MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_015850	GTG	2	6	2260333	2260338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782948
46003	NC_015850	CAA	2	6	2260383	2260388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782948
46004	NC_015850	CCG	2	6	2260403	2260408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782948
46005	NC_015850	TCC	2	6	2260427	2260432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782948
46006	NC_015850	TGC	2	6	2260466	2260471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782948
46007	NC_015850	GTC	2	6	2260499	2260504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782948
46008	NC_015850	CTG	2	6	2260507	2260512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782948
46009	NC_015850	ATC	2	6	2260513	2260518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782948
46010	NC_015850	TGG	2	6	2260553	2260558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782948
46011	NC_015850	CAT	2	6	2260575	2260580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782948
46012	NC_015850	CGG	2	6	2260589	2260594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782948
46013	NC_015850	CGG	2	6	2260656	2260661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782948
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46016	NC_015850	ATC	2	6	2260762	2260767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782948
46017	NC_015850	CAG	2	6	2260780	2260785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782948
46018	NC_015850	CGG	2	6	2260816	2260821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782948
46019	NC_015850	GGA	2	6	2260827	2260832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782948
46020	NC_015850	GGT	2	6	2260888	2260893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782948
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46028	NC_015850	CGT	2	6	2261157	2261162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782948
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46034	NC_015850	CGG	2	6	2261367	2261372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782948
46035	NC_015850	GGT	2	6	2261380	2261385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782948
46036	NC_015850	GGC	2	6	2261389	2261394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782948
46037	NC_015850	GGC	2	6	2261398	2261403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782948
46038	NC_015850	GCC	2	6	2261499	2261504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46039	NC_015850	TAC	2	6	2261571	2261576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782949
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46085	NC_015850	CT	3	6	2263967	2263972	0 %	50 %	0 %	50 %	340782951
46086	NC_015850	TGC	2	6	2264080	2264085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782951
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46091	NC_015850	GCCC	2	8	2264414	2264421	0 %	0 %	25 %	75 %	340782951
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46096	NC_015850	CGCC	2	8	2264846	2264853	0 %	0 %	25 %	75 %	340782951
46097	NC_015850	TCA	2	6	2264857	2264862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782951
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46099	NC_015850	GC	4	8	2264873	2264880	0 %	0 %	50 %	50 %	340782951
46100	NC_015850	GGA	3	9	2264921	2264929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782951
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46102	NC_015850	CGT	2	6	2265165	2265170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782951
46103	NC_015850	GCC	3	9	2265207	2265215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782951
46104	NC_015850	CAG	2	6	2265233	2265238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782951
46105	NC_015850	GTGACC	2	12	2265451	2265462	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340782952
46106	NC_015850	ACC	2	6	2265476	2265481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782952
46107	NC_015850	ACC	2	6	2265600	2265605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782952
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46109	NC_015850	A	6	6	2265651	2265656	100 %	0 %	0 %	0 %	340782952
46110	NC_015850	ATC	2	6	2265673	2265678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782952
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46112	NC_015850	GCC	2	6	2265784	2265789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782952
46113	NC_015850	TGA	2	6	2265883	2265888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782952
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46115	NC_015850	A	7	7	2265910	2265916	100 %	0 %	0 %	0 %	340782952
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46227	NC_015850	CCA	2	6	2272083	2272088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782958
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46229	NC_015850	GTTAC	2	10	2272132	2272141	20 %	40 %	20 %	20 %	340782958
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46231	NC_015850	CCG	2	6	2272323	2272328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782959
46232	NC_015850	GC	3	6	2272385	2272390	0 %	0 %	50 %	50 %	340782959
46233	NC_015850	TCCAG	2	10	2272431	2272440	20 %	20 %	20 %	40 %	340782959
46234	NC_015850	GTCACC	2	12	2272466	2272477	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340782959
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46252	NC_015850	CACT	2	8	2273202	2273209	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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46333	NC_015850	GA	3	6	2277957	2277962	50 %	0 %	50 %	0 %	340782965
46334	NC_015850	GGCGAC	2	12	2277965	2277976	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340782965
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46343	NC_015850	AGCC	2	8	2278300	2278307	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46344	NC_015850	CCA	2	6	2278356	2278361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46345	NC_015850	ACAA	2	8	2278617	2278624	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46346	NC_015850	ATT	2	6	2278633	2278638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46347	NC_015850	TTA	2	6	2278642	2278647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46348	NC_015850	GCC	2	6	2278686	2278691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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46350	NC_015850	C	10	10	2278749	2278758	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46351	NC_015850	GCA	2	6	2278789	2278794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46352	NC_015850	CTC	2	6	2278813	2278818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46353	NC_015850	CTC	2	6	2278833	2278838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46354	NC_015850	CA	3	6	2278933	2278938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46355	NC_015850	G	7	7	2278963	2278969	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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46360	NC_015850	AGCG	2	8	2279280	2279287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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46498	NC_015850	ATCG	2	8	2286502	2286509	25 %	25 %	25 %	25 %	340782971
46499	NC_015850	TCCTGC	2	12	2286521	2286532	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46500	NC_015850	GGC	2	6	2286593	2286598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782972

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