MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_015942	GCT	2	6	2524115	2524120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200627
51502	NC_015942	ACC	2	6	2524136	2524141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200627
51503	NC_015942	TCT	2	6	2524191	2524196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200627
51504	NC_015942	TCA	2	6	2524233	2524238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200627
51505	NC_015942	TGC	2	6	2524264	2524269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200627
51506	NC_015942	GAGC	2	8	2524308	2524315	25 %	0 %	50 %	25 %	344200627
51507	NC_015942	GAA	2	6	2524357	2524362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200627
51508	NC_015942	GC	3	6	2524411	2524416	0 %	0 %	50 %	50 %	344200627
51509	NC_015942	ACTGC	2	10	2524480	2524489	20 %	20 %	20 %	40 %	344200627
51510	NC_015942	CCA	2	6	2524547	2524552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200627
51511	NC_015942	AGGCC	2	10	2524569	2524578	20 %	0 %	40 %	40 %	344200627
51512	NC_015942	A	6	6	2524761	2524766	100 %	0 %	0 %	0 %	344200627
51513	NC_015942	CAT	2	6	2524773	2524778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200627
51514	NC_015942	CGCGCA	2	12	2524791	2524802	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344200627
51515	NC_015942	GCG	2	6	2525037	2525042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200627
51516	NC_015942	CG	3	6	2525111	2525116	0 %	0 %	50 %	50 %	344200627
51517	NC_015942	CCGC	2	8	2525144	2525151	0 %	0 %	25 %	75 %	344200627
51518	NC_015942	A	6	6	2525166	2525171	100 %	0 %	0 %	0 %	344200627
51519	NC_015942	GAT	2	6	2525196	2525201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200627
51520	NC_015942	TGC	2	6	2525252	2525257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200627
51521	NC_015942	AGC	2	6	2525510	2525515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200627
51522	NC_015942	GC	3	6	2525549	2525554	0 %	0 %	50 %	50 %	344200627
51523	NC_015942	GTA	2	6	2525614	2525619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200627
51524	NC_015942	GCGCCA	2	12	2525853	2525864	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344200627
51525	NC_015942	TCC	2	6	2525929	2525934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51526	NC_015942	A	6	6	2525939	2525944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51527	NC_015942	GCGG	2	8	2525986	2525993	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51528	NC_015942	CCG	2	6	2526001	2526006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51529	NC_015942	GAT	2	6	2526235	2526240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200628
51530	NC_015942	ACAT	2	8	2526251	2526258	50 %	25 %	0 %	25 %	344200628
51531	NC_015942	TCA	2	6	2526399	2526404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200628
51532	NC_015942	TCA	2	6	2526511	2526516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200629
51533	NC_015942	ATA	2	6	2526579	2526584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200629
51534	NC_015942	CAG	2	6	2526603	2526608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200629
51535	NC_015942	CGG	2	6	2526638	2526643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200629
51536	NC_015942	ATG	2	6	2526715	2526720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200629
51537	NC_015942	ATC	2	6	2526771	2526776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200629
51538	NC_015942	CAA	2	6	2526810	2526815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200629
51539	NC_015942	ACC	2	6	2526853	2526858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200629
51540	NC_015942	AGA	2	6	2526863	2526868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200629
51541	NC_015942	CTG	2	6	2526966	2526971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200629
51542	NC_015942	ACC	2	6	2526994	2526999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200629
51543	NC_015942	CTG	2	6	2527029	2527034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200629
51544	NC_015942	CAG	2	6	2527068	2527073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200629
51545	NC_015942	GAT	2	6	2527077	2527082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200629
51546	NC_015942	CGAGG	2	10	2527110	2527119	20 %	0 %	60 %	20 %	344200629
51547	NC_015942	GGT	2	6	2527122	2527127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200629
51548	NC_015942	ACC	2	6	2527129	2527134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200629
51549	NC_015942	AATA	2	8	2527212	2527219	75 %	25 %	0 %	0 %	344200629
51550	NC_015942	AGG	2	6	2527312	2527317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200629
51551	NC_015942	AGC	2	6	2527330	2527335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200629
51552	NC_015942	CCA	2	6	2527388	2527393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200629
51553	NC_015942	ACTG	2	8	2527424	2527431	25 %	25 %	25 %	25 %	344200629
51554	NC_015942	CAG	2	6	2527437	2527442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200629
51555	NC_015942	CAG	2	6	2527464	2527469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200629
51556	NC_015942	ACC	2	6	2527473	2527478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200629
51557	NC_015942	ATA	2	6	2527492	2527497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200629
51558	NC_015942	AGC	3	9	2527513	2527521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200629
51559	NC_015942	CAC	2	6	2527578	2527583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200629
51560	NC_015942	GCA	2	6	2527696	2527701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200629
51561	NC_015942	GCC	2	6	2527729	2527734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200629
51562	NC_015942	GAAT	2	8	2527836	2527843	50 %	25 %	25 %	0 %	344200629
51563	NC_015942	CAG	3	9	2527950	2527958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200630
51564	NC_015942	CCCG	2	8	2527994	2528001	0 %	0 %	25 %	75 %	344200630
51565	NC_015942	GCC	2	6	2528104	2528109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200630
51566	NC_015942	CGC	2	6	2528115	2528120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200630
51567	NC_015942	CAC	2	6	2528148	2528153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200630
51568	NC_015942	CAT	2	6	2528214	2528219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200630
51569	NC_015942	CAC	2	6	2528252	2528257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200630
51570	NC_015942	AAT	2	6	2528352	2528357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200630
51571	NC_015942	ACC	2	6	2528358	2528363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200630
51572	NC_015942	A	6	6	2528388	2528393	100 %	0 %	0 %	0 %	344200630
51573	NC_015942	GAA	2	6	2528425	2528430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200630
51574	NC_015942	CTT	2	6	2528442	2528447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200630
51575	NC_015942	TCC	2	6	2528452	2528457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200630
51576	NC_015942	CCA	2	6	2528468	2528473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200630
51577	NC_015942	ATAA	2	8	2528481	2528488	75 %	25 %	0 %	0 %	344200630
51578	NC_015942	ATC	2	6	2528509	2528514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200630
51579	NC_015942	GCCAG	2	10	2528516	2528525	20 %	0 %	40 %	40 %	344200630
51580	NC_015942	GCG	2	6	2528599	2528604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200630
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51582	NC_015942	CAA	2	6	2528757	2528762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200630
51583	NC_015942	CAC	2	6	2528774	2528779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200630
51584	NC_015942	AGC	2	6	2528797	2528802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200630
51585	NC_015942	CCA	2	6	2528804	2528809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200630
51586	NC_015942	AGAA	2	8	2528839	2528846	75 %	0 %	25 %	0 %	344200630
51587	NC_015942	TGG	2	6	2528852	2528857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200630
51588	NC_015942	CCG	2	6	2528865	2528870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200630
51589	NC_015942	AGA	2	6	2528957	2528962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200630
51590	NC_015942	ATC	2	6	2528968	2528973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200630
51591	NC_015942	GCC	2	6	2528995	2529000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200630
51592	NC_015942	GGT	2	6	2529110	2529115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200630
51593	NC_015942	A	6	6	2529116	2529121	100 %	0 %	0 %	0 %	344200630
51594	NC_015942	CGC	2	6	2529165	2529170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200630
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51597	NC_015942	GCCA	2	8	2529238	2529245	25 %	0 %	25 %	50 %	344200630
51598	NC_015942	GC	3	6	2529246	2529251	0 %	0 %	50 %	50 %	344200630
51599	NC_015942	CG	3	6	2529258	2529263	0 %	0 %	50 %	50 %	344200630
51600	NC_015942	GCC	2	6	2529291	2529296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200630
51601	NC_015942	GAG	2	6	2529324	2529329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200630
51602	NC_015942	AT	3	6	2529420	2529425	50 %	50 %	0 %	0 %	344200631
51603	NC_015942	CGC	2	6	2529438	2529443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200631
51604	NC_015942	GGC	2	6	2529452	2529457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200631
51605	NC_015942	ATA	2	6	2529489	2529494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200631
51606	NC_015942	TCA	2	6	2529510	2529515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200631
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51609	NC_015942	GCCA	2	8	2529699	2529706	25 %	0 %	25 %	50 %	344200631
51610	NC_015942	AGGCC	2	10	2529710	2529719	20 %	0 %	40 %	40 %	344200631
51611	NC_015942	GCA	2	6	2529730	2529735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200631
51612	NC_015942	AATA	2	8	2529859	2529866	75 %	25 %	0 %	0 %	344200631
51613	NC_015942	GC	3	6	2529925	2529930	0 %	0 %	50 %	50 %	344200631
51614	NC_015942	A	8	8	2529969	2529976	100 %	0 %	0 %	0 %	344200631
51615	NC_015942	CCA	2	6	2530015	2530020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200631
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51617	NC_015942	GAA	2	6	2530091	2530096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200631
51618	NC_015942	GCCC	2	8	2530177	2530184	0 %	0 %	25 %	75 %	344200631
51619	NC_015942	AAG	2	6	2530257	2530262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200631
51620	NC_015942	TCA	2	6	2530270	2530275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200631
51621	NC_015942	CGC	2	6	2530286	2530291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200631
51622	NC_015942	TGC	2	6	2530313	2530318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200631
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51624	NC_015942	GAG	2	6	2530424	2530429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200631
51625	NC_015942	TGCC	2	8	2530492	2530499	0 %	25 %	25 %	50 %	344200631
51626	NC_015942	TGG	2	6	2530507	2530512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200631
51627	NC_015942	AATA	2	8	2530607	2530614	75 %	25 %	0 %	0 %	344200631
51628	NC_015942	GCA	2	6	2530615	2530620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200631
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51633	NC_015942	TGC	2	6	2530802	2530807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200631
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51641	NC_015942	CTGG	2	8	2531135	2531142	0 %	25 %	50 %	25 %	344200631
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51648	NC_015942	A	6	6	2531442	2531447	100 %	0 %	0 %	0 %	344200632
51649	NC_015942	CAG	2	6	2531514	2531519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200632
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51653	NC_015942	A	6	6	2531591	2531596	100 %	0 %	0 %	0 %	344200632
51654	NC_015942	CCA	2	6	2531668	2531673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200633
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51717	NC_015942	CA	3	6	2534609	2534614	50 %	0 %	0 %	50 %	344200636
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51731	NC_015942	CCAG	2	8	2535204	2535211	25 %	0 %	25 %	50 %	344200636
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