MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44502	NC_015850	TGG	2	6	2189046	2189051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782887
44503	NC_015850	TCG	2	6	2189073	2189078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782887
44504	NC_015850	TGC	2	6	2189112	2189117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782887
44505	NC_015850	TCG	2	6	2189148	2189153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782887
44506	NC_015850	CTG	2	6	2189192	2189197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782887
44507	NC_015850	CGG	2	6	2189238	2189243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782887
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44509	NC_015850	C	6	6	2189352	2189357	0 %	0 %	0 %	100 %	340782887
44510	NC_015850	TGG	3	9	2189455	2189463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782887
44511	NC_015850	GCA	2	6	2189511	2189516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782887
44512	NC_015850	CAG	2	6	2189546	2189551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782887
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44514	NC_015850	GATC	2	8	2189773	2189780	25 %	25 %	25 %	25 %	340782887
44515	NC_015850	GGC	2	6	2189812	2189817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782887
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44517	NC_015850	ACT	2	6	2189946	2189951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782887
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44524	NC_015850	CTG	2	6	2190230	2190235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782887
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44533	NC_015850	GC	3	6	2190627	2190632	0 %	0 %	50 %	50 %	340782887
44534	NC_015850	GTG	2	6	2190647	2190652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782887
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44538	NC_015850	GCG	2	6	2190799	2190804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44539	NC_015850	AGGC	2	8	2190828	2190835	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44540	NC_015850	CAT	3	9	2190836	2190844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44541	NC_015850	CGG	2	6	2190879	2190884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782888
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44554	NC_015850	CTG	3	9	2191427	2191435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782888
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44731	NC_015850	CACC	2	8	2200014	2200021	25 %	0 %	0 %	75 %	340782894
44732	NC_015850	CG	3	6	2200111	2200116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44733	NC_015850	ATC	2	6	2200160	2200165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44844	NC_015850	G	8	8	2205927	2205934	0 %	0 %	100 %	0 %	340782899
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44848	NC_015850	CGGCAC	2	12	2206100	2206111	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	340782899
44849	NC_015850	TCC	2	6	2206129	2206134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782899
44850	NC_015850	AGC	2	6	2206174	2206179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782899
44851	NC_015850	GAC	2	6	2206212	2206217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782899
44852	NC_015850	TC	3	6	2206232	2206237	0 %	50 %	0 %	50 %	340782899
44853	NC_015850	GA	3	6	2206273	2206278	50 %	0 %	50 %	0 %	340782899
44854	NC_015850	AGC	2	6	2206303	2206308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782899
44855	NC_015850	CACCCC	2	12	2206356	2206367	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	340782899
44856	NC_015850	GCCGG	2	10	2206393	2206402	0 %	0 %	60 %	40 %	340782899
44857	NC_015850	ATG	2	6	2206459	2206464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782899
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44859	NC_015850	CG	3	6	2206542	2206547	0 %	0 %	50 %	50 %	340782899
44860	NC_015850	AAG	2	6	2206618	2206623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782899
44861	NC_015850	CGA	2	6	2206637	2206642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782899
44862	NC_015850	CGG	2	6	2206670	2206675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782899
44863	NC_015850	GC	3	6	2206850	2206855	0 %	0 %	50 %	50 %	340782899
44864	NC_015850	CCG	2	6	2206931	2206936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782899
44865	NC_015850	GCCCTT	2	12	2206944	2206955	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	340782899
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44868	NC_015850	CTC	2	6	2207112	2207117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782899
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44875	NC_015850	TG	3	6	2207383	2207388	0 %	50 %	50 %	0 %	340782899
44876	NC_015850	GCC	2	6	2207395	2207400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782899
44877	NC_015850	GCA	2	6	2207416	2207421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782899
44878	NC_015850	TCG	2	6	2207470	2207475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782899
44879	NC_015850	ACC	2	6	2207661	2207666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782899
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44885	NC_015850	C	7	7	2208209	2208215	0 %	0 %	0 %	100 %	340782900
44886	NC_015850	GC	4	8	2208237	2208244	0 %	0 %	50 %	50 %	340782900
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44895	NC_015850	C	6	6	2208549	2208554	0 %	0 %	0 %	100 %	340782900
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44899	NC_015850	CTGCGC	2	12	2208784	2208795	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340782901
44900	NC_015850	CG	3	6	2208800	2208805	0 %	0 %	50 %	50 %	340782901
44901	NC_015850	CAC	2	6	2208829	2208834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782901
44902	NC_015850	GCG	2	6	2208868	2208873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782901
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44905	NC_015850	CAC	2	6	2209005	2209010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44906	NC_015850	ACC	2	6	2209035	2209040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44907	NC_015850	CAC	3	9	2209165	2209173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782902
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44909	NC_015850	CCA	2	6	2209239	2209244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782902
44910	NC_015850	TGA	2	6	2209251	2209256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782902
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44913	NC_015850	GGC	2	6	2209408	2209413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782902
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44929	NC_015850	GGC	2	6	2210156	2210161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782903
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44932	NC_015850	GTA	2	6	2210429	2210434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782903
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44936	NC_015850	GC	3	6	2210628	2210633	0 %	0 %	50 %	50 %	340782903
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44946	NC_015850	GAT	2	6	2210975	2210980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782903
44947	NC_015850	GAC	2	6	2211095	2211100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782903
44948	NC_015850	CTG	2	6	2211107	2211112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782903
44949	NC_015850	CGT	2	6	2211118	2211123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782903
44950	NC_015850	T	6	6	2211130	2211135	0 %	100 %	0 %	0 %	340782903
44951	NC_015850	GCC	2	6	2211141	2211146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782903
44952	NC_015850	GGC	2	6	2211218	2211223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782903
44953	NC_015850	GCT	2	6	2211241	2211246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782903
44954	NC_015850	GGAC	2	8	2211259	2211266	25 %	0 %	50 %	25 %	340782903
44955	NC_015850	TCC	3	9	2211345	2211353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782903
44956	NC_015850	AGC	2	6	2211390	2211395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782903
44957	NC_015850	AC	3	6	2211400	2211405	50 %	0 %	0 %	50 %	340782903
44958	NC_015850	GC	3	6	2211439	2211444	0 %	0 %	50 %	50 %	340782903
44959	NC_015850	CAGC	2	8	2211451	2211458	25 %	0 %	25 %	50 %	340782903
44960	NC_015850	CGGC	2	8	2211469	2211476	0 %	0 %	50 %	50 %	340782903
44961	NC_015850	GAAA	2	8	2211559	2211566	75 %	0 %	25 %	0 %	340782903
44962	NC_015850	GGC	2	6	2211648	2211653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782903
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