MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_015850	TCC	2	6	2109064	2109069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43002	NC_015850	G	6	6	2109134	2109139	0 %	0 %	100 %	0 %	340782801
43003	NC_015850	GCG	2	6	2109173	2109178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782801
43004	NC_015850	TCGT	2	8	2109193	2109200	0 %	50 %	25 %	25 %	340782801
43005	NC_015850	GCA	2	6	2109214	2109219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782801
43006	NC_015850	AGGCA	2	10	2109246	2109255	40 %	0 %	40 %	20 %	340782801
43007	NC_015850	TCG	2	6	2109347	2109352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782801
43008	NC_015850	TGC	2	6	2109395	2109400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782801
43009	NC_015850	TTCA	2	8	2109439	2109446	25 %	50 %	0 %	25 %	340782801
43010	NC_015850	ACG	2	6	2109485	2109490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782801
43011	NC_015850	CCA	2	6	2109614	2109619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782801
43012	NC_015850	GCC	2	6	2109700	2109705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782801
43013	NC_015850	GGA	2	6	2109730	2109735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782801
43014	NC_015850	C	6	6	2109739	2109744	0 %	0 %	0 %	100 %	340782801
43015	NC_015850	GCA	2	6	2109821	2109826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782801
43016	NC_015850	CCA	2	6	2109836	2109841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782801
43017	NC_015850	ATT	2	6	2109866	2109871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340782801
43018	NC_015850	CCA	2	6	2109896	2109901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782801
43019	NC_015850	CAG	2	6	2109947	2109952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782801
43020	NC_015850	AGC	2	6	2109977	2109982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782801
43021	NC_015850	GTTG	2	8	2110055	2110062	0 %	50 %	50 %	0 %	340782801
43022	NC_015850	AAC	2	6	2110094	2110099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782801
43023	NC_015850	TGA	2	6	2110153	2110158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782801
43024	NC_015850	CCTG	2	8	2110164	2110171	0 %	25 %	25 %	50 %	340782802
43025	NC_015850	A	7	7	2110294	2110300	100 %	0 %	0 %	0 %	340782802
43026	NC_015850	AGA	2	6	2110324	2110329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782802
43027	NC_015850	GCC	2	6	2110353	2110358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782802
43028	NC_015850	GCCT	2	8	2110410	2110417	0 %	25 %	25 %	50 %	340782802
43029	NC_015850	AAGC	2	8	2110419	2110426	50 %	0 %	25 %	25 %	340782802
43030	NC_015850	ACT	2	6	2110447	2110452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782802
43031	NC_015850	TTG	2	6	2110458	2110463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340782802
43032	NC_015850	CTG	2	6	2110589	2110594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782802
43033	NC_015850	CGC	2	6	2110601	2110606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782802
43034	NC_015850	CT	3	6	2110620	2110625	0 %	50 %	0 %	50 %	340782802
43035	NC_015850	GGAA	2	8	2110628	2110635	50 %	0 %	50 %	0 %	340782802
43036	NC_015850	CTG	2	6	2110752	2110757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782802
43037	NC_015850	ACT	2	6	2110892	2110897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782802
43038	NC_015850	AACGC	2	10	2111024	2111033	40 %	0 %	20 %	40 %	340782802
43039	NC_015850	CT	3	6	2111049	2111054	0 %	50 %	0 %	50 %	340782802
43040	NC_015850	AGA	2	6	2111062	2111067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782802
43041	NC_015850	GAT	2	6	2111083	2111088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782802
43042	NC_015850	CAT	2	6	2111109	2111114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43043	NC_015850	CAT	2	6	2111225	2111230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782803
43044	NC_015850	GCTG	2	8	2111267	2111274	0 %	25 %	50 %	25 %	340782803
43045	NC_015850	GACC	2	8	2111297	2111304	25 %	0 %	25 %	50 %	340782803
43046	NC_015850	CGCT	2	8	2111424	2111431	0 %	25 %	25 %	50 %	340782803
43047	NC_015850	CAC	2	6	2111452	2111457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782803
43048	NC_015850	ACG	2	6	2111491	2111496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782803
43049	NC_015850	CTT	2	6	2111528	2111533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782803
43050	NC_015850	CGA	2	6	2111561	2111566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782803
43051	NC_015850	CAT	3	9	2111723	2111731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782803
43052	NC_015850	GAC	2	6	2111751	2111756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782803
43053	NC_015850	GGCG	2	8	2111774	2111781	0 %	0 %	75 %	25 %	340782803
43054	NC_015850	CGT	2	6	2111840	2111845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782804
43055	NC_015850	CA	3	6	2111926	2111931	50 %	0 %	0 %	50 %	340782804
43056	NC_015850	TA	3	6	2111955	2111960	50 %	50 %	0 %	0 %	340782805
43057	NC_015850	CCT	2	6	2112043	2112048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782806
43058	NC_015850	GCC	3	9	2112207	2112215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782806
43059	NC_015850	T	7	7	2112267	2112273	0 %	100 %	0 %	0 %	340782806
43060	NC_015850	TTC	2	6	2112317	2112322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782806
43061	NC_015850	GTT	2	6	2112346	2112351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340782806
43062	NC_015850	TGCG	2	8	2112503	2112510	0 %	25 %	50 %	25 %	340782807
43063	NC_015850	GCCTTG	2	12	2112521	2112532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782807
43064	NC_015850	ATG	2	6	2112620	2112625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782807
43065	NC_015850	GGC	2	6	2112647	2112652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782807
43066	NC_015850	TGG	2	6	2112704	2112709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782807
43067	NC_015850	TTTC	2	8	2112804	2112811	0 %	75 %	0 %	25 %	340782807
43068	NC_015850	CGT	2	6	2112900	2112905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782807
43069	NC_015850	ACC	2	6	2113039	2113044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782807
43070	NC_015850	CTG	2	6	2113166	2113171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782807
43071	NC_015850	GCA	2	6	2113214	2113219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782807
43072	NC_015850	GAA	2	6	2113450	2113455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782807
43073	NC_015850	GCC	2	6	2113464	2113469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782807
43074	NC_015850	CTC	2	6	2113501	2113506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782807
43075	NC_015850	AGCA	2	8	2113518	2113525	50 %	0 %	25 %	25 %	340782807
43076	NC_015850	TCC	2	6	2113571	2113576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782807
43077	NC_015850	CCA	2	6	2113596	2113601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782807
43078	NC_015850	CGG	2	6	2113606	2113611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782807
43079	NC_015850	GA	3	6	2113627	2113632	50 %	0 %	50 %	0 %	340782807
43080	NC_015850	ATC	2	6	2113766	2113771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782808
43081	NC_015850	CGATG	2	10	2113842	2113851	20 %	20 %	40 %	20 %	340782808
43082	NC_015850	ATC	2	6	2113886	2113891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782808
43083	NC_015850	CAC	2	6	2113915	2113920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43084	NC_015850	TATCA	2	10	2113939	2113948	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43085	NC_015850	CATC	2	8	2113979	2113986	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43086	NC_015850	CGA	2	6	2114047	2114052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43087	NC_015850	ACGG	2	8	2114145	2114152	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43088	NC_015850	T	7	7	2114165	2114171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43089	NC_015850	CTGTC	2	10	2114213	2114222	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
43090	NC_015850	CGA	2	6	2114255	2114260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43091	NC_015850	CTG	2	6	2114285	2114290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43092	NC_015850	TGC	2	6	2114337	2114342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43093	NC_015850	CTG	2	6	2114360	2114365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43094	NC_015850	TGG	2	6	2114371	2114376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43095	NC_015850	GAT	2	6	2114456	2114461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43096	NC_015850	GGC	2	6	2114547	2114552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43097	NC_015850	GTC	2	6	2114562	2114567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43098	NC_015850	CAA	2	6	2114629	2114634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43099	NC_015850	CTTT	2	8	2114745	2114752	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43100	NC_015850	CAA	2	6	2114769	2114774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43101	NC_015850	AACA	2	8	2114863	2114870	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43102	NC_015850	GT	3	6	2114938	2114943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43103	NC_015850	TCA	3	9	2114955	2114963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43104	NC_015850	T	7	7	2115006	2115012	0 %	100 %	0 %	0 %	340782809
43105	NC_015850	GGC	2	6	2115035	2115040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782809
43106	NC_015850	CGA	3	9	2115078	2115086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782809
43107	NC_015850	TTG	2	6	2115136	2115141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340782809
43108	NC_015850	GA	3	6	2115178	2115183	50 %	0 %	50 %	0 %	340782809
43109	NC_015850	A	6	6	2115344	2115349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43110	NC_015850	ATGT	2	8	2115378	2115385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43111	NC_015850	CCAG	2	8	2115386	2115393	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43112	NC_015850	TTG	2	6	2115412	2115417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43113	NC_015850	TCAA	2	8	2115460	2115467	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43114	NC_015850	CTA	2	6	2115535	2115540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43115	NC_015850	AGTA	2	8	2115572	2115579	50 %	25 %	25 %	0 %	340782810
43116	NC_015850	CGG	2	6	2115591	2115596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782810
43117	NC_015850	GTA	2	6	2115671	2115676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782810
43118	NC_015850	CG	3	6	2115683	2115688	0 %	0 %	50 %	50 %	340782810
43119	NC_015850	AAC	2	6	2115755	2115760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782810
43120	NC_015850	T	6	6	2115761	2115766	0 %	100 %	0 %	0 %	340782810
43121	NC_015850	AAC	2	6	2115874	2115879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782810
43122	NC_015850	TGA	2	6	2115985	2115990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782811
43123	NC_015850	GCA	2	6	2116033	2116038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782811
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43146	NC_015850	TCTTT	2	10	2117016	2117025	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43147	NC_015850	CAA	2	6	2117026	2117031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43148	NC_015850	GAT	2	6	2117068	2117073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43149	NC_015850	TA	3	6	2117102	2117107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43150	NC_015850	GGA	2	6	2117232	2117237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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43152	NC_015850	GTC	2	6	2117314	2117319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43155	NC_015850	AAC	2	6	2117720	2117725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43156	NC_015850	CCTGC	2	10	2117787	2117796	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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43158	NC_015850	AG	3	6	2118066	2118071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43159	NC_015850	AG	3	6	2118168	2118173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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43162	NC_015850	ACA	2	6	2118342	2118347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782812
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43177	NC_015850	GTGCC	2	10	2118955	2118964	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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43188	NC_015850	GTA	2	6	2119800	2119805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782817
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43217	NC_015850	GA	3	6	2120949	2120954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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43222	NC_015850	GCG	2	6	2121149	2121154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43223	NC_015850	GCG	2	6	2121207	2121212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43224	NC_015850	GGT	2	6	2121272	2121277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43225	NC_015850	GAT	2	6	2121381	2121386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43226	NC_015850	CGG	3	9	2121391	2121399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43227	NC_015850	CCGTG	2	10	2121416	2121425	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43228	NC_015850	CG	3	6	2121485	2121490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43229	NC_015850	GGC	2	6	2121586	2121591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43230	NC_015850	CAGC	2	8	2121619	2121626	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43231	NC_015850	TGC	2	6	2121671	2121676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43232	NC_015850	TGG	2	6	2121787	2121792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782818
43233	NC_015850	GCT	2	6	2121811	2121816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782818
43234	NC_015850	TCT	2	6	2121868	2121873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782818
43235	NC_015850	TCCAGG	2	12	2121874	2121885	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340782818
43236	NC_015850	AGT	2	6	2122008	2122013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43237	NC_015850	TGG	2	6	2122046	2122051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43238	NC_015850	AG	3	6	2122087	2122092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43239	NC_015850	GGA	2	6	2122125	2122130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43240	NC_015850	TGG	2	6	2122239	2122244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43241	NC_015850	GAT	2	6	2122276	2122281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43242	NC_015850	CTG	2	6	2122283	2122288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43243	NC_015850	GGC	2	6	2122304	2122309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43244	NC_015850	GA	3	6	2122316	2122321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43245	NC_015850	A	7	7	2122330	2122336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43246	NC_015850	AG	3	6	2122364	2122369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43247	NC_015850	GCAG	2	8	2122392	2122399	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43248	NC_015850	ATGA	2	8	2122415	2122422	50 %	25 %	25 %	0 %	340782819
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43347	NC_015850	AG	3	6	2127785	2127790	50 %	0 %	50 %	0 %	340782824
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43479	NC_015850	TGA	2	6	2134171	2134176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782830
43480	NC_015850	GCT	2	6	2134207	2134212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782830
43481	NC_015850	GGT	2	6	2134238	2134243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782830
43482	NC_015850	TCT	2	6	2134285	2134290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782830
43483	NC_015850	TG	3	6	2134368	2134373	0 %	50 %	50 %	0 %	340782830
43484	NC_015850	TTA	2	6	2134400	2134405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340782830
43485	NC_015850	GAGG	2	8	2134474	2134481	25 %	0 %	75 %	0 %	340782830
43486	NC_015850	AAG	3	9	2134487	2134495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782830
43487	NC_015850	CGT	2	6	2134592	2134597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782830
43488	NC_015850	TGC	2	6	2134611	2134616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782830
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43491	NC_015850	AGA	2	6	2134819	2134824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782830
43492	NC_015850	GGT	2	6	2134828	2134833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782830
43493	NC_015850	GAA	2	6	2134856	2134861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782830
43494	NC_015850	GCG	2	6	2134864	2134869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782830
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43499	NC_015850	CAT	2	6	2135115	2135120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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