MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45502	NC_015850	CCTT	2	8	2234033	2234040	0 %	50 %	0 %	50 %	340782927
45503	NC_015850	CG	3	6	2234114	2234119	0 %	0 %	50 %	50 %	340782927
45504	NC_015850	ATC	2	6	2234128	2234133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782927
45505	NC_015850	CCG	2	6	2234177	2234182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782927
45506	NC_015850	GCC	2	6	2234198	2234203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782927
45507	NC_015850	GAC	2	6	2234395	2234400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782927
45508	NC_015850	GCC	2	6	2234405	2234410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782927
45509	NC_015850	GTT	2	6	2234437	2234442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45510	NC_015850	TCC	2	6	2234443	2234448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45511	NC_015850	GTG	2	6	2234449	2234454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45512	NC_015850	CAT	2	6	2234465	2234470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45513	NC_015850	AGGGC	2	10	2234494	2234503	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
45514	NC_015850	CCA	2	6	2234725	2234730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782928
45515	NC_015850	GAG	2	6	2234762	2234767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782928
45516	NC_015850	CGC	2	6	2234794	2234799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782928
45517	NC_015850	CCTG	2	8	2234833	2234840	0 %	25 %	25 %	50 %	340782928
45518	NC_015850	CCA	2	6	2234895	2234900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782928
45519	NC_015850	GCGG	2	8	2234901	2234908	0 %	0 %	75 %	25 %	340782928
45520	NC_015850	CG	3	6	2234953	2234958	0 %	0 %	50 %	50 %	340782928
45521	NC_015850	GTC	2	6	2234966	2234971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782928
45522	NC_015850	CCCGAT	2	12	2234999	2235010	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340782928
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45524	NC_015850	TGG	3	9	2235060	2235068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782928
45525	NC_015850	GGC	2	6	2235091	2235096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782928
45526	NC_015850	CGA	2	6	2235148	2235153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782928
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45535	NC_015850	CG	3	6	2235803	2235808	0 %	0 %	50 %	50 %	340782929
45536	NC_015850	CAC	2	6	2235860	2235865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782929
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45546	NC_015850	CAT	2	6	2236270	2236275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782929
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45733	NC_015850	AGG	2	6	2246275	2246280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782938
45734	NC_015850	CCCA	2	8	2246358	2246365	25 %	0 %	0 %	75 %	340782938
45735	NC_015850	AGT	2	6	2246493	2246498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782938
45736	NC_015850	ATGA	2	8	2246547	2246554	50 %	25 %	25 %	0 %	340782938
45737	NC_015850	GAT	2	6	2246643	2246648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782938
45738	NC_015850	AAAT	2	8	2246776	2246783	75 %	25 %	0 %	0 %	340782938
45739	NC_015850	ACC	2	6	2246791	2246796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782938
45740	NC_015850	CGATGC	2	12	2246828	2246839	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340782938
45741	NC_015850	AGG	2	6	2246866	2246871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782938
45742	NC_015850	ACG	2	6	2246881	2246886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782938
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45744	NC_015850	GTC	2	6	2246979	2246984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782938
45745	NC_015850	A	7	7	2247098	2247104	100 %	0 %	0 %	0 %	340782938
45746	NC_015850	CAG	2	6	2247105	2247110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782938
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45750	NC_015850	GCC	2	6	2247419	2247424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782938
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45753	NC_015850	GTC	2	6	2247490	2247495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782938
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45759	NC_015850	AGC	2	6	2247753	2247758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782939
45760	NC_015850	GAG	2	6	2247827	2247832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782939
45761	NC_015850	CAG	2	6	2247869	2247874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782939
45762	NC_015850	GC	3	6	2247906	2247911	0 %	0 %	50 %	50 %	340782939
45763	NC_015850	ATA	2	6	2247977	2247982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340782939
45764	NC_015850	CGA	2	6	2247997	2248002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782939
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45766	NC_015850	TTG	2	6	2248125	2248130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45767	NC_015850	GAG	2	6	2248239	2248244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45768	NC_015850	CAA	2	6	2248259	2248264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782940
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45786	NC_015850	CGC	2	6	2249257	2249262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782940
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45833	NC_015850	GCA	2	6	2252014	2252019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782941
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45846	NC_015850	TG	3	6	2252511	2252516	0 %	50 %	50 %	0 %	340782941
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45848	NC_015850	CGC	3	9	2252608	2252616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782941
45849	NC_015850	GGC	2	6	2252624	2252629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782941
45850	NC_015850	GGT	2	6	2252656	2252661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782941
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45928	NC_015850	CG	4	8	2256980	2256987	0 %	0 %	50 %	50 %	340782945
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45957	NC_015850	T	6	6	2258528	2258533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45958	NC_015850	GCAT	2	8	2258551	2258558	25 %	25 %	25 %	25 %	340782946
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45962	NC_015850	TGGC	2	8	2258674	2258681	0 %	25 %	50 %	25 %	340782946
45963	NC_015850	CTC	2	6	2258694	2258699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782946
45964	NC_015850	CAG	2	6	2258715	2258720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782946
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