MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52501	NC_015942	CTG	2	6	2575431	2575436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52502	NC_015942	GTG	2	6	2575481	2575486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52503	NC_015942	ATA	2	6	2575503	2575508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52504	NC_015942	GGC	2	6	2575604	2575609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52505	NC_015942	TCA	2	6	2575614	2575619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52506	NC_015942	TTC	2	6	2575630	2575635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52507	NC_015942	GCA	2	6	2575663	2575668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52508	NC_015942	GC	3	6	2575708	2575713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52509	NC_015942	AT	4	8	2575720	2575727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52510	NC_015942	AT	3	6	2575737	2575742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52511	NC_015942	AGG	2	6	2575750	2575755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52512	NC_015942	TAC	2	6	2575756	2575761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52513	NC_015942	GA	3	6	2575813	2575818	50 %	0 %	50 %	0 %	344200672
52514	NC_015942	GGT	2	6	2575892	2575897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200672
52515	NC_015942	GAT	2	6	2575919	2575924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200672
52516	NC_015942	TCAGG	2	10	2575949	2575958	20 %	20 %	40 %	20 %	344200672
52517	NC_015942	ATGC	2	8	2575994	2576001	25 %	25 %	25 %	25 %	344200672
52518	NC_015942	GGC	2	6	2576030	2576035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200672
52519	NC_015942	ATT	2	6	2576036	2576041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200672
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52521	NC_015942	ATT	2	6	2576110	2576115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200672
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52523	NC_015942	TCC	2	6	2576190	2576195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200672
52524	NC_015942	TGG	2	6	2576250	2576255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200672
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52527	NC_015942	GTG	2	6	2576378	2576383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200672
52528	NC_015942	CGC	2	6	2576448	2576453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200673
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52533	NC_015942	ACG	2	6	2576634	2576639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200673
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52537	NC_015942	CGCC	2	8	2576863	2576870	0 %	0 %	25 %	75 %	344200674
52538	NC_015942	GA	3	6	2576911	2576916	50 %	0 %	50 %	0 %	344200674
52539	NC_015942	CTC	2	6	2576978	2576983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200674
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52545	NC_015942	CGG	2	6	2577269	2577274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200675
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52549	NC_015942	TGC	2	6	2577512	2577517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200676
52550	NC_015942	AC	4	8	2577535	2577542	50 %	0 %	0 %	50 %	344200676
52551	NC_015942	ACAAT	2	10	2577544	2577553	60 %	20 %	0 %	20 %	344200676
52552	NC_015942	TTCCA	2	10	2577603	2577612	20 %	40 %	0 %	40 %	344200676
52553	NC_015942	TG	3	6	2577646	2577651	0 %	50 %	50 %	0 %	344200676
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52555	NC_015942	GA	3	6	2577690	2577695	50 %	0 %	50 %	0 %	344200676
52556	NC_015942	TC	3	6	2577710	2577715	0 %	50 %	0 %	50 %	344200676
52557	NC_015942	TGG	2	6	2577839	2577844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200676
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52559	NC_015942	CAT	2	6	2577932	2577937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52560	NC_015942	CTG	2	6	2577998	2578003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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52564	NC_015942	AAG	2	6	2578179	2578184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200677
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52568	NC_015942	GTC	2	6	2578371	2578376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52569	NC_015942	TCGTA	2	10	2578382	2578391	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52570	NC_015942	CCA	2	6	2578449	2578454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52571	NC_015942	CCG	2	6	2578467	2578472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52572	NC_015942	TGA	2	6	2578481	2578486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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52579	NC_015942	CCAT	2	8	2578961	2578968	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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52589	NC_015942	GTG	2	6	2579480	2579485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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52593	NC_015942	GCA	2	6	2579811	2579816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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52621	NC_015942	ATG	2	6	2581026	2581031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200679
52622	NC_015942	CG	3	6	2581076	2581081	0 %	0 %	50 %	50 %	344200679
52623	NC_015942	CGC	2	6	2581104	2581109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200679
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52625	NC_015942	AG	3	6	2581191	2581196	50 %	0 %	50 %	0 %	344200679
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52649	NC_015942	CAT	2	6	2582591	2582596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200679
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52674	NC_015942	TA	3	6	2583868	2583873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52675	NC_015942	TCG	2	6	2584024	2584029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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52677	NC_015942	CGTCC	2	10	2584183	2584192	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
52678	NC_015942	GCC	2	6	2584318	2584323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200681
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52712	NC_015942	TGA	2	6	2585914	2585919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200682
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52722	NC_015942	CCT	2	6	2586516	2586521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52723	NC_015942	GGACA	2	10	2586547	2586556	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52724	NC_015942	T	6	6	2586589	2586594	0 %	100 %	0 %	0 %	344200683
52725	NC_015942	CAT	2	6	2586613	2586618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200683
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52730	NC_015942	GTATT	2	10	2586824	2586833	20 %	60 %	20 %	0 %	344200683
52731	NC_015942	CGG	2	6	2586835	2586840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200683
52732	NC_015942	GTTT	2	8	2586911	2586918	0 %	75 %	25 %	0 %	344200683
52733	NC_015942	ATC	2	6	2586923	2586928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200683
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52736	NC_015942	GTT	2	6	2587074	2587079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200683
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52843	NC_015942	GCA	2	6	2592290	2592295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200686
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52846	NC_015942	TTG	2	6	2592605	2592610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52847	NC_015942	AAACAG	2	12	2592644	2592655	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52848	NC_015942	TGGCA	2	10	2592671	2592680	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52849	NC_015942	GAA	2	6	2592836	2592841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52850	NC_015942	TG	3	6	2592843	2592848	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52851	NC_015942	CAGA	2	8	2592963	2592970	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52852	NC_015942	CCCG	2	8	2592971	2592978	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52853	NC_015942	GTC	2	6	2593067	2593072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52854	NC_015942	CCAT	2	8	2593495	2593502	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52855	NC_015942	GTA	2	6	2593601	2593606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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52970	NC_015942	TGA	2	6	2600325	2600330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200696
52971	NC_015942	CAAT	2	8	2600338	2600345	50 %	25 %	0 %	25 %	344200696
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52974	NC_015942	ATT	2	6	2600449	2600454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200696
52975	NC_015942	TCA	2	6	2600461	2600466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200696
52976	NC_015942	AT	3	6	2600497	2600502	50 %	50 %	0 %	0 %	344200696
52977	NC_015942	ACGA	2	8	2600517	2600524	50 %	0 %	25 %	25 %	344200696
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