	2602285	2602290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200698
53017	NC_015942	TTC	2	6	2602338	2602343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200698
53018	NC_015942	ATG	2	6	2602402	2602407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200698
53019	NC_015942	TCA	2	6	2602471	2602476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200698
53020	NC_015942	CGG	2	6	2602479	2602484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200698
53021	NC_015942	CGC	2	6	2602585	2602590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200698
53022	NC_015942	CGA	2	6	2602742	2602747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200699
53023	NC_015942	GCA	2	6	2602750	2602755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200699
53024	NC_015942	GGC	3	9	2602788	2602796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200699
53025	NC_015942	GCA	2	6	2602806	2602811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200699
53026	NC_015942	CAA	2	6	2602849	2602854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200699
53027	NC_015942	AGA	2	6	2602949	2602954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200699
53028	NC_015942	GCG	2	6	2603020	2603025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200699
53029	NC_015942	C	7	7	2603028	2603034	0 %	0 %	0 %	100 %	344200699
53030	NC_015942	CACC	2	8	2603042	2603049	25 %	0 %	0 %	75 %	344200699
53031	NC_015942	CAG	2	6	2603087	2603092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200699
53032	NC_015942	CTT	2	6	2603115	2603120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200699
53033	NC_015942	GCA	2	6	2603207	2603212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200699
53034	NC_015942	CAG	2	6	2603233	2603238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200699
53035	NC_015942	CCGC	2	8	2603311	2603318	0 %	0 %	25 %	75 %	344200699
53036	NC_015942	GAT	2	6	2603370	2603375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200699
53037	NC_015942	CCT	2	6	2603490	2603495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200699
53038	NC_015942	GGCC	2	8	2603571	2603578	0 %	0 %	50 %	50 %	344200699
53039	NC_015942	CAC	2	6	2603705	2603710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200699
53040	NC_015942	GCC	2	6	2603740	2603745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200699
53041	NC_015942	A	6	6	2603762	2603767	100 %	0 %	0 %	0 %	344200699
53042	NC_015942	CCG	2	6	2603805	2603810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200699
53043	NC_015942	TTC	2	6	2603815	2603820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200699
53044	NC_015942	GGC	2	6	2603847	2603852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200699
53045	NC_015942	TGG	2	6	2603963	2603968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200699
53046	NC_015942	TTC	2	6	2603974	2603979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200699
53047	NC_015942	GCC	2	6	2603998	2604003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200699
53048	NC_015942	CGGG	2	8	2604064	2604071	0 %	0 %	75 %	25 %	344200699
53049	NC_015942	ACCA	2	8	2604112	2604119	50 %	0 %	0 %	50 %	344200699
53050	NC_015942	CTG	2	6	2604171	2604176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200699
53051	NC_015942	GGTC	2	8	2604198	2604205	0 %	25 %	50 %	25 %	344200699
53052	NC_015942	CGC	2	6	2604212	2604217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200699
53053	NC_015942	TGA	2	6	2604265	2604270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200699
53054	NC_015942	CCT	2	6	2604476	2604481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53055	NC_015942	CTG	2	6	2604493	2604498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53056	NC_015942	TACGGC	2	12	2604522	2604533	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344200700
53057	NC_015942	GTCGG	2	10	2604552	2604561	0 %	20 %	60 %	20 %	344200700
53058	NC_015942	GAG	2	6	2604579	2604584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200700
53059	NC_015942	GCC	2	6	2604625	2604630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200700
53060	NC_015942	TTG	2	6	2604637	2604642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200700
53061	NC_015942	CAG	2	6	2604768	2604773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200700
53062	NC_015942	CGC	2	6	2604785	2604790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200700
53063	NC_015942	TGC	2	6	2604796	2604801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200700
53064	NC_015942	CCAAG	2	10	2604814	2604823	40 %	0 %	20 %	40 %	344200700
53065	NC_015942	GGC	2	6	2604833	2604838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200700
53066	NC_015942	TTC	2	6	2604850	2604855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200700
53067	NC_015942	TGG	2	6	2604866	2604871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200700
53068	NC_015942	TCT	2	6	2604911	2604916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200700
53069	NC_015942	GAG	2	6	2605008	2605013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200700
53070	NC_015942	TGGC	2	8	2605051	2605058	0 %	25 %	50 %	25 %	344200700
53071	NC_015942	TGC	2	6	2605213	2605218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200700
53072	NC_015942	GGC	2	6	2605253	2605258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200700
53073	NC_015942	CAT	2	6	2605292	2605297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200700
53074	NC_015942	TTG	2	6	2605300	2605305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200700
53075	NC_015942	ATG	2	6	2605383	2605388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200700
53076	NC_015942	GA	3	6	2605426	2605431	50 %	0 %	50 %	0 %	344200700
53077	NC_015942	TTC	2	6	2605522	2605527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200700
53078	NC_015942	AAAC	2	8	2605587	2605594	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53079	NC_015942	CCA	2	6	2605664	2605669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53080	NC_015942	CAT	2	6	2605798	2605803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53081	NC_015942	T	7	7	2605822	2605828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53082	NC_015942	TTG	2	6	2605897	2605902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53083	NC_015942	AGA	2	6	2605983	2605988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53084	NC_015942	ATC	2	6	2606002	2606007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53085	NC_015942	TATT	2	8	2606031	2606038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53086	NC_015942	CGG	2	6	2606078	2606083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53087	NC_015942	CAG	2	6	2606152	2606157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53088	NC_015942	AGCTG	2	10	2606162	2606171	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53089	NC_015942	AGG	2	6	2606176	2606181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53090	NC_015942	CCA	2	6	2606390	2606395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200701
53091	NC_015942	TGG	2	6	2606455	2606460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200701
53092	NC_015942	CAC	2	6	2606545	2606550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200701
53093	NC_015942	CGC	2	6	2606558	2606563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200701
53094	NC_015942	TTTCC	2	10	2606586	2606595	0 %	60 %	0 %	40 %	344200701
53095	NC_015942	AACA	2	8	2606624	2606631	75 %	0 %	0 %	25 %	344200701
53096	NC_015942	GCC	2	6	2606712	2606717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200701
53097	NC_015942	GCC	2	6	2606736	2606741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200701
53098	NC_015942	TGA	2	6	2606776	2606781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200701
53099	NC_015942	CGCTT	2	10	2606853	2606862	0 %	40 %	20 %	40 %	344200701
53100	NC_015942	GC	3	6	2606972	2606977	0 %	0 %	50 %	50 %	344200701
53101	NC_015942	CGG	2	6	2607070	2607075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200701
53102	NC_015942	CCGC	2	8	2607079	2607086	0 %	0 %	25 %	75 %	344200701
53103	NC_015942	AG	3	6	2607095	2607100	50 %	0 %	50 %	0 %	344200701
53104	NC_015942	CGC	3	9	2607105	2607113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200701
53105	NC_015942	TCC	2	6	2607117	2607122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200701
53106	NC_015942	TCA	2	6	2607126	2607131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200701
53107	NC_015942	GTC	2	6	2607164	2607169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200701
53108	NC_015942	CGT	2	6	2607228	2607233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200701
53109	NC_015942	TGC	2	6	2607252	2607257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200701
53110	NC_015942	AAT	2	6	2607304	2607309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200701
53111	NC_015942	AGC	2	6	2607332	2607337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200701
53112	NC_015942	CGG	2	6	2607343	2607348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200701
53113	NC_015942	CGAT	2	8	2607408	2607415	25 %	25 %	25 %	25 %	344200701
53114	NC_015942	CGC	2	6	2607449	2607454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200701
53115	NC_015942	CAC	2	6	2607488	2607493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200701
53116	NC_015942	GCG	2	6	2607496	2607501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200701
53117	NC_015942	TGCC	2	8	2607522	2607529	0 %	25 %	25 %	50 %	344200701
53118	NC_015942	CAA	2	6	2607595	2607600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200701
53119	NC_015942	TCA	2	6	2607610	2607615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200701
53120	NC_015942	CCG	2	6	2607628	2607633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200701
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53122	NC_015942	CAA	2	6	2607700	2607705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200701
53123	NC_015942	CA	3	6	2607727	2607732	50 %	0 %	0 %	50 %	344200701
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53138	NC_015942	AATC	2	8	2608739	2608746	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53139	NC_015942	ATCA	2	8	2608794	2608801	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53140	NC_015942	GCG	2	6	2608806	2608811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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53143	NC_015942	T	7	7	2608983	2608989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53144	NC_015942	TGGGTA	2	12	2609017	2609028	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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53146	NC_015942	TGT	2	6	2609219	2609224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53147	NC_015942	TCA	2	6	2609229	2609234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53148	NC_015942	GGA	2	6	2609235	2609240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53149	NC_015942	TCA	2	6	2609241	2609246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53150	NC_015942	ATATA	2	10	2609268	2609277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53151	NC_015942	TGA	2	6	2609323	2609328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53152	NC_015942	CCG	2	6	2609343	2609348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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53154	NC_015942	TGA	2	6	2609530	2609535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200702
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53219	NC_015942	GGCCGA	2	12	2613051	2613062	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344200704
53220	NC_015942	TTGC	2	8	2613100	2613107	0 %	50 %	25 %	25 %	344200704
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53223	NC_015942	CCT	2	6	2613297	2613302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200704
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53225	NC_015942	CTC	2	6	2613459	2613464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200705
53226	NC_015942	CCA	2	6	2613511	2613516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200705
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53228	NC_015942	GGA	2	6	2613608	2613613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200705
53229	NC_015942	GCG	2	6	2613785	2613790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200705
53230	NC_015942	GAG	2	6	2613927	2613932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200705
53231	NC_015942	CGT	2	6	2613948	2613953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200705
53232	NC_015942	CG	3	6	2614018	2614023	0 %	0 %	50 %	50 %	344200705
53233	NC_015942	CGG	2	6	2614034	2614039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200705
53234	NC_015942	CG	3	6	2614050	2614055	0 %	0 %	50 %	50 %	344200705
53235	NC_015942	TGG	3	9	2614062	2614070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200705
53236	NC_015942	AG	3	6	2614086	2614091	50 %	0 %	50 %	0 %	344200705
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53351	NC_015942	GGC	2	6	2619096	2619101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200711
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53353	NC_015942	AGG	2	6	2619152	2619157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200711
53354	NC_015942	TGC	2	6	2619171	2619176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200711
53355	NC_015942	TGC	2	6	2619195	2619200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200711
53356	NC_015942	TGG	2	6	2619218	2619223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200711
53357	NC_015942	CCG	2	6	2619229	2619234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200711
53358	NC_015942	AGG	2	6	2619245	2619250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200711
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53364	NC_015942	AGG	2	6	2619700	2619705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200712
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53382	NC_015942	CTTG	2	8	2620110	2620117	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53383	NC_015942	GCC	2	6	2620126	2620131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53384	NC_015942	ACC	2	6	2620144	2620149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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53467	NC_015942	TGA	2	6	2623779	2623784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200716
53468	NC_015942	CTG	2	6	2623858	2623863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200716
53469	NC_015942	TGG	2	6	2623901	2623906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200716
53470	NC_015942	CGC	2	6	2623911	2623916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200716
53471	NC_015942	CTC	2	6	2624062	2624067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200716
53472	NC_015942	AAC	2	6	2624078	2624083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200716
53473	NC_015942	A	6	6	2624110	2624115	100 %	0 %	0 %	0 %	344200716
53474	NC_015942	CTG	2	6	2624140	2624145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200716
53475	NC_015942	GGC	2	6	2624161	2624166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200716
53476	NC_015942	CGG	2	6	2624343	2624348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200716
53477	NC_015942	GCT	2	6	2624411	2624416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200716
53478	NC_015942	CGG	2	6	2624427	2624432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200716
53479	NC_015942	ATC	2	6	2624530	2624535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200716
53480	NC_015942	TGG	2	6	2624548	2624553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200716
53481	NC_015942	CGC	2	6	2624563	2624568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200716
53482	NC_015942	TGGTG	2	10	2624610	2624619	0 %	40 %	60 %	0 %	344200716
53483	NC_015942	TGG	3	9	2624648	2624656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200716
53484	NC_015942	GAT	2	6	2624707	2624712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200716
53485	NC_015942	TCA	2	6	2624747	2624752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200716
53486	NC_015942	AGC	2	6	2624815	2624820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200717
53487	NC_015942	TC	3	6	2624857	2624862	0 %	50 %	0 %	50 %	344200717
53488	NC_015942	GCA	2	6	2624905	2624910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200717
53489	NC_015942	CTA	2	6	2624996	2625001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200717
53490	NC_015942	GTG	2	6	2625087	2625092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200717
53491	NC_015942	CGT	2	6	2625159	2625164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200718
53492	NC_015942	GCAT	2	8	2625206	2625213	25 %	25 %	25 %	25 %	344200718
53493	NC_015942	TCG	2	6	2625260	2625265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200718
53494	NC_015942	AGA	2	6	2625369	2625374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200718
53495	NC_015942	GGC	2	6	2625381	2625386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200718
53496	NC_015942	GCGGG	2	10	2625405	2625414	0 %	0 %	80 %	20 %	344200718
53497	NC_015942	GGT	2	6	2625417	2625422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200718
53498	NC_015942	CG	3	6	2625630	2625635	0 %	0 %	50 %	50 %	344200719
53499	NC_015942	CTC	2	6	2625636	2625641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200719
53500	NC_015942	GCC	2	6	2625688	2625693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200719

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