MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_015850	GCT	2	6	2379456	2379461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783061
48502	NC_015850	TAT	2	6	2379649	2379654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783061
48503	NC_015850	ACG	2	6	2379809	2379814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783061
48504	NC_015850	TCTACC	2	12	2379848	2379859	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	340783061
48505	NC_015850	TGG	2	6	2379914	2379919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783061
48506	NC_015850	TCG	2	6	2380028	2380033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783061
48507	NC_015850	GCG	2	6	2380119	2380124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783061
48508	NC_015850	CTG	2	6	2380141	2380146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783061
48509	NC_015850	TTC	2	6	2380186	2380191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783061
48510	NC_015850	GCA	2	6	2380222	2380227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783061
48511	NC_015850	CG	3	6	2380311	2380316	0 %	0 %	50 %	50 %	340783061
48512	NC_015850	AGA	2	6	2380322	2380327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783061
48513	NC_015850	TGG	2	6	2380351	2380356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783061
48514	NC_015850	TCG	2	6	2380373	2380378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783061
48515	NC_015850	CGG	2	6	2380413	2380418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783061
48516	NC_015850	GC	3	6	2380586	2380591	0 %	0 %	50 %	50 %	340783062
48517	NC_015850	GAA	2	6	2380712	2380717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783062
48518	NC_015850	AGG	2	6	2380780	2380785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783062
48519	NC_015850	CTG	2	6	2380935	2380940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783062
48520	NC_015850	ACC	2	6	2380952	2380957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783062
48521	NC_015850	CCG	2	6	2380963	2380968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783062
48522	NC_015850	CGG	2	6	2381014	2381019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783062
48523	NC_015850	CGC	2	6	2381023	2381028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783062
48524	NC_015850	TGGC	2	8	2381073	2381080	0 %	25 %	50 %	25 %	340783062
48525	NC_015850	CCG	2	6	2381164	2381169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783062
48526	NC_015850	GCT	2	6	2381175	2381180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783062
48527	NC_015850	GCC	2	6	2381187	2381192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783062
48528	NC_015850	GCC	2	6	2381298	2381303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783062
48529	NC_015850	TGC	2	6	2381346	2381351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783062
48530	NC_015850	GCC	2	6	2381355	2381360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783062
48531	NC_015850	GCCGGA	2	12	2381433	2381444	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340783062
48532	NC_015850	ACGG	2	8	2381481	2381488	25 %	0 %	50 %	25 %	340783062
48533	NC_015850	GAT	2	6	2381524	2381529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48534	NC_015850	CTT	2	6	2381579	2381584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48535	NC_015850	TG	3	6	2381596	2381601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48536	NC_015850	GTG	2	6	2381618	2381623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48537	NC_015850	GC	3	6	2381626	2381631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48538	NC_015850	TGCG	2	8	2381637	2381644	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48539	NC_015850	GC	3	6	2381650	2381655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48540	NC_015850	TGC	2	6	2381675	2381680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48541	NC_015850	GCC	2	6	2381696	2381701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48542	NC_015850	TCT	2	6	2381743	2381748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48543	NC_015850	GAG	2	6	2381774	2381779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48544	NC_015850	A	6	6	2381858	2381863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48545	NC_015850	CGA	2	6	2381866	2381871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48546	NC_015850	CAT	2	6	2381888	2381893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48547	NC_015850	AT	3	6	2382006	2382011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48548	NC_015850	CGG	2	6	2382047	2382052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48549	NC_015850	CCCA	2	8	2382178	2382185	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
48550	NC_015850	AGC	2	6	2382358	2382363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783063
48551	NC_015850	ACG	2	6	2382454	2382459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783063
48552	NC_015850	TCG	2	6	2382505	2382510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783063
48553	NC_015850	GCT	2	6	2382543	2382548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783063
48554	NC_015850	GCC	2	6	2382576	2382581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783063
48555	NC_015850	CGAAAA	2	12	2382587	2382598	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	340783063
48556	NC_015850	CTG	2	6	2382684	2382689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783063
48557	NC_015850	GCG	2	6	2382701	2382706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783063
48558	NC_015850	CTG	2	6	2382765	2382770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783063
48559	NC_015850	CAG	2	6	2382816	2382821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48560	NC_015850	CTTGA	2	10	2382822	2382831	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48561	NC_015850	CGT	2	6	2382966	2382971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48562	NC_015850	GCG	2	6	2383011	2383016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48563	NC_015850	GCC	2	6	2383035	2383040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783064
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48575	NC_015850	GCC	2	6	2383372	2383377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48576	NC_015850	GCG	2	6	2383396	2383401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48577	NC_015850	TGCCGC	2	12	2383558	2383569	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340783066
48578	NC_015850	GTC	2	6	2383583	2383588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783066
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48588	NC_015850	ACAGC	2	10	2384131	2384140	40 %	0 %	20 %	40 %	340783066
48589	NC_015850	CGG	2	6	2384155	2384160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783066
48590	NC_015850	TCA	2	6	2384166	2384171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783066
48591	NC_015850	TTCA	2	8	2384219	2384226	25 %	50 %	0 %	25 %	340783066
48592	NC_015850	CGCC	2	8	2384257	2384264	0 %	0 %	25 %	75 %	340783066
48593	NC_015850	TCG	2	6	2384287	2384292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783066
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48598	NC_015850	CCACT	2	10	2384511	2384520	20 %	20 %	0 %	60 %	340783067
48599	NC_015850	CAG	2	6	2384623	2384628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783067
48600	NC_015850	GC	3	6	2384629	2384634	0 %	0 %	50 %	50 %	340783067
48601	NC_015850	CA	3	6	2384676	2384681	50 %	0 %	0 %	50 %	340783067
48602	NC_015850	GGA	2	6	2384868	2384873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783067
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48606	NC_015850	CTG	2	6	2385046	2385051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783067
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48616	NC_015850	GC	3	6	2385416	2385421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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48735	NC_015850	GAT	2	6	2390499	2390504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783074
48736	NC_015850	CCACC	2	10	2390508	2390517	20 %	0 %	0 %	80 %	340783074
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48837	NC_015850	TACAGG	2	12	2394512	2394523	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340783077
48838	NC_015850	ATC	2	6	2394542	2394547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783077
48839	NC_015850	GCG	2	6	2394558	2394563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783077
48840	NC_015850	CCGA	2	8	2394577	2394584	25 %	0 %	25 %	50 %	340783077
48841	NC_015850	GTA	2	6	2394601	2394606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783077
48842	NC_015850	GTCGGC	2	12	2394685	2394696	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340783077
48843	NC_015850	CCG	2	6	2394798	2394803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783077
48844	NC_015850	GC	3	6	2394829	2394834	0 %	0 %	50 %	50 %	340783077
48845	NC_015850	CGT	2	6	2394891	2394896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48846	NC_015850	TCA	2	6	2395012	2395017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783078
48847	NC_015850	CAA	2	6	2395031	2395036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783078
48848	NC_015850	TCG	2	6	2395073	2395078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783078
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48850	NC_015850	GGC	2	6	2395116	2395121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783078
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