MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47001	NC_015850	ATC	2	6	2309529	2309534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782992
47002	NC_015850	CGG	2	6	2309581	2309586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782992
47003	NC_015850	GAA	2	6	2309649	2309654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782992
47004	NC_015850	ATC	2	6	2309781	2309786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782992
47005	NC_015850	CAT	2	6	2309840	2309845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782992
47006	NC_015850	ACC	2	6	2309970	2309975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782992
47007	NC_015850	GTCATC	2	12	2310003	2310014	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340782992
47008	NC_015850	ATCTGG	2	12	2310132	2310143	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340782993
47009	NC_015850	GC	3	6	2310148	2310153	0 %	0 %	50 %	50 %	340782993
47010	NC_015850	AGCGGC	2	12	2310182	2310193	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340782993
47011	NC_015850	GAC	2	6	2310196	2310201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782993
47012	NC_015850	CTG	2	6	2310203	2310208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782993
47013	NC_015850	GGA	2	6	2310395	2310400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782993
47014	NC_015850	CGG	2	6	2310462	2310467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782993
47015	NC_015850	CGA	2	6	2310562	2310567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782993
47016	NC_015850	CCG	3	9	2310594	2310602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782993
47017	NC_015850	CGA	2	6	2310607	2310612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782993
47018	NC_015850	CTG	2	6	2310614	2310619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782993
47019	NC_015850	GGT	2	6	2310649	2310654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782993
47020	NC_015850	CGC	2	6	2310682	2310687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782993
47021	NC_015850	AGG	2	6	2310747	2310752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782993
47022	NC_015850	TACG	2	8	2310773	2310780	25 %	25 %	25 %	25 %	340782993
47023	NC_015850	TTC	2	6	2310785	2310790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782993
47024	NC_015850	GCT	2	6	2310828	2310833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782993
47025	NC_015850	ACTT	2	8	2310838	2310845	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47026	NC_015850	GCC	2	6	2310856	2310861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47027	NC_015850	GCC	2	6	2310884	2310889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47028	NC_015850	GGC	2	6	2310912	2310917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782994
47029	NC_015850	GCC	2	6	2310934	2310939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782994
47030	NC_015850	CCG	2	6	2310970	2310975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782994
47031	NC_015850	CAG	2	6	2310978	2310983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782994
47032	NC_015850	CGG	2	6	2311022	2311027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782994
47033	NC_015850	CG	3	6	2311045	2311050	0 %	0 %	50 %	50 %	340782994
47034	NC_015850	GAT	2	6	2311125	2311130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782994
47035	NC_015850	GCC	2	6	2311195	2311200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782994
47036	NC_015850	TTGAGG	2	12	2311231	2311242	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	340782994
47037	NC_015850	TGC	2	6	2311432	2311437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782994
47038	NC_015850	GC	3	6	2311467	2311472	0 %	0 %	50 %	50 %	340782994
47039	NC_015850	GCT	2	6	2311475	2311480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782994
47040	NC_015850	GCCTCG	2	12	2311516	2311527	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340782994
47041	NC_015850	GCC	2	6	2311552	2311557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782994
47042	NC_015850	GTC	2	6	2311575	2311580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782994
47043	NC_015850	CGG	2	6	2311595	2311600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782994
47044	NC_015850	TCC	2	6	2311615	2311620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782994
47045	NC_015850	GC	3	6	2311719	2311724	0 %	0 %	50 %	50 %	340782994
47046	NC_015850	CACG	2	8	2311733	2311740	25 %	0 %	25 %	50 %	340782994
47047	NC_015850	GCC	2	6	2311771	2311776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782994
47048	NC_015850	CAG	2	6	2311800	2311805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782994
47049	NC_015850	GCT	3	9	2311886	2311894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782994
47050	NC_015850	CAG	2	6	2311902	2311907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782994
47051	NC_015850	GCC	2	6	2311909	2311914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782994
47052	NC_015850	GGGTGA	2	12	2311982	2311993	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	340782994
47053	NC_015850	GCC	2	6	2312104	2312109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782994
47054	NC_015850	GC	5	10	2312147	2312156	0 %	0 %	50 %	50 %	340782994
47055	NC_015850	AGC	2	6	2312257	2312262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782994
47056	NC_015850	ACCG	2	8	2312321	2312328	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47057	NC_015850	GC	3	6	2312466	2312471	0 %	0 %	50 %	50 %	340782995
47058	NC_015850	CTG	2	6	2312567	2312572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782995
47059	NC_015850	CGC	2	6	2312573	2312578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782995
47060	NC_015850	GCA	2	6	2312596	2312601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782995
47061	NC_015850	AGG	2	6	2312602	2312607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782995
47062	NC_015850	CCTT	2	8	2312613	2312620	0 %	50 %	0 %	50 %	340782995
47063	NC_015850	GC	3	6	2312674	2312679	0 %	0 %	50 %	50 %	340782995
47064	NC_015850	GAG	2	6	2312690	2312695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782995
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47066	NC_015850	GAC	2	6	2312810	2312815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782995
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47068	NC_015850	CGA	2	6	2312905	2312910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782995
47069	NC_015850	CTG	2	6	2312912	2312917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782995
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47081	NC_015850	ACGCC	2	10	2313547	2313556	20 %	0 %	20 %	60 %	340782995
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47083	NC_015850	GGC	3	9	2313701	2313709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782995
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47089	NC_015850	CCTTCA	2	12	2314139	2314150	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	340782996
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47099	NC_015850	GTC	2	6	2314637	2314642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782996
47100	NC_015850	CAC	2	6	2314670	2314675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782996
47101	NC_015850	GC	3	6	2314684	2314689	0 %	0 %	50 %	50 %	340782996
47102	NC_015850	ACC	2	6	2314752	2314757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782996
47103	NC_015850	GGGTC	2	10	2314802	2314811	0 %	20 %	60 %	20 %	340782996
47104	NC_015850	CTGA	2	8	2314842	2314849	25 %	25 %	25 %	25 %	340782996
47105	NC_015850	TGG	2	6	2314874	2314879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782996
47106	NC_015850	GCA	2	6	2315024	2315029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782996
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47115	NC_015850	CCA	2	6	2315495	2315500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782996
47116	NC_015850	TCCTTG	2	12	2315551	2315562	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	340782996
47117	NC_015850	TTG	2	6	2315644	2315649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340782996
47118	NC_015850	TCG	2	6	2315797	2315802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782996
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47120	NC_015850	CCG	2	6	2316073	2316078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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47122	NC_015850	CTG	2	6	2316178	2316183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782997
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47185	NC_015850	CGCGG	2	10	2319285	2319294	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
47186	NC_015850	TC	4	8	2319311	2319318	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47187	NC_015850	GGAT	2	8	2319349	2319356	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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47202	NC_015850	AGAT	2	8	2320045	2320052	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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47221	NC_015850	CTT	2	6	2320948	2320953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783004
47222	NC_015850	CCT	2	6	2320998	2321003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783004
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47228	NC_015850	GCGCA	2	10	2321257	2321266	20 %	0 %	40 %	40 %	340783004
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47230	NC_015850	GTT	2	6	2321334	2321339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783004
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47232	NC_015850	GCAAG	2	10	2321376	2321385	40 %	0 %	40 %	20 %	340783004
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47234	NC_015850	CCT	2	6	2321430	2321435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783004
47235	NC_015850	TCC	2	6	2321477	2321482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783004
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47239	NC_015850	GCT	2	6	2321555	2321560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783004
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47247	NC_015850	ACC	2	6	2322157	2322162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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47332	NC_015850	TTG	2	6	2325603	2325608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783006
47333	NC_015850	CGA	2	6	2325631	2325636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783006
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47337	NC_015850	GTT	3	9	2325793	2325801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783006
47338	NC_015850	CAG	2	6	2325866	2325871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783006
47339	NC_015850	GC	4	8	2325891	2325898	0 %	0 %	50 %	50 %	340783006
47340	NC_015850	AGG	2	6	2325909	2325914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783006
47341	NC_015850	TGC	2	6	2325945	2325950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783006
47342	NC_015850	TCG	2	6	2325954	2325959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783006
47343	NC_015850	CTC	2	6	2325995	2326000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783006
47344	NC_015850	GCA	2	6	2326018	2326023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783006
47345	NC_015850	GCA	2	6	2326066	2326071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783006
47346	NC_015850	GCGTC	2	10	2326200	2326209	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47347	NC_015850	GTC	2	6	2326278	2326283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47348	NC_015850	AGC	2	6	2326337	2326342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783007
47349	NC_015850	GCA	2	6	2326436	2326441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783007
47350	NC_015850	CG	3	6	2326459	2326464	0 %	0 %	50 %	50 %	340783007
47351	NC_015850	GGA	2	6	2326503	2326508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783007
47352	NC_015850	GATCTC	2	12	2326519	2326530	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340783007
47353	NC_015850	CTC	2	6	2326534	2326539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783007
47354	NC_015850	ACC	2	6	2326561	2326566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783007
47355	NC_015850	CTG	2	6	2326576	2326581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783007
47356	NC_015850	GCT	2	6	2326596	2326601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783007
47357	NC_015850	TGA	2	6	2326602	2326607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783007
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47360	NC_015850	CGCT	2	8	2326709	2326716	0 %	25 %	25 %	50 %	340783007
47361	NC_015850	CG	5	10	2326719	2326728	0 %	0 %	50 %	50 %	340783007
47362	NC_015850	TCT	2	6	2326745	2326750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783007
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47366	NC_015850	GCC	2	6	2326834	2326839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783008
47367	NC_015850	CTTGCG	2	12	2326845	2326856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783008
47368	NC_015850	CGC	2	6	2326885	2326890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783008
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47371	NC_015850	A	6	6	2327062	2327067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47372	NC_015850	G	6	6	2327070	2327075	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47373	NC_015850	GAC	2	6	2327077	2327082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47374	NC_015850	AAT	2	6	2327158	2327163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47375	NC_015850	GTT	2	6	2327176	2327181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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47377	NC_015850	GAAG	2	8	2327211	2327218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47378	NC_015850	TGCC	2	8	2327225	2327232	0 %	25 %	25 %	50 %	340783009
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47425	NC_015850	CGATG	2	10	2329692	2329701	20 %	20 %	40 %	20 %	340783012
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47429	NC_015850	CTGG	2	8	2330008	2330015	0 %	25 %	50 %	25 %	340783012
47430	NC_015850	TGC	3	9	2330022	2330030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783012
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47435	NC_015850	T	6	6	2330170	2330175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47436	NC_015850	CCG	2	6	2330276	2330281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47437	NC_015850	GC	3	6	2330346	2330351	0 %	0 %	50 %	50 %	340783013
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47460	NC_015850	ATC	2	6	2332138	2332143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783013
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47463	NC_015850	GGA	2	6	2332242	2332247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47464	NC_015850	GAG	2	6	2332340	2332345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47465	NC_015850	GCC	2	6	2332368	2332373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47466	NC_015850	GCG	2	6	2332392	2332397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783014
47467	NC_015850	GCCAG	2	10	2332430	2332439	20 %	0 %	40 %	40 %	340783014
47468	NC_015850	GCC	2	6	2332452	2332457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783014
47469	NC_015850	GCG	2	6	2332569	2332574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783014
47470	NC_015850	CTCG	2	8	2332680	2332687	0 %	25 %	25 %	50 %	340783014
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47477	NC_015850	GCCTG	2	10	2332866	2332875	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47478	NC_015850	TGG	2	6	2332921	2332926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47479	NC_015850	A	6	6	2332956	2332961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47480	NC_015850	AGC	2	6	2332970	2332975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47481	NC_015850	AC	3	6	2332994	2332999	50 %	0 %	0 %	50 %	340783015
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47499	NC_015850	A	6	6	2334226	2334231	100 %	0 %	0 %	0 %	340783016
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