MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46502	NC_015850	GCC	2	6	2286637	2286642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782972
46503	NC_015850	TGC	2	6	2286662	2286667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782972
46504	NC_015850	TGA	2	6	2286750	2286755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782972
46505	NC_015850	CTG	2	6	2286788	2286793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782972
46506	NC_015850	ACC	2	6	2286976	2286981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782972
46507	NC_015850	GGA	2	6	2287047	2287052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782972
46508	NC_015850	A	6	6	2287114	2287119	100 %	0 %	0 %	0 %	340782972
46509	NC_015850	ATC	2	6	2287222	2287227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782972
46510	NC_015850	CTG	2	6	2287234	2287239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782972
46511	NC_015850	CGA	3	9	2287290	2287298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782972
46512	NC_015850	GC	3	6	2287313	2287318	0 %	0 %	50 %	50 %	340782972
46513	NC_015850	CGTCTG	2	12	2287575	2287586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782973
46514	NC_015850	CGA	2	6	2287664	2287669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782973
46515	NC_015850	CTG	2	6	2287677	2287682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782973
46516	NC_015850	ACC	2	6	2287768	2287773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782973
46517	NC_015850	CGG	2	6	2287793	2287798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782973
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46520	NC_015850	GCAC	2	8	2288013	2288020	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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46534	NC_015850	GCGCC	2	10	2289251	2289260	0 %	0 %	40 %	60 %	340782975
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46617	NC_015850	CGA	2	6	2292586	2292591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782977
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46644	NC_015850	A	6	6	2293712	2293717	100 %	0 %	0 %	0 %	340782977
46645	NC_015850	CAG	2	6	2293718	2293723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782977
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46648	NC_015850	CAG	2	6	2293766	2293771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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46670	NC_015850	GATT	2	8	2295010	2295017	25 %	50 %	25 %	0 %	340782979
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46677	NC_015850	TCG	3	9	2295348	2295356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782979
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46686	NC_015850	CACC	2	8	2295796	2295803	25 %	0 %	0 %	75 %	340782979
46687	NC_015850	GAAG	2	8	2295866	2295873	50 %	0 %	50 %	0 %	340782979
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46722	NC_015850	GC	3	6	2297446	2297451	0 %	0 %	50 %	50 %	340782981
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46724	NC_015850	GGC	2	6	2297553	2297558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782981
46725	NC_015850	C	6	6	2297575	2297580	0 %	0 %	0 %	100 %	340782981
46726	NC_015850	GTC	2	6	2297600	2297605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782981
46727	NC_015850	GCCA	2	8	2297617	2297624	25 %	0 %	25 %	50 %	340782981
46728	NC_015850	AGGC	2	8	2297678	2297685	25 %	0 %	50 %	25 %	340782981
46729	NC_015850	GGTT	2	8	2297727	2297734	0 %	50 %	50 %	0 %	340782981
46730	NC_015850	TGACGA	2	12	2297768	2297779	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340782981
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46834	NC_015850	CGA	2	6	2301728	2301733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782984
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46843	NC_015850	GCA	2	6	2302098	2302103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46844	NC_015850	GCG	2	6	2302115	2302120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46845	NC_015850	TCT	2	6	2302201	2302206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46847	NC_015850	CCT	2	6	2302336	2302341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782985
46848	NC_015850	TCG	2	6	2302347	2302352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782985
46849	NC_015850	GGT	2	6	2302373	2302378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782985
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46963	NC_015850	GC	4	8	2307851	2307858	0 %	0 %	50 %	50 %	340782990
46964	NC_015850	GCG	2	6	2307932	2307937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782990
46965	NC_015850	GGGC	2	8	2307980	2307987	0 %	0 %	75 %	25 %	340782990
46966	NC_015850	AGCCTG	2	12	2308030	2308041	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340782990
46967	NC_015850	CAA	2	6	2308050	2308055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782990
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46969	NC_015850	TCG	2	6	2308260	2308265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782991
46970	NC_015850	CAGT	2	8	2308297	2308304	25 %	25 %	25 %	25 %	340782991
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46976	NC_015850	CGGG	2	8	2308465	2308472	0 %	0 %	75 %	25 %	340782991
46977	NC_015850	CTG	2	6	2308475	2308480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782991
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46980	NC_015850	CGT	2	6	2308516	2308521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782991
46981	NC_015850	TCG	2	6	2308587	2308592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782991
46982	NC_015850	GGT	2	6	2308606	2308611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782991
46983	NC_015850	GACTG	2	10	2308669	2308678	20 %	20 %	40 %	20 %	340782991
46984	NC_015850	GC	3	6	2308820	2308825	0 %	0 %	50 %	50 %	340782991
46985	NC_015850	CGC	2	6	2308840	2308845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782991
46986	NC_015850	CCCG	2	8	2308848	2308855	0 %	0 %	25 %	75 %	340782991
46987	NC_015850	GGC	2	6	2308865	2308870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782991
46988	NC_015850	GGC	2	6	2308898	2308903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46989	NC_015850	GCC	2	6	2309026	2309031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782992
46990	NC_015850	AGC	2	6	2309059	2309064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782992
46991	NC_015850	GC	3	6	2309099	2309104	0 %	0 %	50 %	50 %	340782992
46992	NC_015850	GC	3	6	2309144	2309149	0 %	0 %	50 %	50 %	340782992
46993	NC_015850	AGG	2	6	2309194	2309199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782992
46994	NC_015850	CA	3	6	2309287	2309292	50 %	0 %	0 %	50 %	340782992
46995	NC_015850	GC	4	8	2309360	2309367	0 %	0 %	50 %	50 %	340782992
46996	NC_015850	CAT	2	6	2309370	2309375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782992
46997	NC_015850	CGT	2	6	2309411	2309416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782992
46998	NC_015850	ACCGG	2	10	2309421	2309430	20 %	0 %	40 %	40 %	340782992
46999	NC_015850	TCA	2	6	2309476	2309481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782992
47000	NC_015850	CACC	2	8	2309494	2309501	25 %	0 %	0 %	75 %	340782992

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