MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49501	NC_015942	ATC	2	6	2424409	2424414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200517
49502	NC_015942	AAT	2	6	2424424	2424429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200517
49503	NC_015942	TCA	2	6	2424473	2424478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200517
49504	NC_015942	A	6	6	2424482	2424487	100 %	0 %	0 %	0 %	344200517
49505	NC_015942	CAG	2	6	2424586	2424591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200517
49506	NC_015942	AAC	2	6	2424593	2424598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200517
49507	NC_015942	TCA	2	6	2424707	2424712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200517
49508	NC_015942	ATTG	2	8	2424801	2424808	25 %	50 %	25 %	0 %	344200517
49509	NC_015942	CAT	2	6	2424840	2424845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200517
49510	NC_015942	TCA	2	6	2424894	2424899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200517
49511	NC_015942	ACC	2	6	2424903	2424908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200517
49512	NC_015942	T	6	6	2424917	2424922	0 %	100 %	0 %	0 %	344200517
49513	NC_015942	AAT	2	6	2424927	2424932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200517
49514	NC_015942	GGAC	2	8	2424954	2424961	25 %	0 %	50 %	25 %	344200517
49515	NC_015942	TCA	2	6	2425077	2425082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200518
49516	NC_015942	TCA	2	6	2425110	2425115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200518
49517	NC_015942	T	7	7	2425149	2425155	0 %	100 %	0 %	0 %	344200518
49518	NC_015942	ATG	2	6	2425178	2425183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200518
49519	NC_015942	GCC	2	6	2425194	2425199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200518
49520	NC_015942	CATGA	2	10	2425246	2425255	40 %	20 %	20 %	20 %	344200518
49521	NC_015942	GTA	2	6	2425279	2425284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200518
49522	NC_015942	CCA	2	6	2425350	2425355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200518
49523	NC_015942	ATC	2	6	2425421	2425426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49524	NC_015942	CAT	2	6	2425452	2425457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49525	NC_015942	AT	3	6	2425462	2425467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49526	NC_015942	GTG	2	6	2425485	2425490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49527	NC_015942	AAT	2	6	2425555	2425560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200519
49528	NC_015942	AAT	2	6	2425568	2425573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200519
49529	NC_015942	CCCG	2	8	2425627	2425634	0 %	0 %	25 %	75 %	344200519
49530	NC_015942	CTT	2	6	2425644	2425649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200519
49531	NC_015942	CAC	2	6	2425710	2425715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200519
49532	NC_015942	GCA	2	6	2425722	2425727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200519
49533	NC_015942	CG	3	6	2425775	2425780	0 %	0 %	50 %	50 %	344200519
49534	NC_015942	CGG	2	6	2425790	2425795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200519
49535	NC_015942	TGCC	2	8	2425809	2425816	0 %	25 %	25 %	50 %	344200519
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49537	NC_015942	TGA	2	6	2425953	2425958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200519
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49542	NC_015942	TAAGG	2	10	2426280	2426289	40 %	20 %	40 %	0 %	344200520
49543	NC_015942	CAG	2	6	2426436	2426441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200520
49544	NC_015942	GGGT	2	8	2426491	2426498	0 %	25 %	75 %	0 %	344200520
49545	NC_015942	CAA	2	6	2426517	2426522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200520
49546	NC_015942	CGC	2	6	2426582	2426587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200520
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49549	NC_015942	CTG	2	6	2426703	2426708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200520
49550	NC_015942	GCGG	2	8	2426709	2426716	0 %	0 %	75 %	25 %	344200520
49551	NC_015942	CTCG	2	8	2426730	2426737	0 %	25 %	25 %	50 %	344200520
49552	NC_015942	ATC	2	6	2426814	2426819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200520
49553	NC_015942	TGA	2	6	2426863	2426868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200520
49554	NC_015942	TCG	2	6	2426974	2426979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200520
49555	NC_015942	CAT	2	6	2426987	2426992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200520
49556	NC_015942	CTAT	2	8	2427007	2427014	25 %	50 %	0 %	25 %	344200520
49557	NC_015942	GAGAG	2	10	2427060	2427069	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49558	NC_015942	TCGGC	2	10	2427128	2427137	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49559	NC_015942	TGC	2	6	2427141	2427146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49560	NC_015942	GGA	2	6	2427191	2427196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49561	NC_015942	GC	3	6	2427248	2427253	0 %	0 %	50 %	50 %	344200521
49562	NC_015942	TGC	2	6	2427294	2427299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200521
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49565	NC_015942	CTG	2	6	2427485	2427490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200521
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49567	NC_015942	CAG	2	6	2427581	2427586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200521
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49571	NC_015942	GCCAT	2	10	2427750	2427759	20 %	20 %	20 %	40 %	344200521
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49585	NC_015942	GCT	2	6	2428631	2428636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200522
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49587	NC_015942	TCG	2	6	2428745	2428750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200522
49588	NC_015942	GCG	2	6	2428770	2428775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200522
49589	NC_015942	ACGG	2	8	2428804	2428811	25 %	0 %	50 %	25 %	344200522
49590	NC_015942	CTG	2	6	2428887	2428892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200522
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49599	NC_015942	GCG	2	6	2429441	2429446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200522
49600	NC_015942	TC	3	6	2429560	2429565	0 %	50 %	0 %	50 %	344200522
49601	NC_015942	CGC	3	9	2429644	2429652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200523
49602	NC_015942	GC	4	8	2429708	2429715	0 %	0 %	50 %	50 %	344200523
49603	NC_015942	GCA	2	6	2429773	2429778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200523
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49608	NC_015942	GTC	2	6	2430080	2430085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200524
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49612	NC_015942	CTGC	2	8	2430170	2430177	0 %	25 %	25 %	50 %	344200524
49613	NC_015942	GAT	2	6	2430199	2430204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200524
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49616	NC_015942	CTG	2	6	2430587	2430592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200524
49617	NC_015942	C	7	7	2430593	2430599	0 %	0 %	0 %	100 %	344200524
49618	NC_015942	GCC	2	6	2430626	2430631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200524
49619	NC_015942	CCA	2	6	2430697	2430702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200524
49620	NC_015942	CTT	2	6	2430708	2430713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200524
49621	NC_015942	TGG	2	6	2430723	2430728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200524
49622	NC_015942	CAC	2	6	2430770	2430775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200524
49623	NC_015942	GCG	2	6	2430872	2430877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200524
49624	NC_015942	CGG	2	6	2430878	2430883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200524
49625	NC_015942	TCCCTG	2	12	2430925	2430936	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	344200524
49626	NC_015942	GCA	2	6	2430955	2430960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200524
49627	NC_015942	CTG	2	6	2431019	2431024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200524
49628	NC_015942	GCA	2	6	2431082	2431087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200524
49629	NC_015942	CAG	2	6	2431154	2431159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200524
49630	NC_015942	GC	3	6	2431160	2431165	0 %	0 %	50 %	50 %	344200524
49631	NC_015942	TGC	2	6	2431284	2431289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200524
49632	NC_015942	GCA	2	6	2431299	2431304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200524
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49634	NC_015942	TGT	2	6	2431469	2431474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49635	NC_015942	ATTT	2	8	2431510	2431517	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49636	NC_015942	CAAT	2	8	2431662	2431669	50 %	25 %	0 %	25 %	344200525
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49639	NC_015942	GAT	2	6	2431740	2431745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200525
49640	NC_015942	TAAT	2	8	2431931	2431938	50 %	50 %	0 %	0 %	344200525
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49643	NC_015942	GCC	2	6	2432042	2432047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200525
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49648	NC_015942	TCT	2	6	2432294	2432299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200525
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49652	NC_015942	A	8	8	2432578	2432585	100 %	0 %	0 %	0 %	344200525
49653	NC_015942	CTT	2	6	2432619	2432624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200525
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49656	NC_015942	CAC	2	6	2432818	2432823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200525
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49659	NC_015942	CCT	2	6	2432986	2432991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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49674	NC_015942	CTT	2	6	2433595	2433600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49675	NC_015942	CCT	2	6	2433601	2433606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49676	NC_015942	AGGCG	2	10	2433709	2433718	20 %	0 %	60 %	20 %	344200527
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49702	NC_015942	CGT	2	6	2435129	2435134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200527
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49705	NC_015942	GCA	2	6	2435214	2435219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200527
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49715	NC_015942	CGT	2	6	2435572	2435577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200528
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49730	NC_015942	CGC	2	6	2436433	2436438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200530
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49732	NC_015942	TCCG	2	8	2436464	2436471	0 %	25 %	25 %	50 %	344200530
49733	NC_015942	GCC	2	6	2436539	2436544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200530
49734	NC_015942	CGC	2	6	2436602	2436607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200530
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49777	NC_015942	TCAT	2	8	2438795	2438802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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49820	NC_015942	A	6	6	2441433	2441438	100 %	0 %	0 %	0 %	344200536
49821	NC_015942	AC	3	6	2441457	2441462	50 %	0 %	0 %	50 %	344200536
49822	NC_015942	ATT	2	6	2441483	2441488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200536
49823	NC_015942	TA	3	6	2441586	2441591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49834	NC_015942	TGG	2	6	2442245	2442250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200537
49835	NC_015942	GCG	2	6	2442373	2442378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200537
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49967	NC_015942	CAT	2	6	2448788	2448793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200545
49968	NC_015942	GA	3	6	2448846	2448851	50 %	0 %	50 %	0 %	344200545
49969	NC_015942	GAT	3	9	2448870	2448878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200545
49970	NC_015942	TCC	2	6	2448964	2448969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200545
49971	NC_015942	CCGG	2	8	2449004	2449011	0 %	0 %	50 %	50 %	344200545
49972	NC_015942	ACC	2	6	2449024	2449029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200545
49973	NC_015942	CCA	3	9	2449070	2449078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200545
49974	NC_015942	GACCA	2	10	2449117	2449126	40 %	0 %	20 %	40 %	344200545
49975	NC_015942	CGGC	2	8	2449168	2449175	0 %	0 %	50 %	50 %	344200545
49976	NC_015942	GGT	2	6	2449191	2449196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200545
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49978	NC_015942	TGC	2	6	2449510	2449515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200545
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49980	NC_015942	GCG	2	6	2449668	2449673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200546
49981	NC_015942	GC	3	6	2449684	2449689	0 %	0 %	50 %	50 %	344200546
49982	NC_015942	CGT	2	6	2449723	2449728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200546
49983	NC_015942	TCCT	2	8	2449873	2449880	0 %	50 %	0 %	50 %	344200546
49984	NC_015942	GAT	2	6	2449944	2449949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200546
49985	NC_015942	ACC	2	6	2449964	2449969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200546
49986	NC_015942	GCA	2	6	2449981	2449986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200546
49987	NC_015942	TTG	2	6	2450006	2450011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200546
49988	NC_015942	CCA	2	6	2450025	2450030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200546
49989	NC_015942	GCA	2	6	2450145	2450150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200546
49990	NC_015942	GAT	2	6	2450248	2450253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200546
49991	NC_015942	ACC	2	6	2450273	2450278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200546
49992	NC_015942	CAAA	2	8	2450319	2450326	75 %	0 %	0 %	25 %	344200546
49993	NC_015942	CCG	2	6	2450370	2450375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200546
49994	NC_015942	AGC	2	6	2450417	2450422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200546
49995	NC_015942	GGA	2	6	2450537	2450542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49996	NC_015942	A	6	6	2450627	2450632	100 %	0 %	0 %	0 %	344200547
49997	NC_015942	GC	3	6	2450673	2450678	0 %	0 %	50 %	50 %	344200547
49998	NC_015942	CCTGGG	2	12	2450700	2450711	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344200547
49999	NC_015942	CAA	2	6	2450845	2450850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200547
50000	NC_015942	CAA	2	6	2450882	2450887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200547

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