MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52002	NC_015942	TCA	2	6	2547869	2547874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200648
52003	NC_015942	TTCC	2	8	2547877	2547884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52004	NC_015942	ATT	2	6	2547891	2547896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52005	NC_015942	AGT	2	6	2547921	2547926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52006	NC_015942	CGCC	2	8	2547969	2547976	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52007	NC_015942	CGC	2	6	2548137	2548142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52008	NC_015942	C	6	6	2548190	2548195	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52009	NC_015942	ATT	2	6	2548197	2548202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52010	NC_015942	GCC	2	6	2548226	2548231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200649
52011	NC_015942	TCG	2	6	2548291	2548296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200649
52012	NC_015942	CAA	2	6	2548297	2548302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200649
52013	NC_015942	GGT	2	6	2548306	2548311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200649
52014	NC_015942	GGC	2	6	2548370	2548375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200649
52015	NC_015942	GGC	2	6	2548381	2548386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200649
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52017	NC_015942	GAG	2	6	2548562	2548567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200649
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52023	NC_015942	GC	3	6	2548678	2548683	0 %	0 %	50 %	50 %	344200649
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52039	NC_015942	CAG	2	6	2550052	2550057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200649
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52083	NC_015942	TAT	2	6	2552447	2552452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52089	NC_015942	TCTG	2	8	2552672	2552679	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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52104	NC_015942	TCAGG	2	10	2553220	2553229	20 %	20 %	40 %	20 %	344200651
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52114	NC_015942	ATA	2	6	2553925	2553930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200652
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52117	NC_015942	T	6	6	2554207	2554212	0 %	100 %	0 %	0 %	344200652
52118	NC_015942	TGA	2	6	2554226	2554231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200652
52119	NC_015942	ATA	2	6	2554239	2554244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200652
52120	NC_015942	ACT	2	6	2554277	2554282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200652
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52123	NC_015942	T	7	7	2554309	2554315	0 %	100 %	0 %	0 %	344200652
52124	NC_015942	ATG	2	6	2554319	2554324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200652
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52127	NC_015942	T	7	7	2554464	2554470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52128	NC_015942	TCT	2	6	2554563	2554568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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52131	NC_015942	CTG	2	6	2554618	2554623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52132	NC_015942	ACT	2	6	2554804	2554809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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52141	NC_015942	CG	3	6	2555388	2555393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52142	NC_015942	CGG	3	9	2555402	2555410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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52158	NC_015942	AT	3	6	2556220	2556225	50 %	50 %	0 %	0 %	344200654
52159	NC_015942	TAAA	2	8	2556334	2556341	75 %	25 %	0 %	0 %	344200654
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52162	NC_015942	T	6	6	2556535	2556540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52233	NC_015942	CTA	2	6	2560133	2560138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200657
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52238	NC_015942	GCA	3	9	2560445	2560453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200657
52239	NC_015942	GAC	2	6	2560551	2560556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200657
52240	NC_015942	CCG	2	6	2560569	2560574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200657
52241	NC_015942	ACC	2	6	2560706	2560711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200657
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52243	NC_015942	CCG	2	6	2560821	2560826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200657
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52245	NC_015942	GCT	2	6	2561098	2561103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200657
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52250	NC_015942	GAT	2	6	2561186	2561191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200657
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52252	NC_015942	GGT	2	6	2561241	2561246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200657
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52258	NC_015942	CG	4	8	2561782	2561789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52259	NC_015942	CCG	2	6	2561801	2561806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52260	NC_015942	CAGC	2	8	2561819	2561826	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52261	NC_015942	CGT	2	6	2561869	2561874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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52264	NC_015942	GATG	2	8	2562083	2562090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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52266	NC_015942	GTAT	2	8	2562151	2562158	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52267	NC_015942	ATC	3	9	2562239	2562247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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52270	NC_015942	CG	3	6	2562303	2562308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52271	NC_015942	GAT	2	6	2562365	2562370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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52297	NC_015942	CCAA	2	8	2563900	2563907	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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52344	NC_015942	CG	3	6	2566822	2566827	0 %	0 %	50 %	50 %	344200663
52345	NC_015942	GAA	2	6	2566895	2566900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200663
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52357	NC_015942	AAC	2	6	2567470	2567475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200663
52358	NC_015942	TATC	2	8	2567504	2567511	25 %	50 %	0 %	25 %	344200663
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52360	NC_015942	ATGC	2	8	2567520	2567527	25 %	25 %	25 %	25 %	344200663
52361	NC_015942	GAA	2	6	2567630	2567635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200663
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52370	NC_015942	A	6	6	2568126	2568131	100 %	0 %	0 %	0 %	344200663
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52375	NC_015942	A	6	6	2568303	2568308	100 %	0 %	0 %	0 %	344200663
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52379	NC_015942	AAC	2	6	2568426	2568431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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52385	NC_015942	ATTG	2	8	2568770	2568777	25 %	50 %	25 %	0 %	344200664
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52457	NC_015942	GC	3	6	2573060	2573065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52458	NC_015942	CA	3	6	2573089	2573094	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52459	NC_015942	GCCC	2	8	2573235	2573242	0 %	0 %	25 %	75 %	344200669
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52463	NC_015942	AC	3	6	2573301	2573306	50 %	0 %	0 %	50 %	344200669
52464	NC_015942	GGC	2	6	2573328	2573333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200669
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52467	NC_015942	CGT	2	6	2573477	2573482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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52470	NC_015942	GA	3	6	2573594	2573599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52471	NC_015942	ATG	2	6	2573620	2573625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52472	NC_015942	ATT	2	6	2573631	2573636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200670
52473	NC_015942	CGA	2	6	2573772	2573777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200670
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52475	NC_015942	CTC	2	6	2573790	2573795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200670
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52477	NC_015942	AT	3	6	2574061	2574066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52478	NC_015942	ATT	2	6	2574068	2574073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52479	NC_015942	GAC	2	6	2574120	2574125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52480	NC_015942	CG	3	6	2574213	2574218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52481	NC_015942	GCC	2	6	2574294	2574299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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52499	NC_015942	TGAT	2	8	2575277	2575284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52500	NC_015942	GGCG	2	8	2575379	2575386	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

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